More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_3214 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_3214  aminotransferase class-III  100 
 
 
433 aa  867    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5225  aminotransferase class-III  58.53 
 
 
427 aa  497  1e-139  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.502422  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5426  aminotransferase class-III  60.34 
 
 
442 aa  497  1e-139  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.341099  normal  0.107268 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2538  aminotransferase class-III  55.24 
 
 
434 aa  491  9.999999999999999e-139  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.043195  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2224  aminotransferase class-III  55.48 
 
 
434 aa  492  9.999999999999999e-139  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1796  aminotransferase class-III  58.71 
 
 
436 aa  488  1e-137  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.904494  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0414  aminotransferase  58.39 
 
 
416 aa  483  1e-135  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0982  aminotransferase class-III  62.8 
 
 
436 aa  476  1e-133  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1957  aminotransferase class-III  61.59 
 
 
436 aa  466  9.999999999999999e-131  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.796788  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0312  aminotransferase  61.84 
 
 
436 aa  464  1e-129  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0067  aminotransferase class-III  50.82 
 
 
447 aa  457  1e-127  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5905  aminotransferase class-III  54.39 
 
 
465 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1272  aminotransferase class-III  52.56 
 
 
424 aa  454  1.0000000000000001e-126  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2403  aminotransferase class-III  53.48 
 
 
447 aa  450  1e-125  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.634591  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2498  aminotransferase class-III  51.67 
 
 
446 aa  446  1.0000000000000001e-124  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2916  aminotransferase class-III  51.81 
 
 
448 aa  443  1e-123  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1546  aminotransferase class-III  53.48 
 
 
448 aa  442  1e-123  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.634671  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0048  aminotransferase class-III  50.48 
 
 
458 aa  438  1e-121  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3009  aminotransferase  50.84 
 
 
443 aa  427  1e-118  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4438  aminotransferase class-III  51.54 
 
 
427 aa  417  9.999999999999999e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0985724  normal  0.717239 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1165  aminotransferase, class III  50.47 
 
 
427 aa  410  1e-113  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4354  aminotransferase  45.95 
 
 
427 aa  393  1e-108  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1377  aminotransferase  46.45 
 
 
429 aa  366  1e-100  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.427783  normal  0.27217 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3343  aminotransferase class-III  49.88 
 
 
413 aa  350  2e-95  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.65062 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3361  hypothetical protein  45.28 
 
 
1015 aa  349  5e-95  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0949  hypothetical protein  43.66 
 
 
1023 aa  349  5e-95  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2397  hypothetical protein  45.61 
 
 
1015 aa  348  8e-95  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.584295  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2578  hypothetical protein  43.69 
 
 
1018 aa  348  9e-95  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.54149  normal  0.14969 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0891  hypothetical protein  43.43 
 
 
1049 aa  348  9e-95  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2601  hypothetical protein  44.66 
 
 
1015 aa  347  2e-94  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.338016  normal  0.0406059 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2246  aminotransferase class-III  47.83 
 
 
978 aa  347  3e-94  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.256947  normal  0.907649 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1405  hypothetical protein  43.19 
 
 
1016 aa  345  7e-94  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.920355  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2711  hypothetical protein  42.34 
 
 
994 aa  301  2e-80  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0583099  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3387  hypothetical protein  39.67 
 
 
1003 aa  291  1e-77  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.276595  normal  0.86306 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1713  hypothetical protein  37.7 
 
 
976 aa  276  7e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_52110  hypothetical protein  41.52 
 
 
427 aa  275  9e-73  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6010  hypothetical protein  39.02 
 
 
974 aa  275  1.0000000000000001e-72  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4154  hypothetical protein  37.7 
 
 
910 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4943  hypothetical protein  37.24 
 
 
966 aa  273  3e-72  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.870078  hitchhiker  0.0000072077 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3725  hypothetical protein  37.47 
 
 
976 aa  273  5.000000000000001e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4321  hypothetical protein  38.05 
 
 
981 aa  271  2e-71  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.212999 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4091  hypothetical protein  38.05 
 
 
981 aa  269  5.9999999999999995e-71  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.565558  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4167  hypothetical protein  38.05 
 
 
981 aa  269  5.9999999999999995e-71  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.989146  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4934  hypothetical protein  36.36 
 
 
970 aa  264  2e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4610  hypothetical protein  36.28 
 
 
977 aa  264  3e-69  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.102283  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4495  hypothetical protein  35.32 
 
 
973 aa  263  3e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0622  aminotransferase class-III  39.3 
 
 
448 aa  263  4.999999999999999e-69  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.570795  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5395  aminotransferase, class III  36.57 
 
 
970 aa  262  6.999999999999999e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4205  hypothetical protein  35.9 
 
 
973 aa  262  1e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0290  hypothetical protein  35.28 
 
