More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_4842 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_4842  transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 		 230 aa  461  1e-129  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.283505  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4050  GntR family transcriptional regulator  82.53 
 
 		 230 aa  380  1e-105  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2793  GntR family transcriptional regulator  63.76 
 
 		 230 aa  295  5e-79  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1233  transcriptional regulator, GntR family  60.99 
 
 		 230 aa  275  6e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1158  transcriptional regulator, GntR family  59.64 
 
 		 227 aa  273  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.511472 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1839  GntR family transcriptional regulator  59.82 
 
 		 230 aa  271  4.0000000000000004e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.128914  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1218  GntR domain-containing protein  59.64 
 
 		 250 aa  271  4.0000000000000004e-72  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.415589 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1379  transcriptional regulator, GntR family  59.64 
 
 		 227 aa  271  5.000000000000001e-72  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.163127  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0485  GntR family transcriptional regulator  54.75 
 
 		 242 aa  240  1e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4691  GntR family transcriptional regulator  53.54 
 
 		 233 aa  234  8e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.517604  normal  0.0635309 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1244  GntR family transcriptional regulator  51.34 
 
 		 229 aa  230  1e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.376161 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4670  GntR family transcriptional regulator  51.56 
 
 		 239 aa  228  6e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6033  transcriptional regulator, GntR family  52.44 
 
 		 239 aa  228  7e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3622  GntR family transcriptional regulator  52.47 
 
 		 239 aa  228  7e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.882993  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2268  GntR family transcriptional regulator  52.44 
 
 		 239 aa  228  8e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3619  GntR family transcriptional regulator  50.67 
 
 		 239 aa  224  8e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00335274  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4357  GntR family transcriptional regulator  50.22 
 
 		 240 aa  223  2e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.899298  normal  0.198787 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3115  GntR family transcriptional regulator  50 
 
 		 243 aa  211  7.999999999999999e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.124269  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1855  GntR family transcriptional regulator  49.56 
 
 		 231 aa  206  2e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.98691 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2156  transcriptional regulator, GntR family  47.11 
 
 		 243 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.695514  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2028  GntR family transcriptional regulator  45.54 
 
 		 260 aa  199  3.9999999999999996e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.283342 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3426  GntR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 243 aa  192  3e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.100034 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5951  GntR family transcriptional regulator  47.66 
 
 		 233 aa  188  8e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0388156 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1523  GntR family transcriptional regulator  40.53 
 
 		 236 aa  159  5e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0644  GntR family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 244 aa  105  6e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.412108  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2755  GntR family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 222 aa  103  2e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0339341 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3487  transcriptional regulator, GntR family  34.45 
 
 		 223 aa  102  6e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1510  GntR family transcriptional regulator  39.22 
 
 		 222 aa  102  7e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.535687  normal  0.154359 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0992  transcriptional regulator, GntR family  35.92 
 
 		 223 aa  98.2  9e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1076  GntR family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 223 aa  98.2  9e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2971  GntR family transcriptional regulator  32.7 
 
 		 232 aa  97.1  2e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2535  transcriptional regulator, GntR family  35.23 
 
 		 222 aa  97.1  2e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2090  GntR family transcriptional regulator  36.93 
 
 		 222 aa  97.4  2e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.047228  normal  0.700914 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2798  GntR family transcriptional regulator  35.68 
 
 		 233 aa  97.1  2e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.297778 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0088  transcriptional regulator, GntR family  35.18 
 
 		 239 aa  97.1  2e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1164  GntR family transcriptional regulator  32.85 
 
 		 218 aa  96.7  3e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.720866  normal  0.242245 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0059  GntR family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 229 aa  95.9  4e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0874  transcriptional regulator, GntR family  33.5 
 
 		 226 aa  95.9  5e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.917982  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5133  GntR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 224 aa  95.1  8e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.319425 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2464  GntR family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 219 aa  95.1  8e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0600  GntR family transcriptional regulator  31.55 
 
 		 225 aa  94.7  1e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1595  GntR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 231 aa  94.4  1e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000118605  normal  0.686931 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2175  transcriptional regulator, GntR family  34.48 
 
 		 223 aa  94  2e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000546644  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3752  GntR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 211 aa  92.8  4e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.10635  normal  0.669748 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2970  GntR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 229 aa  92.8  4e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1013  GntR family transcriptional regulator  38.86 
 
 		 232 aa  92.8  4e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.475037  normal  0.972264 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3196  transcriptional regulator, GntR family  34.76 
 
 		 237 aa  92.4  5e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.594143 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2404  GntR family transcriptional regulator  33.51 
 
 		 230 aa  92.4  5e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3335  GntR family transcriptional regulator  33.18 
 
