84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_0248 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_0248  Na+/solute symporter  100 
 
 
500 aa  975    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30460  Na+/proline symporter  24.78 
 
 
554 aa  137  5e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0720305  normal  0.147602 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1604  Na+/solute symporter  24.64 
 
 
556 aa  135  1.9999999999999998e-30  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0772243 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01880  Na+/proline symporter  24.76 
 
 
587 aa  119  1.9999999999999998e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07373  solute symporter family transporter (AFU_orthologue; AFUA_6G03200)  23.84 
 
 
699 aa  103  6e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_20424  urea transporter  23.42 
 
 
704 aa  99.4  1e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.333459  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119678  predicted protein  23.65 
 
 
709 aa  98.2  3e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_29213  urea transport protein  22.64 
 
 
668 aa  97.8  4e-19  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0581449 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0182  Na+/solute symporter  25.17 
 
 
478 aa  96.7  9e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07557  conserved hypothetical protein  25.59 
 
 
692 aa  96.7  1e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.314115  hitchhiker  0.00246133 
 
 
-
 
NC_006686  CND00530  urea transporter, putative  22.37 
 
 
674 aa  95.5  2e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.45321  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1796  Na+/solute symporter  27.19 
 
 
483 aa  95.1  2e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000417622  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_55023  urea permease  23.2 
 
 
659 aa  93.2  1e-17  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.410596  normal 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_768  predicted protein  24.18 
 
 
643 aa  90.5  6e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.530084  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02598  urea active transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G17570)  22.4 
 
 
680 aa  89.4  1e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.811341 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0029  Na+/solute symporter  25.16 
 
 
488 aa  89  2e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.080483 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00418  urea transporter (Dur3), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G04870)  25.22 
 
 
693 aa  87  7e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.798545 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1786  Na+/solute symporter  25.32 
 
 
483 aa  83.6  0.000000000000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.483787  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_52351  urea active transport protein  23.73 
 
 
724 aa  81.6  0.00000000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0516586  normal  0.828998 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2753  Na+/solute symporter  23.94 
 
 
472 aa  80.5  0.00000000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0779  Na+/solute symporter  23.28 
 
 
482 aa  79.7  0.0000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_49064  urea transport protein  21.61 
 
 
679 aa  75.9  0.000000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.427526  normal  0.0261396 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2263  sodium/solute transporter family urea transporter  20.67 
 
 
474 aa  74.3  0.000000000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57505  urea transport protein  19.84 
 
 
668 aa  73.6  0.000000000009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.20443  normal  0.667471 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1268  putative sodium:solute symport protein  24.26 
 
 
474 aa  72.8  0.00000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2635  sodium/solute transporter family urea transporter  22.52 
 
 
476 aa  71.6  0.00000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.451328 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3406  Na+/solute symporter  23.49 
 
 
461 aa  71.2  0.00000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.183888  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4529  Na+/solute symporter  24.55 
 
 
525 aa  68.2  0.0000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0964  Na+/solute symporter  25.18 
 
 
508 aa  67.8  0.0000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0846  Na+/solute symporter  25.06 
 
 
507 aa  66.2  0.000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5240  Na+/solute symporter  23.7 
 
 
460 aa  65.9  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1952  Na+/solute symporter  23.1 
 
 
638 aa  65.9  0.000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0686  Na+/solute symporter  24.26 
 
 
507 aa  64.7  0.000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.663287  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_32520  Urea active transport protein  22.77 
 
 
658 aa  62  0.00000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2570  Na+/solute symporter  22.36 
 
 
464 aa  60.1  0.00000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000435173  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1264  sodium:proline symporter (proline permease)  23.02 
 
 
639 aa  58.9  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1859  SSS sodium solute transporter superfamily  23.6 
 
 
551 aa  58.9  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0355  Na+/solute symporter  26.72 
 
 
492 aa  57  0.0000007  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1057  Na+/solute symporter  23.31 
 
 
476 aa  56.6  0.000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.216268  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0864  hypothetical protein  21.92 
 
 
524 aa  56.2  0.000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.983965  normal  0.0488094 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0436  Na+/solute symporter  24.1 
 
 
478 aa  55.5  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3448  Na+/solute symporter  26.43 
 
