218 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_1787 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_1787  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 290 aa  572  1.0000000000000001e-162  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0086  TPR repeat-containing protein  40.69 
 
 		 307 aa  182  4.0000000000000006e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1399  tetratricopeptide TPR_2  48.1 
 
 		 226 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.972416  normal  0.953611 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1657  hypothetical protein  45.62 
 
 		 192 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.459184  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3988  tetratricopeptide TPR_2  45.51 
 
 		 219 aa  135  6.0000000000000005e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.374893 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0984  TPR repeat-containing protein  45.62 
 
 		 221 aa  135  9e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.815768 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4676  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  44.38 
 
 		 220 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1215  tetratricopeptide TPR_2  41.44 
 
 		 224 aa  133  3e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1419  TPR repeat-containing protein  44.94 
 
 		 221 aa  132  5e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2028  TPR repeat-containing protein  40.62 
 
 		 205 aa  131  1.0000000000000001e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.287446  normal  0.576518 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5960  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  42.6 
 
 		 202 aa  122  6e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0718627  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1166  TPR repeat-containing protein  42.11 
 
 		 230 aa  118  9.999999999999999e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1687  TPR domain-containing protein  41.45 
 
 		 209 aa  117  1.9999999999999998e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1747  TPR domain-containing protein  41.45 
 
 		 229 aa  117  3e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5209  TPR repeat-containing protein  40.24 
 
 		 200 aa  115  8.999999999999998e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.221692  normal  0.106965 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3277  TPR repeat-containing protein  40.13 
 
 		 204 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.983749 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3576  TPR repeat-containing protein  40.4 
 
 		 211 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.316735  normal  0.110411 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0130  TPR repeat-containing protein  39.58 
 
 		 203 aa  108  1e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.250306 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2742  TPR repeat-containing protein  37.02 
 
 		 202 aa  107  2e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.911892  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2969  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  37.02 
 
 		 202 aa  106  4e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.233578  normal  0.742122 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2675  TPR repeat-containing protein  38.92 
 
 		 203 aa  106  4e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.679716  normal  0.152424 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2864  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  38.22 
 
 		 201 aa  104  1e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3257  TPR repeat-containing protein  36.84 
 
 		 194 aa  101  1e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.841733  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2063  TPR repeat-containing protein  38.75 
 
 		 243 aa  99.4  6e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1561  TPR repeat-containing protein  37.5 
 
 		 190 aa  99  8e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.707304  normal  0.548421 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2421  hypothetical protein  36.88 
 
 		 190 aa  97.1  3e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.416486  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0204  TPR repeat-containing protein  35.46 
 
 		 212 aa  97.1  3e-19  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3687  hypothetical protein  34.13 
 
 		 261 aa  97.1  3e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.145402  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1084  TPR repeat-containing protein  38.04 
 
 		 175 aa  96.7  4e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1829  TPR repeat-containing protein  33.48 
 
 		 245 aa  91.3  2e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.320638  normal  0.588931 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3312  TPR protein  37.18 
 
 		 188 aa  84.3  0.000000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.000995394  normal  0.0577925 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0782  tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  37.59 
 
 		 188 aa  81.3  0.00000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0782775  normal  0.104271 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1693  tetratricopeptide TPR_2  34.21 
 
 		 203 aa  73.9  0.000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.521297  normal  0.655187 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0175  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.04 
 
 		 156 aa  73.6  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.723088 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0141  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.17 
 
 		 156 aa  72.8  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0138  TPR repeat-containing protein  32.17 
 
 		 156 aa  72.8  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000611488 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1201  tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.9 
 
 		 183 aa  70.9  0.00000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.564024  normal  0.522722 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2533  TPR repeat-containing protein  31.71 
 
 		 192 aa  70.5  0.00000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2056  tetratricopeptide TPR_2  29.34 
 
 		 233 aa  69.3  0.00000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.134429  normal  0.162736 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4966  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  37.61 
 
 		 155 aa  68.6  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4894  TPR repeat-containing protein  31.82 
 
 		 156 aa  67  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00964612 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1025  TPR repeat-containing protein  37.5 
 
 		 156 aa  64.7  0.000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1342  TPR repeat-containing protein  26.09 
 
 		 391 aa  60.1  0.00000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0572  tetratricopeptide TPR_2  29.77 
 
 		 194 aa  57.8  0.0000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00850831  hitchhiker  0.0000040032 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5131  TPR repeat-containing protein  25 
 
 		 361 aa  57.4  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000131061 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1019  TPR repeat-containing protein  28.45 
 
 		 273 aa  57.4  0.0000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0955  tetratricopeptide TPR_2  31.87 
 
 		 635 aa  57.4  0.0000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.750671 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3022  TPR repeat-containing protein  27.83 
 
