206 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_1840 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_1840  ornithine cyclodeaminase  100 
 
 
379 aa  787    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.199847 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0461  ornithine cyclodeaminase  78.78 
 
 
382 aa  635    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3516  ornithine cyclodeaminase  76.19 
 
 
379 aa  624  1e-178  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.179563  normal  0.283604 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3168  ornithine cyclodeaminase  77.25 
 
 
411 aa  620  1e-176  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1590  ornithine cyclodeaminase  74.34 
 
 
379 aa  606  9.999999999999999e-173  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3763  ornithine cyclodeaminase  71.69 
 
 
383 aa  593  1e-168  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.249055  normal 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4593  ornithine cyclodeaminase  43.95 
 
 
373 aa  289  5.0000000000000004e-77  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00875  ornithine cyclodeaminase protein  27.52 
 
 
340 aa  133  3.9999999999999996e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0180159  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0104  ornithine cyclodeaminase  26.15 
 
 
336 aa  132  6.999999999999999e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0246437  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0108  ornithine cyclodeaminase  26.15 
 
 
336 aa  132  6.999999999999999e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00211883  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0589  ornithine cyclodeaminase  26.43 
 
 
337 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6949  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  26.23 
 
 
336 aa  119  7e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0713  alanine dehydrogenase  32 
 
 
324 aa  119  9e-26  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3192  alanine dehydrogenase  30.23 
 
 
326 aa  117  5e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.897841  hitchhiker  0.00412741 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1116  ornithine cyclodeaminase  26.01 
 
 
355 aa  116  6e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00262553  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1274  alanine dehydrogenase  29.68 
 
 
326 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5200  ornithine cyclodeaminase  30.23 
 
 
337 aa  107  4e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.65234  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1163  ornithine cyclodeaminase  31.94 
 
 
341 aa  104  2e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.371691  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2974  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  29.02 
 
 
334 aa  99.4  1e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3081  Ornithine cyclodeaminase  26.44 
 
 
329 aa  97.1  5e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.305858  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1864  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  26.16 
 
 
332 aa  96.7  7e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13720  predicted ornithine cyclodeaminase, mu-crystallin  28.12 
 
 
340 aa  95.5  1e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2752  Ornithine cyclodeaminase  26.87 
 
 
302 aa  94.7  3e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000954732  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3596  ornithine cyclodeaminase  25.07 
 
 
328 aa  91.7  2e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0238  L-alanine dehydrogenase  26.56 
 
 
319 aa  89.4  1e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2639  Ornithine cyclodeaminase  29.26 
 
 
320 aa  88.6  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.436683  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2867  ornithine cyclodeaminase  27.83 
 
 
320 aa  87.4  4e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4424  Ornithine cyclodeaminase  29.02 
 
 
315 aa  86.7  6e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0765  putative ornithine cyclodeaminase  26.44 
 
 
319 aa  85.5  0.000000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000110452  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3942  Ornithine cyclodeaminase  24.25 
 
 
342 aa  84  0.000000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0721  Ornithine cyclodeaminase  24.29 
 
 
318 aa  83.2  0.000000000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1111  Ornithine cyclodeaminase  24.87 
 
 
328 aa  82.4  0.00000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00600131  unclonable  0.0000000383135 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3082  ornithine cyclodeaminase  25.83 
 
 
329 aa  81.6  0.00000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0653828 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_140  ornithine cyclodeaminase  27.81 
 
 
319 aa  82  0.00000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0899  ornithine cyclodeaminase  24.57 
 
 
341 aa  80.9  0.00000000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2097  ornithine cyclodeaminase  26.35 
 
 
316 aa  81.3  0.00000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00174569  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3909  ornithine cyclodeaminase  25.68 
 
 
326 aa  77.8  0.0000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.263994  normal  0.077542 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1709  Ornithine cyclodeaminase  22.54 
 
 
327 aa  77.8  0.0000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2042  ornithine cyclodeaminase  24.09 
 
 
324 aa  76.6  0.0000000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.234067  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0192  ornithine cyclodeaminase  24.3 
 
 
316 aa  75.9  0.000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0057728  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0800  ornithine cyclodeaminase  22.8 
 
 
325 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4059  Ornithine cyclodeaminase  25.16 
 
 
329 aa  75.5  0.000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3024  ornithine cyclodeaminase  26.56 
 
 
318 aa  76.3  0.000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1351  ornithine cyclodeaminase  25.68 
 
 
326 aa  75.5  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0591538  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3660  Ornithine cyclodeaminase  22.13 
 
 
331 aa  74.7  0.000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3361  ornithine cyclodeaminase  25 
 
 
317 aa  75.1  0.000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2540  ornithine cyclodeaminase  27.14 
 
 
314 aa  75.5  0.000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.984456  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1184  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  24.18 
 
 
334 aa  75.5  0.000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0433932  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1923  Ornithine cyclodeaminase  24.25 
 
 
332 aa  74.7  0.000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3075  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  29.52 
 
