160 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_0832 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_0832  YceI family protein  100 
 
 
182 aa  357  4e-98  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.261869  hitchhiker  0.00246548 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2321  YceI  33.79 
 
 
191 aa  97.4  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1935  YceI family protein  33.33 
 
 
191 aa  95.5  4e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.321555  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3201  YceI family protein  35.12 
 
 
186 aa  94.7  6e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.484936 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2178  YceI family protein  34.72 
 
 
188 aa  93.2  2e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3683  YceI  32.4 
 
 
192 aa  87  1e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.579212  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0295  cytochrome b561  30.23 
 
 
416 aa  86.3  3e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0256942  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5251  YceI family protein  33.11 
 
 
192 aa  84.3  8e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1204  YceI  34.03 
 
 
421 aa  83.2  0.000000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1711  YceI  35.46 
 
 
420 aa  82.8  0.000000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.811721  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4402  YceI family protein  34.25 
 
 
190 aa  81.6  0.000000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.426674 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3507  hypothetical protein  31.16 
 
 
194 aa  79.3  0.00000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.317049  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4487  YceI family protein  31.62 
 
 
441 aa  78.2  0.00000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.547173 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3506  YceI family protein  30.57 
 
 
192 aa  75.9  0.0000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.790188 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3579  YceI family protein  30.61 
 
 
196 aa  72  0.000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.948947  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1027  YceI family protein  29.93 
 
 
193 aa  71.2  0.000000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0458  YceI family protein  29.05 
 
 
190 aa  70.5  0.00000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1030  hypothetical protein  30.63 
 
 
186 aa  70.1  0.00000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.103898  normal  0.0258647 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1616  hypothetical protein  28.76 
 
 
191 aa  67  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1196  YceI family protein  26.45 
 
 
183 aa  66.6  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00341988  normal  0.225217 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3153  YceI  28 
 
 
183 aa  66.6  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0885591  normal  0.570024 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01687  YceI like family  28.57 
 
 
189 aa  65.9  0.0000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.740504  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3325  YceI family protein  29.6 
 
 
178 aa  65.1  0.0000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000106411 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1869  YceI family protein  30.18 
 
 
189 aa  64.7  0.0000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.155995  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1860  YceI family protein  27.34 
 
 
186 aa  63.2  0.000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0470  YceI family protein  28.68 
 
 
193 aa  63.2  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3996  hypothetical protein  30.17 
 
 
187 aa  62.4  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.29888  normal  0.350257 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1199  YceI family protein  30.94 
 
 
183 aa  62.8  0.000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.144393  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2184  putative cytochrome B561  32.64 
 
 
400 aa  62.8  0.000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2307  YceI family protein  30.1 
 
 
204 aa  62.8  0.000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000000152609  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0705  YceI family protein  30.73 
 
 
187 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.587119  normal  0.613914 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2371  YceI family protein  29.69 
 
 
198 aa  62  0.000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2795  YceI  29.09 
 
 
184 aa  62  0.000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.772608  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2036  YceI family protein  30.65 
 
 
195 aa  61.2  0.000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.460798 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1611  hypothetical protein  27.59 
 
 
191 aa  61.2  0.000000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2314  YceI family protein  23.27 
 
 
177 aa  61.2  0.000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.133318  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3449  YceI  28.02 
 
 
196 aa  58.9  0.00000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1745  cytochrome B561  32.54 
 
 
406 aa  57.4  0.0000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.399847  normal  0.227689 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1312  YceI family protein  30.97 
 
 
201 aa  55.8  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000260413 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0382  hypothetical protein  25.97 
 
 
180 aa  56.2  0.0000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0621265  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0685  hypothetical protein  22.94 
 
 
189 aa  55.8  0.0000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2065  hypothetical protein  29.5 
 
 
191 aa  55.5  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.257216  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0473  hypothetical protein  27.01 
 
 
189 aa  55.8  0.0000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  1.81293e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3045  YceI family protein  25 
 
 
190 aa  55.8  0.0000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2718  signal peptide protein  25.31 
 
 
189 aa  55.5  0.0000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.495901  normal  0.071315 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3001  YceI family protein  27.49 
 
 
195 aa  55.1  0.0000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000127378  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1887  YceI family protein  26.94 
 
 
192 aa  55.5  0.0000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.810222  hitchhiker  0.000541612 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2227  YceI family protein  25.36 
 
 
190 aa  55.1  0.0000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.000482548  decreased coverage  0.00464038 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4183  YceI family protein  31.25 
 
