More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_1217 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_1217  DNA mismatch repair protein  100 
 
 		 612 aa  1229    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.469734  normal  0.0661873 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1951  DNA mismatch repair protein  51.32 
 
 		 585 aa  595  1e-168  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.448925  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0934  DNA mismatch repair protein  44.3 
 
 		 603 aa  484  1e-135  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.540426 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1168  DNA mismatch repair protein  45.23 
 
 		 588 aa  474  1e-132  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.985109  normal  0.444607 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1703  DNA mismatch repair protein MutL  42.16 
 
 		 603 aa  468  9.999999999999999e-131  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3225  DNA mismatch repair protein MutL  42.36 
 
 		 599 aa  451  1e-125  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.142793  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1203  DNA mismatch repair protein  38.88 
 
 		 619 aa  396  1e-109  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.288753  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1612  DNA mismatch repair protein  35.26 
 
 		 614 aa  395  1e-108  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.235254  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0157  DNA mismatch repair protein MutL  39.74 
 
 		 559 aa  392  1e-107  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2098  DNA mismatch repair protein  36.79 
 
 		 659 aa  388  1e-106  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0072  DNA mismatch repair protein  36.31 
 
 		 647 aa  389  1e-106  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3617  DNA mismatch repair protein  36.01 
 
 		 626 aa  385  1e-105  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.552847  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3904  DNA mismatch repair protein  36.01 
 
 		 626 aa  385  1e-105  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.595251  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2128  DNA mismatch repair protein  38.89 
 
 		 639 aa  385  1e-105  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000120986  normal  0.021871 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0864  DNA mismatch repair protein  34.57 
 
 		 645 aa  382  1e-104  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.23826  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2096  DNA mismatch repair protein  38.87 
 
 		 630 aa  380  1e-104  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0526  DNA mismatch repair protein  35.74 
 
 		 668 aa  373  1e-102  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0554  DNA mismatch repair protein MutL  38.18 
 
 		 565 aa  369  1e-101  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1114  DNA mismatch repair protein MutL  39.46 
 
 		 620 aa  367  1e-100  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000422632  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0963  DNA mismatch repair protein MutL  38.54 
 
 		 608 aa  368  1e-100  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2999  DNA mismatch repair protein MutL  36.64 
 
 		 631 aa  368  1e-100  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3780  DNA mismatch repair protein  34.04 
 
 		 647 aa  364  2e-99  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0217989 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1432  DNA mismatch repair protein  34.29 
 
 		 647 aa  364  2e-99  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.980701 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3802  DNA mismatch repair protein  34.98 
 
 		 647 aa  363  4e-99  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.618994  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1172  DNA mismatch repair protein  33.43 
 
 		 674 aa  362  1e-98  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11660  DNA mismatch repair protein MutL  33.95 
 
 		 644 aa  361  2e-98  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1359  DNA mismatch repair protein  33.58 
 
 		 674 aa  361  3e-98  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.52416  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1936  DNA mismatch repair protein MutL  36.86 
 
 		 612 aa  360  5e-98  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000687656 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_978  DNA mismatch repair protein, MutL/HexB family  35.8 
 
 		 566 aa  359  7e-98  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3527  DNA mismatch repair protein  33.95 
 
 		 647 aa  359  8e-98  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3867  DNA mismatch repair protein  34.04 
 
 		 647 aa  358  9.999999999999999e-98  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1195  MutL/HexB family DNA mismatch repair protein  36.08 
 
 		 566 aa  358  1.9999999999999998e-97  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0321912  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1006  DNA mismatch repair protein MutL  35.2 
 
 		 566 aa  356  5.999999999999999e-97  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2517  DNA mismatch repair protein  34.53 
 
 		 656 aa  356  7.999999999999999e-97  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4548  DNA mismatch repair protein MutL  37.3 
 
 		 605 aa  354  2.9999999999999997e-96  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1304  DNA mismatch repair protein  35.53 
 
 		 628 aa  349  7e-95  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0761454  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3219  DNA mismatch repair protein MutL  34.95 
 
 		 647 aa  349  7e-95  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.428383  normal  0.251683 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0149  DNA mismatch repair protein MutL  36.93 
 
 		 605 aa  348  1e-94  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0800  DNA mismatch repair protein MutL  35.87 
 
 		 586 aa  345  8.999999999999999e-94  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1696  DNA mismatch repair protein MutL  33.28 
 
 		 665 aa  344  4e-93  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.930861  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0100  DNA mismatch repair protein MutL  36.35 
 
 		 605 aa  342  8e-93  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2001  DNA mismatch repair protein  36.19 
 
 		 606 aa  342  1e-92  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0369313  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1186  DNA mismatch repair protein  36.26 
 
 		 575 aa  336  1e-90  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00913008  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0845  DNA mismatch repair protein  36.05 
 
 		 574 aa  334  2e-90  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00243998  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1575  DNA mismatch repair protein MutL  35.09 
 
 		 648 aa  335  2e-90  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0978  DNA mismatch repair protein  34.98 
 
 		 647 aa  333  5e-90  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0100042  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1770  DNA mismatch repair protein  35.07 
 
 		 602 aa  333  8e-90  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00259733  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2053  DNA mismatch repair protein  36.26 
 
 		 622 aa  332  9e-90  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00117239  hitchhiker  0.0000000712721 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1924  DNA mismatch repair protein MutL  36.24 
 
 		 560 aa  331  2e-89  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1487  DNA mismatch repair protein MutL  37.2 
 
