More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_1966 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_5340  Extracellular ligand-binding receptor  92.42 
 
 		 396 aa  731    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.200092  normal  0.984381 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3303  extracellular ligand-binding receptor  83.2 
 
 		 393 aa  636    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4853  extracellular ligand-binding receptor  93.43 
 
 		 396 aa  734    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1966  Extracellular ligand-binding receptor  100 
 
 		 396 aa  787    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0542442 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2081  twin-arginine translocation pathway signal  69.48 
 
 		 394 aa  538  9.999999999999999e-153  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.353288 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3837  extracellular ligand-binding receptor  68.27 
 
 		 395 aa  530  1e-149  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2165  extracellular ligand-binding receptor  64.77 
 
 		 390 aa  503  1e-141  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3767  Extracellular ligand-binding receptor  36.18 
 
 		 397 aa  216  4e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.191669 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3366  extracellular ligand-binding receptor  36.18 
 
 		 397 aa  216  5e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.453868  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1164  Extracellular ligand-binding receptor  36.2 
 
 		 404 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.179963  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03165  Extracellular ligand-binding receptor  34.44 
 
 		 364 aa  210  4e-53  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0291  extracellular ligand-binding receptor  35.62 
 
 		 401 aa  207  3e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.512826 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4060  extracellular ligand-binding receptor  35.91 
 
 		 400 aa  206  4e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1798  extracellular ligand-binding receptor  35.14 
 
 		 402 aa  206  7e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.637603  normal  0.0827017 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4053  extracellular ligand-binding receptor  35.87 
 
 		 406 aa  203  4e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0915  Extracellular ligand-binding receptor  33.85 
 
 		 405 aa  202  7e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3706  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  34.25 
 
 		 405 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.209947  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3521  extracellular ligand-binding receptor  33.33 
 
 		 400 aa  199  5e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1838  extracellular ligand-binding receptor  34.03 
 
 		 399 aa  199  7.999999999999999e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.0000495341  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0612  extracellular ligand-binding receptor  34.19 
 
 		 412 aa  197  3e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0299  extracellular ligand-binding receptor  34.93 
 
 		 403 aa  195  1e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.102439  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3194  Extracellular ligand-binding receptor  36.16 
 
 		 415 aa  192  9e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.100454  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2647  extracellular ligand-binding receptor  31.46 
 
 		 397 aa  189  7e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.154433  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1549  extracellular ligand-binding receptor  32.35 
 
 		 392 aa  182  1e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  decreased coverage  0.000137786  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0355  extracellular ligand-binding receptor  32.51 
 
 		 394 aa  179  1e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3230  extracellular ligand-binding receptor  31.97 
 
 		 400 aa  161  2e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.293864  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0219  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  31.95 
 
 		 376 aa  159  7e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00187981  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3577  extracellular ligand-binding receptor  31.85 
 
 		 412 aa  159  7e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2019  extracellular ligand-binding receptor  31.52 
 
 		 374 aa  158  2e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.288201 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2712  extracellular ligand-binding receptor  31.69 
 
 		 405 aa  156  7e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.620726  hitchhiker  0.00485368 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1681  extracellular ligand-binding receptor  31.27 
 
 		 385 aa  148  2.0000000000000003e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.681493  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0089  Extracellular ligand-binding receptor  29.35 
 
 		 396 aa  142  9.999999999999999e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0070  extracellular ligand-binding receptor  29.35 
 
 		 396 aa  140  3e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0893  extracellular ligand-binding receptor  30.11 
 
 		 396 aa  139  1e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2020  extracellular ligand-binding receptor  30.31 
 
 		 384 aa  138  2e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.168799 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1392  Extracellular ligand-binding receptor  30.82 
 
 		 382 aa  136  6.0000000000000005e-31  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.54413  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3823  Extracellular ligand-binding receptor  28.83 
 
 		 394 aa  130  3e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00025514  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3057  Extracellular ligand-binding receptor  30.03 
 
 		 398 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2271  extracellular ligand-binding receptor  30.95 
 
 		 378 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.731283  normal  0.0249434 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3260  hypothetical protein  27.48 
 
 		 424 aa  127  3e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.128123  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0995  Extracellular ligand-binding receptor  28.61 
 
 		 379 aa  124  2e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.725983  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0331  Extracellular ligand-binding receptor  32.01 
 
 		 377 aa  124  2e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.179963  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0067  Extracellular ligand-binding receptor  31.52 
 
 		 376 aa  124  2e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.188079 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1860  Extracellular ligand-binding receptor  31.1 
 
 		 382 aa  123  5e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.153544  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5317  extracellular ligand-binding receptor  27.98 
 
 		 397 aa  123  7e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.862776  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3822  Extracellular ligand-binding receptor  26.03 
 
 		 394 aa  122  8e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000102798  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2131  extracellular ligand-binding receptor  29.18 
 
 		 379 aa  122  8e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0617424  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0668  extracellular ligand-binding receptor  27.72 
 
 		 392 aa  122  8e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.431771  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3105  Extracellular ligand-binding receptor  24.17 
 
 		 389 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2189  Extracellular ligand-binding receptor  29.12 
 
