More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_1428 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_31970  lysyl-tRNA synthetase (class II)  67 
 
 		 510 aa  662    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2977  lysyl-tRNA synthetase  64.72 
 
 		 504 aa  659    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.120285  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0576  lysyl-tRNA synthetase  70.22 
 
 		 500 aa  697    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.1487  normal  0.0696554 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4277  lysyl-tRNA synthetase  65.72 
 
 		 502 aa  644    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.654573 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1428  lysyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 501 aa  1015    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.680622  normal  0.318104 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5144  lysyl-tRNA synthetase  87.6 
 
 		 512 aa  900    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4758  lysyl-tRNA synthetase  87.8 
 
 		 512 aa  901    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.38099  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4000  lysyl-tRNA synthetase  74.7 
 
 		 507 aa  753    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0329  lysyl-tRNA synthetase  68.89 
 
 		 503 aa  699    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0855  lysyl-tRNA synthetase  66 
 
 		 504 aa  654    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4844  lysyl-tRNA synthetase  87.8 
 
 		 512 aa  901    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.722103  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5360  lysyl-tRNA synthetase  91.42 
 
 		 509 aa  937    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.370612  normal  0.216522 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0641  lysyl-tRNA synthetase  65.52 
 
 		 495 aa  648    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.15563 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4711  lysyl-tRNA synthetase  65.11 
 
 		 502 aa  643    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.243441  hitchhiker  0.000510854 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13631  lysyl-tRNA synthetase  79.8 
 
 		 505 aa  798    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.57395e-59  normal  0.0200312 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2092  lysyl-tRNA synthetase  64.48 
 
 		 515 aa  632  1e-180  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0637  lysyl-tRNA synthetase  64.98 
 
 		 528 aa  631  1e-180  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6309  lysyl-tRNA synthetase  62.45 
 
 		 501 aa  629  1e-179  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12890  lysyl-tRNA synthetase (class II)  63.19 
 
 		 502 aa  629  1e-179  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0133257  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0720  lysyl-tRNA synthetase  64.11 
 
 		 503 aa  623  1e-177  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.574509  normal  0.145533 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0393  lysine--tRNA ligase  59.15 
 
 		 565 aa  592  1e-168  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1777  lysyl-tRNA synthetase  58.79 
 
 		 560 aa  581  1e-164  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0105014  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2881  lysyl-tRNA synthetase  60.57 
 
 		 496 aa  575  1.0000000000000001e-163  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.075021  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4987  lysyl-tRNA synthetase  59.72 
 
 		 500 aa  572  1.0000000000000001e-162  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.771259  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16450  lysyl-tRNA synthetase  59.11 
 
 		 499 aa  558  1e-158  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4482  lysyl-tRNA synthetase  60.37 
 
 		 499 aa  557  1e-157  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4347  lysyl-tRNA synthetase  58.95 
 
 		 516 aa  555  1e-157  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3422  lysyl-tRNA synthetase  59.15 
 
 		 499 aa  551  1e-155  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.316072  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0329  lysyl-tRNA synthetase  57.17 
 
 		 512 aa  537  1e-151  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9155  lysyl-tRNA synthetase  58.13 
 
 		 500 aa  538  1e-151  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.256999  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0165  lysyl-tRNA synthetase  56.36 
 
 		 510 aa  533  1e-150  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01510  lysyl-tRNA synthetase  56.94 
 
 		 504 aa  530  1e-149  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8377  lysyl-tRNA synthetase  55.4 
 
 		 506 aa  531  1e-149  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0216  lysyl-tRNA synthetase  54.91 
 
 		 501 aa  518  1e-146  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.404886  normal  0.127983 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24660  lysyl-tRNA synthetase  54.17 
 
 		 520 aa  511  1e-143  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3970  lysyl-tRNA synthetase  54.22 
 
 		 1113 aa  499  1e-140  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0906  lysyl-tRNA synthetase  52.87 
 
 		 1094 aa  466  9.999999999999999e-131  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.527316  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0064  lysyl-tRNA synthetase  49.69 
 
 		 1100 aa  447  1.0000000000000001e-124  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.9544  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2661  Lysyl-tRNA synthetase (class II)-like protein  50.72 
 
 		 1098 aa  448  1.0000000000000001e-124  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0688281  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2983  lysyl-tRNA synthetase  48.1 
 
 		 1112 aa  424  1e-117  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3027  lysyl-tRNA synthetase  48.1 
 
 		 1112 aa  424  1e-117  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2998  lysyl-tRNA synthetase  48.1 
 
 		 1111 aa  422  1e-117  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.604901  normal  0.107077 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1737  lysyl-tRNA synthetase  47.15 
 
 		 1120 aa  414  1e-114  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0127  lysyl-tRNA synthetase  48.58 
 
 		 1138 aa  414  1e-114  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3544  lysyl-tRNA synthetase  46.79 
 
 		 1101 aa  409  1e-113  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.899884 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3330  lysyl-tRNA synthetase  48.07 
 
 		 1100 aa  411  1e-113  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.27282  normal  0.711465 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0345  lysyl-tRNA synthetase  44.16 
 
 		 573 aa  404  1e-111  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0856  lysyl-tRNA synthetase  44.55 
 
 		 573 aa  402  1e-111  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0883  lysyl-tRNA synthetase  44.55 
 
 		 573 aa  398  1e-109  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.158887  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00750  Lysyl-tRNA synthetase  43.09 
 
 		 491 aa  396  1e-109  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000253681  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19490  lysyl-tRNA synthetase (class II)  43.86 
 
