134 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_1245 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008347  Mmar10_1245  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 196 aa  393  1e-109  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00929139 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3795  transcriptional regulator, TetR family  27.27 
 
 		 202 aa  57  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.277058  hitchhiker  0.000257317 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2689  putative transcriptional regulator, TetR family  26.37 
 
 		 325 aa  55.5  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.559134 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1515  regulatory protein, TetR  34.83 
 
 		 208 aa  52.4  0.000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2056  TetR family regulatory protein  49.12 
 
 		 223 aa  50.4  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.273802  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1663  regulator AmrR  49.12 
 
 		 223 aa  50.4  0.00001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.211549  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0318  TetR family regulatory protein  49.12 
 
 		 223 aa  50.4  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0868367  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1888  multidrug efflux operon transciptional regulator AmrR  49.12 
 
 		 223 aa  50.4  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.103015  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1902  multidrug efflux operon transciptional regulator AmrR  49.12 
 
 		 223 aa  50.4  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00105547  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0842  regulator AmrR  49.12 
 
 		 223 aa  50.4  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.063166  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2845  TetR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 197 aa  50.8  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.735257  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0726  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 201 aa  48.5  0.00006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.892311  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2446  regulator AmrR  47.37 
 
 		 209 aa  48.5  0.00006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.584689  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2508  TetR family transcriptional regulator  27.08 
 
 		 195 aa  48.5  0.00006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0332011  normal  0.924216 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1507  TetR family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 224 aa  48.1  0.00007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0289697  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1196  TetR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 235 aa  48.1  0.00009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0270816  normal  0.528782 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3783  TetR family transcriptional regulator  27.98 
 
 		 197 aa  47.8  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.539516 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3439  TetR family transcriptional regulator  26.39 
 
 		 239 aa  47.4  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1012  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 212 aa  47  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.156612  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3660  transcriptional regulator, TetR family  36.08 
 
 		 199 aa  46.6  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.880035  normal  0.502238 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2488  TetR family transcriptional regulator  25.3 
 
 		 201 aa  46.2  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0524247 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5760  putative transcriptional regulator, TetR family  26.26 
 
 		 209 aa  46.6  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.238463  normal  0.204819 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2324  transcriptional regulator, TetR family  46.55 
 
 		 195 aa  45.8  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0281  transcriptional regulator, TetR family  30.26 
 
 		 218 aa  46.2  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.645912  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5693  transcriptional regulator, TetR family  35.63 
 
 		 211 aa  45.8  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0563608  normal  0.866587 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0265  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 200 aa  45.1  0.0007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00630944 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0533  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 398 aa  45.1  0.0007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0165878  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10080  Transcriptional regulator, TetR family  46.15 
 
 		 217 aa  45.1  0.0007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.530554  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3744  transcriptional regulator, TetR family  39.29 
 
 		 223 aa  45.1  0.0007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6580  transcriptional regulator, TetR family  32.58 
 
 		 242 aa  45.1  0.0007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.603144 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0012  putative AcrAB operon repressor transcription regulator protein  39.29 
 
 		 219 aa  45.1  0.0008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.631075  normal  0.0464367 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2067  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 216 aa  44.7  0.0008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0411  transcriptional regulator, TetR family  27.78 
 
 		 196 aa  44.7  0.0008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.3269  hitchhiker  0.00212654 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4117  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 210 aa  44.7  0.0008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0314  TetR family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 211 aa  44.3  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1017  repressor protein  40.35 
 
 		 211 aa  44.3  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0679  TetR family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 211 aa  44.3  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2010  TetR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 184 aa  44.3  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2753  transcriptional regulator, TetR family  41.82 
 
 		 197 aa  43.9  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.920315  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2056  TetR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 184 aa  44.3  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0609  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  40.35 
 
 		 211 aa  44.3  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.780096  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2443  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  40.35 
 
 		 211 aa  44.3  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0852  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  40.35 
 
 		 211 aa  44.3  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0857  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  40.35 
 
 		 211 aa  44.3  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1991  TetR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 184 aa  44.3  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.645683  normal  0.738548 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4113  TetR family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 236 aa  44.3  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.249212  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0057  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  40.35 
 
 		 211 aa  44.3  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3703  DNA-binding transcriptional regulator EnvR  35.71 
 
