125 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A3314 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A3314  hypothetical protein  100 
 
 		 201 aa  392  1e-108  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0091  DTW domain-containing protein  51.31 
 
 		 215 aa  148  6e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00346625 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0945  DTW domain-containing protein  46.39 
 
 		 215 aa  141  7e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0983717  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1830  DTW domain-containing protein  48 
 
 		 212 aa  140  9.999999999999999e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1459  DTW  46.35 
 
 		 197 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1758  DTW domain containing protein  43.48 
 
 		 227 aa  123  1e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.370644  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1957  DTW domain-containing protein  43.48 
 
 		 227 aa  122  3e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1728  hypothetical protein  44.09 
 
 		 199 aa  117  9e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0343203  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32830  DTW domain protein  45.5 
 
 		 213 aa  116  3e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0299  DTW domain-containing protein  36.76 
 
 		 203 aa  114  6.9999999999999995e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3447  hypothetical protein  40.31 
 
 		 209 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1801  DTW domain-containing protein  43.75 
 
 		 197 aa  112  3e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.26433  normal  0.410877 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3664  DTW  42.47 
 
 		 199 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0140034  normal  0.15667 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3914  hypothetical protein  41.67 
 
 		 203 aa  109  3e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.249648  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46020  hypothetical protein  42.93 
 
 		 203 aa  108  7.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.637513  normal  0.748876 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4026  DTW domain-containing protein  42.47 
 
 		 199 aa  107  1e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.169478  normal  0.0883291 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3812  DTW domain-containing protein  42.25 
 
 		 199 aa  107  1e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00599656 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0198  DTW domain containing protein  36.96 
 
 		 207 aa  106  2e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4137  DTW domain-containing protein  36.76 
 
 		 207 aa  107  2e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4520  DTW domain containing protein  40.86 
 
 		 199 aa  105  6e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.108637  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1391  DTW domain-containing protein  40.86 
 
 		 199 aa  104  7e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3947  DTW domain-containing protein  36.56 
 
 		 200 aa  104  9e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0863  DTW  34.69 
 
 		 198 aa  104  1e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3822  DTW domain-containing protein  39.77 
 
 		 188 aa  103  2e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0198  DTW domain-containing protein  36.41 
 
 		 207 aa  103  2e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0676  hypothetical protein  37.43 
 
 		 183 aa  102  4e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0390701  unclonable  0.0000000107509 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4554  hypothetical protein  37.1 
 
 		 197 aa  101  7e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3586  DTW domain-containing protein  37.23 
 
 		 200 aa  100  2e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2149  DTW domain-containing protein  33.33 
 
 		 243 aa  98.2  7e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3749  DTW domain-containing protein  37.43 
 
 		 188 aa  97.4  1e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0317  DTW domain-containing protein  37.57 
 
 		 211 aa  96.7  2e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0256  DTW domain-containing protein  33.15 
 
 		 197 aa  96.3  2e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3954  DTW domain-containing protein  36.36 
 
 		 223 aa  95.9  4e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2058  DTW  38.71 
 
 		 203 aa  95.1  6e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.382489  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0326  DTW domain-containing protein  33.15 
 
 		 201 aa  94.4  1e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0889  DTW domain-containing protein  29.83 
 
 		 208 aa  92  5e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.458899  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4270  DTW domain-containing protein  37.74 
 
 		 181 aa  91.3  9e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0664777 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004037  hypothetical protein  31.28 
 
 		 204 aa  89  4e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.152409  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1899  DTW domain containing protein  37.3 
 
 		 203 aa  88.2  8e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.369938  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1820  DTW domain containing protein  36.76 
 
 		 202 aa  87.4  1e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1565  hypothetical protein  33.15 
 
 		 200 aa  87.4  1e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0932097  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0255  DTW domain-containing protein  36.02 
 
 		 174 aa  84.7  9e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.614012 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1739  DTW domain-containing protein  38.04 
 
 		 204 aa  82.8  0.000000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.438659 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4292  DTW domain-containing protein  28.8 
 
 		 196 aa  81.6  0.000000000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.616546  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3493  hypothetical protein  34.39 
 
 		 205 aa  80.9  0.00000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04079  DTW domain containing protein  28.82 
 
 		 194 aa  80.5  0.00000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3739  DTW domain-containing protein  34.44 
 
 		 241 aa  79  0.00000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0810655  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2845  DTW domain containing protein  28.64 
 
 		 243 aa  69.7  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.517511  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01424  hypothetical protein  33.58 
 
 		 171 aa  68.6  0.00000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2829  DTW domain-containing protein  29.05 
 
 		 200 aa  67  0.0000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.106705 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2899  DTW  26.77 
 
 		 243 aa  64.7  0.0000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.124472  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2561  DTW  29.15 
 
