298 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfla_2316 on replicon NC_007947
Organism: Methylobacillus flagellatus KT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007947  Mfla_2316  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  100 
 
 		 428 aa  874    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000260717  hitchhiker  0.000176219 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2607  cyclic nucleotide-binding protein  30.16 
 
 		 215 aa  71.6  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1570  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  23.55 
 
 		 424 aa  71.2  0.00000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2700  cyclic nucleotide-binding protein  30.16 
 
 		 215 aa  70.5  0.00000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00108848  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1256  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  30.16 
 
 		 215 aa  68.2  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3921  putative ribonuclease BN  26.64 
 
 		 360 aa  65.1  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00855127  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3176  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  33.09 
 
 		 225 aa  64.3  0.000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.231761 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1954  putative Crp/Fnr family transcriptional regulator  29.37 
 
 		 141 aa  63.5  0.000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1995  transcriptional regulator  31.65 
 
 		 224 aa  63.5  0.000000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3692  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  31.67 
 
 		 146 aa  63.2  0.000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0297  ribonuclease BN  22.3 
 
 		 291 aa  62.4  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.421979 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0453  YihY family protein  23.67 
 
 		 286 aa  62.8  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3395  Crp/FNR family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 225 aa  62.8  0.00000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4029  ribonuclease BN  24.26 
 
 		 316 aa  61.2  0.00000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.394592 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4230  ribonuclease BN  22.56 
 
 		 330 aa  60.8  0.00000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.375686  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4850  YihY family protein  24.6 
 
 		 288 aa  60.5  0.00000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0474  YihY family protein  24.6 
 
 		 288 aa  60.5  0.00000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3922  ribonuclease BN  23.21 
 
 		 370 aa  58.9  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.644027  normal  0.211181 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05940  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.8 
 
 		 231 aa  59.3  0.0000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.558941  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0581  ribonuclease BN  23.24 
 
 		 446 aa  59.3  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000420999  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0281  YihY family protein  22.85 
 
 		 283 aa  59.3  0.0000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0389  putative ribonuclease BN  23.29 
 
 		 289 aa  58.9  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4111  ribonuclease BN  22.41 
 
 		 290 aa  57.8  0.0000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.235548  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03771  ribonuclease BN  22.41 
 
 		 290 aa  57.8  0.0000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.841593  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4100  ribonuclease BN  22.41 
 
 		 290 aa  57.8  0.0000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2085  cyclic nucleotide binding protein  30.43 
 
 		 238 aa  57.8  0.0000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4271  ribonuclease BN  22.41 
 
 		 290 aa  57.8  0.0000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3869  putative ribonuclease BN  23.79 
 
 		 401 aa  58.2  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.124849 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4132  ribonuclease BN  22.41 
 
 		 290 aa  57.8  0.0000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4409  ribonuclease BN  22.41 
 
 		 290 aa  57.8  0.0000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5333  ribonuclease BN  22.41 
 
 		 290 aa  57.8  0.0000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.247154 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4364  ribonuclease BN  22.41 
 
 		 290 aa  57.8  0.0000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03720  hypothetical protein  22.41 
 
 		 290 aa  57.8  0.0000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.664641  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4345  ribonuclease BN  23.26 
 
 		 331 aa  57.4  0.0000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0371842  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0594  ribonuclease BN  23.02 
 
 		 446 aa  57.8  0.0000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000174757 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0272  YihY family protein  22.85 
 
 		 283 aa  57.4  0.0000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.975594  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25400  cAMP-binding protein  30.15 
 
 		 225 aa  57  0.0000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1457  ribonuclease BN  20.73 
 
 		 484 aa  56.6  0.0000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2776  putative ribonuclease BN  23.44 
 
 		 417 aa  56.6  0.0000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0523  ribonuclease BN, putative  23.29 
 
 		 289 aa  56.6  0.0000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0395  ribonuclease BN  23.29 
 
 		 289 aa  56.6  0.0000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0386  ribonuclease BN  23.29 
 
 		 289 aa  56.6  0.0000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0383  ribonuclease BN  23.29 
 
 		 289 aa  56.6  0.0000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0409  ribonuclease BN  23.29 
 
 		 289 aa  56.6  0.0000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0523  YihY family protein  23.29 
 
 		 289 aa  56.6  0.0000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3408  ribonuclease BN  23.27 
 
 		 299 aa  56.2  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0329161  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1108  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.81 
 
 		 1075 aa  55.8  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000733786  normal  0.267995 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0764  ribonuclease BN  20.88 
 
 		 452 aa  55.8  0.000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2616  cyclic nucleotide-binding protein  33.96 
 
 		 219 aa  55.1  0.000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1806  ribonuclease BN  27.12 
 
 		 292 aa  55.5  0.000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1738  ribonuclease BN  27.12 
 
