More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_0831 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_0831  replication factor C large subunit  100 
 
 		 454 aa  928    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.248634  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1074  replication factor C large subunit  57.02 
 
 		 481 aa  535  1e-151  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.106166  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1751  replication factor C large subunit  56.61 
 
 		 451 aa  519  1e-146  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0916  replication factor C large subunit  52.83 
 
 		 483 aa  459  9.999999999999999e-129  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.371942  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0498  replication factor C large subunit  49.3 
 
 		 476 aa  444  1e-123  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0470  replication factor C large subunit  40.2 
 
 		 467 aa  319  5e-86  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.252286  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2242  replication factor C large subunit  38.86 
 
 		 497 aa  307  2.0000000000000002e-82  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3011  replication factor C large subunit  38.3 
 
 		 507 aa  297  3e-79  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.379588  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2075  replication factor C large subunit  41.11 
 
 		 642 aa  294  2e-78  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.314797  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1757  replication factor C large subunit  37.91 
 
 		 497 aa  290  3e-77  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0412755  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0729  AAA ATPase central domain protein  36.49 
 
 		 514 aa  282  8.000000000000001e-75  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1913  AAA ATPase central domain protein  41.01 
 
 		 497 aa  278  2e-73  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1810  replication factor C large subunit  38.73 
 
 		 500 aa  274  2.0000000000000002e-72  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0507  AAA ATPase central domain protein  37.73 
 
 		 437 aa  263  4.999999999999999e-69  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0629  replication factor C large subunit  32.96 
 
 		 484 aa  235  1.0000000000000001e-60  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1333  replication factor C large subunit  31.35 
 
 		 492 aa  228  1e-58  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.513611  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1361  replication factor C large subunit  34.04 
 
 		 474 aa  228  2e-58  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1324  replication factor C large subunit  33.65 
 
 		 482 aa  226  5.0000000000000005e-58  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.414275  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1352  replication factor C large subunit  32.37 
 
 		 484 aa  218  2e-55  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0266  replication factor C large subunit  34.87 
 
 		 413 aa  210  5e-53  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_2009  replication factor C large subunit  32.04 
 
 		 422 aa  182  1e-44  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0004  replication factor C large subunit  30.5 
 
 		 421 aa  177  3e-43  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0657  replication factor C large subunit  30.79 
 
 		 423 aa  177  3e-43  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.291269  hitchhiker  0.00784495 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0003  replication factor C large subunit  30.05 
 
 		 422 aa  171  3e-41  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0920  replication factor C large subunit  30.77 
 
 		 418 aa  167  2.9999999999999998e-40  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2049  replication factor C large subunit  27.5 
 
 		 443 aa  159  1e-37  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1828  AAA ATPase central domain protein  31.06 
 
 		 405 aa  144  3e-33  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0627242  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0270  ATPase central domain-containing protein  29.32 
 
 		 385 aa  143  6e-33  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.022175 
 
 
-
 
NC_006680  CNK01320  purine nucleotide binding protein, putative  29.3 
 
 		 1001 aa  114  3e-24  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH00420  sister chromatid cohesion-related protein, putative  25.71 
 
 		 892 aa  110  6e-23  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_30204  predicted protein  28.63 
 
 		 498 aa  109  1e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.381291  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2050  replication factor C small subunit  32.94 
 
 		 326 aa  109  1e-22  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06303  Replication factor C like protein [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:P78622]  30.43 
 
 		 1092 aa  107  6e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0695  replication factor C small subunit  33.74 
 
 		 319 aa  103  5e-21  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0267  replication factor C small subunit  33.82 
 
 		 325 aa  103  7e-21  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1668  replication factor C small subunit  34.13 
 
 		 320 aa  103  7e-21  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.348586  normal  0.014006 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0583  replication factor C small subunit  33.65 
 
 		 324 aa  102  1e-20  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1846  replication factor C small subunit  34.74 
 
 		 322 aa  102  2e-20  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.432596 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0919  replication factor C  33.99 
 
 		 348 aa  101  3e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0005  replication factor C small subunit  32.22 
 
 		 326 aa  99.4  1e-19  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0002  replication factor C small subunit  31.38 
 
 		 329 aa  99.8  1e-19  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08064  subunit of heteropentameric Replication factor (Eurofung)  35.62 
 
 		 398 aa  99  2e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0656  replication factor C small subunit  32.22 
 
 		 329 aa  97.8  3e-19  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0195839  hitchhiker  0.005923 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1248  replication factor C small subunit  30.52 
 
 		 322 aa  95.9  1e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_2008  replication factor C small subunit  33.05 
 
 		 328 aa  95.5  2e-18  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_35815  predicted protein  26.84 
 
 		 764 aa  94.7  3e-18  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.756935 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0750  ATPase central domain-containing protein  29.88 
 
 		 318 aa  94.7  3e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06517  subunit of heteropentameric replication factor (Eurofung)  32.06 
 
 		 289 aa  94  6e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39197  predicted protein  33.18 
 
 		 334 aa  93.6  7e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.023839  normal  0.0377209 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0515  replication factor C small subunit  30.13 
 
