238 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_0050 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_0050  Radical SAM domain protein  100 
 
 		 365 aa  758    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0040  radical SAM domain-containing protein  80.78 
 
 		 362 aa  608  1e-173  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0048  radical SAM domain-containing protein  67.86 
 
 		 367 aa  519  1e-146  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2970  hypothetical protein  63.31 
 
 		 366 aa  483  1e-135  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0038  radical SAM domain-containing protein  57.34 
 
 		 362 aa  422  1e-117  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0047  radical SAM domain-containing protein  57.62 
 
 		 362 aa  424  1e-117  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0411  Radical SAM domain protein  54.49 
 
 		 364 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2410  hypothetical protein  50.98 
 
 		 361 aa  380  1e-104  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0123  hypothetical protein  50.99 
 
 		 361 aa  378  1e-104  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2623  Radical SAM domain protein  48.2 
 
 		 800 aa  336  3.9999999999999995e-91  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.000614503  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0975  FO synthase  46.44 
 
 		 792 aa  313  3.9999999999999997e-84  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.156535  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0592  radical SAM domain-containing protein  45.06 
 
 		 419 aa  311  1e-83  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_51122  predicted protein  43.9 
 
 		 841 aa  303  3.0000000000000004e-81  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0345053 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0750  FO synthase subunit 2  44.25 
 
 		 362 aa  303  4.0000000000000003e-81  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.054782  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4075  Radical SAM domain protein  45.03 
 
 		 859 aa  300  3e-80  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0893  FO synthase subunit 2  43.71 
 
 		 359 aa  299  5e-80  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1483  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  47.52 
 
 		 872 aa  299  5e-80  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1071  FO synthase subunit 2  42.41 
 
 		 359 aa  298  9e-80  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4423  FO synthase  44.81 
 
 		 820 aa  296  4e-79  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.308289  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0814  FO synthase  44.48 
 
 		 842 aa  296  4e-79  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.333048  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1115  radical SAM domain-containing protein  43.6 
 
 		 418 aa  295  6e-79  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1053  FO synthase subunit 2  42.12 
 
 		 370 aa  292  8e-78  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5865  FO synthase  45.19 
 
 		 944 aa  291  1e-77  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.342546  normal  0.564684 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2167  FO synthase  43.4 
 
 		 859 aa  290  3e-77  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0462649 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0745  FO synthase  44.54 
 
 		 899 aa  289  5.0000000000000004e-77  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4032  FO synthase  41.74 
 
 		 859 aa  289  7e-77  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.249392  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4107  FO synthase  41.74 
 
 		 859 aa  289  7e-77  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4262  FO synthase  41.74 
 
 		 859 aa  288  8e-77  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0918112 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8766  FO synthase  46.37 
 
 		 857 aa  287  2e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.977085  normal  0.875781 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0717  FO synthase  45.4 
 
 		 779 aa  287  2e-76  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00851827 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11198  FO synthase  42.57 
 
 		 856 aa  286  4e-76  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.152769  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4262  Radical SAM domain protein  45.38 
 
 		 826 aa  285  8e-76  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.296294  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4252  Radical SAM domain protein  42.98 
 
 		 435 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0238128  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0769  FO synthase  45.69 
 
 		 884 aa  285  1.0000000000000001e-75  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0435943  normal  0.470763 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1621  FO synthase subunit 2  41.43 
 
 		 359 aa  284  1.0000000000000001e-75  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4533  FO synthase  42.82 
 
 		 859 aa  284  2.0000000000000002e-75  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.434673  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0746  radical SAM domain-containing protein  45.89 
 
 		 881 aa  284  2.0000000000000002e-75  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.331413 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1148  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  40.9 
 
 		 863 aa  283  3.0000000000000004e-75  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.064662  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3619  FO synthase  43.15 
 
 		 841 aa  282  5.000000000000001e-75  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3417  FO synthase subunit 2  43.15 
 
 		 384 aa  281  1e-74  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.1497 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4048  hypothetical protein  40.66 
 
 		 429 aa  281  2e-74  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.129032  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2519  FO synthase  42.61 
 
 		 871 aa  280  4e-74  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.391262  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1376  FO synthase  44.55 
 
 		 867 aa  275  6e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0059  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  44.15 
 
 		 453 aa  275  9e-73  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.17333 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1072  FO synthase subunit 2  42.41 
 
 		 358 aa  275  9e-73  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3416  FO synthase subunit 2  44.06 
 
 		 376 aa  273  3e-72  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.90673  normal  0.237046 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3771  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  41.55 
 
 		 875 aa  271  2e-71  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0863  FO synthase  41.69 
 
 		 852 aa  270  4e-71  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.241376  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0441  radical SAM domain-containing protein  40.44 
 
 		 361 aa  269  5.9999999999999995e-71  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0888  FO synthase  41.44 
 
 		 836 aa  268  8.999999999999999e-71  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0248143 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0900  Radical SAM domain protein  43.53 
 
