141 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_2020 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008340  Mlg_2020  hypothetical protein  100 
 
 
379 aa  732    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2181  putative hydrogenase expression/formation protein HupK  34.42 
 
 
329 aa  83.6  0.000000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.124929  normal  0.212664 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1158  putative hydrogenase expression/formation protein HupK  30.84 
 
 
329 aa  80.5  0.00000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.846378  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1965  hypothetical protein  30.16 
 
 
390 aa  79  0.0000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.241509  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2497  Ni,Fe-hydrogenase I large subunit  28.54 
 
 
379 aa  76.3  0.0000000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.633578  normal  0.13514 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1437  nickel-dependent hydrogenase, large subunit  22.49 
 
 
417 aa  72.8  0.000000000008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1172  coenzyme F420-reducing hydrogenase alpha subunit-like  29.4 
 
 
370 aa  71.6  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.903456  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3763  putative hydrogenase expression/formation protein HupK  37.41 
 
 
373 aa  70.9  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1954  nickel-dependent hydrogenase, large subunit  36.73 
 
 
485 aa  70.9  0.00000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.935689  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1400  nickel-dependent hydrogenase large subunit  36.7 
 
 
439 aa  69.7  0.00000000009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.2671  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2806  HupV protein  41.67 
 
 
485 aa  68.9  0.0000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1161  nickel-dependent hydrogenase, large subunit  33.33 
 
 
481 aa  68.6  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1167  putative hydrogenase expression/formation protein HupK  38.67 
 
 
406 aa  67.4  0.0000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.819635  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3774  nickel-dependent hydrogenase, large subunit  33.56 
 
 
480 aa  65.5  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.967031 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1995  uptake hydrogenase accessory  34 
 
 
479 aa  65.9  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4118  putative hydrogenase expression/formation protein HupK  28.23 
 
 
391 aa  65.1  0.000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2010  nickel-dependent hydrogenase, large subunit  29.73 
 
 
482 aa  65.1  0.000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3805  nickel-dependent hydrogenase large subunit  33.88 
 
 
540 aa  64.7  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.793332 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1147  nickel-dependent hydrogenase large subunit  35.19 
 
 
488 aa  63.5  0.000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2817  HupK protein  29.17 
 
 
388 aa  63.5  0.000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0702  hydrogenase-2, large subunit  26.44 
 
 
532 aa  62.4  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3960  nickel-dependent hydrogenase, large subunit  34.25 
 
 
472 aa  62.8  0.00000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0850  Hydrogen:quinone oxidoreductase  26.44 
 
 
532 aa  62.4  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.844824 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4121  hydrogen:quinone oxidoreductase  36.11 
 
 
496 aa  62.8  0.00000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1534  hypothetical protein  39.29 
 
 
101 aa  62.8  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00103217  normal  0.023944 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0441  hypothetical protein  33.1 
 
 
397 aa  61.6  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7257  HupK protein  29.07 
 
 
336 aa  62  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.53403  normal  0.383588 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1153  nickel-dependent hydrogenase large subunit  36.7 
 
 
481 aa  59.7  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3095  nickel-dependent hydrogenase, large subunit  37.04 
 
 
477 aa  59.3  0.0000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3378  NADH ubiquinone oxidoreductase, 20 kDa subunit  40.71 
 
 
474 aa  58.5  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.40537  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3886  nickel-dependent hydrogenase large subunit  29.41 
 
 
531 aa  57.4  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.713091 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2144  hydrogen:quinone oxidoreductase  35.67 
 
 
475 aa  57.4  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.883688  normal  0.196706 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2493  nickel-dependent hydrogenase, large subunit  37.5 
 
 
484 aa  57  0.0000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00408967  normal  0.431982 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0493  hydrogenase large subunit  41.07 
 
 
475 aa  57  0.0000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0342  nickel-dependent hydrogenase large subunit  32.73 
 
 
485 aa  56.6  0.0000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0846503  normal  0.979503 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3368  hydrogen:quinone oxidoreductase  31.01 
 
 
534 aa  55.5  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50500  hydrogenase expression/formation protein HoxV  43.18 
 
 
348 aa  55.8  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.102569  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1076  hydrogen:quinone oxidoreductase  35 
 
 
535 aa  54.7  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.108784  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4563  hypothetical protein  42.17 
 
 
368 aa  55.1  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0805  nickel-dependent hydrogenase large subunit  40.74 
 
 
465 aa  54.7  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3763  nickel-dependent hydrogenase large subunit  29.84 
 
 
532 aa  54.3  0.000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3224  cytochrome-c3 hydrogenase  28.81 
 
 
535 aa  53.9  0.000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.851787  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2005  hydrogenase expression/formation  31.93 
 
 
368 aa  53.1  0.000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.432728  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1071  nickel-dependent hydrogenase large subunit  30.28 
 
 
470 aa  52.8  0.000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.018808  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3865  nickel-dependent hydrogenase large subunit  29.75 
 
 
562 aa  52.8  0.00001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0766  nickel-dependent hydrogenase large subunit  32.53 
 
 
569 aa  52.8  0.00001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2907  nickel-dependent hydrogenase large subunit  31.78 
 
 
531 aa  52.4  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0923  nickel-dependent hydrogenase, large subunit  27.83 
 
 
513 aa  52.4  0.00001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3213  nickel-dependent hydrogenase large subunit  31.78 
 
 
531 aa  52.4  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1348  nickel-dependent hydrogenase large subunit  52.27 
 
 
509 aa  52.8  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1818  nickel-dependent hydrogenase large subunit  29.75 
 
 
531 aa  52.4  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4595  nickel-dependent hydrogenase, large subunit  29.45 
 
