More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_0587 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_0465  preprotein translocase subunit SecY  76.52 
 
 
477 aa  758    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0555  preprotein translocase subunit SecY  78.62 
 
 
477 aa  784    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.323996 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0104  preprotein translocase subunit SecY  72.92 
 
 
479 aa  718    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2230  preprotein translocase subunit SecY  74.32 
 
 
479 aa  755    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.408121  normal  0.455137 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0587  preprotein translocase subunit SecY  100 
 
 
477 aa  949    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00173275  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0087  preprotein translocase subunit SecY  55.19 
 
 
492 aa  529  1e-149  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.023527  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0024  preprotein translocase subunit SecY  54.95 
 
 
492 aa  505  9.999999999999999e-143  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00318334  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0233  preprotein translocase, SecY subunit  54.6 
 
 
489 aa  478  1e-134  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.520667  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2426  preprotein translocase subunit SecY  55.49 
 
 
492 aa  477  1e-133  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2241  preprotein translocase, SecY subunit  52.41 
 
 
500 aa  462  1e-129  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1705  preprotein translocase subunit SecY  50.95 
 
 
537 aa  449  1e-125  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.602032  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1851  preprotein translocase subunit SecY  51.69 
 
 
504 aa  433  1e-120  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.642367 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2315  preprotein translocase subunit SecY  50.71 
 
 
491 aa  412  1e-114  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.368701  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1498  preprotein translocase, SecY subunit  41.04 
 
 
599 aa  352  8e-96  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.312314  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0667  preprotein translocase subunit SecY  37.87 
 
 
442 aa  309  9e-83  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00940535 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0733  preprotein translocase subunit SecY  38.99 
 
 
443 aa  300  5e-80  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.581929  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1251  preprotein translocase subunit SecY  37.45 
 
 
442 aa  298  1e-79  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.05624  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0156  preprotein translocase subunit SecY  37.45 
 
 
442 aa  295  9e-79  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1407  preprotein translocase subunit SecY  37.37 
 
 
443 aa  289  6e-77  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.886151  n/a   
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_56443  transport protein Sec61 alpha subunit  30.93 
 
 
559 aa  222  9.999999999999999e-57  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27583  IISP family transporter: protein transport protein Sec61 alpha subunit  31.96 
 
 
476 aa  219  1e-55  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.527579  normal  0.285595 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0233  preprotein translocase subunit SecY  30.82 
 
 
476 aa  215  1.9999999999999998e-54  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.745222  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI00040  protein transporter, putative  31.66 
 
 
478 aa  213  5.999999999999999e-54  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1755  Translocon Sec61/SecY, plug domain protein  31.04 
 
 
469 aa  207  4e-52  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.227644  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0402  preprotein translocase subunit SecY  28.83 
 
 
476 aa  206  7e-52  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.144908 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07721  hypothetical protein similar to Sec61 (Broad)  30.23 
 
 
478 aa  204  3e-51  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0245702  normal  0.107035 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0114  preprotein translocase subunit SecY  28.11 
 
 
463 aa  200  5e-50  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  unclonable  0.000000000441427  hitchhiker  0.00000810769 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_68832  Protein transport protein SEC61 alpha subunit  30.4 
 
 
478 aa  194  2e-48  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1304  preprotein translocase subunit SecY  28.4 
 
 
459 aa  177  3e-43  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.783086 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0964  preprotein translocase subunit SecY  27.2 
 
 
460 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.905411  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1034  preprotein translocase subunit SecY  27.59 
 
 
455 aa  159  1e-37  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    decreased coverage  0.00000391627 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1874  preprotein translocase subunit SecY  27.07 
 
 
465 aa  159  1e-37  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.653631  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1254  preprotein translocase subunit SecY  27.5 
 
 
482 aa  147  4.0000000000000006e-34  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.000000145561 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80530  protein involved in co-translational pathway of protein transport  26.41 
 
 
501 aa  120  3.9999999999999996e-26  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.453921 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0309  preprotein translocase subunit SecY  23.43 
 
 
443 aa  87.4  5e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0197098  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0735  preprotein translocase, SecY subunit  23.49 
 
 
433 aa  84.3  0.000000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0339  preprotein translocase subunit SecY  24.18 
 
 
440 aa  82  0.00000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000142446  unclonable  0.0000000706243 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20670  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  24.9 
 
 
439 aa  82  0.00000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5022  preprotein translocase subunit SecY  25.31 
 
 
445 aa  80.9  0.00000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.697019  normal  0.479008 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0201  preprotein translocase subunit SecY  23.74 
 
 
443 aa  81.3  0.00000000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.124191  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2691  preprotein translocase, SecY subunit  23.28 
 
 
430 aa  81.3  0.00000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.803147  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1333  preprotein translocase subunit SecY  23.38 
 
 
455 aa  80.5  0.00000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.158258 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2276  preprotein translocase subunit SecY  23.72 
 
 
441 aa  79.3  0.0000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000725785  hitchhiker  0.00410487 
 
 
-
 
NC_004310  BR1213  preprotein translocase subunit SecY  25.16 
 
 
446 aa  79  0.0000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1831  preprotein translocase subunit SecY  23.47 
 
 
443 aa  79  0.0000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.321149  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1685  preprotein translocase subunit SecY  24.09 
 
 
421 aa  79  0.0000000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2044  preprotein translocase subunit SecY  24.54 
 
 
441 aa  78.6  0.0000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00113194  normal  0.318737 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0739  preprotein translocase subunit SecY  24.74 
 
 
440 aa  78.2  0.0000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00521081  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1856  preprotein translocase subunit SecY  23.88 
 
 
421 aa  77.8  0.0000000000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1976  preprotein translocase subunit SecY  25.37 
 