 		 215 aa  44.3  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.83778 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3291  TetR family transcriptional regulator  28.15 
 
 		 195 aa  43.9  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3164  transcriptional regulator, TetR family  35.16 
 
 		 208 aa  44.3  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.859639  normal  0.0513104 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4215  TetR family transcriptional regulator  26.72 
 
 		 269 aa  43.9  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.261755 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4734  TetR family transcriptional regulator  26.47 
 
 		 242 aa  43.9  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1281  TetR family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 210 aa  43.9  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.781108  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5941  TetR family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 213 aa  43.5  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.272965 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0992  TetR family transcriptional regulator  30.68 
 
 		 226 aa  43.1  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000245295 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3587  TetR family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 242 aa  43.9  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0561  transcriptional regulator, TetR family  40.96 
 
 		 197 aa  43.5  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2657  TetR family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 213 aa  43.1  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3421  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 223 aa  43.5  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.288907  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2788  transcriptional regulator, TetR family  27.43 
 
 		 201 aa  43.5  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0719  TetR family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 408 aa  43.9  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0260522 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0170  transcriptional regulator, TetR family  37.04 
 
 		 201 aa  43.5  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.307357  hitchhiker  0.00190078 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2460  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 201 aa  43.5  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.315446  normal  0.37249 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1940  TetR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 198 aa  43.5  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.688335  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2639  TetR family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 213 aa  43.1  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2530  TetR family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 213 aa  43.1  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.704068 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0477  TetR family transcriptional regulator  35.85 
 
 		 211 aa  43.1  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.178939  normal  0.0289146 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0425  transcriptional regulator, TetR family  31.3 
 
 		 195 aa  43.9  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.752712  normal  0.122961 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3959  transcriptional regulator, TetR family  39.62 
 
 		 204 aa  43.5  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00461459  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02185  transcriptional regulator  25.83 
 
 		 196 aa  42.7  0.003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.69519  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2248  TetR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 222 aa  42.7  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0660336  normal  0.0152181 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2000  TetR family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 234 aa  43.1  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.920156  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2610  TetR family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 234 aa  43.1  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.341012  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1994  TetR family transcriptional regulator  35.04 
 
 		 173 aa  42.7  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.187018  normal  0.996586 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0817  TetR family transcriptional regulator  24.87 
 
 		 212 aa  42.7  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2444  transcriptional regulator, TetR family  31.91 
 
 		 211 aa  42.7  0.003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0505938 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3111  TetR family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 210 aa  42.7  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2373  TetR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 205 aa  43.1  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3046  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  24.83 
 
 		 216 aa  43.1  0.003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.303422  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4426  TetR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 210 aa  42.7  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.062473  normal  0.279059 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1027  TetR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 210 aa  42.7  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4766  TetR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 215 aa  42.4  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.745504 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1362  TetR family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 211 aa  42.4  0.004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0306  TetR family transcriptional regulator  23.35 
 
 		 219 aa  42.4  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0641939  normal  0.172302 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3722  TetR family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 202 aa  42.4  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.869277  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1519  TetR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 215 aa  42.7  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3795  TetR family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 202 aa  42.4  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.796114  normal  0.124585 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3734  TetR family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 202 aa  42.4  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0165853  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30260  transcriptional regulator  38.89 
 
 		 400 aa  42.4  0.004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.473296 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0805  TetR family transcriptional regulator  24.71 
 
 		 204 aa  42.4  0.004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1426  transcriptional regulator, TetR family  32.05 
 
 		 204 aa  42.4  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0803354  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1542  TetR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 215 aa  42.7  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2832  transcriptional regulator, TetR family  38.46 
 
 		 204 aa  42.7  0.004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1387  TetR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 210 aa  42.4  0.005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.649854  normal  0.844436 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1310  TetR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 182 aa  42.4  0.005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000104064  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2556  transcriptional regulator, TetR family  36 
 
 		 208 aa  42.4  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000000489141  normal  0.182844 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2746  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 201 aa  42.4  0.005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0257  transcriptional regulator, TetR family  40.32 
 
 		 188 aa  42.4  0.005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4096  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 201 aa  42.4  0.005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.428343  normal  0.46248 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0027  TetR family transcriptional regulator  26.72 
 
 		 209 aa  42  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.790094 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>