More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_0620 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_0620  signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 725 aa  1493    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1881  PAS sensor protein  28.71 
 
 		 872 aa  232  2e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2090  signal transduction histidine kinase  39.94 
 
 		 372 aa  228  3e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.893944 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1984  signal transduction histidine kinase  41.03 
 
 		 713 aa  223  9.999999999999999e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0094  signal transduction histidine kinase  34.62 
 
 		 929 aa  218  4e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1350  signal transduction histidine kinase  29.25 
 
 		 1016 aa  217  5.9999999999999996e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.597121 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4215  signal transduction histidine kinase  31.81 
 
 		 582 aa  215  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0433147 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5584  signal transduction histidine kinase  33.83 
 
 		 586 aa  213  7.999999999999999e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1190  PAS sensor protein  28.97 
 
 		 1041 aa  212  2e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0314947 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2022  PAS sensor protein  39.51 
 
 		 717 aa  210  8e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.620506 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0172  signal transduction histidine kinase  29.39 
 
 		 897 aa  210  8e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2299  signal transduction histidine kinase  39.51 
 
 		 713 aa  210  8e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.924903  normal  0.101705 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2563  signal transduction histidine kinase  40.26 
 
 		 409 aa  209  2e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6181  signal transduction histidine kinase  30.03 
 
 		 1191 aa  207  7e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.299797 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0965  signal transduction histidine kinase  35.16 
 
 		 850 aa  202  9.999999999999999e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0932  signal transduction histidine kinase  49.77 
 
 		 759 aa  202  1.9999999999999998e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1130  signal transduction histidine kinase  29.61 
 
 		 1002 aa  202  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.039296  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1677  signal transduction histidine kinase  33.91 
 
 		 840 aa  199  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0007  signal transduction histidine kinase  33.03 
 
 		 482 aa  198  3e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.489749  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6552  signal transduction histidine kinase  33.03 
 
 		 489 aa  198  3e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.433672 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0358  signal transduction histidine kinase  31.98 
 
 		 602 aa  195  3e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0743  HWE histidine kinase  32.59 
 
 		 483 aa  193  8e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3126  signal transduction histidine kinase  41.22 
 
 		 352 aa  192  1e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4799  signal transduction histidine kinase  31.35 
 
 		 620 aa  191  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3048  signal transduction histidine kinase  28.99 
 
 		 1001 aa  191  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.143163  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4495  signal transduction histidine kinase  28.55 
 
 		 571 aa  189  1e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6933  signal transduction histidine kinase  34.05 
 
 		 488 aa  190  1e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0223762  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0108  PAS sensor protein  31.35 
 
 		 620 aa  186  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2666  signal transduction histidine kinase  30.09 
 
 		 446 aa  185  3e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.653198  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5905  signal transduction histidine kinase  31.89 
 
 		 601 aa  183  8.000000000000001e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.584764  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5290  signal transduction histidine kinase  32.76 
 
 		 662 aa  182  1e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.249657 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3331  signal transduction histidine kinase  35.6 
 
 		 503 aa  182  2e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2070  signal transduction histidine kinase  34.81 
 
 		 358 aa  182  2e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.315094  normal  0.359428 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1069  signal transduction histidine kinase  44.39 
 
 		 387 aa  181  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.591232 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0899  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.66 
 
 		 491 aa  181  2.9999999999999997e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0517319 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3982  hypothetical protein  32.95 
 
 		 478 aa  181  5.999999999999999e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4109  signal transduction histidine kinase  44.5 
 
 		 384 aa  180  8e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0421223  normal  0.437508 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3105  PAS sensor protein  34.6 
 
 		 728 aa  177  5e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3834  signal transduction histidine kinase  34.6 
 
 		 728 aa  177  5e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.284621 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2833  signal transduction histidine kinase  39.09 
 
 		 738 aa  177  5e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0471  signal transduction histidine kinase  39.24 
 
 		 349 aa  177  6e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3978  signal transduction histidine kinase  46.53 
 
 		 577 aa  177  8e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.301159 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1074  signal transduction histidine kinase  43.36 
 
 		 481 aa  177  9e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.255381  normal  0.984755 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2544  Signal transduction histidine kinase  31.64 
 
 		 489 aa  176  1.9999999999999998e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5560  signal transduction histidine kinase  32.55 
 
 		 341 aa  175  1.9999999999999998e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.256684  normal  0.0162393 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5235  signal transduction histidine kinase  45.41 
 
 		 571 aa  175  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.878632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4932  signal transduction histidine kinase  32.69 
 
 		 907 aa  173  1e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.752686 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3313  hypothetical protein  34.52 
 
 		 480 aa  172  2e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.29262 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3500  signal transduction histidine kinase  30.17 
 
 		 583 aa  171  3e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.319784  normal  0.0807687 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2014  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.23 
 
 		 904 aa  172  3e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3300  PAS sensor protein  27.86 
 
