241 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_1621 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009637  MmarC7_1053  FO synthase subunit 2  91.09 
 
 
370 aa  683    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1621  FO synthase subunit 2  100 
 
 
359 aa  739    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0893  FO synthase subunit 2  92.48 
 
 
359 aa  684    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1071  FO synthase subunit 2  82.68 
 
 
359 aa  617  1e-176  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0750  FO synthase subunit 2  61.05 
 
 
362 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.054782  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1072  FO synthase subunit 2  61 
 
 
358 aa  438  9.999999999999999e-123  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1054  FO synthase subunit 2  61.56 
 
 
358 aa  434  1e-120  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1620  FO synthase subunit 2  62.12 
 
 
358 aa  433  1e-120  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3416  FO synthase subunit 2  52.16 
 
 
376 aa  353  2.9999999999999997e-96  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.90673  normal  0.237046 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3417  FO synthase subunit 2  49.57 
 
 
384 aa  344  1e-93  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.1497 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1303  FO synthase subunit 2  54.29 
 
 
356 aa  343  2.9999999999999997e-93  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4032  FO synthase  49.24 
 
 
859 aa  337  9.999999999999999e-92  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.249392  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4107  FO synthase  49.24 
 
 
859 aa  337  9.999999999999999e-92  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4262  FO synthase  49.24 
 
 
859 aa  338  9.999999999999999e-92  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0918112 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11198  FO synthase  47.88 
 
 
856 aa  334  1e-90  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.152769  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0592  radical SAM domain-containing protein  46.37 
 
 
419 aa  332  5e-90  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2167  FO synthase  48.62 
 
 
859 aa  332  9e-90  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0462649 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1148  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  46.73 
 
 
863 aa  330  2e-89  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.064662  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0975  FO synthase  45.86 
 
 
792 aa  328  1.0000000000000001e-88  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.156535  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4533  FO synthase  48.01 
 
 
859 aa  326  3e-88  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.434673  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0814  FO synthase  46.67 
 
 
842 aa  319  3.9999999999999996e-86  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.333048  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0059  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  44.32 
 
 
453 aa  318  6e-86  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.17333 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3619  FO synthase  47.71 
 
 
841 aa  318  7e-86  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4252  Radical SAM domain protein  44.63 
 
 
435 aa  315  8e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0238128  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0863  FO synthase  44 
 
 
852 aa  315  9e-85  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.241376  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0745  FO synthase  42.41 
 
 
899 aa  313  1.9999999999999998e-84  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2623  Radical SAM domain protein  43.79 
 
 
800 aa  312  3.9999999999999997e-84  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.000614503  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5865  FO synthase  43.55 
 
 
944 aa  312  5.999999999999999e-84  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.342546  normal  0.564684 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8766  FO synthase  44.86 
 
 
857 aa  310  2e-83  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.977085  normal  0.875781 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1376  FO synthase  44.55 
 
 
867 aa  308  6.999999999999999e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4075  Radical SAM domain protein  43.79 
 
 
859 aa  305  7e-82  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0946  FO synthase  44.91 
 
 
860 aa  305  7e-82  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1483  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  43.35 
 
 
872 aa  304  1.0000000000000001e-81  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0284  radical SAM domain-containing protein  45.07 
 
 
358 aa  304  1.0000000000000001e-81  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0888  FO synthase  43.99 
 
 
836 aa  302  5.000000000000001e-81  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0248143 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6472  FO synthase  46.15 
 
 
838 aa  302  7.000000000000001e-81  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0769  FO synthase  44.24 
 
 
884 aa  301  8.000000000000001e-81  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0435943  normal  0.470763 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1115  radical SAM domain-containing protein  45.9 
 
 
418 aa  301  9e-81  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4048  hypothetical protein  43.7 
 
 
429 aa  300  4e-80  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.129032  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0746  radical SAM domain-containing protein  46.41 
 
 
881 aa  299  5e-80  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.331413 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0048  radical SAM domain-containing protein  43.37 
 
 
367 aa  298  9e-80  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4423  FO synthase  42.82 
 
 
820 aa  297  2e-79  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.308289  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3771  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  43.73 
 
 
875 aa  295  8e-79  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2519  FO synthase  41.36 
 
 
871 aa  292  6e-78  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.391262  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1304  FO synthase subunit 2  41.71 
 
 
356 aa  290  4e-77  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_51122  predicted protein  41.42 
 
 
841 aa  283  5.000000000000001e-75  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0345053 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0717  FO synthase  43.79 
 
 
779 aa  282  6.000000000000001e-75  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00851827 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2970  hypothetical protein  42.31 
 
 
366 aa  280  3e-74  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0040  radical SAM domain-containing protein  41.88 
 
 
362 aa  279  6e-74  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4262  Radical SAM domain protein  40.11 
 
 
826 aa  277  2e-73  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.296294  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0050  Radical SAM domain protein  41.43 
 
