More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_2500 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_3084  amino acid permease-associated region  87.57 
 
 		 506 aa  907    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.150726  normal  0.347515 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2500  amino acid permease-associated region  100 
 
 		 521 aa  1042    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0303184  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2463  amino acid permease-associated region  98.46 
 
 		 521 aa  1028    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.143129  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2508  amino acid permease-associated region  98.46 
 
 		 521 aa  1028    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.522988 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3688  amino acid permease-associated region  59.92 
 
 		 538 aa  583  1.0000000000000001e-165  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3724  amino acid permease-associated region  58.66 
 
 		 562 aa  548  1e-154  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1591  permease, urea carboxylase system  48.72 
 
 		 513 aa  408  1.0000000000000001e-112  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.457317  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3666  amino acid permease-associated region  48.58 
 
 		 503 aa  398  1e-109  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3891  permease, urea carboxylase system  46.53 
 
 		 519 aa  362  9e-99  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.920286  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0901  amino acid permease-associated region  42.72 
 
 		 531 aa  347  4e-94  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00797467 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3725  amino acid permease-associated region  43.75 
 
 		 549 aa  345  1e-93  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.747367  normal  0.414333 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1845  amino acid permease-associated region  31.21 
 
 		 505 aa  223  9e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.19393  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1043  amino acid permease-associated region  31 
 
 		 494 aa  215  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.490599 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1734  amino acid permease-associated region  31.32 
 
 		 506 aa  206  1e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2000  amino acid permease-associated region  30.41 
 
 		 547 aa  192  1e-47  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0734041  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7845  Amino acid transporter-like protein  30.42 
 
 		 527 aa  181  4e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.162631  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3379  amino acid permease-associated region  28.36 
 
 		 505 aa  179  2e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.367289  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2300  amino acid permease-associated region  30.14 
 
 		 486 aa  176  9.999999999999999e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.83831  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2253  amino acid permease-associated region  30.14 
 
 		 486 aa  176  9.999999999999999e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.217736  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2292  amino acid permease-associated region  30.14 
 
 		 486 aa  176  9.999999999999999e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49570  amino acid permease  29.49 
 
 		 496 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.87664  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3537  amino acid permease-associated region  30.16 
 
 		 499 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.433323 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3532  amino acid permease-associated region  29.96 
 
 		 499 aa  171  2e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.36606  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3605  amino acid permease-associated region  29.96 
 
 		 539 aa  172  2e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.51831  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2651  amino acid permease-associated region  30.56 
 
 		 496 aa  171  3e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4043  amino acid permease-associated region  29.81 
 
 		 510 aa  170  5e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.844499 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4517  amino acid permease-associated region  28.6 
 
 		 502 aa  170  5e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.844231  normal  0.657499 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3928  amino acid permease-associated region  28.82 
 
 		 492 aa  168  2e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.183878  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5375  amino acid permease-associated region  28.42 
 
 		 483 aa  157  6e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5286  amino acid permease-associated region  28.42 
 
 		 483 aa  157  6e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5665  amino acid permease-associated region  28.63 
 
 		 487 aa  155  1e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.562505  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3296  hypothetical protein  28.94 
 
 		 519 aa  153  5.9999999999999996e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.171098 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3846  amino acid permease-associated region  25.56 
 
 		 497 aa  148  3e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.296689  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0043  amino acid permease-associated region  27.7 
 
 		 483 aa  145  1e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.979083  normal  0.243492 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1853  amino acid permease-associated region  27.8 
 
 		 528 aa  145  2e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.133441  normal  0.907353 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0796  amino acid permease family protein  26.63 
 
 		 521 aa  145  2e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0800  amino acid permease-associated region  28.63 
 
 		 483 aa  141  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.55518  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2589  amino acid permease-associated region  29.35 
 
 		 527 aa  139  1e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.729584  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0940  amino acid permease-associated region  25.84 
 
 		 504 aa  139  2e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2277  amino acid permease-associated region  28.1 
 
 		 522 aa  132  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.308026 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5923  amino acid permease-associated region  28.87 
 
 		 514 aa  130  7.000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.123062 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2131  amino acid permease-associated region  22.95 
 
 		 515 aa  123  6e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.702859 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3364  amino acid permease-associated region  26.29 
 
 		 510 aa  123  8e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2894  amino acid permease-associated region  24.6 
 
 		 543 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2946  Amino acid permease protein  24.01 
 
 		 523 aa  122  1.9999999999999998e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5201  amino acid permease-associated region  26.29 
 
 		 530 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.165021  normal  0.85496 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7231  amino acid permease-associated region  25.6 
 
 		 514 aa  121  3.9999999999999996e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.331409  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2753  amino acid transporter  25.99 
 
 		 510 aa  121  3.9999999999999996e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2634  amino acid permease-associated region  24.75 
 
 		 520 aa  119  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0482773  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2391  amino acid permease-associated region  30.11 
 
 		 516 aa  117  5e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.407177  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC06480  hypothetical protein  24.07 
 
