More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_0965 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_1677  signal transduction histidine kinase  83.8 
 
 		 840 aa  1254    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0965  signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 850 aa  1675    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1984  signal transduction histidine kinase  61.33 
 
 		 713 aa  599  1e-170  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2022  PAS sensor protein  60.27 
 
 		 717 aa  594  1e-168  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.620506 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2299  signal transduction histidine kinase  60.55 
 
 		 713 aa  592  1e-168  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.924903  normal  0.101705 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2833  signal transduction histidine kinase  58.42 
 
 		 738 aa  579  1e-164  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0932  signal transduction histidine kinase  42.8 
 
 		 759 aa  298  3e-79  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5584  signal transduction histidine kinase  41.97 
 
 		 586 aa  290  7e-77  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3331  signal transduction histidine kinase  40.55 
 
 		 503 aa  273  1e-71  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1881  PAS sensor protein  43.24 
 
 		 872 aa  253  8.000000000000001e-66  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0801  signal transduction histidine kinase  37.88 
 
 		 488 aa  250  9e-65  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.185769  normal  0.110715 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4932  signal transduction histidine kinase  40.81 
 
 		 907 aa  247  8e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.752686 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0875  PAS sensor protein  36.88 
 
 		 488 aa  240  8e-62  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.111744 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0835  signal transduction histidine kinase  36.88 
 
 		 488 aa  239  2e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0971828 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4215  signal transduction histidine kinase  39.12 
 
 		 582 aa  235  3e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0433147 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1350  signal transduction histidine kinase  41.26 
 
 		 1016 aa  228  2e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.597121 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1190  PAS sensor protein  41.02 
 
 		 1041 aa  227  6e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0314947 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3048  signal transduction histidine kinase  41.97 
 
 		 1001 aa  227  9e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.143163  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3623  signal transduction histidine kinase  38.57 
 
 		 583 aa  221  3e-56  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.173185  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3834  signal transduction histidine kinase  41.87 
 
 		 728 aa  222  3e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.284621 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3105  PAS sensor protein  41.57 
 
 		 728 aa  221  6e-56  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3662  alcohol dehydrogenase  41.77 
 
 		 733 aa  220  7e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.899908  normal  0.588935 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0172  signal transduction histidine kinase  43.28 
 
 		 897 aa  220  7.999999999999999e-56  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3300  PAS sensor protein  38.34 
 
 		 583 aa  220  7.999999999999999e-56  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.928069  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3500  signal transduction histidine kinase  37.93 
 
 		 583 aa  218  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.319784  normal  0.0807687 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1130  signal transduction histidine kinase  41.99 
 
 		 1002 aa  216  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.039296  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2563  signal transduction histidine kinase  47.97 
 
 		 409 aa  216  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4495  signal transduction histidine kinase  39.43 
 
 		 571 aa  211  5e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5905  signal transduction histidine kinase  36.7 
 
 		 601 aa  207  6e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.584764  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5290  signal transduction histidine kinase  36.95 
 
 		 662 aa  206  1e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.249657 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3652  signal transduction histidine kinase  31.63 
 
 		 491 aa  205  3e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2607  signal transduction histidine kinase  34.74 
 
 		 489 aa  204  8e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.436893  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6262  sensor histidine kinase  34.84 
 
 		 1202 aa  203  9e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0163021  normal  0.538502 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2090  signal transduction histidine kinase  45.96 
 
 		 372 aa  203  9.999999999999999e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.893944 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0620  signal transduction histidine kinase  35.16 
 
 		 725 aa  203  9.999999999999999e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6901  signal transduction histidine kinase  39.47 
 
 		 465 aa  201  5e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0588  sensory box protein  32.1 
 
 		 463 aa  201  6e-50  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0554  sensory box protein  32.33 
 
 		 463 aa  200  9e-50  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5219  signal transduction histidine kinase  42.42 
 
 		 512 aa  200  1.0000000000000001e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.673975 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1700  signal transduction histidine kinase  44.32 
 
 		 339 aa  199  2.0000000000000003e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.193151  normal  0.0718068 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3126  signal transduction histidine kinase  42.64 
 
 		 352 aa  196  1e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1069  signal transduction histidine kinase  50.23 
 
 		 387 aa  196  2e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.591232 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4317  sensor histidine kinase  35.56 
 
 		 499 aa  193  1e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.305311  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1074  signal transduction histidine kinase  37.6 
 
 		 481 aa  189  1e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.255381  normal  0.984755 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0471  signal transduction histidine kinase  41.38 
 
 		 349 aa  187  8e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0094  signal transduction histidine kinase  32.26 
 
 		 929 aa  185  3e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5776  putative PAS/PAC sensor protein  36.41 
 
 		 1160 aa  184  6e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.491611  normal  0.0137055 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2344  signal transduction histidine kinase  37.16 
 
 		 500 aa  182  2e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00211814  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5235  signal transduction histidine kinase  45.75 
 
 		 571 aa  181  4.999999999999999e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.878632  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3978  signal transduction histidine kinase  46.9 
 
