More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_3357 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_3357  integrase family protein  100 
 
 		 209 aa  421  1e-117  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.276444  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0119  integrase family protein  94.74 
 
 		 209 aa  392  1e-108  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4790  integrase family protein  93.3 
 
 		 209 aa  391  1e-108  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0791  integrase family protein  92.34 
 
 		 209 aa  384  1e-106  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.334688  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0772  integrase family protein  85.65 
 
 		 209 aa  369  1e-101  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0811  Phage integrase  64.9 
 
 		 208 aa  280  1e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2386  integrase family protein  60.87 
 
 		 208 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6236  integrase family protein  64.56 
 
 		 207 aa  272  2.0000000000000002e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5964  Phage integrase  60.19 
 
 		 208 aa  266  2e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3034  integrase family protein  61.76 
 
 		 206 aa  260  8e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.155662  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2339  integrase family protein  60.71 
 
 		 210 aa  258  3e-68  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0020288 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1729  phage integrase family protein  62.87 
 
 		 207 aa  255  3e-67  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.425016  normal  0.48456 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3791  phage integrase family site specific recombinase  60 
 
 		 208 aa  251  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0452484 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3817  integrase family protein  59.39 
 
 		 210 aa  246  1e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.736864  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2267  phage integrase family protein  57.58 
 
 		 210 aa  244  4.9999999999999997e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.783329  normal  0.401703 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2590  hypothetical protein  55.71 
 
 		 210 aa  242  3e-63  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0020859 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3118  phage integrase  55.56 
 
 		 210 aa  238  5e-62  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3208  phage integrase family protein  56.06 
 
 		 204 aa  238  6.999999999999999e-62  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0839313  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6083  integrase family protein  58.42 
 
 		 210 aa  236  2e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0217  phage integrase family protein  58.16 
 
 		 200 aa  236  2e-61  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6093  integrase family protein  57.92 
 
 		 210 aa  235  4e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.61747  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5291  integrase family protein  57.43 
 
 		 210 aa  233  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0658  phage integrase protein  56.57 
 
 		 210 aa  227  1e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2062  phage integrase family site specific recombinase  49.74 
 
 		 198 aa  218  3.9999999999999997e-56  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.27505  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1978  phage integrase family protein  61.71 
 
 		 238 aa  216  1e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00595062 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1287  integrase family protein  52.97 
 
 		 203 aa  207  9e-53  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2569  phage integrase family protein  48.97 
 
 		 198 aa  202  3e-51  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0769947 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06813  integrase  46.88 
 
 		 197 aa  201  9e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2164  phage integrase family protein  49.23 
 
 		 198 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1123  phage integrase family protein  48.72 
 
 		 198 aa  194  8.000000000000001e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1181  phage integrase family protein  48.72 
 
 		 198 aa  194  8.000000000000001e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.820562  normal  0.553114 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3899  phage integrase family protein  48.72 
 
 		 198 aa  194  8.000000000000001e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.97558 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3467  integrase family protein  48.19 
 
 		 197 aa  193  1e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0824  phage integrase family protein  48.19 
 
 		 197 aa  193  1e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.917981  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0261  putative tyrosine recombinase XerD  60.93 
 
 		 175 aa  191  6e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4474  integrase family protein  50.52 
 
 		 198 aa  190  2e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1950  phage integrase family protein  45.6 
 
 		 197 aa  185  5e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.827298  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0251  phage integrase family protein  46.07 
 
 		 198 aa  181  7e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.705292 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4334  phage integrase family protein  54.49 
 
 		 173 aa  165  5.9999999999999996e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3446  phage integrase family protein  47.95 
 
 		 163 aa  142  5e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.993422  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0365  hypothetical protein  71.25 
 
 		 103 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0134906 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0153  phage integrase family site specific recombinase  45.52 
 
 		 141 aa  104  1e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.246008  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0790  hypothetical protein  53.26 
 
 		 130 aa  99.4  4e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.517667  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0280  phage integrase family site specific recombinase  64.52 
 
 		 66 aa  89  5e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1167  hypothetical protein  53.85 
 
 		 78 aa  86.3  3e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.347632 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2576  hypothetical protein  53.95 
 
 		 89 aa  85.1  7e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1166  hypothetical protein  54.79 
 
 		 76 aa  83.6  0.000000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.347632 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6970  hypothetical protein  55.56 
 
 		 88 aa  79.7  0.00000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011656  BCAH187_E0001  site-specific recombinase  26.11 
 
 		 190 aa  73.2  0.000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.149945  normal  1 
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A08  integrase  29.49 
 
 		 195 aa  70.1  0.00000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000000003137  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2232  integrase family protein  31.36 
 
 		 197 aa  69.3  0.00000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.394376  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2240  integrase family protein  31.36 
 
 		 197 aa  69.3  0.00000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.0000448435  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0174  integrase family protein  29.61 
 
