72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_5634 on replicon NC_011758
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007514  Cag_1309  methylase  50.53 
 
 		 933 aa  919    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00329115  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0478  hypothetical protein  43.85 
 
 		 908 aa  825    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5634  methylase  100 
 
 		 937 aa  1910    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1744  DNA methyltransferase  48.91 
 
 		 909 aa  947    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000656447  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2607  methylase  67.58 
 
 		 928 aa  1253    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.483035  decreased coverage  0.00951903 
 
 
-
 
NC_009516  PsycPRwf_2393  Type II restriction enzyme methylase subunits-like protein  37.12 
 
 		 934 aa  632  1e-180  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.233566  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3043  hypothetical protein  39.01 
 
 		 871 aa  614  9.999999999999999e-175  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.743399  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1465  hypothetical protein  39.05 
 
 		 914 aa  593  1e-168  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.152551  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0176  type II restriction enzyme methylase subunits- like protein  38.56 
 
 		 919 aa  588  1e-166  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4906  hypothetical protein  38.6 
 
 		 941 aa  563  1.0000000000000001e-159  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0028  hypothetical protein  39.38 
 
 		 916 aa  562  1e-158  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0759  hypothetical protein  35.12 
 
 		 912 aa  556  1e-157  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.231322  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15580  Type II restriction enzyme, methylase subunit  36.94 
 
 		 926 aa  504  1e-141  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000708191  unclonable  6.0148299999999996e-21 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4502  hypothetical protein  37.65 
 
 		 955 aa  489  1e-137  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.264892 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2530  putative DNA methylase  34.95 
 
 		 928 aa  479  1e-134  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0253553  hitchhiker  0.000494571 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5513  hypothetical protein  37.39 
 
 		 934 aa  482  1e-134  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.032293  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2250  hypothetical protein  37.42 
 
 		 929 aa  478  1e-133  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5334  type II restriction enzyme methylase subunit  34.38 
 
 		 926 aa  467  9.999999999999999e-131  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1287  putative DNA methylase  34.63 
 
 		 932 aa  464  1e-129  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000167364 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1748  putative DNA methylase  33.72 
 
 		 928 aa  454  1.0000000000000001e-126  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.431397 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4499  putative DNA methylase  33.18 
 
 		 921 aa  444  1e-123  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.154819  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1962  type II restriction enzyme, methylase subunit  33.1 
 
 		 918 aa  436  1e-120  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0531091  normal  0.121709 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3315  type II restriction enzyme, methylase subunit  32.68 
 
 		 929 aa  410  1e-113  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0261  type II restriction enzyme, methylase subunit  31.7 
 
 		 909 aa  405  1e-111  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.504808  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7690  putative type II restriction enzyme, methylase subunit  33.4 
 
 		 622 aa  291  4e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.212385 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3845  DNA modification methyltransferase-related protein  26.42 
 
 		 978 aa  224  7e-57  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0841462  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1365  hypothetical protein  25.91 
 
 		 925 aa  184  9.000000000000001e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1460  Type II restriction enzyme methylase subunits-like  23.67 
 
 		 1186 aa  177  8e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.811371  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2985  hypothetical protein  24.14 
 
 		 1173 aa  167  8e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0952598  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4156  hypothetical protein  24.33 
 
 		 1151 aa  158  5.0000000000000005e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3857  hypothetical protein  24.01 
 
 		 973 aa  157  1e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.663936  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3686  hypothetical protein  24.35 
 
 		 918 aa  156  2e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.619967  normal  1 
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4987  hypothetical protein  25.23 
 
 		 1154 aa  154  8e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.0015789  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2902  N6 adenine-specific DNA methyltransferase protein, N12 class  27.48 
 
 		 621 aa  152  2e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00367965 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2740  hypothetical protein  27.24 
 
 		 1018 aa  150  9e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010374  M446_7058  hypothetical protein  22.8 
 
 		 1188 aa  138  5e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.48722  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3238  hypothetical protein  26.6 
 
 		 1184 aa  137  9e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0308131  normal  0.512831 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4327  hypothetical protein  22.3 
 
 		 1170 aa  122  1.9999999999999998e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3225  hypothetical protein  22.65 
 
 		 869 aa  105  4e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1615  hypothetical protein  47.62 
 
 		 97 aa  85.1  0.000000000000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000631366  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2538  hypothetical protein  23.9 
 
 		 1243 aa  71.2  0.00000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.136229  hitchhiker  0.00255392 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0223  hypothetical protein  23.15 
 
 		 1342 aa  64.3  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0122903 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3219  hypothetical protein  24.67 
 
 		 1298 aa  63.5  0.00000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1326  hypothetical protein  21.98 
 
 		 1321 aa  62.8  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0465  hypothetical protein  23.08 
 
 		 1347 aa  62.8  0.00000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03250  hypothetical protein  23.04 
 
 		 1347 aa  61.6  0.00000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1501  protein of unknown function DUF450  22.14 
 
 		 974 aa  61.2  0.00000008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000140584  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0884  hypothetical protein  23.08 
 
 		 1290 aa  58.2  0.0000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0748  N-6 DNA methylase  20.75 
 
 		 504 aa  57.8  0.0000009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000203871 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1310  N-6 DNA methylase  21.38 
 
 		 1041 aa  57  0.000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.881884  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1300  hypothetical protein  21.51 
 
 		 1282 aa  57  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2544  hypothetical protein  21.7 
 
 		 1346 aa  57  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0868504  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2592  hypothetical protein  24.08 
 
 		 1339 aa  55.5  0.000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.565404  hitchhiker  0.000489463 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2323  hypothetical protein  24.24 
 
 		 1366 aa  54.3  0.00001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.771882  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3519  N-6 DNA methylase  25.41 
 
 		 694 aa  54.3  0.00001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3351  hypothetical protein  23.83 
 
 		 1338 aa  52.8  0.00003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.465815  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1882  hypothetical protein  25.53 
 
 		 1422 aa  50.1  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1272  hypothetical protein  21.14 
 
 		 1353 aa  50.4  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4598  Type I restriction-modification system methyltransferase subunit-like  22.84 
 
 		 416 aa  49.3  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0828  hypothetical protein  25.38 
 
 		 1339 aa  49.7  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.215826  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0812  hypothetical protein  25.38 
 
 		 1339 aa  49.7  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0416  hypothetical protein  21.93 
 
 		 536 aa  48.5  0.0006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4784  hypothetical protein  21.96 
 
 		 1365 aa  48.1  0.0008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.0358899 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1426  RNA-binding region RNP-1  24.28 
 
 		 430 aa  47.4  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1179  hypothetical protein  22.08 
 
 		 1452 aa  47.8  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1622  hypothetical protein  58.14 
 
 		 53 aa  47.8  0.001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0031  type II restriction-modification enzyme  21.9 
 
 		 1257 aa  46.2  0.003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0043  type II restriction-modification enzyme  21.97 
 
 		 1252 aa  45.4  0.005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2547  type IIS restriction endonuclease, putative  24.89 
 
 		 1076 aa  45.1  0.006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00176401  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0068  type II restriction-modification enzyme  21.97 
 
 		 1244 aa  45.1  0.006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.337945  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1892  protein of unknown function DUF450  17.23 
 
 		 1058 aa  44.7  0.007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0299  hypothetical protein  19.1 
 
 		 1154 aa  44.7  0.008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.309485 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>