 
446 aa  77.8  0.0000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.923807  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1176  preprotein translocase subunit SecY  24.95 
 
 
446 aa  77.8  0.0000000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0379017  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2062  preprotein translocase subunit SecY  24.36 
 
 
421 aa  77.8  0.0000000000004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0235  preprotein translocase subunit SecY  23.98 
 
 
419 aa  77.4  0.0000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00849669  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1352  preprotein translocase subunit SecY  25.16 
 
 
446 aa  77  0.0000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.0023208  normal  0.481629 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5050  preprotein translocase subunit SecY  22.08 
 
 
444 aa  75.9  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.478224  normal  0.981585 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3686  preprotein translocase, SecY subunit  23.45 
 
 
441 aa  76.3  0.000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.000792509  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2403  preprotein translocase subunit SecY  23.29 
 
 
443 aa  76.3  0.000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0193161  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0680  preprotein translocase subunit SecY  22.32 
 
 
437 aa  75.9  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1863  preprotein translocase subunit SecY  24.31 
 
 
446 aa  75.1  0.000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.271597  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5059  preprotein translocase subunit SecY  23.56 
 
 
442 aa  74.7  0.000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000898122  normal  0.284155 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0979  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  24.36 
 
 
447 aa  74.3  0.000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000479753  hitchhiker  0.00549319 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0099  preprotein translocase subunit SecY  21.82 
 
 
437 aa  74.7  0.000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0986849 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1165  preprotein translocase, SecY subunit  25 
 
 
450 aa  74.7  0.000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000330141  normal  0.11389 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2209  preprotein translocase subunit SecY  23.29 
 
 
443 aa  74.3  0.000000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000211329  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1006  preprotein translocase subunit SecY  24.79 
 
 
446 aa  73.6  0.000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.38875  hitchhiker  0.00669682 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4006  preprotein translocase, SecY subunit  23.71 
 
 
450 aa  73.6  0.000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000605815  hitchhiker  0.000026914 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0053  preprotein translocase subunit SecY  22.74 
 
 
420 aa  73.2  0.000000000009  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0504  preprotein translocase subunit SecY  23.56 
 
 
443 aa  72.8  0.00000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000390206  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0474  preprotein translocase subunit SecY  23.56 
 
 
443 aa  73.2  0.00000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.733359  hitchhiker  0.00000433507 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0507  preprotein translocase subunit SecY  23.56 
 
 
443 aa  73.2  0.00000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0640452  normal  0.0135524 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3647  preprotein translocase subunit SecY  22.67 
 
 
443 aa  73.2  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2469  preprotein translocase subunit SecY  21.25 
 
 
434 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0545369  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4729  preprotein translocase subunit SecY  23.56 
 
 
443 aa  73.2  0.00000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0376135  normal  0.430849 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0306  preprotein translocase subunit SecY  24.14 
 
 
421 aa  72.8  0.00000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0894763  normal  0.194972 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1634  preprotein translocase subunit SecY  24.47 
 
 
452 aa  72.8  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0116955  normal  0.0410443 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1745  preprotein translocase subunit SecY  22.27 
 
 
437 aa  73.2  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.261464  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2412  preprotein translocase subunit SecY  21.88 
 
 
434 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00625491  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0607  preprotein translocase, SecY subunit  22.15 
 
 
429 aa  73.2  0.00000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0598508  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1450  preprotein translocase subunit SecY  24.52 
 
 
446 aa  72  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.337945  normal  0.16685 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1360  preprotein translocase, SecY subunit  23.47 
 
 
423 aa  72  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0347  preprotein translocase, SecY subunit  22.88 
 
 
443 aa  72  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.742267  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0425  preprotein translocase subunit SecY  22.46 
 
 
437 aa  72  0.00000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.65116  normal  0.157207 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1949  preprotein translocase, SecY subunit  22.89 
 
 
420 aa  72.4  0.00000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0517  preprotein translocase, SecY subunit  22.88 
 
 
443 aa  72  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.120445  unclonable  0.0000000000266535 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1074  preprotein translocase subunit SecY  23.19 
 
 
441 aa  71.6  0.00000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0857  preprotein translocase subunit SecY  24.1 
 
 
442 aa  71.6  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1046  preprotein translocase subunit SecY  23.19 
 
 
441 aa  71.6  0.00000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.303562  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09050  preprotein translocase subunit SecY  24.1 
 
 
442 aa  71.6  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.224184 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1575  preprotein translocase subunit SecY  22.2 
 
 
435 aa  71.6  0.00000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0569624  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0103  preprotein translocase subunit SecY  23.13 
 
 
421 aa  71.6  0.00000000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1062  preprotein translocase subunit SecY  23.19 
 
 
441 aa  71.6  0.00000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.160681  normal  0.323313 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0646  preprotein translocase, SecY subunit  23.13 
 
 
444 aa  71.2  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.617938  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4528  preprotein translocase subunit SecY  23.13 
 
 
444 aa  71.2  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.447133  normal  0.242735 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16970  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  25.36 
 
 
435 aa  71.2  0.00000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0174147  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3318  preprotein translocase subunit SecY  24.11 
 
 
441 aa  70.9  0.00000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.150394  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1565  preprotein translocase subunit SecY  21.7 
 
 
443 aa  70.9  0.00000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.112443  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0886  preprotein translocase subunit SecY  21.81 
 
 
418 aa  70.9  0.00000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.609907  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3889  preprotein translocase subunit SecY  23.91 
 
 
442 aa  70.5  0.00000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000822061  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1384  preprotein translocase subunit SecY  21.91 
 
 
443 aa  70.1  0.00000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.378018 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29540  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  23.16 
 
 
429 aa  70.1  0.00000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.498773  normal  0.844433 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>