More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_2003 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_4342  molydopterin dinucleotide-binding region  81.36 
 
 		 727 aa  1185    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.303774  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2009  formate dehydrogenase  51.67 
 
 		 715 aa  650    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1990  molybdopterin oxidoreductase  51.58 
 
 		 743 aa  667    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2055  formate dehydrogenase  51.85 
 
 		 733 aa  671    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2187  molybdopterin oxidoreductase  53.45 
 
 		 725 aa  709    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000199348  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2003  molybdopterin oxidoreductase  100 
 
 		 726 aa  1469    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.447732 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2565  molybdopterin oxidoreductase  39.47 
 
 		 747 aa  436  1e-121  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0260966 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5376  molydopterin dinucleotide-binding region  39.28 
 
 		 739 aa  432  1e-119  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00550563 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1074  molybdopterin oxidoreductase  34.56 
 
 		 717 aa  420  1e-116  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4525  molybdopterin oxidoreductase  36.74 
 
 		 701 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0840542 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1413  molydopterin dinucleotide-binding region  38.04 
 
 		 739 aa  412  1e-114  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.395603  normal  0.324246 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0643  formate dehydrogenase  34.08 
 
 		 764 aa  416  1e-114  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2236  formate dehydrogenase  33.11 
 
 		 726 aa  411  1e-113  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1613  putative oxidoreductase  36.06 
 
 		 702 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6518  molybdopterin dinucleotide-binding region  35.35 
 
 		 773 aa  405  1e-111  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3340  molydopterin dinucleotide-binding region  36.11 
 
 		 702 aa  405  1e-111  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.203215  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2925  molydopterin dinucleotide-binding region  34.6 
 
 		 691 aa  401  9.999999999999999e-111  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0793208  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18640  putative oxidoreductase  35.78 
 
 		 702 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0882727 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3899  molybdopterin oxidoreductase:molydopterin dinucleotide-binding region  35.91 
 
 		 702 aa  398  1e-109  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.945677 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4810  molybdopterin dinucleotide-binding region  36.57 
 
 		 739 aa  398  1e-109  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03498  Anaerobic dehydrogenase  32.62 
 
 		 729 aa  395  1e-108  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2059  molybdopterin oxidoreductase  32.53 
 
 		 704 aa  393  1e-108  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2947  molydopterin dinucleotide-binding region  36.86 
 
 		 731 aa  393  1e-108  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.975721  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1080  molydopterin dinucleotide-binding region  35.23 
 
 		 702 aa  389  1e-106  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.753131  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3848  molybdopterin oxidoreductase  34.75 
 
 		 738 aa  389  1e-106  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0167  molydopterin dinucleotide-binding region  33.33 
 
 		 741 aa  386  1e-106  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1121  molydopterin dinucleotide-binding region  34.95 
 
 		 702 aa  388  1e-106  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.103516  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4332  molydopterin dinucleotide-binding region  34.95 
 
 		 702 aa  389  1e-106  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4162  oxidoreductase, molybdopterin-binding protein  35.08 
 
 		 732 aa  385  1e-105  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1109  molydopterin dinucleotide-binding region  33.84 
 
 		 702 aa  381  1e-104  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2405  molydopterin dinucleotide-binding region  33.06 
 
 		 1299 aa  382  1e-104  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.598133  hitchhiker  0.00155962 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0816  molybdopterin dinucleotide-binding region  34.5 
 
 		 732 aa  377  1e-103  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1497  molydopterin dinucleotide-binding region  32.2 
 
 		 713 aa  377  1e-103  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3610  molybdopterin dinucleotide-binding region  36.82 
 
 		 733 aa  370  1e-101  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.992314  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2776  molydopterin dinucleotide-binding region  36.3 
 
 		 687 aa  364  3e-99  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1721  molydopterin dinucleotide-binding region  32.99 
 
 		 753 aa  352  1e-95  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.54844  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4457  molydopterin dinucleotide-binding region  35.39 
 
 		 757 aa  338  1.9999999999999998e-91  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.609279 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0515  molybdopterin dinucleotide-binding region  33.92 
 
 		 721 aa  337  2.9999999999999997e-91  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4442  molydopterin dinucleotide-binding region  32.97 
 
 		 720 aa  321  3e-86  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.510451  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3956  formate dehydrogenase  31.67 
 
 		 721 aa  319  1e-85  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0923262  decreased coverage  0.00564803 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3942  formate dehydrogenase  31.52 
 
 		 721 aa  318  3e-85  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4016  formate dehydrogenase  31.52 
 
 		 721 aa  318  3e-85  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2249  formate dehydrogenase  32.41 
 
 		 720 aa  312  1e-83  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.404887  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5802  molybdopterin oxidoreductase  43.06 
 
 		 768 aa  283  7.000000000000001e-75  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.203441  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2551  molybdopterin oxidoreductase  27.89 
 
 		 777 aa  227  5.0000000000000005e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.163664  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2114  molybdopterin oxidoreductase family protein  27.71 
 
 		 804 aa  227  5.0000000000000005e-58  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3201  molybdopterin oxidoreductase family protein  27.89 
 
 		 777 aa  227  5.0000000000000005e-58  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.938387  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1387  molybdopterin oxidoreductase family protein  27.71 
 
 		 804 aa  227  5.0000000000000005e-58  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.397965  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1612  molybdopterin oxidoreductase family protein  27.76 
 
 		 773 aa  227  6e-58  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.915489  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2639  molybdopterin oxidoreductase family protein  27.89 
 