 		 526 aa  113  1.0000000000000001e-23  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.559132  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01061  GABA transporter (Eurofung)  25.58 
 
 		 530 aa  110  4.0000000000000004e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0276029  normal  0.0879466 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1845  amino acid permease-associated region  26.99 
 
 		 522 aa  105  3e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.689083  normal  0.664447 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_41155  predicted protein  24.63 
 
 		 539 aa  102  1e-20  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.745721  normal  0.0472974 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02043  GABA transporter, putative (Eurofung)  23.76 
 
 		 507 aa  99  2e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2042  phospholipid binding protein  30.15 
 
 		 525 aa  98.6  2e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL05010  GabA permease, putative  24.76 
 
 		 518 aa  95.5  2e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08726  GABA transporter (Eurofung)  23.76 
 
 		 514 aa  94.4  5e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.538203 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03345  GABA transporter, putative (Eurofung)  23.92 
 
 		 532 aa  92  2e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.505774  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08990  GABA transporter, putative (Eurofung)  23.35 
 
 		 542 aa  92.4  2e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00206587  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2756  amino acid permease-associated region  28.26 
 
 		 497 aa  91.3  3e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00077559 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2080  amino acid permease-associated region  28.65 
 
 		 447 aa  90.9  5e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.88578  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_41725  predicted protein  24.07 
 
 		 571 aa  90.9  5e-17  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.817066  hitchhiker  0.00692909 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0779  amino acid permease family protein  26.38 
 
 		 467 aa  90.1  8e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0818  amino acid permease family protein  26.38 
 
 		 467 aa  90.1  8e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0872  amino acid permease family protein  26.23 
 
 		 467 aa  90.1  9e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4463  amino acid permease family protein  25.83 
 
 		 467 aa  89.4  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.821822 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0714  amino acid permease  26.04 
 
 		 467 aa  88.6  3e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL06000  GabA permease, putative  23.35 
 
 		 547 aa  88.2  3e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.423661  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0413  amino acid permease-associated region  25.57 
 
 		 454 aa  87.8  4e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0914  amino acid permease family protein  25.83 
 
 		 467 aa  87.8  4e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.43784e-41 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2164  amino acid permease-associated region  27.83 
 
 		 455 aa  87.4  5e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0983  amino acid permease family protein  26.02 
 
 		 467 aa  87.8  5e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12343  cationic amino acid transport integral membrane protein rocE  28.12 
 
 		 471 aa  86.7  9e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0728  amino acid permease  26.02 
 
 		 467 aa  86.3  0.000000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0060  amino acid permease-associated region  27.84 
 
 		 440 aa  86.7  0.000000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0909  amino acid permease family protein  25.82 
 
 		 467 aa  85.9  0.000000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0728  amino acid permease-associated region  27.38 
 
 		 467 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1589  amino acid permease-associated region  28.17 
 
 		 539 aa  85.1  0.000000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.984032  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2384  amino acid permease-associated region  26.49 
 
 		 518 aa  84.7  0.000000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.402999 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2442  amino acid permease-associated region  27.57 
 
 		 468 aa  84  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3056  amino acid permease-associated region  27.57 
 
 		 468 aa  84  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.738455  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3054  amino acid permease-associated region  26.79 
 
 		 506 aa  84  0.000000000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.479156  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7480  amino acid permease-associated region  28.12 
 
 		 454 aa  83.6  0.000000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006687  CNE01030  choline transporter, putative  27.41 
 
 		 576 aa  84  0.000000000000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3075  amino acid permease-associated region  27.57 
 
 		 468 aa  83.2  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3101  amino acid permease-associated region  27.72 
 
 		 466 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.29025  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2967  amino acid permease-associated region  27.63 
 
 		 466 aa  81.6  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.799342  normal  0.23719 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10972  choline transport protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G15150)  23.44 
 
 		 516 aa  81.6  0.00000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.815116 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0272  amino acid permease-associated region  28.73 
 
 		 478 aa  82  0.00000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.656438  normal  0.846723 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0263  amino acid permease  29.17 
 
 		 471 aa  81.6  0.00000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000358452  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA05590  amino acid/metabolite permease, putative  22.56 
 
 		 764 aa  81.6  0.00000000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0277  amino acid transporter, cationic amino acid transporter (CAT) family  28.69 
 
 		 471 aa  82  0.00000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000621788  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6404  amino acid tranporter  27.54 
 
 		 468 aa  81.6  0.00000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.307303 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0207  amino acid permease-associated region  28.93 
 
 		 469 aa  81.6  0.00000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3053  amino acid permease-associated region  27.85 
 
 		 466 aa  81.3  0.00000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3790  amino acid permease-associated region  25.74 
 
 		 491 aa  80.9  0.00000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.198748  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0721  amino acid permease family protein  26.45 
 
 		 471 aa  80.1  0.00000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0258  amino acid permease  28.15 
 
 		 471 aa  80.1  0.00000000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000104623  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5067  amino acid permease  28.15 
 
 		 471 aa  80.1  0.00000000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000115655  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>