 		 161 aa  57.4  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000246943 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0897  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  30.97 
 
 		 541 aa  56.6  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.713797  normal  1 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_8734  predicted protein  35.9 
 
 		 124 aa  56.2  0.0000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.662786  normal  1 
 
 
-
 
NC_013163  Cyan8802_4605  TPR repeat-containing protein  27.18 
 
 		 279 aa  55.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0755  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 662 aa  55.5  0.000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.466717  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3029  peptidase C14  28 
 
 		 527 aa  54.7  0.000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.148896  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3793  TPR repeat-containing protein  29.35 
 
 		 428 aa  54.3  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.085128 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2383  TPR repeat-containing protein  31.25 
 
 		 1421 aa  54.3  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.823331 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28701  hypothetical protein  28.42 
 
 		 582 aa  54.7  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28721  hypothetical protein  28.42 
 
 		 706 aa  54.7  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2336  TPR repeat-containing protein  35.92 
 
 		 413 aa  53.9  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.367246  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4645  TPR repeat-containing protein  29.47 
 
 		 349 aa  53.9  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.656867  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28481  hypothetical protein  28.85 
 
 		 462 aa  53.9  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28501  hypothetical protein  29.47 
 
 		 706 aa  53.9  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13031  TPR repeat-containing protein  29 
 
 		 306 aa  53.5  0.000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0823406 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0032  TPR repeat-containing protein  25.69 
 
 		 1445 aa  53.1  0.000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1009  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  29.25 
 
 		 528 aa  53.1  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.781757  normal  0.111483 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20371  hypothetical protein  29.7 
 
 		 233 aa  53.1  0.000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0775177 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  31.52 
 
 		 3560 aa  52.8  0.000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1335  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29.06 
 
 		 522 aa  52.8  0.000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.479436  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0905  TPR domain-containing protein  27.87 
 
 		 295 aa  52.4  0.000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  31.91 
 
 		 1276 aa  52.4  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.92 
 
 		 988 aa  52.4  0.000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2200  TPR domain-containing protein  24.03 
 
 		 695 aa  51.2  0.00002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0964  TPR domain-containing protein  27.87 
 
 		 295 aa  50.8  0.00002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.166963  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0910  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.23 
 
 		 553 aa  51.6  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.354692  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  29.67 
 
 		 1979 aa  51.2  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.04 
 
 		 1056 aa  51.2  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2322  TPR repeat-containing protein  24.4 
 
 		 352 aa  51.2  0.00002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1000  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.35 
 
 		 219 aa  50.8  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.810235  normal  0.0608831 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2994  hypothetical protein  28.09 
 
 		 417 aa  50.4  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.542641  normal  0.0105744 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1000  TPR repeat-containing protein  35.82 
 
 		 486 aa  50.4  0.00003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.326539  normal  0.768066 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4355  TPR repeat-containing protein  26.53 
 
 		 1192 aa  50.8  0.00003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.862224  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  28.41 
 
 		 927 aa  50.1  0.00004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3115  TPR repeat-containing protein  29.79 
 
 		 284 aa  50.1  0.00004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000023055  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5381  methyltransferase type 11  29.03 
 
 		 438 aa  50.1  0.00004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.554977 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0774  TPR repeat-containing protein  25.69 
 
 		 1534 aa  50.1  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2680  peptidase S41  25.88 
 
 		 745 aa  50.4  0.00004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.20871  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0121  TPR repeat-containing protein  29.67 
 
 		 732 aa  50.1  0.00005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.261868  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1392  TPR repeat-containing protein  27.87 
 
 		 301 aa  49.7  0.00006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.800927  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5158  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29.69 
 
 		 474 aa  49.7  0.00006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.927175  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0369  TPR repeat-containing protein  27.17 
 
 		 446 aa  49.7  0.00006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0416  1-deoxy-D-xylulose 5-phosphate reductoisomerase  27.37 
 
 		 541 aa  49.3  0.00008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3949  TPR repeat-containing protein  27.45 
 
 		 361 aa  49.3  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.71 
 
 		 1056 aa  49.3  0.00008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1066  TPR repeat-containing protein  30.61 
 
 		 747 aa  48.9  0.00009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0301  TPR repeat-containing protein  31.87 
 
 		 1827 aa  48.9  0.0001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1449  tetratricopeptide TPR_2  31.86 
 
 		 1067 aa  48.5  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0407  TPR repeat-containing protein  28.72 
 
 		 423 aa  48.1  0.0001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7350  hypothetical protein  34.48 
 
 		 668 aa  48.5  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0858  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  24.71 
 
 		 479 aa  48.9  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.8 
 
 		 818 aa  48.1  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0554  caspase-like domain- and TPR repeat-containing peptidase  29.52 
 
 		 518 aa  48.9  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.463703 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>