 		 583 aa  171  4e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.928069  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3623  signal transduction histidine kinase  28.16 
 
 		 583 aa  171  5e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.173185  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0825  signal transduction histidine kinase  28.94 
 
 		 455 aa  171  5e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.111815  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2710  hypothetical protein  30.69 
 
 		 744 aa  169  1e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3662  alcohol dehydrogenase  29.94 
 
 		 733 aa  170  1e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.899908  normal  0.588935 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0801  signal transduction histidine kinase  31.06 
 
 		 488 aa  169  2e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.185769  normal  0.110715 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3835  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  34.58 
 
 		 1167 aa  168  2.9999999999999998e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2814  putative sensor histidine kinase  46.51 
 
 		 505 aa  168  2.9999999999999998e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.467962  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5262  signal transduction histidine kinase  38.75 
 
 		 338 aa  167  5.9999999999999996e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0218  signal transduction histidine kinase  27.48 
 
 		 867 aa  166  1.0000000000000001e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.269004 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6901  signal transduction histidine kinase  39.21 
 
 		 465 aa  164  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6531  signal transduction histidine kinase  40.39 
 
 		 344 aa  164  5.0000000000000005e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.14349  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6262  sensor histidine kinase  32.2 
 
 		 1202 aa  164  6e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0163021  normal  0.538502 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5776  putative PAS/PAC sensor protein  43.75 
 
 		 1160 aa  164  8.000000000000001e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.491611  normal  0.0137055 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2607  signal transduction histidine kinase  31.88 
 
 		 489 aa  163  1e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.436893  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1301  signal transduction histidine kinase  42.72 
 
 		 588 aa  162  3e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0798  PAS sensor protein  26.34 
 
 		 624 aa  161  3e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1395  signal transduction histidine kinase  40.49 
 
 		 304 aa  161  4e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.695001  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0678  two-component sensor histidine kinase  28.16 
 
 		 460 aa  161  4e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.320332 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3523  diguanylate cyclase with PAS/PAC and GAF sensors  25.52 
 
 		 1079 aa  161  5e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2344  signal transduction histidine kinase  39.19 
 
 		 500 aa  161  5e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00211814  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1333  signal transduction histidine kinase  38.92 
 
 		 346 aa  160  7e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0112868 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2330  putative bacteriophytochrome  39.02 
 
 		 842 aa  159  2e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.766617  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6450  signal transduction histidine kinase  27.98 
 
 		 635 aa  158  3e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5922  signal transduction histidine kinase  38.92 
 
 		 346 aa  159  3e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.151215  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3897  PAS sensor protein  39.44 
 
 		 930 aa  158  4e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.240133 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1700  signal transduction histidine kinase  37.16 
 
 		 339 aa  158  4e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.193151  normal  0.0718068 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0827  signal transduction histidine kinase  31.68 
 
 		 512 aa  157  9e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4265  signal transduction histidine kinase  39.44 
 
 		 930 aa  156  1e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.588648  normal  0.462436 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3090  signal transduction histidine kinase  36.32 
 
 		 575 aa  157  1e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0895303  normal  0.0359946 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0707  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  30.54 
 
 		 1190 aa  155  2e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3652  signal transduction histidine kinase  37.21 
 
 		 491 aa  155  2.9999999999999998e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1551  signal transduction histidine kinase  40.72 
 
 		 642 aa  155  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00518292 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0167  signal transduction histidine kinase  34.71 
 
 		 336 aa  155  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3344  signal transduction histidine kinase  33.96 
 
 		 336 aa  155  4e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1377  putative sensor histidine kinase  39.41 
 
 		 561 aa  154  5e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.351027  normal  0.486528 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0554  sensory box protein  36.36 
 
 		 463 aa  154  7e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1888  PAS sensor protein  35 
 
 		 326 aa  154  8e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0588  sensory box protein  36.36 
 
 		 463 aa  154  8e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0875  PAS sensor protein  38.71 
 
 		 488 aa  153  1e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.111744 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0835  signal transduction histidine kinase  38.71 
 
 		 488 aa  153  1e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0971828 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0615  signal transduction histidine kinase  39.05 
 
 		 258 aa  152  2e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3755  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  38.7 
 
 		 1063 aa  151  3e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4605  MCP methyltransferase, CheR-type  29.91 
 
 		 1092 aa  151  3e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.315944  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6211  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  38.7 
 
 		 1061 aa  151  3e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.820077  normal  0.703655 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0079  signal transduction histidine kinase  39.51 
 
 		 639 aa  151  4e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.464916 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0487  signal transduction histidine kinase  43.23 
 
 		 555 aa  151  5e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2385  phytochrome:GAF:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal:HWE histidine kinase  42.08 
 
 		 1003 aa  150  6e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.460117  normal  0.215255 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1182  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  43.78 
 
 		 846 aa  150  8e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.75997  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2364  signal transduction histidine kinase  28.91 
 
 		 633 aa  150  9e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.932865  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>