 		 757 aa  266  2.9999999999999995e-70  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.180074  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1303  FO synthase subunit 2  43.15 
 
 		 356 aa  265  7e-70  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0284  radical SAM domain-containing protein  46.2 
 
 		 358 aa  264  1e-69  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1089  radical SAM domain-containing protein  40.5 
 
 		 368 aa  265  1e-69  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0946  FO synthase  40.61 
 
 		 860 aa  262  6.999999999999999e-69  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1643  Radical SAM domain protein  39.88 
 
 		 367 aa  259  4e-68  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000555203  hitchhiker  0.00000328368 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4284  radical SAM domain-containing protein  39.33 
 
 		 360 aa  259  4e-68  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1304  FO synthase subunit 2  39.71 
 
 		 356 aa  258  1e-67  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4090  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  41.11 
 
 		 737 aa  256  5e-67  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0388859 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1054  FO synthase subunit 2  42.61 
 
 		 358 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1620  FO synthase subunit 2  43.14 
 
 		 358 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3391  hypothetical protein  38.66 
 
 		 360 aa  253  3e-66  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.352496  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1450  Radical SAM domain protein  37.74 
 
 		 368 aa  253  4.0000000000000004e-66  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000839661  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4165  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  41.01 
 
 		 741 aa  253  5.000000000000001e-66  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.358903  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4147  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  41.19 
 
 		 737 aa  251  2e-65  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.280737  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2195  radical SAM domain-containing protein  37.22 
 
 		 367 aa  250  3e-65  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0625  Radical SAM domain protein  39.83 
 
 		 359 aa  249  4e-65  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.834734  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3578  radical SAM domain-containing protein  39.04 
 
 		 359 aa  248  2e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6472  FO synthase  40.35 
 
 		 838 aa  246  3e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0218  Radical SAM domain protein  38.86 
 
 		 358 aa  245  6.999999999999999e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0234  Radical SAM domain protein  38.57 
 
 		 358 aa  244  1.9999999999999999e-63  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1846  hypothetical protein  39.61 
 
 		 373 aa  244  1.9999999999999999e-63  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1157  radical SAM domain-containing protein  37.15 
 
 		 359 aa  242  7e-63  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.423135  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3281  FO synthase subunit 2  39.28 
 
 		 381 aa  240  2e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.370195  normal  0.662491 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0551  radical SAM domain-containing protein  40.92 
 
 		 372 aa  240  2e-62  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0260021  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3089  radical SAM domain-containing protein  38.2 
 
 		 373 aa  239  5e-62  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.185999  hitchhiker  0.000152785 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3080  FO synthase subunit 2  37.4 
 
 		 384 aa  238  1e-61  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3040  FO synthase subunit 2  37.67 
 
 		 384 aa  238  1e-61  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.591688  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0194  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  38.33 
 
 		 382 aa  237  2e-61  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.200924  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1645  Radical SAM domain protein  41.23 
 
 		 358 aa  237  3e-61  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000004914  hitchhiker  0.00000000624327 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0372  hypothetical protein  39.45 
 
 		 388 aa  236  4e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.153227  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0671  Radical SAM domain protein  39.55 
 
 		 355 aa  235  1.0000000000000001e-60  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1619  hypothetical protein  38.73 
 
 		 348 aa  235  1.0000000000000001e-60  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.320855  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2637  Radical SAM domain protein  37.38 
 
 		 459 aa  234  2.0000000000000002e-60  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0319  hypothetical protein  38.1 
 
 		 362 aa  233  3e-60  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000596234  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1844  hypothetical protein  41.51 
 
 		 360 aa  234  3e-60  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0400  Radical SAM domain protein  38.9 
 
 		 388 aa  233  5e-60  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0645  Radical SAM domain protein  35.89 
 
 		 459 aa  233  6e-60  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1434  FO synthase subunit 2  35.37 
 
 		 376 aa  232  6e-60  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1271  radical SAM domain-containing protein  36.49 
 
 		 367 aa  231  2e-59  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1418  FO synthase subunit 2  37.63 
 
 		 451 aa  231  2e-59  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1528  hypothetical protein  38.15 
 
 		 363 aa  231  2e-59  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4206  radical SAM domain-containing protein  38.25 
 
 		 387 aa  230  3e-59  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1499  Radical SAM domain protein  38.84 
 
 		 373 aa  229  5e-59  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0850  Radical SAM domain protein  36.52 
 
 		 350 aa  229  6e-59  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000345291  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0401  Radical SAM domain protein  38.63 
 
 		 388 aa  229  7e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.575372  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0554  radical SAM domain-containing protein  34.82 
 
 		 372 aa  229  7e-59  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.420102 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1280  Radical SAM domain protein  37.86 
 
 		 381 aa  228  9e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0320  hypothetical protein  41.1 
 
 		 355 aa  228  1e-58  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000157308  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2097  hypothetical protein  35.77 
 
 		 376 aa  228  1e-58  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0332172  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>