More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_1573 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008340  Mlg_1573  RND family efflux transporter MFP subunit  100 
 
 		 399 aa  763    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1477  efflux transporter, RND family, MFP subunit  56.74 
 
 		 396 aa  353  2.9999999999999997e-96  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.153552  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1916  RND family efflux transporter MFP subunit  54.16 
 
 		 401 aa  325  1e-87  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1702  secretion protein HlyD  48.52 
 
 		 398 aa  301  2e-80  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.16483  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2062  efflux transporter, RND family, MFP subunit  45.52 
 
 		 419 aa  277  3e-73  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0208015  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1011  RND family efflux transporter MFP subunit  45.13 
 
 		 402 aa  270  2.9999999999999997e-71  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1581  secretion protein HlyD  50.38 
 
 		 396 aa  266  4e-70  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0301644  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1477  efflux transporter, RND family, MFP subunit  39.85 
 
 		 390 aa  243  6e-63  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2204  RND family efflux transporter MFP subunit  42.78 
 
 		 411 aa  241  2e-62  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0311908 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0326  efflux transporter, RND family, MFP subunit  45.68 
 
 		 438 aa  238  1e-61  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.856716 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1940  secretion protein HlyD  39.14 
 
 		 395 aa  236  5.0000000000000005e-61  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.345824  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4266  RND family efflux transporter MFP subunit  42.38 
 
 		 407 aa  235  1.0000000000000001e-60  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1419  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.44 
 
 		 387 aa  235  1.0000000000000001e-60  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.267588  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1281  efflux transporter, RND family, MFP subunit  40.62 
 
 		 387 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000959286  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3438  putative secretion protein HlyD precursor  39.78 
 
 		 399 aa  228  1e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0583205  normal  0.262777 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2304  RND family efflux transporter MFP subunit  37.4 
 
 		 396 aa  226  8e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1507  RND family efflux transporter MFP subunit  37.57 
 
 		 393 aa  225  1e-57  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.679392  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1210  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.88 
 
 		 389 aa  224  2e-57  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00968103 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1054  efflux transporter, RND family, MFP subunit  39.89 
 
 		 400 aa  224  2e-57  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.153115  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5375  HlyD family secretion protein  39.19 
 
 		 399 aa  223  3e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.288749  normal  0.0889869 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0078  putative secretion protein HlyD  38.16 
 
 		 409 aa  220  3e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.36335 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2069  HlyD family secretion protein  41.19 
 
 		 404 aa  219  7.999999999999999e-56  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.473909 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0300  RND family efflux transporter MFP subunit  43.11 
 
 		 407 aa  218  2e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1123  secretion protein HlyD  38.94 
 
 		 401 aa  209  7e-53  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.18847  normal  0.38508 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2959  RND family efflux transporter MFP subunit  45.48 
 
 		 393 aa  206  6e-52  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4499  efflux transporter, RND family, MFP subunit  38.92 
 
 		 391 aa  204  2e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.345717  normal  0.0635316 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4367  efflux transporter, RND family, MFP subunit  38.92 
 
 		 391 aa  204  2e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.122634  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2283  RND family efflux transporter MFP subunit  37.74 
 
 		 398 aa  202  9.999999999999999e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.181226  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0218  hypothetical protein  33.76 
 
 		 392 aa  196  8.000000000000001e-49  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0064  RND family efflux transporter MFP subunit  39.26 
 
 		 522 aa  192  9e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6250  RND family efflux transporter MFP subunit  38.87 
 
 		 388 aa  192  1e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5171  secretion protein HlyD  37.7 
 
 		 395 aa  188  2e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.345793  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4211  RND family efflux transporter MFP subunit  40.59 
 
 		 398 aa  184  3e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.342556  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3585  RND family efflux transporter MFP subunit  35.8 
 
 		 389 aa  175  9.999999999999999e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2843  efflux transporter, RND family, MFP subunit  42.9 
 
 		 393 aa  174  2.9999999999999996e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2658  secretion protein HlyD  48.97 
 
 		 393 aa  155  1e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.253454  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2749  efflux transporter, RND family, MFP subunit  48.47 
 
 		 393 aa  150  3e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.130988  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2872  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.72 
 
 		 387 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2082  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.9 
 
 		 416 aa  114  3e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2455  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.09 
 
 		 391 aa  114  3e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.035635  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3711  RND family efflux transporter MFP subunit  28.42 
 
 		 383 aa  104  3e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1713  multidrug resistance efflux pump-like protein  26.16 
 
 		 392 aa  102  8e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.254154  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2584  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.3 
 
 		 421 aa  96.7  7e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1147  RND family efflux transporter MFP subunit  34.36 
 
 		 395 aa  94.7  2e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3522  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.04 
 
 		 421 aa  95.1  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0549  secretion protein HlyD  31.34 
 
 		 407 aa  94  4e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2611  macrolide transporter subunit MacA  25.13 
 
 		 370 aa  93.2  7e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2696  macrolide transporter subunit MacA  25.13 
 
