More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_3738 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_0325  sarcosine oxidase, alpha subunit family  50.54 
 
 		 1004 aa  926    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.684006  normal  0.0259905 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3777  sarcosine oxidase alpha subunit  57.46 
 
 		 997 aa  1114    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.152645  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2364  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  44.38 
 
 		 984 aa  733    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.442559  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0348  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  50.79 
 
 		 1004 aa  928    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.223565  normal  0.24512 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1103  sarcosine oxidase subunit alpha  51.89 
 
 		 1003 aa  976    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0428535 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1952  sarcosine oxidase, alpha subunit, heterotetrameric  52.13 
 
 		 1002 aa  966    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0048  sarcosine oxidase subunit alpha  50.87 
 
 		 1028 aa  984    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.416697 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2750  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  58.24 
 
 		 997 aa  1116    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2480  sarcosine oxidase, alpha subunit  49.01 
 
 		 1007 aa  946    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4034  sarcosine oxidase, alpha subunit  49.01 
 
 		 1007 aa  946    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0231  sarcosine oxidase, alpha subunit  59.82 
 
 		 999 aa  1189    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0994  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  59.46 
 
 		 998 aa  1088    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0458  sarcosine oxidase, alpha subunit  50.44 
 
 		 1006 aa  922    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5633  sarcosine oxidase, alpha subunit family  47.21 
 
 		 984 aa  786    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0892  sarcosine oxidase, alpha subunit, truncation  51.91 
 
 		 889 aa  851    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2115  sarcosine oxidase subunit alpha  59.42 
 
 		 1000 aa  1189    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4715  sarcosine oxidase, alpha subunit, heterotetrameric  50.74 
 
 		 1006 aa  925    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.764897  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7231  sarcosine oxidase, alpha subunit family  47.9 
 
 		 985 aa  835    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0118066  normal  0.098262 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1934  sarcosine oxidase, alpha subunit family  46.48 
 
 		 1008 aa  796    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.857913  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3593  sarcosine oxidase, alpha subunit family  44.52 
 
 		 980 aa  709    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4828  sarcosine oxidase, alpha subunit, heterotetrameric  51.29 
 
 		 1003 aa  968    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.527733  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3331  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  51.25 
 
 		 999 aa  976    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.967331 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1947  sarcosine oxidase, alpha subunit  45.2 
 
 		 992 aa  749    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.861688 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0393  putative sarcosine oxidase alpha subunit  52.13 
 
 		 1002 aa  969    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5205  sarcosine oxidase, alpha subunit, heterotetrameric  50.05 
 
 		 1005 aa  916    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0352677 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2689  putative sarcosine oxidase, alpha subunit  47.34 
 
 		 993 aa  865    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5130  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  51.89 
 
 		 1003 aa  991    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.564835  normal  0.907469 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0488  sarcosine oxidase, alpha subunit, heterotetrameric  51.89 
 
 		 1003 aa  993    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1579  sarcosine oxidase, alpha subunit family  45.99 
 
 		 1009 aa  785    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3356  sarcosine oxidase, alpha subunit family  58 
 
 		 997 aa  1125    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0943  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  46.41 
 
 		 974 aa  748    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.535106  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3738  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  100 
 
 		 995 aa  2027    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.161816  normal  0.187034 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4702  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  46.5 
 
 		 989 aa  743    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.272798  normal  0.7148 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0998  sarcosine oxidase, alpha subunit  52.23 
 
 		 1002 aa  983    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1143  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  43.44 
 
 		 987 aa  721    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.983501 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3391  sarcosine oxidase, alpha subunit family  86.23 
 
 		 995 aa  1713    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.782992  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2186  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  45.52 
 
 		 1009 aa  823    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2881  sarcosine oxidase, alpha subunit family  49.51 
 
 		 955 aa  707    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6206  sarcosine oxidase subunit alpha  52.32 
 
 		 1005 aa  939    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2638  sarcosine oxidase, alpha subunit family  43.96 
 
 		 984 aa  723    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3447  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  44.13 
 
 		 976 aa  747    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.54882 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5050  sarcosine oxidase, alpha subunit family  50.75 
 
 		 1000 aa  946    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.125712  normal  0.268825 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1598  sarcosine oxidase, alpha subunit, heterotetrameric  50.45 
 
 		 1000 aa  966    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.898229  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3506  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  52.48 
 
 		 1003 aa  994    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5067  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  51.79 
 
 		 1003 aa  990    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.844501  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1000  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  49.71 
 
 		 1019 aa  871    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.99192  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4033  sarcosine oxidase, alpha subunit family  99.5 
 
 		 995 aa  2018    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.319981  normal  0.145852 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2264  putative sarcosine oxidase  41.43 
 
