More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC7_0060 on replicon NC_009637
Organism: Methanococcus maripaludis C7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009637  MmarC7_0060  phage integrase family protein  100 
 
 		 340 aa  696    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.106477  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1842  integrase family protein  100 
 
 		 340 aa  696    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.00549349  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0262  phage integrase family protein  83.79 
 
 		 326 aa  563  1.0000000000000001e-159  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0634  phage integrase family protein  67.91 
 
 		 321 aa  453  1.0000000000000001e-126  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.650036  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1634  phage integrase family protein  51.07 
 
 		 322 aa  344  1e-93  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00686439  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1508  phage integrase family protein  51.38 
 
 		 322 aa  338  9e-92  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000321752 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1647  phage integrase family protein  52.6 
 
 		 322 aa  333  3e-90  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0765801  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0135  integrase family protein  52.33 
 
 		 322 aa  322  8e-87  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0689406  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0436  integrase family protein  48.47 
 
 		 323 aa  306  3e-82  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.788545  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0110  integrase family protein  49.68 
 
 		 324 aa  300  2e-80  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.126491  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0418  integrase family protein  49.84 
 
 		 328 aa  292  6e-78  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0307048  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0036  integrase family protein  47.7 
 
 		 324 aa  286  2.9999999999999996e-76  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.95657  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0021  phage integrase family protein  47.37 
 
 		 324 aa  285  9e-76  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.135699  hitchhiker  0.00129232 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1225  phage integrase family protein  41.69 
 
 		 324 aa  263  3e-69  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0633  phage integrase family protein  41.95 
 
 		 333 aa  228  1e-58  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.191689  n/a   
 
 
-
 
NC_009136  MmarC5_1846  putative integrase/recombinase  33.33 
 
 		 304 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0630  phage integrase family protein  34.97 
 
 		 347 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.7962  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1179  phage integrase family protein  33.63 
 
 		 398 aa  161  1e-38  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0294292  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1484  phage integrase family protein  31.11 
 
 		 341 aa  149  6e-35  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.269781  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0660  integrase family protein  29.82 
 
 		 284 aa  91.7  2e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5348  integrase family protein  26.74 
 
 		 330 aa  90.5  4e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.464558 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2008  integrase family protein  26.74 
 
 		 330 aa  90.5  4e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.461761  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2228  integrase family protein  26.74 
 
 		 330 aa  90.5  4e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.763924 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2378  tyrosine recombinase XerD  26.09 
 
 		 296 aa  88.6  1e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.336575 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0775  integrase family protein  23.91 
 
 		 339 aa  87.4  3e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000364623 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2257  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.24 
 
 		 299 aa  87  5e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.977256  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5408  phage integrase family protein  26.46 
 
 		 330 aa  85.1  0.000000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.123433 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1241  phage integrase  26.13 
 
 		 336 aa  85.5  0.000000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.097797 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7458  integrase family protein  22.87 
 
 		 335 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.259677  normal  1 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3266  phage integrase family protein  25.24 
 
 		 330 aa  84  0.000000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.119927  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0370  integrase family protein  24.66 
 
 		 332 aa  84  0.000000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3505  phage integrase family protein  26.64 
 
 		 330 aa  83.6  0.000000000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.431904  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0452  tyrosine recombinase XerC subunit  23.68 
 
 		 335 aa  83.6  0.000000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.577676  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0319  tyrosine recombinase XerD  28.74 
 
 		 307 aa  82.4  0.00000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.944891  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0367  site-specific tyrosine recombinase XerD  25 
 
 		 298 aa  81.6  0.00000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1762  phage/XerD family site-specific recombinase  27.21 
 
 		 338 aa  81.6  0.00000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0292  tyrosine recombinase XerD  25.78 
 
 		 305 aa  81.6  0.00000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0758  phage integrase family protein  26.91 
 
 		 304 aa  81.6  0.00000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.000222973  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3550  integrase family protein  24.16 
 
 		 324 aa  80.5  0.00000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.74971  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0470  tyrosine recombinase XerC  24.83 
 
 		 293 aa  80.5  0.00000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0772  phage integrase  27.89 
 
 		 304 aa  80.1  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.672054 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2194  integrase family protein  32.73 
 
 		 317 aa  79.7  0.00000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.103281  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0519  phage integrase family protein  24.51 
 
 		 300 aa  79.7  0.00000000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.24612  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1202  tyrosine recombinase XerC  23.95 
 
 		 304 aa  79.3  0.00000000000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.910177  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1524  integrase family protein  28.22 
 
 		 300 aa  78.6  0.0000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.681425  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0861  site-specific tyrosine recombinase XerD  31.74 
 
 		 299 aa  79  0.0000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0487  tyrosine recombinase XerC  26.25 
 
 		 293 aa  78.2  0.0000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000269064 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1501  tyrosine recombinase XerD subunit  25.5 
 
 		 295 aa  78.2  0.0000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2746  tyrosine recombinase XerC  25 
 
 		 314 aa  77.8  0.0000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1619  phage integrase family protein  25.78 
 
 		 286 aa  77.8  0.0000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2366  integrase family protein  25 
 