 
365 aa  276  3e-73  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0775  FO synthase subunit 2  40.44 
 
 
391 aa  275  1.0000000000000001e-72  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.848355  hitchhiker  0.00153433 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3281  FO synthase subunit 2  41.98 
 
 
381 aa  273  3e-72  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.370195  normal  0.662491 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2116  FO synthase subunit 2  42.27 
 
 
398 aa  272  5.000000000000001e-72  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0194  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  41.74 
 
 
382 aa  271  1e-71  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.200924  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3040  FO synthase subunit 2  40.61 
 
 
384 aa  271  2e-71  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.591688  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3080  FO synthase subunit 2  40.61 
 
 
384 aa  270  2e-71  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1434  FO synthase subunit 2  43.75 
 
 
376 aa  270  2.9999999999999997e-71  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0038  radical SAM domain-containing protein  38.81 
 
 
362 aa  266  2.9999999999999995e-70  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0218  Radical SAM domain protein  39.19 
 
 
358 aa  261  1e-68  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0234  Radical SAM domain protein  38.9 
 
 
358 aa  259  4e-68  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0047  radical SAM domain-containing protein  38.32 
 
 
362 aa  259  5.0000000000000005e-68  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1450  Radical SAM domain protein  37.11 
 
 
368 aa  258  1e-67  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000839661  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4090  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  39.55 
 
 
737 aa  258  1e-67  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0388859 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1089  radical SAM domain-containing protein  36.75 
 
 
368 aa  257  2e-67  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4165  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  39.27 
 
 
741 aa  258  2e-67  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.358903  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0411  Radical SAM domain protein  38.74 
 
 
364 aa  256  4e-67  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3391  hypothetical protein  38.62 
 
 
360 aa  255  6e-67  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.352496  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1157  radical SAM domain-containing protein  39.32 
 
 
359 aa  256  6e-67  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.423135  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0441  radical SAM domain-containing protein  37.46 
 
 
361 aa  254  1.0000000000000001e-66  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4147  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  38.98 
 
 
737 aa  254  2.0000000000000002e-66  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.280737  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0123  hypothetical protein  41.42 
 
 
361 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0686  FO synthase subunit 2  40.29 
 
 
386 aa  253  4.0000000000000004e-66  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1643  Radical SAM domain protein  37.61 
 
 
367 aa  251  2e-65  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000555203  hitchhiker  0.00000328368 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4285  radical SAM domain-containing protein  40 
 
 
364 aa  251  2e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2410  hypothetical protein  37.43 
 
 
361 aa  250  3e-65  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0900  Radical SAM domain protein  41.37 
 
 
757 aa  249  6e-65  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.180074  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1159  hypothetical protein  36.93 
 
 
356 aa  249  6e-65  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.34532  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2193  radical SAM domain-containing protein  40.71 
 
 
355 aa  249  7e-65  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0797  hypothetical protein  37.46 
 
 
371 aa  248  1e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.106816  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0404  hypothetical protein  37.22 
 
 
349 aa  248  2e-64  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0742  radical SAM domain-containing protein  36.18 
 
 
365 aa  247  2e-64  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.547138 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4284  radical SAM domain-containing protein  37.75 
 
 
360 aa  247  2e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1645  Radical SAM domain protein  38.35 
 
 
358 aa  247  2e-64  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000004914  hitchhiker  0.00000000624327 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0551  radical SAM domain-containing protein  37.71 
 
 
372 aa  246  3e-64  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0260021  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1528  hypothetical protein  37.96 
 
 
363 aa  246  4e-64  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0315  Radical SAM domain protein  38.87 
 
 
360 aa  241  1e-62  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0798  hypothetical protein  37.43 
 
 
371 aa  241  2e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.22786  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0235  Radical SAM domain protein  38 
 
 
357 aa  241  2e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.568527  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2195  radical SAM domain-containing protein  35.91 
 
 
367 aa  241  2e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1619  hypothetical protein  37.57 
 
 
348 aa  240  2.9999999999999997e-62  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.320855  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0801  hypothetical protein  37.61 
 
 
348 aa  239  4e-62  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000463089  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0487  hypothetical protein  40.19 
 
 
348 aa  239  5e-62  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.995091  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0320  hypothetical protein  36.36 
 
 
355 aa  239  5.999999999999999e-62  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000157308  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1477  hypothetical protein  37.29 
 
 
348 aa  239  6.999999999999999e-62  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.32235  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1007  Radical SAM domain protein  36.39 
 
 
369 aa  238  1e-61  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0379726 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1844  hypothetical protein  36.69 
 
 
360 aa  237  2e-61  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4206  radical SAM domain-containing protein  34.46 
 
 
387 aa  236  5.0000000000000005e-61  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3088  radical SAM domain-containing protein  37.25 
 
 
354 aa  236  5.0000000000000005e-61  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.675437  unclonable  0.0000126154 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3390  hypothetical protein  36.68 
 
 
353 aa  236  6e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>