 		 221 aa  91.7  8e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.222517  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2737  transcriptional regulator, GntR family  33.02 
 
 		 231 aa  91.7  9e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.224257 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2384  GntR family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 211 aa  91.7  1e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3148  transcriptional regulator, GntR family  34.78 
 
 		 222 aa  90.9  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0723  GntR family transcriptional regulator  36.2 
 
 		 243 aa  90.9  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.214964  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2208  GntR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 223 aa  89.7  3e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.223397  normal  0.583334 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0933  transcriptional regulator, GntR family  34.69 
 
 		 212 aa  89.7  3e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2509  GntR family transcriptional regulator  34.5 
 
 		 211 aa  90.1  3e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0825913 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1831  transcriptional regulator, GntR family  31.98 
 
 		 239 aa  89.7  4e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.185738  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2160  GntR family transcriptional regulator  32.85 
 
 		 211 aa  89.4  5e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0507248  normal  0.384122 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1327  transcriptional regulator, GntR family  33.5 
 
 		 227 aa  89  6e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.349018 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3298  GntR family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 226 aa  89  6e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.197273 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4793  transcriptional regulator, GntR family  37.95 
 
 		 244 aa  88.6  7e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00330899  hitchhiker  0.000000951338 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6860  GntR family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 242 aa  88.6  7e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2039  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 211 aa  88.6  7e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3199  GntR family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 222 aa  88.6  8e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.405937  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1848  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 		 211 aa  88.2  9e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3370  GntR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 235 aa  87.8  1e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1149  GntR family transcriptional regulator  32.42 
 
 		 223 aa  87.8  1e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0675802  normal  0.772542 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0081  GntR family transcriptional regulator  36.55 
 
 		 240 aa  87.8  1e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0384322 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3389  GntR family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 223 aa  88.2  1e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0526  transcriptional regulator, GntR family  29.95 
 
 		 231 aa  87  2e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000481506  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3323  transcriptional regulator  33.5 
 
 		 226 aa  87.4  2e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0441  GntR family transcriptional regulator  31.84 
 
 		 233 aa  87.4  2e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0023  transcriptional regulator, GntR family  30.65 
 
 		 228 aa  87.4  2e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0023  transcriptional regulator, GntR family  34.24 
 
 		 230 aa  87  2e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.697058  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0022  GntR domain-containing protein  34.24 
 
 		 228 aa  87  2e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2899  GntR family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 226 aa  87  2e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.0000458154  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0202  transcriptional regulator, GntR family  36.55 
 
 		 233 aa  85.9  4e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0023081  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1964  transcriptional regulator, GntR family  31.48 
 
 		 229 aa  85.9  5e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.461761  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0909  GntR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 212 aa  85.9  5e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.730812  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4161  GntR family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 235 aa  85.9  5e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1104  transcriptional regulator, GntR family  31.25 
 
 		 232 aa  85.5  6e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5631  GntR family transcriptional regulator  31.6 
 
 		 229 aa  85.1  9e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4046  GntR family transcriptional regulator  38.64 
 
 		 235 aa  84.3  0.000000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1537  transcriptional regulator, GntR family  31.37 
 
 		 226 aa  84.7  0.000000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000150611  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0572  transcriptional regulator, GntR family  35.03 
 
 		 216 aa  84.7  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.666259  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0065  GntR family transcriptional regulator  34.52 
 
 		 235 aa  84.3  0.000000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0261299  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0165  GntR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 222 aa  84.3  0.000000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.108309  decreased coverage  0.00499675 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0043  transcriptional regulator, GntR family  33.7 
 
 		 231 aa  84  0.000000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0169991 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3844  GntR family transcriptional regulator  34.7 
 
 		 260 aa  84.3  0.000000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0591762 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0614  transcriptional regulator, GntR family  34.46 
 
 		 216 aa  84  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.22125  normal  0.431633 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4056  GntR family transcriptional regulator  35.88 
 
 		 244 aa  83.6  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.153402  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1652  transcriptional regulator, GntR family  35.54 
 
 		 248 aa  84  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.13154  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0208  GntR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 229 aa  84  0.000000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00667385  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2514  GntR family transcriptional regulator  34.3 
 
 		 234 aa  84  0.000000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3667  transcriptional regulator  32.95 
 
 		 214 aa  84  0.000000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.808717  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4007  GntR family transcriptional regulator  32.38 
 
 		 233 aa  83.2  0.000000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2126  transcriptional regulator, GntR family  32.64 
 
 		 215 aa  83.2  0.000000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.199216  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2096  transcriptional regulator, GntR family  36.04 
 
 		 237 aa  82.8  0.000000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3723  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 216 aa  82.8  0.000000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.504621 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5730  GntR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 251 aa  82.8  0.000000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.645386  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>