More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_3817 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_3510  ATPase domain-containing protein  97.03 
 
 		 932 aa  1592    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3817  Hpt sensor hybrid histidine kinase  100 
 
 		 909 aa  1752    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3895  multi-sensor hybrid histidine kinase  82.79 
 
 		 920 aa  1317    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.750763  normal  0.625428 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5358  multi-sensor hybrid histidine kinase  58.94 
 
 		 891 aa  793    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.102832 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2086  multi-sensor hybrid histidine kinase  59.22 
 
 		 909 aa  778    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.114824 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3847  Hpt sensor hybrid histidine kinase  40 
 
 		 921 aa  383  1e-105  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3350  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal:Hpt  35.88 
 
 		 923 aa  340  8e-92  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.634179 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2787  Hpt sensor hybrid histidine kinase  30.44 
 
 		 909 aa  331  5.0000000000000004e-89  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0319908  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1056  two component hybrid sensor histidine kinase  32.93 
 
 		 1014 aa  330  7e-89  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1949  two component hybrid histidine kinase/sensor response regulator  32.82 
 
 		 833 aa  322  1.9999999999999998e-86  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2953  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.65 
 
 		 1202 aa  314  4.999999999999999e-84  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.999143  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1730  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.35 
 
 		 916 aa  313  9e-84  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0675189  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0960  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.56 
 
 		 1245 aa  313  9e-84  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4059  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.88 
 
 		 1326 aa  310  6.999999999999999e-83  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.129878 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0835  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.96 
 
 		 1165 aa  309  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0240  Hpt sensor hybrid histidine kinase  33.98 
 
 		 1005 aa  308  2.0000000000000002e-82  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1670  ATPase domain-containing protein  36.3 
 
 		 750 aa  308  2.0000000000000002e-82  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.081803  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0859  sensory box histidine kinase/response regulator  33.59 
 
 		 1765 aa  305  2.0000000000000002e-81  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2520  hybrid sensory histidine kinase BarA  30.79 
 
 		 929 aa  305  2.0000000000000002e-81  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.314221  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1548  Hpt sensor hybrid histidine kinase  33.64 
 
 		 929 aa  304  5.000000000000001e-81  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0628  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.8 
 
 		 1765 aa  304  5.000000000000001e-81  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2106  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.89 
 
 		 993 aa  304  6.000000000000001e-81  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.295041 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2152  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.43 
 
 		 985 aa  303  7.000000000000001e-81  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0146455  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3200  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.78 
 
 		 1768 aa  303  9e-81  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1958  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.7 
 
 		 816 aa  303  1e-80  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.952692  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1691  sensor histidine kinase/response regulator GacS  36.02 
 
 		 917 aa  301  3e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1212  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.45 
 
 		 919 aa  301  3e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.979568  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1204  sensory box histidine kinase/response regulator  37.08 
 
 		 1177 aa  300  6e-80  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4222  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.17 
 
 		 922 aa  299  2e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.588582  normal  0.325016 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0965  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  32.66 
 
 		 1331 aa  298  2e-79  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0366  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.29 
 
 		 1266 aa  298  3e-79  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.926091  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0715  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.01 
 
 		 1767 aa  298  4e-79  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4069  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.99 
 
 		 1284 aa  297  6e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.92301  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0357  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.06 
 
 		 1310 aa  297  6e-79  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.464939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1850  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.34 
 
 		 946 aa  297  7e-79  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0866059  normal  0.191772 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3698  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal:Hpt  35.62 
 
 		 917 aa  296  1e-78  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.34744  hitchhiker  0.00600076 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0790  hybrid sensory histidine kinase BarA  29.21 
 
 		 906 aa  296  1e-78  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.437862  normal  0.397369 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3307  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.95 
 
 		 1767 aa  296  1e-78  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0835  multi-sensor hybrid histidine kinase  34 
 
 		 1782 aa  296  2e-78  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1200  hybrid sensory histidine kinase BarA  31.61 
 
 		 933 aa  296  2e-78  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.930165  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3550  hybrid sensory histidine kinase BarA  32.63 
 
 		 928 aa  295  3e-78  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.189146  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4582  sensor/response regulator hybrid  35.83 
 
 		 925 aa  295  3e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0870  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.28 
 
 		 1786 aa  295  3e-78  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52260  sensor/response regulator hybrid  34.98 
 
 		 925 aa  295  3e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.173365 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0305  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.78 
 
 		 967 aa  295  4e-78  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000133293 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02943  two-component system sensor protein  35.68 
 
 		 727 aa  294  5e-78  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00726909  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1703  histidine kinase  38.28 
 
 		 1346 aa  294  6e-78  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0067  signal transduction histidine kinase-like protein protein  34.38 
 
 		 1021 aa  293  7e-78  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3505  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.28 
 
 		 1784 aa  294  7e-78  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3355  hybrid sensory histidine kinase BarA  30.27 
 
 		 937 aa  293  1e-77  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0869798  hitchhiker  0.00259338 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2865  Signal transduction histidine kinase-like protein  31.2 
 
 		 2213 aa  293  1e-77  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000726448 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1285  hybrid sensory histidine kinase BarA  30.34 
 
 		 937 aa  293  1e-77  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000242189 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1650  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.32 
 
