More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_2480 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_2480  endoribonuclease L-PSP  100 
 
 		 131 aa  273  8e-73  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4018  endoribonuclease L-PSP  61.07 
 
 		 131 aa  181  3e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.693135  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5093  endoribonuclease L-PSP  54.62 
 
 		 132 aa  158  2e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.552883  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3623  endoribonuclease L-PSP  54.33 
 
 		 131 aa  155  2e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.450254 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2280  endoribonuclease L-PSP  56.69 
 
 		 132 aa  154  3e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2117  Endoribonuclease L-PSP  53.49 
 
 		 137 aa  154  4e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.413824 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5043  Endoribonuclease L-PSP  54.2 
 
 		 132 aa  152  1e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0276  putative aerobic 2-aminobenzoate  54.2 
 
 		 131 aa  150  7e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7162  Endoribonuclease L-PSP  53.44 
 
 		 131 aa  149  8.999999999999999e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0743912  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4466  endoribonuclease L-PSP  55.38 
 
 		 134 aa  149  1e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.136863 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3169  endoribonuclease L-PSP  52.71 
 
 		 130 aa  149  1e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00329207  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2196  endoribonuclease L-PSP  52.24 
 
 		 137 aa  149  2e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0707908  normal  0.188687 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0498  endoribonuclease L-PSP  51.16 
 
 		 130 aa  147  6e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0754281  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4074  endoribonuclease L-PSP  55.12 
 
 		 132 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02014  hypothetical protein  52.71 
 
 		 130 aa  144  3e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3130  Endoribonuclease L-PSP  50.39 
 
 		 131 aa  143  8.000000000000001e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3838  Endoribonuclease L-PSP  52.71 
 
 		 130 aa  143  1e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.481327 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3951  Endoribonuclease L-PSP  52.71 
 
 		 130 aa  143  1e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0816657 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2178  endoribonuclease L-PSP  51.15 
 
 		 136 aa  142  2e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0587  endoribonuclease L-PSP  48.82 
 
 		 131 aa  141  3e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0823  endoribonuclease L-PSP  46.51 
 
 		 130 aa  137  3.9999999999999997e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1589  endoribonuclease L-PSP  48.09 
 
 		 130 aa  135  2e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.229274  hitchhiker  0.00909657 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2689  hypothetical protein  47.24 
 
 		 148 aa  134  3.0000000000000003e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0980036 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4884  Endoribonuclease L-PSP  46.92 
 
 		 142 aa  131  3e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0746987 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2689  endoribonuclease L-PSP  46.83 
 
 		 130 aa  128  3e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2231  endoribonuclease L-PSP  44.53 
 
 		 131 aa  127  5.0000000000000004e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1200  Endoribonuclease L-PSP  48.41 
 
 		 142 aa  124  5e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2924  Endoribonuclease L-PSP  44.19 
 
 		 133 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2865  endoribonuclease L-PSP  42.19 
 
 		 133 aa  113  7.999999999999999e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.16949  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2607  endoribonuclease L-PSP  42.19 
 
 		 133 aa  113  8.999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.171659  hitchhiker  0.00292827 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1330  endoribonuclease L-PSP  40.62 
 
 		 134 aa  112  1.0000000000000001e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.805737  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2159  Endoribonuclease L-PSP  40.46 
 
 		 137 aa  92.4  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.741048 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1397  Endoribonuclease L-PSP  38.17 
 
 		 176 aa  92  3e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.492198  decreased coverage  0.000402676 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5521  Endoribonuclease L-PSP  38.17 
 
 		 134 aa  85.9  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.174544 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3501  hypothetical protein  33.59 
 
 		 132 aa  83.6  9e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.987985  normal  0.527016 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0304  Endoribonuclease L-PSP  33.86 
 
 		 143 aa  82  0.000000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.4542  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0885  endoribonuclease L-PSP  39.64 
 
 		 155 aa  65.1  0.0000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.60332  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3282  endoribonuclease L-PSP  35.54 
 
 		 126 aa  65.5  0.0000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.925015  normal  0.517573 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3227  endoribonuclease L-PSP  40.68 
 
 		 140 aa  63.5  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.841476  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2046  L-PSP family endoribonuclease  34.78 
 
 		 136 aa  59.3  0.00000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0308  endoribonuclease L-PSP  35.58 
 
 		 127 aa  58.5  0.00000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20920  putative endoribonuclease L-PSP  30.19 
 
 		 125 aa  58.5  0.00000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3297  Endoribonuclease L-PSP  32.81 
 
 		 127 aa  57.8  0.00000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.815851  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4515  endoribonuclease L-PSP  32.5 
 
 		 137 aa  57.4  0.00000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0868  YjgF family translation initiation inhibitor  33.04 
 
 		 126 aa  56.2  0.0000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000000281222  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0496  endoribonuclease L-PSP  28.12 
 
 		 124 aa  56.2  0.0000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000921293  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1433  Endoribonuclease L-PSP  31.9 
 
 		 132 aa  55.8  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.652248  normal  0.596243 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0443  endoribonuclease L-PSP  36.13 
 
 		 139 aa  55.8  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5244  Endoribonuclease L-PSP  32.5 
 
 		 130 aa  55.5  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.677365  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2263  endoribonuclease L-PSP  33.05 
 
 		 129 aa  55.1  0.0000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.598957  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3465  hypothetical protein  35.29 
 
