More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_0925 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_0925  histidine kinase  100 
 
 
341 aa  697    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0213393  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2200  histidine kinase  41.21 
 
 
299 aa  158  1e-37  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1339  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.94 
 
 
931 aa  150  4e-35  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1981  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.6 
 
 
651 aa  144  2e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1520  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.5 
 
 
439 aa  139  6e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.622382  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1250  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.87 
 
 
559 aa  139  7e-32  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1502  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.59 
 
 
783 aa  137  2e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0445794 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0053  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.68 
 
 
968 aa  136  5e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1525  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.18 
 
 
813 aa  135  9.999999999999999e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0266  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.1 
 
 
736 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0015  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  35.58 
 
 
347 aa  132  6.999999999999999e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.84393  normal  0.0442191 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1739  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.8 
 
 
841 aa  130  3e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.165697  normal  0.509542 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0309  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.86 
 
 
657 aa  130  3e-29  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1962  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.59 
 
 
603 aa  129  6e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1048  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.84 
 
 
931 aa  129  7.000000000000001e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.339388  normal  0.130033 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1231  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.18 
 
 
366 aa  128  1.0000000000000001e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0108298  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2554  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.84 
 
 
844 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1482  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.84 
 
 
656 aa  124  3e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.548294  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1167  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.4 
 
 
544 aa  124  3e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.230477  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0715  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.82 
 
 
644 aa  123  4e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0932  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.93 
 
 
753 aa  122  6e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.20268 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1433  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.29 
 
 
974 aa  122  6e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.717996  normal  0.840517 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0058  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.27 
 
 
581 aa  122  7e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1481  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.5 
 
 
1425 aa  122  8e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1647  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.1 
 
 
638 aa  122  8e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.211834  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1520  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.71 
 
 
1325 aa  122  9.999999999999999e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.120961 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1121  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.07 
 
 
1513 aa  122  9.999999999999999e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0274  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.99 
 
 
472 aa  121  1.9999999999999998e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.836728  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0545  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.78 
 
 
896 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.91043  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1070  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.33 
 
 
1426 aa  120  3e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.632131  normal  0.158919 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1755  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.63 
 
 
781 aa  120  3e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1847  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.6 
 
 
763 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.926751  normal  0.806541 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1933  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35 
 
 
589 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0700  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.94 
 
 
569 aa  119  4.9999999999999996e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.176462  normal  0.11002 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2477  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.68 
 
 
1439 aa  120  4.9999999999999996e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.131363  normal  0.44536 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1112  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.18 
 
 
493 aa  120  4.9999999999999996e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.607083 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0157  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.84 
 
 
478 aa  119  6e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.260977 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1242  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.62 
 
 
472 aa  119  9e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.41521  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1104  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.78 
 
 
569 aa  119  9e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.53532  normal  0.324425 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0358  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.38 
 
 
571 aa  118  9.999999999999999e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.213349  normal  0.100259 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0161  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.85 
 
 
1039 aa  119  9.999999999999999e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2366  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.33 
 
 
901 aa  118  9.999999999999999e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.180969  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1919  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.28 
 
 
862 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.592004  normal  0.385421 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2672  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.79 
 
 
619 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1208  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.18 
 
 
619 aa  117  3e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0242207  normal  0.0474084 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1353  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.85 
 
 
1078 aa  117  3e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0325  histidine kinase  36.63 
 
 
185 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.28293 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1244  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37 
 
 
813 aa  117  3.9999999999999997e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2965  histidine kinase  32.38 
 
 
350 aa  115  8.999999999999998e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1687  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.83 
 
 
404 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0708821  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0170  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.17 
 
 
603 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.651305 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1307  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.63 
 
 
1225 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.551936  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1055  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.93 
 
 
639 aa  114  3e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.345165 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0339  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.78 
 
 
771 aa  114  3e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.84298 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1943  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32 
 
 
596 aa  113  5e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0549  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.99 
 
 
765 aa  112  6e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0877  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.5 
 
 
1050 aa  113  6e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.948624  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1687  signal-transducing histidine kinase  31.86 
 
 
565 aa  112  8.000000000000001e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.10306  normal  0.175724 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1649  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  33.04 
 
 
550 aa  112  8.000000000000001e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.181327  normal  0.670777 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1420  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.64 
 
 
1121 aa  112  9e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0817518  normal  0.492636 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0493  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  34.8 
 
 
440 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.274957  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2259  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.75 
 
 
593 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0935  histidine kinase  32.02 
 
 
379 aa  111  1.0000000000000001e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.957792  normal  0.0100677 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1309  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.45 
 
 
472 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.974547  normal  0.0144544 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1415  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.33 
 
 
2072 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.384608  normal  0.53452 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2719  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.17 
 
 
586 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.000000435656  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0295  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.46 
 
 
655 aa  111  2.0000000000000002e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2258  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.49 
 
 
566 aa  110  3e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.866363 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1514  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.92 
 
 
1253 aa  110  3e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.841858  normal  0.0475592 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0640  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.77 
 
 
890 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0271774 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1199  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.97 
 
 
968 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0569956 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1349  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.86 
 
 
1111 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.444762  normal  0.501062 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2213  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.04 
 
 
1069 aa  109  5e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.273979 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2693  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.82 
 
 
727 aa  110  5e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0252521 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0331  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.83 
 
 
608 aa  109  6e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2038  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  33.49 
 
 
524 aa  109  7.000000000000001e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.032498  normal  0.0495143 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1352  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.83 
 
 
732 aa  109  8.000000000000001e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.161755  normal  0.747327 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1234  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
552 aa  108  1e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.397898  normal  0.016153 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1350  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.56 
 
 
1758 aa  108  1e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.669381 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0459  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.56 
 
 
1301 aa  108  1e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.012558 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2061  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  32.84 
 
 
600 aa  107  2e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.658977 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1287  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.86 
 
 
935 aa  107  2e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0339259  normal  0.305866 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1417  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.62 
 
 
1055 aa  108  2e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0587691  normal  0.569805 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3167  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.67 
 
 
678 aa  107  2e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0872  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.83 
 
 
500 aa  108  2e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.3427  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1347  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.85 
 
 
638 aa  107  2e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.679676  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2110  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.67 
 
 
789 aa  107  2e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.377648  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1172  histidine kinase  32.24 
 
 
288 aa  107  3e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0237  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  32.04 
 
 
440 aa  107  3e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1140  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.84 
 
 
563 aa  107  4e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0338  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
653 aa  107  4e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.84298 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0292  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.02 
 
 
530 aa  105  8e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0986  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  31.88 
 
 
433 aa  105  1e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0645349  normal  0.624976 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1354  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31 
 
 
1276 aa  105  2e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.530457  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1463  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.65 
 
 
768 aa  103  3e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.103172  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2107  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.21 
 
 
660 aa  103  4e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1419  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35 
 
 
769 aa  103  5e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0849788  normal  0.753623 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2385  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.99 
 
 
720 aa  103  5e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.788418 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0640  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.58 
 
 
886 aa  103  6e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.257142  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0402  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
766 aa  103  6e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.371468  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>