 		 379 aa  120  3e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2323  extracellular ligand-binding receptor  25.75 
 
 		 383 aa  120  3.9999999999999996e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2130  extracellular ligand-binding receptor  27.37 
 
 		 380 aa  120  4.9999999999999996e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.482674  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0095  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  27.86 
 
 		 399 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.237273 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0192  hypothetical protein  29.7 
 
 		 411 aa  120  6e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.681892  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3937  extracellular ligand-binding receptor  27.42 
 
 		 397 aa  119  7e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.108497  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3583  extracellular ligand-binding receptor  27.42 
 
 		 397 aa  119  7e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.160701  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2502  extracellular ligand-binding receptor  30.06 
 
 		 399 aa  119  7.999999999999999e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.101059  normal  0.128771 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2535  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  27.7 
 
 		 397 aa  119  9e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5102  extracellular ligand-binding receptor  28.53 
 
 		 397 aa  119  9e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.294794 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0376  extracellular ligand-binding receptor  30.38 
 
 		 381 aa  118  1.9999999999999998e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000374663  hitchhiker  0.000123514 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0096  extracellular ligand-binding receptor  27.95 
 
 		 416 aa  118  1.9999999999999998e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.809601 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1734  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  27.69 
 
 		 380 aa  117  3e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.534498  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1735  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  29.23 
 
 		 378 aa  117  3e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.583415  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0350  extracellular ligand-binding receptor  29.38 
 
 		 376 aa  117  3.9999999999999997e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000281139  normal  0.291499 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3501  extracellular ligand-binding receptor  28.46 
 
 		 448 aa  116  6e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1682  extracellular ligand-binding receptor  28.01 
 
 		 410 aa  116  6.9999999999999995e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.0000183641  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1520  extracellular ligand-binding receptor  27.59 
 
 		 381 aa  116  7.999999999999999e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.657552  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1866  extracellular ligand-binding receptor  28.21 
 
 		 373 aa  116  7.999999999999999e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4069  extracellular ligand-binding receptor  25.94 
 
 		 393 aa  116  7.999999999999999e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.236469 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1050  extracellular ligand-binding receptor  26.95 
 
 		 381 aa  115  2.0000000000000002e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.464924 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0150  extracellular ligand-binding receptor  26.52 
 
 		 417 aa  114  3e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2038  Extracellular ligand-binding receptor  28.35 
 
 		 379 aa  114  4.0000000000000004e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000518039 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0090  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  27.87 
 
 		 395 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0960253  normal  0.350813 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1861  Extracellular ligand-binding receptor  28.02 
 
 		 379 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.571716  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1823  extracellular ligand-binding receptor  27.6 
 
 		 380 aa  112  2.0000000000000002e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4261  ABC branched chain amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  25.5 
 
 		 404 aa  111  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0480  Extracellular ligand-binding receptor  27.44 
 
 		 407 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1934  Extracellular ligand-binding receptor  27.05 
 
 		 397 aa  110  3e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000937878  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4395  Extracellular ligand-binding receptor  25.65 
 
 		 404 aa  110  4.0000000000000004e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.817669  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2037  Extracellular ligand-binding receptor  29.49 
 
 		 379 aa  110  4.0000000000000004e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000596452 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3401  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  26.22 
 
 		 396 aa  110  6e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.232513  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0805  Extracellular ligand-binding receptor  30.38 
 
 		 384 aa  109  8.000000000000001e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.822655  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0680  extracellular ligand-binding receptor  26.85 
 
 		 399 aa  108  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0932  Extracellular ligand-binding receptor  28.66 
 
 		 376 aa  108  2e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000568006  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0522  Extracellular ligand-binding receptor  26.53 
 
 		 387 aa  108  2e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1720  extracellular ligand-binding receptor  27.33 
 
 		 396 aa  108  2e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.565956  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2190  Extracellular ligand-binding receptor  29.37 
 
 		 379 aa  108  2e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4416  Extracellular ligand-binding receptor  25.36 
 
 		 404 aa  108  2e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2022  Extracellular ligand-binding receptor  25.08 
 
 		 373 aa  107  3e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.882154  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1671  extracellular ligand-binding receptor  26.68 
 
 		 379 aa  107  4e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2283  Extracellular ligand-binding receptor  26.43 
 
 		 395 aa  107  5e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000119381 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0645  extracellular ligand-binding receptor  30.08 
 
 		 386 aa  106  6e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5833  extracellular ligand-binding receptor  26.03 
 
 		 382 aa  104  2e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00373072 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2179  ABC branched-chain amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  27.65 
 
 		 410 aa  104  3e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.138394  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2306  Extracellular ligand-binding receptor  23.86 
 
 		 419 aa  104  3e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.110917  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2750  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  26.98 
 
 		 425 aa  103  4e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0109739  normal  0.254921 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0833  extracellular ligand-binding receptor  26.15 
 
 		 383 aa  103  4e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000252201  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1970  extracellular ligand-binding receptor  30.74 
 
 		 372 aa  103  4e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0123  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2113  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  25.48 
 
 		 399 aa  103  5e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0378  extracellular ligand-binding receptor  26.46 
 
 		 396 aa  103  6e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.432032 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>