 
531 aa  52  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.63509  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3771  nickel-dependent hydrogenase, large subunit  28.23 
 
 
597 aa  52  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.292608  normal  0.910106 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2366  hydrogen:quinone oxidoreductase  27.54 
 
 
536 aa  51.2  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.201655  normal  0.04307 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0461  uptake hydrogenase large subunit  28.23 
 
 
532 aa  50.4  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0412944  normal  0.0758473 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1733  nickel-dependent hydrogenase large subunit  29.69 
 
 
549 aa  50.8  0.00004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1162  nickel-dependent hydrogenase, large subunit  29.55 
 
 
596 aa  50.4  0.00005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.122791  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0920  coenzyme F420-reducing hydrogenase alpha subunit-like protein  30.67 
 
 
379 aa  50.4  0.00005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2742  Hydrogen:quinone oxidoreductase  26.72 
 
 
518 aa  50.1  0.00006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000126046  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2826  nickel-iron hydrogenase, large subunit  32.94 
 
 
618 aa  50.1  0.00007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.652434  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1038  nickel-dependent hydrogenase large subunit  23.62 
 
 
558 aa  49.7  0.00008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.368471  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3098  nickel-dependent hydrogenase, large subunit  32.94 
 
 
597 aa  49.7  0.00009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1163  nickel-dependent hydrogenase, large subunit  30.59 
 
 
597 aa  48.9  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.28682  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1297  nickel-dependent hydrogenase, large subunit  31.76 
 
 
619 aa  48.5  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0139093  normal 
 
 
-
 
NC_008036  Sala_3198  nickel-dependent hydrogenase, large subunit  28.68 
 
 
547 aa  48.5  0.0002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1787  nickel-dependent hydrogenase large subunit  30.38 
 
 
481 aa  48.9  0.0002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.993845  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0471  nickel-dependent hydrogenase large subunit  30.51 
 
 
545 aa  48.5  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.980581  normal  0.166741 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1974  nickel-dependent hydrogenase, large subunit  23.42 
 
 
618 aa  48.5  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.688051  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0110  [Ni/Fe] hydrogenase, group 1, large subunit, putative  28.07 
 
 
526 aa  48.1  0.0003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0854  nickel-dependent hydrogenase large subunit  32.5 
 
 
572 aa  48.1  0.0003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.255543 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2138  periplasmic (NiFe) hydrogenase, large subunit, isozyme 1  30.12 
 
 
568 aa  47.8  0.0004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03860  nickel-dependent hydrogenase large subunit  29.11 
 
 
470 aa  47.8  0.0004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1592  nickel-dependent hydrogenase large subunit  30 
 
 
572 aa  47.4  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.663154  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2889  nickel-dependent hydrogenase, large subunit  26.74 
 
 
505 aa  47  0.0005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50580  Membrane bound nickel-dependent hydrogenase, large subunit, HoxG  28.19 
 
 
602 aa  47  0.0005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.980558  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2952  nickel-dependent hydrogenase, large subunit  30.68 
 
 
546 aa  47  0.0005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.437472 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2089  nickel-dependent hydrogenase, large subunit  25.81 
 
 
567 aa  47.4  0.0005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3971  nickel-dependent hydrogenase, large subunit  31.76 
 
 
570 aa  47  0.0006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.533836  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1997  uptake hydrogenase large subunit precursor  25 
 
 
596 aa  46.6  0.0006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0496  hydrogenase protein large subunit  31.76 
 
 
596 aa  46.6  0.0007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2147  nickel-dependent hydrogenase, large subunit  31.76 
 
 
596 aa  46.6  0.0007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0605986  normal  0.266797 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3375  hypothetical protein  31.76 
 
 
596 aa  46.6  0.0007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.281049  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2320  nickel-dependent hydrogenase, large subunit  29.89 
 
 
570 aa  46.6  0.0007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0266  nickel-dependent hydrogenase large subunit  32.53 
 
 
566 aa  46.6  0.0008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.322067  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0270  nickel-dependent hydrogenase large subunit  30.12 
 
 
567 aa  46.6  0.0008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.11146 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3147  nickel-dependent hydrogenase large subunit  29.89 
 
 
570 aa  46.6  0.0008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1678  hydrogenase large chain  25.16 
 
 
567 aa  46.2  0.0009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1245  nickel-dependent hydrogenase, large subunit  31.33 
 
 
566 aa  46.2  0.0009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.11159 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1888  nickel-dependent hydrogenase large subunit  25.24 
 
 
567 aa  46.2  0.0009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.261784  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1914  nickel-dependent hydrogenase large subunit  25.24 
 
 
567 aa  46.2  0.0009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.392356  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2405  nickel-dependent hydrogenase large subunit  25.24 
 
 
567 aa  46.2  0.0009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.286384  hitchhiker  0.000502851 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1921  nickel-dependent hydrogenase large subunit  25.24 
 
 
567 aa  46.2  0.0009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3980  hypothetical protein  38.27 
 
 
308 aa  46.2  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2174  nickel-dependent hydrogenase large subunit  32.94 
 
 
604 aa  46.2  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.0021467  normal  0.160198 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1940  hydrogen:quinone oxidoreductase  35.23 
 
 
475 aa  46.2  0.001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1155  nickel-dependent hydrogenase large subunit  28.24 
 
 
597 aa  46.2  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.295857  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1879  nickel-dependent hydrogenase, large subunit  26.47 
 
 
567 aa  45.4  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0718  nickel-dependent hydrogenase, large subunit  32.53 
 
 
549 aa  45.4  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.338951 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1764  nickel-dependent hydrogenase, large subunit  27.45 
 
 
568 aa  45.4  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3270  nickel-dependent hydrogenase large subunit  27.73 
 
 
517 aa  45.4  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>