 		 622 aa  328  2.0000000000000001e-88  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.101291  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00410  DNA mismatch repair protein  35.28 
 
 		 625 aa  327  4.0000000000000003e-88  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2669  DNA mismatch repair protein  34.99 
 
 		 630 aa  327  4.0000000000000003e-88  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.680786  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2771  DNA mismatch repair protein  34.86 
 
 		 629 aa  324  3e-87  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2223  DNA mismatch repair protein  34.75 
 
 		 607 aa  323  4e-87  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.38556  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2088  DNA mismatch repair protein  34.67 
 
 		 601 aa  323  5e-87  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.02775 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1692  DNA mismatch repair protein  36.39 
 
 		 611 aa  321  1.9999999999999998e-86  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0821  DNA mismatch repair protein MutL  32.81 
 
 		 630 aa  322  1.9999999999999998e-86  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000000117941  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1040  DNA mismatch repair protein MutL  33.28 
 
 		 632 aa  322  1.9999999999999998e-86  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.619157 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2133  DNA mismatch repair protein  34.75 
 
 		 607 aa  321  3e-86  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1078  DNA mismatch repair protein MutL  34 
 
 		 572 aa  319  7e-86  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1715  DNA mismatch repair protein  34.8 
 
 		 608 aa  319  9e-86  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.233899  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0895  DNA mismatch repair protein MutL  33.6 
 
 		 611 aa  319  1e-85  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.347619  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07520  DNA mismatch repair protein  33.59 
 
 		 641 aa  318  3e-85  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0413  DNA mismatch repair protein  34.27 
 
 		 630 aa  317  3e-85  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1478  DNA mismatch repair protein MutL  36.14 
 
 		 557 aa  317  3e-85  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.064699  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4896  DNA mismatch repair protein  32.92 
 
 		 632 aa  316  8e-85  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4948  DNA mismatch repair protein  32.71 
 
 		 632 aa  315  9.999999999999999e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.167425  normal  0.037125 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0633  DNA mismatch repair protein  33.81 
 
 		 623 aa  315  9.999999999999999e-85  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.211888 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0172  DNA mismatch repair protein MutL  32.42 
 
 		 624 aa  315  1.9999999999999998e-84  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4772  DNA mismatch repair protein  32.87 
 
 		 633 aa  315  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.209994  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4944  DNA mismatch repair protein MutL  34.65 
 
 		 645 aa  314  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2758  DNA mismatch repair protein  36.8 
 
 		 616 aa  314  3.9999999999999997e-84  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2081  DNA mismatch repair protein  34.64 
 
 		 621 aa  313  7.999999999999999e-84  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0570  DNA mismatch repair protein  34.21 
 
 		 648 aa  311  2e-83  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.963062 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1095  DNA mismatch repair protein  35.68 
 
 		 632 aa  311  2e-83  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.045837  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2002  DNA mismatch repair protein  34.91 
 
 		 619 aa  311  2e-83  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2933  DNA mismatch repair protein  35.97 
 
 		 612 aa  310  4e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.169061 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4687  DNA mismatch repair protein  32.56 
 
 		 633 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.427145  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0481  DNA mismatch repair protein MutL  31.65 
 
 		 623 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.324517  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0267  DNA mismatch repair protein MutL  31.43 
 
 		 622 aa  307  3e-82  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000997696 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0993  DNA mismatch repair protein  34.15 
 
 		 589 aa  306  5.0000000000000004e-82  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.139394  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0145  DNA mismatch repair protein  31.59 
 
 		 644 aa  306  6e-82  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4044  DNA mismatch repair protein MutL  35.01 
 
 		 628 aa  306  6e-82  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0816003  normal  0.310643 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1275  DNA mismatch repair protein  33.63 
 
 		 644 aa  305  1.0000000000000001e-81  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0428  DNA mismatch repair protein  34.18 
 
 		 605 aa  305  1.0000000000000001e-81  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.329312  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0293  DNA mismatch repair protein  33.81 
 
 		 602 aa  305  2.0000000000000002e-81  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0977  DNA mismatch repair ATPase  33.93 
 
 		 584 aa  305  2.0000000000000002e-81  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0710055  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2769  DNA mismatch repair protein  33.13 
 
 		 652 aa  304  4.0000000000000003e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.286219  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07070  putative DNA mismatch repair protein  31.69 
 
 		 617 aa  303  4.0000000000000003e-81  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.748012  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2701  DNA mismatch repair protein MutL  30.87 
 
 		 626 aa  304  4.0000000000000003e-81  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00383046  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65350  DNA mismatch repair protein  33.38 
 
 		 633 aa  303  5.000000000000001e-81  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1981  DNA mismatch repair protein  31.8 
 
 		 626 aa  303  9e-81  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.201794  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1084  DNA mismatch repair protein MutL  30.7 
 
 		 630 aa  302  9e-81  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.967595  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0491  DNA mismatch repair protein  34.77 
 
 		 594 aa  303  9e-81  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0595243  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0895  DNA mismatch repair protein  32.87 
 
 		 617 aa  302  1e-80  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.380086  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1517  DNA mismatch repair protein MutL  33.33 
 
 		 598 aa  302  1e-80  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.249931 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5675  DNA mismatch repair protein  33.23 
 
 		 633 aa  302  1e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1499  DNA mismatch repair protein MutL  31.83 
 
 		 589 aa  302  1e-80  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3164  DNA mismatch repair protein MutL  33.85 
 
 		 615 aa  301  2e-80  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2908  DNA mismatch repair protein  32.77 
 
 		 655 aa  301  2e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>