 		 849 aa  227  6e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2497  molybdopterin oxidoreductase  27.71 
 
 		 804 aa  227  7e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.512402  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1975  molybdopterin oxidoreductase family protein  28.53 
 
 		 769 aa  220  7e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.595995  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4198  formate dehydrogenase  29.15 
 
 		 679 aa  211  5e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.100839  normal  0.216188 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1621  nitrate reductase  31.56 
 
 		 746 aa  209  1e-52  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.161606  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3010  formate dehydrogenase  27.65 
 
 		 754 aa  197  6e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.189553  normal  0.616096 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0588  molybdopterin oxidoreductase  25.7 
 
 		 671 aa  189  1e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29050  putative molybdopterin oxidoreductase  27.31 
 
 		 769 aa  186  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000388245 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3288  formate dehydrogenase  26.56 
 
 		 753 aa  181  4.999999999999999e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.138891  normal  0.334154 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2751  formate dehydrogenase  26.52 
 
 		 752 aa  179  2e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.215233  normal  0.0781523 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2721  formate dehydrogenase  25.94 
 
 		 752 aa  178  3e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.94379  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2765  formate dehydrogenase  25.94 
 
 		 752 aa  178  3e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1073  molydopterin dinucleotide-binding region  26.77 
 
 		 835 aa  178  4e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1778  molydopterin dinucleotide-binding region  25.63 
 
 		 738 aa  177  7e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3416  molybdopterin oxidoreductase  27.63 
 
 		 708 aa  176  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.928899  normal  0.530079 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10199  oxidoreductase  28.72 
 
 		 749 aa  176  9.999999999999999e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.29998  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2193  formate dehydrogenase subunit alpha  25.82 
 
 		 745 aa  176  1.9999999999999998e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.571777  normal  0.536023 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0313  molybdopterin oxidoreductase  24.49 
 
 		 698 aa  173  1e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.16634  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2648  molybdopterin oxidoreductase  25.55 
 
 		 747 aa  172  1e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.104156  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1583  aminotransferase class V  27.6 
 
 		 1139 aa  171  5e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0608  formate dehydrogenase, alpha subunit  24.53 
 
 		 674 aa  168  2.9999999999999998e-40  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1581  aminotransferase, class V  27.01 
 
 		 1135 aa  168  2.9999999999999998e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.863454  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2997  molybdopterin dinucleotide-binding region  31.55 
 
 		 757 aa  168  4e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.312767 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0913  formate dehydrogenase, alpha subunit  25.5 
 
 		 668 aa  168  4e-40  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1045  formate dehydrogenase, alpha subunit  23.67 
 
 		 688 aa  167  5.9999999999999996e-40  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.77936  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2630  aminotransferase class V  27.12 
 
 		 1143 aa  167  8e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2701  anaerobic dehydrogenase, acetylene hydratase-like  25.57 
 
 		 692 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00185864  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0126  formate dehydrogenase  24.36 
 
 		 685 aa  166  1.0000000000000001e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2436  molybdopterin oxidoreductase  24.83 
 
 		 936 aa  164  4.0000000000000004e-39  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.982452  normal  0.336779 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1823  molybdopterin oxidoreductase  28.53 
 
 		 726 aa  164  6e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.320306  normal  0.908332 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2312  formate dehydrogenase subunit alpha  25.75 
 
 		 899 aa  163  1e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0941024  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1466  molybdopterin oxidoreductase  26.7 
 
 		 731 aa  162  1e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0402  formate dehydrogenase  26.85 
 
 		 693 aa  162  2e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1243  molybdopterin oxidoreductase  28.31 
 
 		 662 aa  162  3e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2227  molybdopterin oxidoreductase  25.38 
 
 		 891 aa  160  6e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.178988  hitchhiker  0.00000402166 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2849  molybdopterin oxidoreductase  25.5 
 
 		 691 aa  160  6e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0447  molybdopterin oxidoreductase  24.5 
 
 		 731 aa  160  6e-38  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4110  molybdopterin oxidoreductase  25.85 
 
 		 744 aa  160  9e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.220187  normal  0.43512 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2859  oxidoreductase protein  27.36 
 
 		 698 aa  159  1e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3507  formate dehydrogenase, alpha subunit  25.83 
 
 		 893 aa  157  5.0000000000000005e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0713  molybdopterin oxidoreductase  24.62 
 
 		 668 aa  157  5.0000000000000005e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1932  molybdopterin oxidoreductase  27.31 
 
 		 726 aa  157  6e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.496239  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2597  molybdopterin oxidoreductase  26.06 
 
 		 688 aa  157  7e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00221589 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7633  reductase  27.01 
 
 		 708 aa  157  7e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0930  molybdopterin oxidoreductase  25.49 
 
 		 731 aa  157  8e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.99852  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1217  molybdopterin oxidoreductase  25.53 
 
 		 666 aa  156  1e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.718553  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3503  formate dehydrogenase, alpha subunit  26.24 
 
 		 900 aa  156  2e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1890  molybdopterin oxidoreductase  27.46 
 
 		 726 aa  155  2.9999999999999998e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0190  formate dehydrogenase, alpha subunit  26.46 
 
 		 685 aa  155  2.9999999999999998e-36  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3491  molybdopterin oxidoreductase  27.38 
 
 		 1312 aa  155  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.421 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2208  molybdopterin oxidoreductase  27.04 
 
 		 726 aa  154  4e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.881316  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>