 
344 aa  73.9  0.000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0978  Ornithine cyclodeaminase  23.96 
 
 
330 aa  73.9  0.000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.311273 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2675  ornithine cyclodeaminase  26.77 
 
 
316 aa  74.3  0.000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.648145  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1391  ornithine cyclodeaminase  23.62 
 
 
333 aa  73.6  0.000000000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.24882  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0978  ornithine cyclodeaminase  24.03 
 
 
333 aa  73.6  0.000000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.553397  normal  0.242292 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2955  ornithine cyclodeaminase  26.83 
 
 
314 aa  73.2  0.000000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0527705  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1891  ornithine cyclodeaminase  23.9 
 
 
354 aa  72.8  0.000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.529227  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0340  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  29.71 
 
 
344 aa  72.8  0.000000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.826722 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0995  ornithine cyclodeaminase  22.9 
 
 
325 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1083  ornithine cyclodeaminase  22.9 
 
 
325 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1004  ornithine cyclodeaminase  25.08 
 
 
313 aa  72.8  0.00000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0342377  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0803  ornithine cyclodeaminase  21.9 
 
 
325 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0801  ornithine cyclodeaminase  23.86 
 
 
325 aa  72  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.272961  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3726  ornithine cyclodeaminase  24.8 
 
 
318 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1146  Ornithine cyclodeaminase  25.85 
 
 
319 aa  72  0.00000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3170  ornithine cyclodeaminase  25.3 
 
 
315 aa  71.2  0.00000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4637  ornithine cyclodeaminase  22.4 
 
 
348 aa  71.2  0.00000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0589367  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1163  ornithine cyclodeaminase  24.42 
 
 
318 aa  70.9  0.00000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3992  ornithine cyclodeaminase  26.79 
 
 
323 aa  70.1  0.00000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.100495 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2702  ornithine cyclodeaminase  24.81 
 
 
321 aa  70.5  0.00000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.430916 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4602  ornithine cyclodeaminase  22.01 
 
 
365 aa  70.1  0.00000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0944  ornithine cyclodeaminase  22.8 
 
 
325 aa  70.1  0.00000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00286859  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1041  ornithine cyclodeaminase  25.41 
 
 
329 aa  70.1  0.00000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.726287  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2032  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  24.64 
 
 
332 aa  69.7  0.00000000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.46077  normal  0.343668 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4368  ornithine cyclodeaminase  26.39 
 
 
321 aa  68.9  0.0000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0208  ornithine cyclodeaminase  23.12 
 
 
345 aa  68.9  0.0000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.118382  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3503  ornithine cyclodeaminase  24.42 
 
 
318 aa  69.3  0.0000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.599895 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2173  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  25.32 
 
 
346 aa  68.9  0.0000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3998  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  24.2 
 
 
321 aa  68.6  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1928  ornithine cyclodeaminase  27.86 
 
 
324 aa  68.2  0.0000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1731  ornithine cyclodeaminase  23.97 
 
 
354 aa  68.6  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.734503  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0990  ornithine cyclodeaminase  21.57 
 
 
325 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.7286400000000005e-62 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0890  ornithine cyclodeaminase  27.04 
 
 
330 aa  67.8  0.0000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.506898 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2200  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  24.75 
 
 
313 aa  67.8  0.0000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7398  ornithine cyclodeaminase  24.61 
 
 
338 aa  67  0.0000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3190  ornithine cyclodeaminase  25.09 
 
 
315 aa  66.6  0.0000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1673  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  25.84 
 
 
337 aa  66.6  0.0000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2960  pyridoxal-phosphate dependent enzyme family/ornithine cyclodeaminase family protein  27.53 
 
 
707 aa  66.6  0.0000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.76325  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0844  ornithine cyclodeaminase  25 
 
 
311 aa  66.6  0.0000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1976  Ornithine cyclodeaminase  26.59 
 
 
350 aa  66.6  0.0000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.100827  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3311  ornithine cyclodeaminase  24.2 
 
 
321 aa  66.6  0.0000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2526  ornithine cyclodeaminase  25.47 
 
 
315 aa  66.6  0.0000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0910957  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0854  ornithine cyclodeaminase  21.57 
 
 
325 aa  66.2  0.0000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0902  ornithine cyclodeaminase  21.57 
 
 
325 aa  66.2  0.0000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.350786  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0367  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  24.38 
 
 
333 aa  66.2  0.0000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0432436 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5311  ornithine cyclodeaminase  25.08 
 
 
359 aa  66.2  0.0000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2745  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit:ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  30.65 
 
 
685 aa  65.9  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.278132  normal  0.0380808 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2542  ornithine cyclodeaminase  24.76 
 
 
359 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3534  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  23.58 
 
 
328 aa  65.5  0.000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.492943  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0204  ornithine cyclodeaminase  26.87 
 
 
316 aa  65.5  0.000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.358948  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4387  ornithine cyclodeaminase  23.13 
 
 
325 aa  64.7  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.196038  hitchhiker  2.3288500000000002e-24 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>