81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_1973 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_1973  hypothetical protein  100 
 
 		 179 aa  356  8e-98  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0974788 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2011  hypothetical protein  92.19 
 
 		 170 aa  250  9.000000000000001e-66  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.272674  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2287  hypothetical protein  92.19 
 
 		 170 aa  250  9.000000000000001e-66  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.56667 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0487  hypothetical protein  77.52 
 
 		 154 aa  213  8e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.492113  normal  0.732049 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4360  hypothetical protein  65 
 
 		 165 aa  199  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4924  hypothetical protein  65 
 
 		 169 aa  198  3e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.195094  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4974  hypothetical protein  49.69 
 
 		 203 aa  160  1e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5490  hypothetical protein  47.65 
 
 		 204 aa  154  9e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.30695  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4945  hypothetical protein  50.68 
 
 		 199 aa  152  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6942  hypothetical protein  51.39 
 
 		 202 aa  148  4e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3722  hypothetical protein  45.12 
 
 		 228 aa  146  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.167012  normal  0.0261827 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3413  hypothetical protein  44.87 
 
 		 230 aa  141  4e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.188559  normal  0.623749 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3606  conserved hypothetical proteinn  48.18 
 
 		 228 aa  141  5e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00367306  normal  0.482079 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3426  hypothetical protein  49.32 
 
 		 178 aa  141  6e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5160  hypothetical protein  42.67 
 
 		 204 aa  129  3e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.131388 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1674  hypothetical protein  47.01 
 
 		 147 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1887  hypothetical protein  47.33 
 
 		 146 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3740  hypothetical protein  47.46 
 
 		 147 aa  109  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00447243  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3624  hypothetical protein  45.3 
 
 		 147 aa  107  7.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.13672  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2595  hypothetical protein  44.72 
 
 		 167 aa  106  2e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.13732  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2264  hypothetical protein  36.69 
 
 		 213 aa  105  5e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.144386 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1874  hypothetical protein  34.57 
 
 		 225 aa  104  7e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0912  hypothetical protein  42.18 
 
 		 145 aa  103  1e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.423404 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2734  hypothetical protein  48.76 
 
 		 156 aa  103  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0802358 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1333  hypothetical protein  43.55 
 
 		 123 aa  102  4e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.497148 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3433  hypothetical protein  40.14 
 
 		 145 aa  98.6  5e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2677  hypothetical protein  34.91 
 
 		 231 aa  97.4  1e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.137476  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5609  hypothetical protein  41.88 
 
 		 136 aa  96.7  2e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.343437  normal  0.446429 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2974  hypothetical protein  35.48 
 
 		 207 aa  95.5  4e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.155724  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1710  hypothetical protein  38.13 
 
 		 134 aa  93.6  1e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.661743  normal  0.276056 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2348  hypothetical protein  39.04 
 
 		 146 aa  92.4  3e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.553066  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2668  hypothetical protein  38.73 
 
 		 147 aa  91.7  5e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3305  hypothetical protein  42.96 
 
 		 134 aa  90.9  9e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1034  hypothetical protein  38.89 
 
 		 168 aa  90.1  1e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.74359 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4354  hypothetical protein  40.56 
 
 		 134 aa  90.1  2e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2391  hypothetical protein  38.03 
 
 		 147 aa  88.6  4e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.69026  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0175  hypothetical protein  38.13 
 
 		 135 aa  88.2  5e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3114  hypothetical protein  35.92 
 
 		 142 aa  87  1e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3048  hypothetical protein  34.51 
 
 		 143 aa  86.7  2e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.904899  normal  0.0139913 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1853  Protein of unknown function DUF2147  40.5 
 
 		 149 aa  85.9  3e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6201  Protein of unknown function DUF2147  33.56 
 
 		 151 aa  73.2  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6391  putative signal peptide protein  33.33 
 
 		 145 aa  70.9  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1379  hypothetical protein  30.82 
 