 
495 aa  54.7  0.000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3347  putative osmoregulated proline transporter  23.03 
 
 
486 aa  54.7  0.000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0463  sodium/solute symporter transmembrane protein  23.57 
 
 
479 aa  53.9  0.000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0353  Na+/solute symporter  23.08 
 
 
479 aa  52.8  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.606466  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4818  Na+/solute symporter  25.56 
 
 
501 aa  52  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1454  Na+/solute symporter  23.46 
 
 
459 aa  52.4  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0563954  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5457  Na+/solute symporter  22.56 
 
 
482 aa  52  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.692749  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2048  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  26.84 
 
 
550 aa  52  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4125  Na+/solute symporter  23.4 
 
 
479 aa  51.6  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0765871  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3985  SSS sodium solute transporter superfamily  24.54 
 
 
527 aa  51.6  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000000567258  normal  0.756619 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5121  Na+/solute symporter  25.75 
 
 
462 aa  50.8  0.00005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0378  sodium:solute symporter  28.57 
 
 
461 aa  51.2  0.00005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0924  twin-arginine translocation pathway signal  23.43 
 
 
452 aa  50.4  0.00007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.839391  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0672  Na+/solute symporter  22.82 
 
 
633 aa  50.1  0.00008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0882  Na+/solute symporter  22.32 
 
 
500 aa  50.4  0.00008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.984718  normal  0.413071 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0122  Na+/solute symporter  21.02 
 
 
449 aa  50.1  0.00009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00309864  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0375  Na+/solute symporter  23.56 
 
 
478 aa  50.1  0.00009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.197469 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0800  Na+/solute symporter  23.78 
 
 
483 aa  50.1  0.0001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4155  Na+/solute symporter  22.65 
 
 
515 aa  49.7  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.128874  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03760  putative sodium:solute symporter  28.57 
 
 
461 aa  50.1  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.188515  normal  0.0159939 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0871  Na+/solute symporter  22.82 
 
 
482 aa  49.3  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.857902  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1620  Na+/solute symporter  24.4 
 
 
460 aa  48.5  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0163738 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0575  Na+/solute symporter  25.43 
 
 
479 aa  48.1  0.0003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.00000227559  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0324  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  23.13 
 
 
567 aa  47.8  0.0005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.549745 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4843  SSS sodium solute transporter superfamily  23.79 
 
 
544 aa  47.8  0.0005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2949  Na+/solute symporter  23.57 
 
 
500 aa  47  0.0007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0128221  hitchhiker  0.000189844 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1961  sodium/proline symporter  24.07 
 
 
482 aa  47  0.0007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0044995 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0422  Na+/solute symporter  25.1 
 
 
476 aa  47  0.0008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.273483  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2774  SSS sodium solute transporter superfamily  21.69 
 
 
529 aa  46.2  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00224729  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2204  SSS sodium solute transporter superfamily  22.94 
 
 
537 aa  46.2  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.814033  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1387  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  25 
 
 
565 aa  46.6  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.108494  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00590  Sodium:solute symporter  22.35 
 
 
460 aa  45.4  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000000130807  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0718  Na+/solute symporter  21.93 
 
 
486 aa  45.8  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2177  sodium/proline symporter  21.76 
 
 
482 aa  45.8  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000107736  normal  0.0804917 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0338  Na+/solute symporter  22.86 
 
 
479 aa  45.1  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2541  sodium/pantothenate symporter  21.25 
 
 
487 aa  45.1  0.003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000222476  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0190  Na+/solute symporter  21.53 
 
 
471 aa  45.1  0.003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0470055  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1619  sodium/proline symporter  23.15 
 
 
483 aa  44.7  0.004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000146301  decreased coverage  0.00000122936 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46110  putative sodium:solute symport protein  21.9 
 
 
463 aa  44.7  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0497302  normal  0.205453 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04330  Na+/proline symporter  26.09 
 
 
497 aa  44.3  0.006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.723621  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3921  sodium:solute symport protein  21.65 
 
 
463 aa  44.3  0.006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3541  Na+/solute symporter  24.05 
 
 
597 aa  43.5  0.009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.165749  normal  0.131888 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1220  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  23.2 
 
 
489 aa  43.5  0.009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>