 		 186 aa  68.9  0.00000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00273109  n/a   
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3590  integrase family protein  27.75 
 
 		 189 aa  67  0.0000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  0.0592429  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1720  tyrosine recombinase XerD  31.82 
 
 		 319 aa  66.2  0.0000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.514315 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0377  integrase family protein  33.11 
 
 		 186 aa  65.9  0.0000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000239772 
 
 
-
 
NC_010724  Nther_2955  integrase family protein  28.25 
 
 		 187 aa  65.1  0.0000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.819146  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3517  phage integrase family protein  33.11 
 
 		 188 aa  65.1  0.0000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010182  BcerKBAB4_5345  integrase family protein  31.14 
 
 		 182 aa  64.3  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0861  integrase/recombinase XerC  31.74 
 
 		 304 aa  63.5  0.000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0788  phage integrase family protein  29.17 
 
 		 293 aa  63.2  0.000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1165  integrase family protein  25.62 
 
 		 187 aa  62.8  0.000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012794  GWCH70_3453  integrase family protein  25.97 
 
 		 189 aa  62.4  0.000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.590005  normal  0.791222 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3599  integrase family protein  25.71 
 
 		 180 aa  62  0.000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.616601  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2613  prophage LambdaBa04, site-specific recombinase, phage integrase family  25.71 
 
 		 180 aa  60.5  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.301879  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1390  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.71 
 
 		 328 aa  60.5  0.00000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000179914  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2271  phage integrase family protein  31.91 
 
 		 321 aa  60.5  0.00000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0728  site-specific tyrosine recombinase XerC  31.45 
 
 		 330 aa  59.7  0.00000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.442089  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2711  prophage LambdaBa04, site-specific recombinase, phage integrase family  26.14 
 
 		 180 aa  59.7  0.00000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0042219  normal  0.247582 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4009  prophage LambdaBa04, site-specific recombinase, phage integrase family  26.29 
 
 		 180 aa  60.1  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1368  prophage LambdaBa04, site-specific recombinase, phage integrase family  26.29 
 
 		 180 aa  59.3  0.00000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.358053 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1428  phage integrase  31.06 
 
 		 317 aa  59.3  0.00000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.473602  normal  0.0585003 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2815  integrase/recombinase XerD  31.48 
 
 		 311 aa  58.5  0.00000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1654  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.21 
 
 		 330 aa  58.5  0.00000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000000234006  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1611  tyrosine recombinase  28.57 
 
 		 308 aa  58.2  0.00000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.4794 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0652  DNA integration/recombination/invertion protein  24.57 
 
 		 180 aa  58.2  0.00000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1531  phage integrase family protein  29.81 
 
 		 311 aa  57.8  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.504949 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4012  tyrosine recombinase XerC  30.13 
 
 		 294 aa  57.8  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00152232  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1196  phage integrase  31.37 
 
 		 291 aa  57.4  0.0000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1634  integrase family protein  34.34 
 
 		 354 aa  57.4  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.280587  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2230  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase, phage integrase family  28.1 
 
 		 180 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1279  phage integrase family protein  32.52 
 
 		 323 aa  56.6  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0644752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0998  phage integrase family protein  26.19 
 
 		 215 aa  56.2  0.0000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00570052  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0530  tyrosine recombinase XerD  30.71 
 
 		 320 aa  56.6  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.931339  normal  0.0955198 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0262  integrase family protein  28.28 
 
 		 291 aa  56.6  0.0000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0017  prophage integration/recombination/invertion protein  26.46 
 
 		 190 aa  56.2  0.0000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000444728  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0128  site-specific tyrosine recombinase XerC  32 
 
 		 303 aa  55.8  0.0000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.742386  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0488  tyrosine recombinase XerD  32.14 
 
 		 319 aa  55.8  0.0000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4392  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase, phage integrase family  28.1 
 
 		 180 aa  55.8  0.0000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3451  integrase family protein  26.14 
 
 		 186 aa  55.5  0.0000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0127606  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2876  integrase family protein  28.72 
 
 		 241 aa  55.1  0.0000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1481  phage integrase family protein  30.86 
 
 		 311 aa  55.1  0.0000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0281722  normal  0.205606 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3811  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  27.59 
 
 		 180 aa  55.1  0.0000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0141622  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3829  site-specific recombinase, phage integrase family  26.44 
 
 		 176 aa  54.3  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000329942 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4099  prophage lambdaba02, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  28.1 
 
 		 169 aa  54.3  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2484  phage integrase  30 
 
 		 304 aa  54.7  0.000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.72317  normal  0.0269236 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2512  tyrosine recombinase XerD  33.33 
 
 		 328 aa  54.3  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.234856 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0047  tyrosine recombinase XerC  33.99 
 
 		 298 aa  54.7  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0822  putative phage integrase  28.99 
 
 		 291 aa  53.5  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.341397 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6657  integrase family protein  27.81 
 
 		 291 aa  53.5  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.358251 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>