More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A1772 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A1772  putative amino acid transport system permease lipoprotein transmembrane  100 
 
 		 430 aa  831    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0280835 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2576  inner-membrane translocator  68.47 
 
 		 430 aa  585  1e-166  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.262012  normal  0.349812 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2389  inner-membrane translocator  68.54 
 
 		 429 aa  565  1e-160  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0550478  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1681  inner-membrane translocator  66.9 
 
 		 445 aa  533  1e-150  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2023  inner-membrane translocator  66.43 
 
 		 445 aa  531  1e-149  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.102668  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2932  inner-membrane translocator  64.86 
 
 		 440 aa  521  1e-146  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.303159  normal  0.436375 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1851  inner-membrane translocator  64.86 
 
 		 432 aa  483  1e-135  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1795  inner-membrane translocator  64.3 
 
 		 422 aa  472  1e-132  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2928  inner-membrane translocator  60.19 
 
 		 442 aa  467  9.999999999999999e-131  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0634587  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3310  inner-membrane translocator  60.94 
 
 		 454 aa  462  1e-129  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0932406  normal  0.021749 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1839  inner-membrane translocator  66.34 
 
 		 434 aa  458  1e-127  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.27938 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1401  inner-membrane translocator  51.68 
 
 		 439 aa  397  1e-109  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.296284  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1860  inner-membrane translocator  50 
 
 		 437 aa  387  1e-106  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.22716 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1493  inner-membrane translocator  51.49 
 
 		 444 aa  382  1e-105  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.530836  normal  0.532886 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1452  inner-membrane translocator  52.3 
 
 		 444 aa  379  1e-104  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0642822  hitchhiker  0.000453493 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1752  amino acid ABC transporter permease  50.83 
 
 		 440 aa  370  1e-101  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.550202  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1572  inner-membrane translocator  48.3 
 
 		 433 aa  324  2e-87  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.720427 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0224  inner-membrane translocator  50.68 
 
 		 441 aa  322  8e-87  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4566  inner-membrane translocator  46.34 
 
 		 433 aa  320  3.9999999999999996e-86  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.163512  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4169  inner-membrane translocator  45.39 
 
 		 433 aa  318  2e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.595582  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1578  inner-membrane translocator  47.47 
 
 		 433 aa  317  3e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.611653  normal  0.703431 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3167  inner-membrane translocator  50.14 
 
 		 442 aa  309  5e-83  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.581238  normal  0.308914 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2817  inner-membrane translocator  44.81 
 
 		 430 aa  279  5e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.678214  normal  0.0943993 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1319  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  49.08 
 
 		 428 aa  266  4e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2652  branched-chain amino acid ABC transporter, permease/ATP binding protein, putative  49.34 
 
 		 741 aa  228  2e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1606  inner-membrane translocator  46.46 
 
 		 419 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1334  inner-membrane translocator  39.62 
 
 		 408 aa  212  1e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0220278  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1295  inner-membrane translocator  45.31 
 
 		 408 aa  211  2e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1439  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  47.63 
 
 		 755 aa  210  3e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0908  branched-chain amino acid ABC transporter, permease/ATP binding protein, putative  47.63 
 
 		 761 aa  210  4e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0441  putative branched-chain amino acid ABC transporter, permease/ATP binding protein  47.63 
 
 		 749 aa  210  4e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.721247  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1650  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  47.63 
 
 		 752 aa  210  5e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1826  ABC-transporter  47.63 
 
 		 758 aa  209  5e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.256194  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1672  ABC-transporter  47.63 
 
 		 746 aa  210  5e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.504815  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0721  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  47.32 
 
 		 746 aa  206  8e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1393  inner-membrane translocator  43.37 
 
 		 409 aa  199  9e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.194259 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1900  inner-membrane translocator  46.03 
 
 		 405 aa  191  2e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.157524 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4559  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  44.05 
 
 		 409 aa  191  2e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.267582  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0933  inner-membrane translocator  44.01 
 
 		 409 aa  188  1e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.532515  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1415  inner-membrane translocator  44.01 
 
 		 409 aa  188  1e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.446365  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0023  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  35.94 
 
 		 406 aa  163  4.0000000000000004e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1575  inner-membrane translocator  39.37 
 
 		 408 aa  160  3e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.832106  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0026  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  35.68 
 
 		 406 aa  160  4e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2025  inner-membrane translocator  37.45 
 
 		 339 aa  142  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3556  inner-membrane translocator  35.38 
 
 		 340 aa  138  2e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0669576  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2899  ABC transporter related  32.34 
 
 		 852 aa  138  2e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1448  inner-membrane translocator  36.1 
 
 		 337 aa  137  5e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00412694  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1286  inner-membrane translocator  36.1 
 
 		 337 aa  137  5e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.20936  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4999  inner-membrane translocator  35.21 
 