 
970 aa  261  2e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2580  hypothetical protein  36.36 
 
 
975 aa  259  6e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.458682 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2095  hypothetical protein  36.1 
 
 
967 aa  252  8.000000000000001e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.174405 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0941  aminotransferase class-III  35.03 
 
 
431 aa  228  1e-58  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.224071  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14780  4-aminobutyrate aminotransferase  32.01 
 
 
437 aa  221  9.999999999999999e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0220  aminotransferase  35.82 
 
 
436 aa  214  2.9999999999999995e-54  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30190  aminotransferase  35.91 
 
 
419 aa  206  7e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.168399  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1947  aminotransferase  33.33 
 
 
433 aa  205  1e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4970  aminotransferase class-III  33.1 
 
 
431 aa  205  1e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.260445  normal  0.117498 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3669  aminotransferase class-III  34.89 
 
 
443 aa  204  2e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.445293  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3215  aminotransferase class-III  34.34 
 
 
436 aa  204  2e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.26914  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1030  aminotransferase class-III  33.73 
 
 
431 aa  204  2e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0606808 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2993  aminotransferase class-III  35.57 
 
 
436 aa  202  8e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4758  Acetylornithine transaminase  36.78 
 
 
418 aa  201  1.9999999999999998e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.569005 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2104  aminotransferase class-III  36.06 
 
 
430 aa  200  3.9999999999999996e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.939975  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2913  4-aminobutyrate aminotransferase  33.71 
 
 
434 aa  199  9e-50  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.976227 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3380  aminotransferase class-III  32.4 
 
 
431 aa  198  2.0000000000000003e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.130996  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2400  4-aminobutyrate aminotransferase  33.83 
 
 
430 aa  196  5.000000000000001e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.681516  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1916  Acetylornithine transaminase  35.44 
 
 
417 aa  196  8.000000000000001e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0686  aminotransferase  34.46 
 
 
429 aa  193  6e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1796  Acetylornithine transaminase  32.58 
 
 
439 aa  192  9e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.778199  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1532  aminotransferase  30.42 
 
 
436 aa  191  2.9999999999999997e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3989  4-aminobutyrate aminotransferase  31.15 
 
 
461 aa  189  8e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.992424  normal  0.611425 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5089  aminotransferase class-III  33.33 
 
 
451 aa  187  4e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.447769  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1757  aminotransferase  35.62 
 
 
425 aa  186  5e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.744583  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1481  aminotransferase  30.14 
 
 
449 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2668  aminotransferase  32.79 
 
 
457 aa  184  2.0000000000000003e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1778  aminotransferase  30.14 
 
 
450 aa  185  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.250209  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3926  aminotransferase class-III  33.09 
 
 
442 aa  185  2.0000000000000003e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1704  aminotransferase  30.14 
 
 
450 aa  185  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0566  4-aminobutyrate aminotransferase  30.79 
 
 
428 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1727  aminotransferase  30.14 
 
 
449 aa  184  3e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1491  aminotransferase  30.14 
 
 
449 aa  184  3e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.112289  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1636  aminotransferase  29.9 
 
 
450 aa  183  5.0000000000000004e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1519  aminotransferase  29.9 
 
 
449 aa  183  6e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.152783  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3219  aminotransferase class-III  32.84 
 
 
442 aa  182  7e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.338952 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1673  aminotransferase  30.7 
 
 
450 aa  182  1e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0301264  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0539  4-aminobutyrate aminotransferase  30.58 
 
 
444 aa  181  2e-44  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1738  aminotransferase class-III  32.61 
 
 
465 aa  180  4e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.243066  normal  0.440114 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4825  aminotransferase class-III  33.33 
 
 
446 aa  180  4.999999999999999e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00475157  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3251  aminotransferase class-III  33.57 
 
 
428 aa  179  1e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.414034  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5114  aminotransferase class-III  32.28 
 
 
436 aa  178  2e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.128293 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2019  aminotransferase class-III  32.13 
 
 
465 aa  178  2e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3671  aminotransferase  30.22 
 
 
450 aa  178  2e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0477751  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0357  4-aminobutyrate aminotransferase  27.23 
 
 
478 aa  177  3e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0293  4-aminobutyrate aminotransferase  27.23 
 
 
454 aa  177  3e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0297  4-aminobutyrate aminotransferase  27.23 
 
 
454 aa  177  3e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2583  diaminobutyrate--2-oxoglutarate aminotransferase  32.7 
 
 
458 aa  177  3e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.406627  hitchhiker  0.00247951 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1896  aminotransferase class-III  33.92 
 
 
432 aa  177  3e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0311328 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1957  4-aminobutyrate aminotransferase  30 
 
 
427 aa  177  3e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0305  4-aminobutyrate aminotransferase  27.23 
 
 
454 aa  177  3e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>