 		 145 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.589893 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2176  endoribonuclease L-PSP  30.25 
 
 		 151 aa  54.7  0.0000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.589076  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1579  endoribonuclease L-PSP, putative  33.01 
 
 		 120 aa  54.3  0.0000005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0655756  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1984  hypothetical protein  30.83 
 
 		 128 aa  54.7  0.0000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4350  Endoribonuclease L-PSP  30.15 
 
 		 133 aa  54.3  0.0000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1176  putative endoribonuclease L-PSP  30.91 
 
 		 130 aa  54.3  0.0000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1989  hypothetical protein  30.83 
 
 		 128 aa  54.3  0.0000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2605  endoribonuclease L-PSP  35.35 
 
 		 126 aa  54.3  0.0000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.615726  normal  0.989955 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0135  endoribonuclease L-PSP, putative  30.17 
 
 		 126 aa  53.9  0.0000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00324378  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2506  endoribonuclease L-PSP  26.52 
 
 		 131 aa  53.9  0.0000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0850215  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1824  YjgF-like protein  28.99 
 
 		 132 aa  53.9  0.0000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.516822  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2691  endoribonuclease L-PSP  26.52 
 
 		 131 aa  53.9  0.0000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.65572  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2367  Endoribonuclease L-PSP  34.78 
 
 		 145 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.308002  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3109  endoribonuclease L-PSP  32.74 
 
 		 123 aa  53.5  0.0000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0400559 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0382  endoribonuclease L-PSP  29.41 
 
 		 133 aa  53.5  0.0000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.395966  normal  0.101256 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3267  endoribonuclease L-PSP  35.65 
 
 		 138 aa  53.5  0.0000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.431089  normal  0.0317231 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1390  endoribonuclease L-PSP, putative  33.01 
 
 		 120 aa  53.5  0.0000009  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000483032  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1346  hypothetical protein  31.36 
 
 		 129 aa  53.5  0.0000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.703391 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3993  Endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 127 aa  53.5  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.655583 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0521  putative endoribonuclease L-PSP  24.8 
 
 		 123 aa  52.8  0.000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.170713  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0517  Endoribonuclease L-PSP  32.74 
 
 		 129 aa  53.1  0.000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0463  endoribonuclease L-PSP  34.74 
 
 		 129 aa  52.8  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.97811  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0972  YjgF-like protein  31.36 
 
 		 130 aa  53.5  0.000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00459079  normal  0.578034 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0935  Endoribonuclease L-PSP  30.51 
 
 		 128 aa  53.5  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34570  putative translation initiation inhibitor, yjgF family  32.58 
 
 		 136 aa  53.5  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00491284  normal  0.846357 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1171  endoribonuclease L-PSP  29.36 
 
 		 136 aa  52.4  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.468535  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2433  endoribonuclease L-PSP  27.61 
 
 		 132 aa  52  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000161475  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2595  endoribonuclease L-PSP  29.32 
 
 		 147 aa  52.4  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.629341 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5405  endoribonuclease L-PSP  35.29 
 
 		 149 aa  52.8  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0585911 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0351  endoribonuclease L-PSP  27.13 
 
 		 132 aa  52.8  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000170484  normal  0.265808 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0853  endoribonuclease L-PSP  29.66 
 
 		 129 aa  52.4  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.287208 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3031  endoribonuclease L-PSP  33.61 
 
 		 144 aa  52.8  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00544929  normal  0.808496 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2299  Endoribonuclease L-PSP  33.08 
 
 		 126 aa  52.4  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0234  Endoribonuclease L-PSP  28.33 
 
 		 118 aa  52.8  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0531  putative endoribonuclease L-PSP  29.31 
 
 		 126 aa  51.6  0.000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000228568  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0262  putative endoribonuclease L-PSP  32.04 
 
 		 120 aa  52  0.000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2960  putative endoribonuclease L-PSP  29.06 
 
 		 129 aa  51.6  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0518  putative endoribonuclease L-PSP  29.31 
 
 		 126 aa  51.6  0.000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000619405  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2388  endoribonuclease L-PSP  35.59 
 
 		 145 aa  52  0.000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1697  putative endoribonuclease L-PSP  29.46 
 
 		 144 aa  52  0.000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71200  YjgF family translation initiation inhibitor  34.45 
 
 		 140 aa  52  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6178  hypothetical protein  34.45 
 
 		 140 aa  52  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1301  endoribonuclease L-PSP  28.68 
 
 		 130 aa  51.2  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1940  putative endoribonuclease L-PSP  29.2 
 
 		 128 aa  51.2  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.049388  hitchhiker  0.000000582392 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0109  endoribonuclease L-PSP  32.38 
 
 		 140 aa  51.2  0.000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.748315  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2706  putative endoribonuclease L-PSP  26.52 
 
 		 131 aa  51.2  0.000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000241959 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2756  putative endoribonuclease L-PSP  25.76 
 
 		 131 aa  51.2  0.000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00188195  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6992  endoribonuclease L-PSP  34.78 
 
 		 145 aa  51.2  0.000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.615821  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1191  endoribonuclease L-PSP  25.93 
 
 		 227 aa  51.2  0.000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.42742  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7080  endoribonuclease L-PSP  34.45 
 
 		 145 aa  51.2  0.000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0944873 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>