 		 499 aa  397  1e-109  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00347128  unclonable  0.00000000087404 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0078  lysyl-tRNA synthetase  42.94 
 
 		 494 aa  397  1e-109  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.312229  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1647  lysyl-tRNA synthetase  45.16 
 
 		 489 aa  393  1e-108  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11657  lysyl-tRNA synthetase  45.62 
 
 		 1172 aa  393  1e-108  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.73947 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0175  lysyl-tRNA synthetase  41.87 
 
 		 510 aa  394  1e-108  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000127982  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11780  lysyl-tRNA synthetase (class II)  46.75 
 
 		 1147 aa  393  1e-108  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.105343  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2238  lysyl-tRNA synthetase  44.01 
 
 		 647 aa  390  1e-107  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000093194  normal  0.362438 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6390  lysyl-tRNA synthetase  43.08 
 
 		 583 aa  389  1e-107  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.163114  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0163  lysyl-tRNA synthetase  44.31 
 
 		 488 aa  390  1e-107  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000142799  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2415  lysyl-tRNA synthetase  45.51 
 
 		 504 aa  392  1e-107  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0221722 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0659  lysyl-tRNA synthetase  43.43 
 
 		 497 aa  391  1e-107  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000863751  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0384  lysyl-tRNA synthetase  42.94 
 
 		 509 aa  385  1e-106  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.808438  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2781  lysyl-tRNA synthetase  42.57 
 
 		 501 aa  388  1e-106  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2467  lysyl-tRNA synthetase  42.37 
 
 		 501 aa  387  1e-106  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0075  lysyl-tRNA synthetase  41.85 
 
 		 494 aa  388  1e-106  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0156  lysyl-tRNA synthetase  40.24 
 
 		 495 aa  383  1e-105  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.033113  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1357  lysyl-tRNA synthetase  44.31 
 
 		 501 aa  382  1e-105  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1883  lysyl-tRNA synthetase  45.02 
 
 		 508 aa  383  1e-105  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2271  lysyl-tRNA synthetase  42.97 
 
 		 491 aa  380  1e-104  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0968  lysyl-tRNA synthetase  43.03 
 
 		 515 aa  380  1e-104  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.685874 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0116  lysyl-tRNA synthetase  41.48 
 
 		 493 aa  381  1e-104  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0354257  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2515  lysyl-tRNA synthetase  46.37 
 
 		 1118 aa  381  1e-104  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.889838  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0251  lysyl-tRNA synthetase  41.32 
 
 		 499 aa  381  1e-104  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000260184  normal  0.314985 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3111  lysyl-tRNA synthetase  43.52 
 
 		 508 aa  376  1e-103  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0398  lysyl-tRNA synthetase  44.38 
 
 		 506 aa  378  1e-103  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.575675  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1700  lysyl-tRNA synthetase  43.52 
 
 		 508 aa  376  1e-103  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.816716  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1480  lysyl-tRNA synthetase  43.52 
 
 		 508 aa  376  1e-103  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1667  lysyl-tRNA synthetase  42.89 
 
 		 515 aa  378  1e-103  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.208313  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2591  lysyl-tRNA synthetase  43.52 
 
 		 508 aa  376  1e-103  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2723  lysyl-tRNA synthetase  43.52 
 
 		 508 aa  376  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1733  lysyl-tRNA synthetase  42.18 
 
 		 511 aa  375  1e-103  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1601  lysyl-tRNA synthetase  44.32 
 
 		 577 aa  375  1e-103  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000097302  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0152  lysyl-tRNA synthetase  44.83 
 
 		 489 aa  377  1e-103  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000016249  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0810  lysyl-tRNA synthetase  40.32 
 
 		 499 aa  376  1e-103  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000714975  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2645  lysyl-tRNA synthetase  43.52 
 
 		 508 aa  376  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.929733  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1450  lysyl-tRNA synthetase  43.19 
 
 		 512 aa  376  1e-103  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.499845 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1032  lysyl-tRNA synthetase  42.6 
 
 		 501 aa  375  1e-103  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.565305  normal  0.238368 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2207  lysyl-tRNA synthetase  43.52 
 
 		 508 aa  376  1e-103  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0457  lysyl-tRNA synthetase  44.38 
 
 		 506 aa  377  1e-103  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1152  lysyl-tRNA synthetase  44.6 
 
 		 508 aa  375  1e-102  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.562013  normal  0.115463 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0553  lysyl-tRNA synthetase  40.44 
 
 		 515 aa  372  1e-102  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0116888  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0072  lysyl-tRNA synthetase  40.04 
 
 		 499 aa  374  1e-102  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.407963  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3384  lysyl-tRNA synthetase  42.33 
 
 		 502 aa  372  1e-102  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3150  lysyl-tRNA synthetase  43.27 
 
 		 561 aa  374  1e-102  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000153086  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5424  lysyl-tRNA synthetase  43.58 
 
 		 524 aa  374  1e-102  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1365  lysyl-tRNA synthetase  41.58 
 
 		 532 aa  374  1e-102  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.040149  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0539  lysyl-tRNA synthetase  40.44 
 
 		 515 aa  372  1e-102  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00455686  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13230  lysyl-tRNA synthetase (class II)  42.48 
 
 		 771 aa  375  1e-102  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0295969  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2136  lysyl-tRNA synthetase  42.75 
 
 		 508 aa  369  1e-101  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.251549 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5959  lysyl-tRNA synthetase  42.75 
 
 		 508 aa  369  1e-101  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>