 		 917 aa  292  2e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.1856 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3419  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.29 
 
 		 1767 aa  292  2e-77  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0913  PAS sensor protein  32.02 
 
 		 2035 aa  292  2e-77  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.271495  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2952  sensory box histidine kinase/response regulator  33.85 
 
 		 1763 aa  292  2e-77  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.684028  normal  0.230032 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1180  hybrid sensory histidine kinase BarA  30.01 
 
 		 929 aa  291  3e-77  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.175711  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1887  transmission sensor LetS  29.75 
 
 		 910 aa  291  3e-77  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0419  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 		 1260 aa  291  3e-77  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.784662  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2078  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.58 
 
 		 990 aa  291  5.0000000000000004e-77  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.553649  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1252  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.71 
 
 		 917 aa  290  6e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.376653  hitchhiker  0.0000592891 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4067  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.99 
 
 		 917 aa  290  8e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.125923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3238  hybrid sensory histidine kinase BarA  33.42 
 
 		 918 aa  289  1e-76  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.943664  normal  0.0194611 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2762  PAS sensor protein  34.54 
 
 		 1135 aa  289  1e-76  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.449168  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0979  sensor histidine kinase  31.29 
 
 		 1574 aa  289  2e-76  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00449169 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.59 
 
 		 1771 aa  289  2e-76  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002502  BarA sensory histidine kinase  30.25 
 
 		 932 aa  289  2e-76  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1109  hybrid sensory histidine kinase BarA  30.05 
 
 		 935 aa  288  2e-76  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.527009 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03530  hybrid sensory histidine kinase BarA  31.12 
 
 		 932 aa  288  2.9999999999999996e-76  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1031  hybrid sensory histidine kinase BarA  31.66 
 
 		 941 aa  287  5.999999999999999e-76  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.581247  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3543  Hpt sensor hybrid histidine kinase  33.28 
 
 		 1498 aa  287  8e-76  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.476146  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4002  sensory transduction histidine kinase  32.2 
 
 		 1689 aa  286  9e-76  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1109  hybrid sensory histidine kinase BarA  29.96 
 
 		 935 aa  286  1.0000000000000001e-75  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.715392 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3099  hybrid sensory histidine kinase BarA  31.61 
 
 		 918 aa  285  2.0000000000000002e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.528607  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1175  hybrid sensory histidine kinase BarA  29.9 
 
 		 935 aa  285  2.0000000000000002e-75  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.846523  normal  0.0419846 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1876  transmission sensor LetS  29.43 
 
 		 910 aa  285  3.0000000000000004e-75  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3180  hybrid sensory histidine kinase BarA  31.61 
 
 		 918 aa  285  3.0000000000000004e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.359202 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3278  hybrid sensory histidine kinase BarA  31.61 
 
 		 918 aa  285  3.0000000000000004e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.225719 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3164  hybrid sensory histidine kinase BarA  31.47 
 
 		 918 aa  285  3.0000000000000004e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0703153 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37090  alginate regulatory hybrid histidine protein kinase GacS  35.21 
 
 		 905 aa  285  3.0000000000000004e-75  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0555684  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0829  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.26 
 
 		 1240 aa  285  4.0000000000000003e-75  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3117  hybrid sensory histidine kinase BarA  31.61 
 
 		 918 aa  285  4.0000000000000003e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.306406  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0617  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.07 
 
 		 1398 aa  285  4.0000000000000003e-75  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.536457  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2767  hybrid sensory histidine kinase BarA  30.18 
 
 		 933 aa  284  6.000000000000001e-75  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.294821  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3457  hybrid sensory histidine kinase BarA  30.24 
 
 		 935 aa  283  1e-74  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3148  hybrid sensory histidine kinase BarA  30.29 
 
 		 932 aa  283  1e-74  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0238696  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0319  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  39.48 
 
 		 636 aa  282  2e-74  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2032  hybrid sensory histidine kinase BarA  30 
 
 		 927 aa  281  3e-74  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0864566  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2241  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.55 
 
 		 956 aa  281  4e-74  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.87793  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1908  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.8 
 
 		 991 aa  281  4e-74  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1223  hybrid sensory histidine kinase BarA  30.98 
 
 		 933 aa  281  5e-74  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.915072  hitchhiker  0.00275603 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3391  hybrid sensory histidine kinase BarA  32.05 
 
 		 931 aa  281  5e-74  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3706  Hpt sensor hybrid histidine kinase  36.34 
 
 		 738 aa  281  6e-74  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02631  hybrid sensory histidine kinase, in two-component regulatory system with UvrY  31.41 
 
 		 918 aa  280  7e-74  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.228632  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4117  hybrid sensory histidine kinase BarA  28.27 
 
 		 948 aa  280  7e-74  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.598015  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02593  hypothetical protein  31.41 
 
 		 918 aa  280  7e-74  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.252422  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1730  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.94 
 
 		 833 aa  280  8e-74  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1598  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.25 
 
 		 964 aa  280  9e-74  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.349888 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3920  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  38.35 
 
 		 758 aa  279  1e-73  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0902  Hpt sensor hybrid histidine kinase  31.28 
 
 		 918 aa  279  2e-73  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.594186  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>