 		 162 aa  69.7  0.00000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.951506  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3095  hypothetical protein  28.57 
 
 		 143 aa  67  0.0000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.304289  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4374  hypothetical protein  30.61 
 
 		 139 aa  66.6  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3794  hypothetical protein  34.68 
 
 		 134 aa  65.9  0.0000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.134727 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4359  hypothetical protein  35.54 
 
 		 133 aa  63.2  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3722  Protein of unknown function DUF2147  28.68 
 
 		 143 aa  62  0.000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.861772  normal  0.147522 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3728  hypothetical protein  33.33 
 
 		 137 aa  60.8  0.000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.607549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1499  hypothetical protein  28.87 
 
 		 272 aa  60.5  0.00000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0914941 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1740  hypothetical protein  32.14 
 
 		 138 aa  60.5  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29440  hypothetical protein  37.14 
 
 		 149 aa  59.7  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.809204  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3442  hypothetical protein  30.43 
 
 		 148 aa  59.7  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000636062  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1884  hypothetical protein  32.77 
 
 		 119 aa  57.4  0.0000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4129  hypothetical protein  30.33 
 
 		 300 aa  56.6  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.409896 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4104  hypothetical protein  29.6 
 
 		 141 aa  55.8  0.0000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.713286  normal  0.899389 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2829  hypothetical protein  31.93 
 
 		 280 aa  55.5  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.023481  normal  0.780645 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1598  hypothetical protein  31.85 
 
 		 144 aa  55.5  0.0000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.267519  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2639  hypothetical protein  29.41 
 
 		 283 aa  54.7  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000954423 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5701  hypothetical protein  31.01 
 
 		 111 aa  53.9  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.479655 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0555  hypothetical protein  31.13 
 
 		 136 aa  52.4  0.000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0594263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4794  hypothetical protein  27.42 
 
 		 150 aa  51.2  0.000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0246667  normal  0.215514 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1033  hypothetical protein  26.47 
 
 		 148 aa  51.2  0.000008  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1716  putative signal peptide protein  31.17 
 
 		 161 aa  50.8  0.000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6444  Protein of unknown function DUF2147  27.27 
 
 		 140 aa  50.8  0.000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2631  putative signal peptide protein  34.68 
 
 		 151 aa  50.4  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.66393  normal  0.77547 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4322  putative signal peptide protein  25.68 
 
 		 144 aa  50.8  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.338595  normal  0.0273369 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3041  conserved hypothetical signal peptide protein  34.68 
 
 		 151 aa  50.4  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.434971  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0575  Protein of unknown function DUF2147  31.16 
 
 		 168 aa  49.7  0.00002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6197  hypothetical protein  28.81 
 
 		 262 aa  48.1  0.00006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.701843  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1747  hypothetical protein  29.79 
 
 		 128 aa  47.4  0.0001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.838706  normal  0.0182475 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0322  hypothetical protein  34.97 
 
 		 155 aa  47.4  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.200609  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4317  hypothetical protein  28.24 
 
 		 146 aa  45.4  0.0004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3075  putative signal peptide protein  33.33 
 
 		 153 aa  45.4  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.973881  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2874  putative signal peptide protein  33.33 
 
 		 157 aa  45.4  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.000419101  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0965  hypothetical protein  41.82 
 
 		 112 aa  43.9  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.996069  normal  0.580537 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1419  hypothetical protein  44.44 
 
 		 112 aa  43.1  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.874564  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1118  hypothetical protein  38.18 
 
 		 112 aa  42.4  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0758369 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0944  hypothetical protein  31.91 
 
 		 148 aa  42.7  0.003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.502231  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2798  putative signal peptide protein  33.33 
 
 		 152 aa  42.4  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00624822  normal  0.61981 
 
 
-
 
NC_003296  RS03893  putative signal peptide protein  22.22 
 
 		 156 aa  41.2  0.008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.536357 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>