 		 314 aa  77.8  0.0000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.18523  hitchhiker  0.000000198716 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0863  phage integrase family protein  27.8 
 
 		 313 aa  78.2  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1585  site-specific recombinase XerD-like  25.67 
 
 		 332 aa  77.8  0.0000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.264485  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3042  tyrosine recombinase XerD subunit  25.26 
 
 		 294 aa  77  0.0000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000138339  normal  0.959316 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0645  site-specific tyrosine recombinase XerD  30.77 
 
 		 299 aa  77  0.0000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.241995  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0396  tyrosine recombinase XerD  24.43 
 
 		 309 aa  76.6  0.0000000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0519  site-specific tyrosine recombinase XerD  25.24 
 
 		 302 aa  76.6  0.0000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0998774  normal  0.238721 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1023  tyrosine recombinase XerC subunit  34.81 
 
 		 307 aa  77  0.0000000000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.554982  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3066  integrase family protein  28.9 
 
 		 390 aa  77  0.0000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0221886  normal  0.652565 
 
 
-
 
NC_002936  DET1215  tyrosine recombinase XerD  27.6 
 
 		 302 aa  76.3  0.0000000000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.157843  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1099  tyrosine recombinase XerD  25.7 
 
 		 296 aa  76.3  0.0000000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2329  tyrosine recombinase XerD  25.84 
 
 		 277 aa  75.9  0.0000000000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00235896  normal  0.0350779 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2104  tyrosine recombinase XerD  24.4 
 
 		 301 aa  75.9  0.0000000000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.443082 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_5002  hypothtical protein  23.71 
 
 		 308 aa  75.9  0.000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0748381  hitchhiker  0.0000000255834 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2383  tyrosine recombinase XerD  24.46 
 
 		 295 aa  75.5  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3300  tyrosine recombinase XerD  30.17 
 
 		 299 aa  75.5  0.000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3124  integrase family protein  23.08 
 
 		 323 aa  75.5  0.000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_998  integrase/recombinase  27.3 
 
 		 302 aa  75.9  0.000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0607  recombinase  26.15 
 
 		 296 aa  75.5  0.000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4897  integrase family protein  25.51 
 
 		 336 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0421  integrase family protein  25.9 
 
 		 329 aa  75.9  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02726  site-specific tyrosine recombinase XerD  31.18 
 
 		 298 aa  75.1  0.000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.292633  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0798  tyrosine recombinase XerD  31.18 
 
 		 298 aa  75.1  0.000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.966972  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1025  tyrosine recombinase XerD subunit  28.05 
 
 		 302 aa  74.7  0.000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3027  site-specific tyrosine recombinase XerD  31.18 
 
 		 298 aa  75.1  0.000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0815  site-specific tyrosine recombinase XerD  31.18 
 
 		 298 aa  74.7  0.000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.624778  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4185  site-specific tyrosine recombinase XerD  31.18 
 
 		 298 aa  75.1  0.000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1381  site-specific tyrosine recombinase XerD  32.26 
 
 		 298 aa  75.1  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00360913  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3380  site-specific tyrosine recombinase XerD  31.18 
 
 		 298 aa  75.1  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0478  tyrosine recombinase XerD  32.1 
 
 		 319 aa  74.7  0.000000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02689  hypothetical protein  31.18 
 
 		 298 aa  75.1  0.000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.364794  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2052  tyrosine recombinase XerD  26.42 
 
 		 296 aa  74.7  0.000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0047  integrase family protein  27.05 
 
 		 314 aa  74.7  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.456307  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3053  site-specific tyrosine recombinase XerD  31.18 
 
 		 298 aa  75.1  0.000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1995  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.33 
 
 		 302 aa  74.3  0.000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3220  site-specific tyrosine recombinase XerD  31.18 
 
 		 298 aa  75.1  0.000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3245  phage integrase family protein  31.4 
 
 		 312 aa  75.1  0.000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.676462  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3314  site-specific tyrosine recombinase XerD  31.18 
 
 		 298 aa  75.1  0.000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0169  phage integrase family protein  26.32 
 
 		 282 aa  74.7  0.000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0558238  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3200  site-specific tyrosine recombinase XerD  31.18 
 
 		 298 aa  75.1  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.550002  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3278  site-specific tyrosine recombinase XerD  31.18 
 
 		 298 aa  75.1  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3212  site-specific tyrosine recombinase XerD  31.18 
 
 		 298 aa  75.1  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.476349 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4583  tyrosine recombinase XerD  24.34 
 
 		 317 aa  74.3  0.000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.422443 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3426  tyrosine recombinase XerD  31.79 
 
 		 299 aa  74.3  0.000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5117  tyrosine recombinase XerD  31.38 
 
 		 327 aa  73.9  0.000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.843466 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1283  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.4 
 
 		 297 aa  74.3  0.000000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16040  site-specific tyrosine recombinase XerD  32.26 
 
 		 298 aa  74.3  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1450  integrase family protein  27.49 
 
 		 299 aa  73.9  0.000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00858396  normal  0.734684 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4524  Phage integrase  26.88 
 
 		 310 aa  73.9  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3275  site-specific tyrosine recombinase XerD  30.59 
 
 		 298 aa  73.6  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>