 		 333 aa  135  9.999999999999999e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0649125  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6572  inner-membrane translocator  33.33 
 
 		 351 aa  133  5e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0236609  normal  0.0263346 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0547  inner-membrane translocator  37.93 
 
 		 337 aa  133  6.999999999999999e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3735  putative branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  32.29 
 
 		 333 aa  132  7.999999999999999e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4477  branched-chain amino acid inner-membrane translocator  34.67 
 
 		 332 aa  132  1.0000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0364038  normal  0.0227687 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5859  inner-membrane translocator  34.49 
 
 		 342 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0455278 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6328  inner-membrane translocator  33.11 
 
 		 320 aa  128  2.0000000000000002e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.540674  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0052  inner-membrane translocator  32.78 
 
 		 346 aa  127  3e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.460999  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2564  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  33.45 
 
 		 355 aa  125  1e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0734  putative branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  31.38 
 
 		 315 aa  125  1e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1990  inner-membrane translocator  32.87 
 
 		 315 aa  124  2e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.97086  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4183  inner-membrane translocator  31.16 
 
 		 358 aa  125  2e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.708738  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3576  ABC transporter related  31.85 
 
 		 838 aa  123  8e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0617  inner-membrane translocator  31.06 
 
 		 339 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0657  inner-membrane translocator  31.06 
 
 		 339 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.558006  normal  0.165436 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0010  inner-membrane translocator  32.98 
 
 		 309 aa  121  1.9999999999999998e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00370487 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6025  inner-membrane translocator  33.66 
 
 		 333 aa  121  1.9999999999999998e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4701  ABC transporter related  31.21 
 
 		 840 aa  121  1.9999999999999998e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.676085  normal  0.601296 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2761  inner-membrane translocator  30.88 
 
 		 411 aa  121  3e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1946  inner-membrane translocator  30.88 
 
 		 411 aa  121  3e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.939983  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6433  inner-membrane translocator  31.68 
 
 		 344 aa  120  3.9999999999999996e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0224691  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3307  inner-membrane translocator  31.69 
 
 		 314 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1675  inner-membrane translocator  34.77 
 
 		 314 aa  119  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.675221  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1583  inner-membrane translocator  33.33 
 
 		 319 aa  118  1.9999999999999998e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2235  inner-membrane translocator  33.89 
 
 		 327 aa  118  1.9999999999999998e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.344649  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1079  inner-membrane translocator  33.21 
 
 		 333 aa  117  3e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.710188  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0059  inner-membrane translocator  33.33 
 
 		 328 aa  117  5e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0244383  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1513  inner-membrane translocator  30.67 
 
 		 399 aa  117  6e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.395595  normal  0.69839 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3164  inner-membrane translocator  29.14 
 
 		 324 aa  116  7.999999999999999e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.317947  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2558  ABC transporter permease  33.33 
 
 		 330 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.30876 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3531  inner-membrane translocator  33.94 
 
 		 340 aa  115  1.0000000000000001e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.696528 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6269  inner-membrane translocator  35.86 
 
 		 339 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4079  inner-membrane translocator  32.25 
 
 		 323 aa  115  2.0000000000000002e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2332  inner-membrane translocator  29.87 
 
 		 324 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.404854  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2520  inner-membrane translocator  29.94 
 
 		 323 aa  113  5e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6489  inner-membrane translocator  33.75 
 
 		 320 aa  113  6e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.635062  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4452  inner-membrane translocator  35.5 
 
 		 331 aa  113  6e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.37302  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8053  inner-membrane translocator  35.5 
 
 		 331 aa  113  6e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1439  inner-membrane translocator  34.94 
 
 		 330 aa  113  7.000000000000001e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.674436  normal  0.355177 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0936  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  31.9 
 
 		 656 aa  112  9e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0175058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2868  inner-membrane translocator  33.44 
 
 		 330 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4327  inner-membrane translocator  33.57 
 
 		 646 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0490651  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2122  inner-membrane translocator  34.32 
 
 		 304 aa  112  1.0000000000000001e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.589332 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3242  inner-membrane translocator  33.83 
 
 		 329 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.194129  normal  0.515147 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2032  inner-membrane translocator  32.77 
 
 		 318 aa  112  1.0000000000000001e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0957  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  35.44 
 
 		 331 aa  111  2.0000000000000002e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.834531  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1050  inner-membrane translocator  28.16 
 
 		 328 aa  112  2.0000000000000002e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4462  inner-membrane translocator  33.22 
 
 		 633 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.906456  normal  0.226245 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3696  ABC transporter related  33.12 
 
 		 840 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.500885  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3483  inner-membrane translocator  34.32 
 
 		 328 aa  112  2.0000000000000002e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.742895  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3759  hypothetical protein  29.22 
 
 		 322 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.232972  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5097  inner-membrane translocator  31.79 
 
 		 330 aa  111  3e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.282354  normal  0.971195 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>