 		 370 aa  92.8  8e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.761507  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1597  macrolide transporter subunit MacA  25.13 
 
 		 370 aa  92.8  8e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0505  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.26 
 
 		 349 aa  93.2  8e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1281  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.02 
 
 		 357 aa  92.8  9e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.036609  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1184  secretion protein HlyD  28 
 
 		 396 aa  92.4  1e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0871  secretion protein HlyD  28.42 
 
 		 406 aa  90.1  6e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.75327  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1259  RND family efflux transporter MFP subunit  27.98 
 
 		 415 aa  90.1  7e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4678  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25 
 
 		 442 aa  89.4  9e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00314415  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1672  RND family efflux transporter MFP subunit  22.54 
 
 		 429 aa  88.2  2e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0753  secretion protein HlyD  27.51 
 
 		 370 aa  87.4  4e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2100  RND family efflux transporter MFP subunit  32.35 
 
 		 379 aa  87.4  4e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0493506  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2217  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.22 
 
 		 356 aa  87  5e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0743158  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2825  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.66 
 
 		 476 aa  87  6e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.292175  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1685  RND family efflux transporter MFP subunit  26.29 
 
 		 387 aa  86.7  7e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.261181  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2586  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.42 
 
 		 388 aa  86.3  8e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000121955  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1671  HlyD family secretion protein  26.76 
 
 		 408 aa  85.5  0.000000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1617  secretion protein HlyD  26.76 
 
 		 408 aa  85.5  0.000000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0160623  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1571  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.21 
 
 		 435 aa  85.1  0.000000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.334008  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2764  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.13 
 
 		 371 aa  84.3  0.000000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.161658  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1670  macrolide transporter subunit MacA  26.56 
 
 		 348 aa  84.7  0.000000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0775  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.6 
 
 		 479 aa  84.3  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2603  secretion protein HlyD  26.38 
 
 		 389 aa  84.3  0.000000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.22725  normal  0.133946 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00883  macrolide transporter subunit, membrane fusion protein (MFP) component  24.87 
 
 		 371 aa  83.2  0.000000000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2374  RND family efflux transporter MFP subunit  26.39 
 
 		 395 aa  83.2  0.000000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.347836 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1298  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.07 
 
 		 410 aa  83.2  0.000000000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.61066  normal  0.83964 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00889  hypothetical protein  24.87 
 
 		 371 aa  83.2  0.000000000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1940  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.26 
 
 		 377 aa  82.8  0.000000000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.69897  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0927  macrolide efflux protein MacA  27 
 
 		 399 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2186  macrolide efflux protein MacA  26.93 
 
 		 428 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0951  macrolide transporter subunit MacA  24.87 
 
 		 371 aa  82.8  0.00000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0557503  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0836  macrolide efflux protein MacA  26.93 
 
 		 435 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0404665  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1791  macrolide efflux protein MacA  25.68 
 
 		 420 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1908  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.46 
 
 		 407 aa  82.4  0.00000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0982  macrolide transporter subunit MacA  24.87 
 
 		 371 aa  82.8  0.00000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.44834  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4563  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.74 
 
 		 426 aa  82.8  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2456  hypothetical protein  26.6 
 
 		 431 aa  82.4  0.00000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2718  macrolide transporter subunit MacA  24.87 
 
 		 371 aa  82.8  0.00000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2451  macrolide transporter subunit MacA  24.87 
 
 		 371 aa  82.8  0.00000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00913289  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1039  macrolide transporter subunit MacA  24.87 
 
 		 371 aa  81.6  0.00000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.184306  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1863  RND family efflux transporter MFP subunit  25.32 
 
 		 393 aa  81.6  0.00000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1550  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.93 
 
 		 413 aa  80.5  0.00000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0505882  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1504  RND family efflux transporter MFP subunit  31.1 
 
 		 397 aa  80.9  0.00000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0583737 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1389  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.21 
 
 		 374 aa  80.5  0.00000000000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000158934  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3461  secretion protein HlyD  26.52 
 
 		 384 aa  80.1  0.00000000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2282  macrolide transporter subunit MacA  24.6 
 
 		 371 aa  80.1  0.00000000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000339116  normal  0.0134871 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1970  secretion protein HlyD  26.63 
 
 		 390 aa  79.7  0.00000000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0699832  normal  0.38447 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0463  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.49 
 
 		 414 aa  79  0.0000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1857  secretion protein HlyD  24.05 
 
 		 390 aa  79  0.0000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.779454 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1101  RND family efflux transporter MFP subunit  25.63 
 
 		 414 aa  79.3  0.0000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.402678  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2543  secretion protein HlyD  25.82 
 
 		 471 aa  78.2  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.467529  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2837  RND family efflux transporter MFP subunit  28.31 
 
 		 406 aa  78.2  0.0000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0025637 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1047  RND family efflux transporter subunit MFP  24.4 
 
 		 461 aa  78.6  0.0000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0423833  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1462  RND family efflux transporter MFP subunit  26.79 
 
 		 418 aa  78.6  0.0000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>