 		 321 aa  93.2  9e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.647591  normal  0.738478 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0384  replication factor C small subunit  31.92 
 
 		 327 aa  92.8  1e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.817409  normal  1 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_49374  predicted protein  34.25 
 
 		 349 aa  91.3  4e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.186193  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1827  Replication factor C  31.73 
 
 		 330 aa  90.5  6e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1424  replication factor C small subunit  29.47 
 
 		 315 aa  90.1  7e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0411425  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1126  replication factor C small subunit  31.94 
 
 		 322 aa  90.1  7e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.609813  normal  0.991344 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0188  Replication factor C  31.65 
 
 		 317 aa  89.7  1e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00219478  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG02470  Activator 1 40 kDa subunit, putative  32.57 
 
 		 347 aa  89.4  1e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0027  Replication factor C  29.91 
 
 		 330 aa  88.2  3e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39313  DNA replication factor C  30.19 
 
 		 325 aa  88.2  3e-16  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1210  replication factor C small subunit  29.47 
 
 		 315 aa  87.8  3e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_11922  predicted protein  31.11 
 
 		 338 aa  88.2  3e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1412  replication factor C small subunit  26.55 
 
 		 315 aa  88.2  3e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2103  replication factor C small subunit  29.29 
 
 		 326 aa  87.8  4e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0484  replication factor C small subunit  29.47 
 
 		 315 aa  87.8  4e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.362585  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_60537  DNA replication factor C  31.62 
 
 		 322 aa  87.4  5e-16  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0632786  normal  0.140839 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0994  replication factor C small subunit  29.91 
 
 		 323 aa  87  6e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.265102  normal  0.191705 
 
 
-
 
NC_006693  CNH00770  activator 1 41 kda subunit, putative  30.73 
 
 		 363 aa  86.3  0.000000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119614  replication factor C subunit 5 (36kDa), probable  29.72 
 
 		 332 aa  85.5  0.000000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006683  CNN00630  DNA replication factor, putative  29.07 
 
 		 373 aa  85.5  0.000000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.853584  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1927  replication factor C small subunit  29.22 
 
 		 326 aa  85.5  0.000000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43994  predicted protein  27.75 
 
 		 942 aa  84.7  0.000000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_72583  Replication factor C, subunit RFC4  29.24 
 
 		 369 aa  84  0.000000000000006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0238341 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1910  Replication factor C  29.44 
 
 		 341 aa  83.6  0.000000000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1674  replication factor C small subunit  29.75 
 
 		 322 aa  83.2  0.000000000000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.511307  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9547  predicted protein  31.02 
 
 		 350 aa  80.9  0.00000000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.606232  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1582  replication factor C small subunit  27.6 
 
 		 334 aa  79.7  0.0000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0240  replication factor C  29.47 
 
 		 316 aa  78.2  0.0000000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_35082  predicted protein  26.76 
 
 		 342 aa  76.3  0.000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.216032  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02969  subunit of heteropentameric Replication factor C (RF-C) (Eurofung)  27.8 
 
 		 387 aa  75.1  0.000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.715501  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0262  replication factor C small subunit  30.13 
 
 		 305 aa  74.7  0.000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0941959  n/a   
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_41967  predicted protein  30.41 
 
 		 235 aa  73.9  0.000000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.296814  normal  0.0690197 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45690  predicted protein  26.28 
 
 		 1015 aa  72  0.00000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.136558  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_33013  predicted protein  22.78 
 
 		 571 aa  70.1  0.00000000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.0011992  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0277  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  22.52 
 
 		 517 aa  67.4  0.0000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.433516  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_48947  predicted protein  24.62 
 
 		 725 aa  66.6  0.0000000008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  decreased coverage  0.00599657 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0824  recombination factor protein RarA  22.83 
 
 		 392 aa  64.3  0.000000004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.00630594  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1312  replication factor C small subunit  33.91 
 
 		 940 aa  63.9  0.000000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.425984  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0603  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  27.43 
 
 		 735 aa  62.4  0.00000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.705665 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl678  DNA polymerase III gamma and tau subunits  23.79 
 
 		 631 aa  60.5  0.00000006  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1776  recombination factor protein RarA  22.83 
 
 		 397 aa  59.3  0.0000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0502  recombination factor protein RarA  28.12 
 
 		 444 aa  58.5  0.0000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0383176  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1507  DNA-directed DNA polymerase  28.32 
 
 		 699 aa  58.2  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1397  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  22.94 
 
 		 460 aa  57.8  0.0000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.610857  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0815  AAA ATPase central domain protein  23.36 
 
 		 395 aa  57.8  0.0000004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4294  recombination factor protein RarA  25 
 
 		 428 aa  57.4  0.0000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.118829  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4628  recombination factor protein RarA  25 
 
 		 428 aa  57.4  0.0000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00879535  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4131  recombination factor protein RarA  24.53 
 
 		 428 aa  57  0.0000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000013957  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0082  recombination factor protein RarA  26.59 
 
 		 419 aa  57  0.0000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1468  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  25.34 
 
 		 627 aa  57  0.0000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3583  recombination factor protein RarA  29.91 
 
 		 437 aa  57  0.0000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000174356  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>