 		 292 aa  55.8  0.000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.554379  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1598  hypothetical protein  28.3 
 
 		 407 aa  55.1  0.000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.303519  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2988  tRNA-processing RNAse BN  21.74 
 
 		 405 aa  55.1  0.000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0115566 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1061  Crp family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 214 aa  54.7  0.000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0336611  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2801  ribonuclease BN  20.96 
 
 		 307 aa  54.7  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.128758 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1591  ribonuclease BN  21 
 
 		 424 aa  53.9  0.000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.884253 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1421  ribonuclease BN, putative  20.74 
 
 		 392 aa  53.9  0.000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4460  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.46 
 
 		 171 aa  53.9  0.000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5809  ribonuclease BN, putative  24.31 
 
 		 321 aa  53.5  0.000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1876  ribonuclease BN  22.22 
 
 		 306 aa  53.5  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6450  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.82 
 
 		 253 aa  53.5  0.000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0395  putative ribonuclease BN  22.18 
 
 		 289 aa  53.1  0.000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0412  ribonuclease BN  20.99 
 
 		 317 aa  53.1  0.000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4596  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.62 
 
 		 230 aa  53.1  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00917  putative ribonuclease protein  22.96 
 
 		 317 aa  53.1  0.00001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0723  Crp/FNR family transcriptional regulator  30 
 
 		 228 aa  52.8  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.362046  normal  0.190371 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2481  ribonuclease BN  23.18 
 
 		 324 aa  52.8  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.541316  normal  0.806631 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0067  cyclic nucleotide-binding protein  29.7 
 
 		 415 aa  52.4  0.00002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2533  ribonuclease BN  24.6 
 
 		 311 aa  52.4  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0964  ribonuclease BN  26.98 
 
 		 285 aa  52  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.487515  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2075  ribonuclease BN  21.35 
 
 		 328 aa  52  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4339  ribonuclease BN, putative  23.03 
 
 		 350 aa  52  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.168174  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4719  putative ribonuclease BN  23.03 
 
 		 350 aa  52  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.196963  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4425  putative ribonuclease BN  23.03 
 
 		 350 aa  52  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.690543  normal  0.619354 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4305  ribonuclease BN  22.92 
 
 		 290 aa  51.6  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.269266  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1294  cyclic nucleotide-binding: regulatory protein, Crp  28.69 
 
 		 220 aa  51.2  0.00003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.957461  normal  0.413121 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4238  ribonuclease BN  22.92 
 
 		 290 aa  51.6  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.89383  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4351  ribonuclease BN  22.92 
 
 		 290 aa  51.6  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4260  ribonuclease BN  22.92 
 
 		 290 aa  51.6  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4416  ribonuclease BN  22.92 
 
 		 290 aa  51.6  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2184  putative ribonuclease BN  21.96 
 
 		 276 aa  51.2  0.00003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00880085  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5315  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.85 
 
 		 228 aa  51.2  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.527594 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3166  cyclic nucleotide-binding protein  32.5 
 
 		 482 aa  51.2  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00363184  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0345  ribonuclease BN  21.5 
 
 		 334 aa  51.2  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.464437  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3345  cyclic nucleotide-binding protein  27.62 
 
 		 417 aa  51.2  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.254717  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51960  ribonuclease  22.89 
 
 		 411 aa  51.2  0.00004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000384323 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1378  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  23.08 
 
 		 408 aa  50.4  0.00005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4558  ribonuclease  22.89 
 
 		 411 aa  50.8  0.00005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.176119  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5884  ribonuclease BN  19.75 
 
 		 499 aa  50.8  0.00005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0535  putative ribonuclease BN  21.6 
 
 		 329 aa  50.8  0.00005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0967  ribonuclease BN  23.62 
 
 		 300 aa  50.4  0.00007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.89911  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1337  putative ribonuclease BN  23.79 
 
 		 443 aa  50.1  0.00007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.500166  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0638  putative ribonuclease BN  23.44 
 
 		 449 aa  50.1  0.00008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00048226  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0739  putative ribonuclease BN  21.31 
 
 		 434 aa  50.1  0.00008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18280  cAMP-binding protein  31.73 
 
 		 225 aa  50.1  0.00008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.186071  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1377  ribonuclease BN  23.79 
 
 		 443 aa  50.1  0.00008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.763301  normal  0.704772 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0303  cyclic nucleotide-binding domain protein  27.82 
 
 		 236 aa  49.7  0.00009  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.232206 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2492  response regulator receiver  28.07 
 
 		 352 aa  49.7  0.00009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.570528  normal  0.0101485 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0324  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 226 aa  49.7  0.00009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.105795  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2894  cyclic nucleotide-binding protein  31.25 
 
 		 482 aa  49.3  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00660929  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>