 
192 aa  54.7  0.0000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1520  YceI family protein  23.3 
 
 
192 aa  54.3  0.0000009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0602  YceI family protein  22.35 
 
 
189 aa  54.3  0.0000009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5859  YceI family protein  28.66 
 
 
191 aa  54.3  0.0000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3656  YceI family protein  32.69 
 
 
180 aa  53.9  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0464334  normal  0.0393691 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3803  hypothetical protein  27.01 
 
 
186 aa  53.1  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4031  YceI  28.74 
 
 
182 aa  53.1  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.269923  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4106  YceI family protein  28.74 
 
 
182 aa  53.1  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0443  hypothetical protein  24.63 
 
 
190 aa  53.1  0.000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4261  YceI family protein  28.74 
 
 
182 aa  53.1  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.651401  normal  0.0270494 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2670  YceI family protein  27.01 
 
 
186 aa  53.1  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.415789  normal  0.822376 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1086  hypothetical protein  31.69 
 
 
181 aa  52.4  0.000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0932  YceI  28.48 
 
 
183 aa  52.4  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.656064  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14930  hypothetical protein  32.93 
 
 
182 aa  52.4  0.000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4184  YceI family protein  26.67 
 
 
193 aa  52  0.000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2817  YceI  27.78 
 
 
190 aa  51.6  0.000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1870  YceI family protein  28.25 
 
 
182 aa  51.6  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0076574  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0992  YceI family protein  28.48 
 
 
183 aa  51.6  0.000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00460227  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0469  hypothetical protein  23.88 
 
 
190 aa  51.6  0.000006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.189395  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2913  YceI family protein  30.2 
 
 
201 aa  51.6  0.000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2552  YceI family protein  25.44 
 
 
190 aa  51.6  0.000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.370741  normal  0.285953 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2815  YceI family protein  30.84 
 
 
175 aa  51.6  0.000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3326  YceI family protein  29.93 
 
 
190 aa  51.2  0.000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000103156 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0989  YceI family protein  27.81 
 
 
183 aa  51.2  0.000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.324604  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0231  YceI  27.01 
 
 
186 aa  51.2  0.000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0733061  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0715  YceI family protein  27.01 
 
 
186 aa  51.2  0.000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1536  hypothetical protein  23.88 
 
 
190 aa  51.2  0.000008  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3093  YceI family protein  28.17 
 
 
182 aa  51.2  0.000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0366  YceI family protein  30.22 
 
 
189 aa  51.2  0.000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0333  YceI family protein  28.24 
 
 
199 aa  50.8  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.192845  normal  0.888817 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0530  YceI family protein  29.47 
 
 
186 aa  50.8  0.00001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.456104  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2531  YceI family protein  28.26 
 
 
186 aa  50.8  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.178135 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0682  YceI family protein  26.28 
 
 
186 aa  50.4  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.424973  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0089  YceI family protein  30.56 
 
 
184 aa  50.1  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4531  YceI family protein  28.24 
 
 
181 aa  48.9  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.642699  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3307  YceI family protein  26 
 
 
182 aa  48.9  0.00004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.872006  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3638  YceI family protein  27.82 
 
 
214 aa  48.9  0.00004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.159017 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0955  YceI family protein  30.06 
 
 
186 aa  48.5  0.00005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1711  YceI family protein  25.64 
 
 
188 aa  48.5  0.00005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2169  YceI family protein  27.65 
 
 
181 aa  48.5  0.00005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0221884 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1400  cytochrome B561  27.21 
 
 
397 aa  48.5  0.00005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.687205 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4627  YceI family protein  24.65 
 
 
175 aa  48.1  0.00006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1049  cytochrome B561  25.69 
 
 
410 aa  48.1  0.00007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.183438  normal  0.102385 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1405  YceI family protein  30.17 
 
 
201 aa  48.1  0.00007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.247492 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3540  YceI  22.42 
 
 
185 aa  47.8  0.00009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.27831 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1467  YceI family protein  26.92 
 
 
175 aa  47  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000602513  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1272  YceI-like family protein  29.93 
 
 
207 aa  47.4  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1821  hypothetical protein  24.34 
 
 
192 aa  47.4  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.129752  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2224  hypothetical protein  24.34 
 
 
192 aa  47.4  0.0001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0021514  hitchhiker  0.00838786 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1931  hypothetical protein  24.34 
 
 
192 aa  47.4  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2381  hypothetical protein  28.96 
 
 
186 aa  46.6  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.481751  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2566  hypothetical protein  29.93 
 
 
186 aa  46.2  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>