 		 243 aa  63.9  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0180989  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2954  hypothetical protein  27.98 
 
 		 195 aa  63.5  0.000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2062  hypothetical protein  27.36 
 
 		 238 aa  63.9  0.000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2572  hypothetical protein  27.22 
 
 		 243 aa  60.8  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.328993  normal  0.0276515 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3068  DTW domain-containing protein  33.33 
 
 		 232 aa  59.3  0.00000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00118921 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02075  hypothetical cytosolic protein  28.16 
 
 		 230 aa  57.8  0.0000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2921  hypothetical protein  28.92 
 
 		 245 aa  57  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1520  hypothetical protein  25.91 
 
 		 237 aa  56.2  0.0000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0474866  normal  0.0473662 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2890  DTW  28.5 
 
 		 247 aa  55.8  0.0000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1748  hypothetical protein  24.74 
 
 		 252 aa  55.8  0.0000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00914575 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2736  DTW domain-containing protein  27.51 
 
 		 232 aa  54.7  0.0000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00625703  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1085  DTW domain containing protein  27.51 
 
 		 232 aa  54.3  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.202356  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3820  DTW domain protein  27.51 
 
 		 232 aa  54.7  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00329477  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2028  DTW domain-containing protein  26.02 
 
 		 256 aa  53.9  0.000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2388  hypothetical protein  29.52 
 
 		 198 aa  54.3  0.000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2740  DTW domain-containing protein  27.51 
 
 		 232 aa  54.3  0.000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.209586  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2870  DTW domain-containing protein  27.51 
 
 		 232 aa  54.7  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.308845  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3747  DTW domain-containing protein  27.56 
 
 		 234 aa  54.7  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0410798  normal  0.151422 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1094  DTW domain-containing protein  27.51 
 
 		 232 aa  54.3  0.000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.158379  normal  0.0446057 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2953  DTW domain protein  27.51 
 
 		 232 aa  54.7  0.000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0352183  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2862  DTW domain protein  27.07 
 
 		 226 aa  54.3  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.277232  normal  0.735331 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2866  DTW domain-containing protein  27.51 
 
 		 226 aa  53.9  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.186752  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02477  hypothetical protein  27.51 
 
 		 232 aa  53.9  0.000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02441  hypothetical protein  27.51 
 
 		 232 aa  53.9  0.000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2844  DTW domain protein  27.51 
 
 		 226 aa  53.9  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1461  DTW domain containing protein  28.66 
 
 		 246 aa  53.1  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2978  hypothetical protein  27.51 
 
 		 226 aa  53.1  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0338202  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3935  hypothetical protein  28.28 
 
 		 246 aa  52.8  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002117  hypothetical protein  25.81 
 
 		 201 aa  53.1  0.000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1429  hypothetical protein  37.22 
 
 		 201 aa  52.8  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.57306  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2401  DTW domain-containing protein  32.9 
 
 		 205 aa  52.8  0.000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.663769  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2080  DTW domain containing protein  25.64 
 
 		 254 aa  52.4  0.000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0268812  hitchhiker  0.0000673484 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2087  DTW domain-containing protein  25.64 
 
 		 254 aa  52.4  0.000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2265  DTW domain-containing protein  25.64 
 
 		 254 aa  52.4  0.000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2382  DTW domain-containing protein  25.64 
 
 		 254 aa  52  0.000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.375493  normal  0.0103216 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_93924  predicted protein  28.57 
 
 		 252 aa  51.6  0.000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0426424 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0886  DTW domain containing protein  27.33 
 
 		 237 aa  50.8  0.00001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0581756  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2760  DTW domain protein  26.98 
 
 		 226 aa  51.2  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00353783  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0853  DTW domain containing protein  28.4 
 
 		 238 aa  50.4  0.00002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.473335  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2330  DTW domain-containing protein  23.59 
 
 		 249 aa  48.5  0.00007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000604871  normal  0.102486 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1139  hypothetical protein  25.54 
 
 		 245 aa  48.1  0.00008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.248975  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3205  DTW domain-containing protein  25.68 
 
 		 249 aa  48.1  0.00009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3464  DTW domain-containing protein  25.68 
 
 		 249 aa  48.1  0.00009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0992214  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3422  hypothetical protein  28.74 
 
 		 202 aa  47.4  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2099  DTW domain-containing protein  32.1 
 
 		 189 aa  47.8  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3342  DTW domain-containing protein  25.68 
 
 		 228 aa  47.8  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.342433  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1181  DTW  25.14 
 
 		 247 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.197243 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3397  DTW domain-containing protein  25.6 
 
 		 239 aa  47  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1289  DTW domain-containing protein  29.53 
 
 		 244 aa  47  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>