 		 980 aa  667    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.710125 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3377  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  45.36 
 
 		 984 aa  781    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.958217 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2758  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  48.32 
 
 		 1010 aa  902    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0971  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  45.56 
 
 		 1011 aa  828    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5744  sarcosine oxidase alpha subunit  47.32 
 
 		 987 aa  831    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.100825  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1860  sarcosine oxidase, alpha subunit  52.23 
 
 		 1002 aa  971    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.769627  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0347  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  50.54 
 
 		 1004 aa  924    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.584295  normal  0.398352 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2145  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  44.09 
 
 		 981 aa  728    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3218  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  51.89 
 
 		 1003 aa  991    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.6611  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3658  sarcosine oxidase, alpha subunit family  57.99 
 
 		 997 aa  1134    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.259851  normal  0.147827 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3858  sarcosine oxidase alpha subunit  45.68 
 
 		 937 aa  667    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0454194  normal  0.0206575 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2485  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  86.23 
 
 		 995 aa  1702    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.269886  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4882  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  50.84 
 
 		 1005 aa  934    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.815421  normal  0.441482 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4048  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  47.36 
 
 		 1005 aa  833    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.802614 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0593  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  59.46 
 
 		 997 aa  1136    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.967493  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0303  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  59.62 
 
 		 999 aa  1183    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1347  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  47.14 
 
 		 993 aa  864    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0394007 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0867  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  72.56 
 
 		 1003 aa  1404    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1874  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  47.54 
 
 		 993 aa  865    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8586  sarcosine oxidase, alpha subunit family  61.24 
 
 		 999 aa  1139    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.523076  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4129  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  51.33 
 
 		 1005 aa  935    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4544  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  52.19 
 
 		 1003 aa  989    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71500  sarcosine oxidase alpha subunit  52.32 
 
 		 1005 aa  942    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3702  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  45.02 
 
 		 984 aa  742    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1652  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  46.12 
 
 		 1009 aa  790    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.90362 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5149  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  51.89 
 
 		 1003 aa  991    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.685714  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3287  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  46.53 
 
 		 987 aa  839    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3993  sarcosine oxidase, alpha subunit family  95.98 
 
 		 995 aa  1901    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18830  glycine cleavage system T protein (aminomethyltransferase)  45.24 
 
 		 925 aa  701    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0515  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  46.73 
 
 		 977 aa  839    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4907  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  44.13 
 
 		 976 aa  707    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.232501 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3618  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  47.53 
 
 		 767 aa  626  1e-178  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.21581  normal  0.0424125 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0224  sarcosine oxidase alpha subunit  61.7 
 
 		 909 aa  594  1e-168  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1696  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  39.19 
 
 		 963 aa  541  9.999999999999999e-153  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2102  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  35.82 
 
 		 967 aa  523  1e-147  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3474  aminomethyltransferase  35.51 
 
 		 965 aa  522  1e-146  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5916  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  36.68 
 
 		 988 aa  521  1e-146  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.564133 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2450  sarcosine oxidase, alpha subunit  34.06 
 
 		 968 aa  514  1e-144  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0353624  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2222  aminomethyltransferase  34.23 
 
 		 968 aa  516  1e-144  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.282485  normal  0.38236 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2496  aminomethyltransferase  35.28 
 
 		 977 aa  511  1e-143  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1349  aminomethyltransferase  34.54 
 
 		 961 aa  506  1e-141  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0486795  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0454  aminomethyltransferase  35.61 
 
 		 961 aa  489  1e-136  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.343433  normal  0.24512 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4871  FAD dependent oxidoreductase  30.96 
 
 		 825 aa  160  9e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.862382  normal  0.731807 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0426  glycine cleavage system T protein  32.29 
 
 		 372 aa  157  7e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.473658  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0642  FAD dependent oxidoreductase  30.05 
 
 		 815 aa  156  2e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1756  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  32.01 
 
 		 362 aa  154  5.9999999999999996e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.971274  normal  0.141351 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0961  glycine cleavage system T protein  32.55 
 
 		 364 aa  153  1e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.132468  normal  0.780252 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13330  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  33.61 
 
 		 370 aa  153  2e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4916  FAD dependent oxidoreductase  31.77 
 
 		 815 aa  150  9e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0232  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  28.07 
 
 		 368 aa  149  2.0000000000000003e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1914  glycine cleavage system T protein  33.7 
 
 		 381 aa  150  2.0000000000000003e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00180377 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1496  glycine cleavage system T protein  30.88 
 
 		 371 aa  148  5e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2351  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  32.6 
 
 		 372 aa  147  1e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.417081  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>