 		 577 aa  181  5.999999999999999e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.301159 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0079  signal transduction histidine kinase  39.12 
 
 		 639 aa  179  1e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.464916 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5560  signal transduction histidine kinase  39.85 
 
 		 341 aa  177  5e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.256684  normal  0.0162393 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3835  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  37.03 
 
 		 1167 aa  177  9e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3416  signal transduction histidine kinase  44.36 
 
 		 413 aa  176  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.813211  normal  0.0120926 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4368  signal transduction histidine kinase  45.74 
 
 		 934 aa  175  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.523014 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4271  histidine kinase  31.22 
 
 		 692 aa  173  1e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.305016  normal  0.0625064 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0064  Signal transduction histidine kinase  36.73 
 
 		 1714 aa  172  2e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.274411 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5515  hypothetical protein  36.12 
 
 		 703 aa  172  2e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0827  signal transduction histidine kinase  30.14 
 
 		 512 aa  170  1e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2666  signal transduction histidine kinase  36.89 
 
 		 446 aa  169  2e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.653198  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6181  signal transduction histidine kinase  36.9 
 
 		 1191 aa  169  2e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.299797 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0615  signal transduction histidine kinase  45.28 
 
 		 258 aa  168  2.9999999999999998e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4265  signal transduction histidine kinase  42.56 
 
 		 930 aa  168  4e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.588648  normal  0.462436 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3897  PAS sensor protein  42.56 
 
 		 930 aa  168  4e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.240133 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2714  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.63 
 
 		 1168 aa  167  9e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5262  signal transduction histidine kinase  40.46 
 
 		 338 aa  167  1.0000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3300  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.29 
 
 		 745 aa  166  2.0000000000000002e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.705901 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1551  signal transduction histidine kinase  47.16 
 
 		 642 aa  166  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00518292 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1395  signal transduction histidine kinase  40.36 
 
 		 304 aa  166  2.0000000000000002e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.695001  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3264  HWE histidine kinase  45.15 
 
 		 261 aa  164  6e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00440778 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5012  putative sensory transduction histidine kinase  32.81 
 
 		 333 aa  164  6e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.235153  normal  0.174809 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1301  signal transduction histidine kinase  45.41 
 
 		 588 aa  162  2e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1944  signal transduction histidine kinase  40.75 
 
 		 507 aa  162  3e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0183597  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2160  signal transduction histidine kinase  45.92 
 
 		 263 aa  161  6e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.31354  normal  0.0264622 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6450  signal transduction histidine kinase  31.34 
 
 		 635 aa  160  8e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0678  two-component sensor histidine kinase  39.78 
 
 		 460 aa  160  9e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.320332 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4278  putative PAS/PAC sensor protein  40.64 
 
 		 1027 aa  160  9e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2814  putative sensor histidine kinase  44.08 
 
 		 505 aa  160  1e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.467962  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6933  signal transduction histidine kinase  36.83 
 
 		 488 aa  159  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0223762  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0358  signal transduction histidine kinase  31.89 
 
 		 602 aa  158  4e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1753  sensor histidine kinase  44.02 
 
 		 364 aa  158  4e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.405521 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0180  signal transduction histidine kinase  38.27 
 
 		 380 aa  158  5.0000000000000005e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.012775  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0798  PAS sensor protein  29.07 
 
 		 624 aa  158  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3344  signal transduction histidine kinase  38.52 
 
 		 336 aa  157  7e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5539  signal transduction histidine kinase  46.08 
 
 		 677 aa  157  1e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2768  signal transduction histidine kinase  33.44 
 
 		 333 aa  155  2e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000214374 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1153  signal transduction histidine kinase  42.23 
 
 		 275 aa  156  2e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.614752  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0950  Signal transduction histidine kinase protein  42.92 
 
 		 334 aa  156  2e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.29493  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0507  signal transduction histidine kinase  37.36 
 
 		 336 aa  155  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0007  signal transduction histidine kinase  29.88 
 
 		 482 aa  154  8e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.489749  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5794  signal transduction histidine kinase  32.51 
 
 		 717 aa  154  8e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.63151  normal  0.343732 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4109  signal transduction histidine kinase  44.67 
 
 		 384 aa  153  2e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0421223  normal  0.437508 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0167  signal transduction histidine kinase  36.98 
 
 		 336 aa  152  2e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1377  putative sensor histidine kinase  43.16 
 
 		 561 aa  152  3e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.351027  normal  0.486528 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3974  signal transduction histidine kinase  31.5 
 
 		 635 aa  151  5e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0272817 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0741  Signal transduction histidine kinase  40.09 
 
 		 498 aa  151  6e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6552  signal transduction histidine kinase  37 
 
 		 489 aa  151  6e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.433672 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5922  signal transduction histidine kinase  39.13 
 
 		 346 aa  150  7e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.151215  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1053  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.79 
 
 		 1059 aa  150  8e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.111783  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0743  HWE histidine kinase  34.23 
 
 		 483 aa  150  8e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>