More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_1319 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010468  EcolC_3883  helicase superfamily protein  31.12 
 
 
2113 aa  867    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0319703  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0354  Protein of unknown function DUF1998  29.77 
 
 
2087 aa  714    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1353  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.11 
 
 
2099 aa  903    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5810  DEAD/DEAH box helicase domain protein  30.9 
 
 
2113 aa  866    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1319  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  100 
 
 
2213 aa  4573    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4896  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.84 
 
 
2113 aa  857    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4830  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.21 
 
 
2113 aa  868    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1418  DEAD/DEAH box helicase domain protein  30.93 
 
 
2136 aa  838    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.411331  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5422  helicase superfamily protein  29.8 
 
 
2224 aa  620  1e-176  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.383128 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3086  helicase superfamily protein  29.31 
 
 
2125 aa  588  1e-166  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.652376  hitchhiker  0.00603337 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35200  helicase family protein with metal-binding cysteine cluster  28.93 
 
 
2082 aa  419  9.999999999999999e-116  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3741  Protein of unknown function DUF1998  27.53 
 
 
2124 aa  416  1e-114  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1711  DEAD/DEAH box helicase domain protein  24.16 
 
 
1764 aa  300  2e-79  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2269  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.33 
 
 
1607 aa  155  5.9999999999999996e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1673  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.47 
 
 
1589 aa  153  3e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1404  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  25.25 
 
 
1602 aa  150  3e-34  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0588  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.45 
 
 
1759 aa  149  8.000000000000001e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0511  helicase  31.74 
 
 
1578 aa  145  8e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.769472  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2319  DEAD/DEAH box helicase domain protein  32.65 
 
 
1525 aa  142  6e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.102202  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2590  DEAD/DEAH box helicase domain protein  33.57 
 
 
1672 aa  136  5e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000259422 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1539  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.64 
 
 
1542 aa  134  1.0000000000000001e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0352  DEAD/DEAH box helicase-like  33.33 
 
 
1704 aa  134  3e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1124  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  31.16 
 
 
1561 aa  132  5.0000000000000004e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.416463  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3253  DEAD/DEAH box helicase-like  26.62 
 
 
2093 aa  132  5.0000000000000004e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.224571  normal  0.0428877 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0806  DEAD/DEAH box helicase-like protein  34.73 
 
 
1543 aa  133  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0821  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.73 
 
 
1543 aa  133  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.301369 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1527  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.9 
 
 
1725 aa  131  1.0000000000000001e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.46826  normal  0.102614 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0223  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  37.25 
 
 
1711 aa  130  2.0000000000000002e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.229884  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1679  helicase superfamily protein  28.98 
 
 
1784 aa  130  3e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0293  DEAD/DEAH box helicase domain protein  33.8 
 
 
1787 aa  130  4.0000000000000003e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2015  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.38 
 
 
1743 aa  130  4.0000000000000003e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.724661  normal  0.480876 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5807  DEAD/DEAH box helicase domain protein  32.71 
 
 
2104 aa  127  2e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4827  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.08 
 
 
2104 aa  127  2e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3296  DEAD/DEAH box helicase domain protein  34.19 
 
 
1734 aa  127  2e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3886  helicase superfamily protein  32.08 
 
 
2104 aa  127  2e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3350  hypothetical protein  31.75 
 
 
1838 aa  126  4e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.168378  normal  0.500488 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4772  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.64 
 
 
1741 aa  126  4e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal  0.232543 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0833  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.67 
 
 
1765 aa  125  9e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.888983 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2672  DEAD/DEAH box helicase domain protein  33.56 
 
 
1770 aa  124  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.47983 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1543  DEAD/DEAH box helicase-like protein  35.86 
 
 
1711 aa  124  1.9999999999999998e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1954  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.33 
 
 
1695 aa  124  1.9999999999999998e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3298  DEAD/DEAH box helicase domain protein  25.57 
 
 
1741 aa  124  1.9999999999999998e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0631  DEAD/DEAH box helicase domain protein  31.58 
 
 
1740 aa  123  4.9999999999999996e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2038  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.72 
 
 
2120 aa  123  4.9999999999999996e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.104871 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4093  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.62 
 
 
685 aa  122  9e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.317776  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0274  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.46 
 
 
1754 aa  121  9.999999999999999e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2494  hypothetical protein  33.33 
 
 
2106 aa  121  1.9999999999999998e-25  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0742  DEAD/DEAH box helicase domain protein  33.8 
 
 
1861 aa  119  7.999999999999999e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1675  DEAD/DEAH box helicase domain protein  32.54 
 
 
2104 aa  119  8.999999999999998e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1423  DEAD/DEAH box helicase domain protein  30.19 
 
 
1723 aa  117  3e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1302  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.59 
 
 
1719 aa  117  3e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7833  DEAD/DEAH box helicase domain protein  35.19 
 
 
1723 aa  115  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2729  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.48 
 
 
1722 aa  113  3e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.631527  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2665  DEAD/DEAH box helicase domain protein  30.11 
 
 
1698 aa  102  1e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1020  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.16 
 
 
744 aa  89.4  7e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  1.28402e-16 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1457  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35 
 
 
744 aa  87.8  0.000000000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.507421  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1467  DEAD/DEAH box helicase domain protein  27.23 
 
 
1948 aa  87  0.000000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.160999  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0240  helicase superfamily protein  24.43 
 
 
2097 aa  83.6  0.00000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1964  helicase domain protein  26.83 
 
 
1780 aa  83.2  0.00000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.285846  normal  0.0141604 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1523  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.37 
 
 
744 aa  83.2  0.00000000000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.750209  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0302  putative helicase  28.16 
 
 
1878 aa  82  0.0000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1650  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.57 
 
 
751 aa  79.3  0.0000000000009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2941  putative DEAD/DEAH box helicase  27.31 
 
 
1475 aa  74.7  0.00000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3683  DEAD/DEAH box helicase-like  30.41 
 
 
905 aa  72.8  0.00000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0546  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  37.74 
 
 
740 aa  70.9  0.0000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14630  DEAD/DEAH box helicase domain protein  27.78 
 
 
751 aa  70.1  0.0000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000706515  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4091  helicase domain-containing protein  21.21 
 
 
1422 aa  68.9  0.0000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1002  DEAD/DEAH box helicase domain protein  25.85 
 
 
739 aa  68.2  0.000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2375  DEAD/DEAH box helicase domain protein  29.61 
 
 
758 aa  67.4  0.000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1443  DEAD/DEAH box helicase domain protein  25.71 
 
 
803 aa  67.4  0.000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000111055  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1732  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.95 
 
 
768 aa  67  0.000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.199645  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2723  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.08 
 
 
1053 aa  66.6  0.000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.215301  normal  0.377392 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1303  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.08 
 
 
756 aa  66.2  0.000000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.000031195  normal  0.342253 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0861  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.08 
 
 
744 aa  65.9  0.000000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1160  DEAD/DEAH box helicase domain protein  45.07 
 
 
701 aa  65.9  0.000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2251  Protein of unknown function DUF1998  39 
 
 
797 aa  65.5  0.00000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.216915 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0189  DEAD/DEAH box helicase domain protein  38 
 
 
734 aa  65.1  0.00000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.583958  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1910  DEAD/DEAH box helicase domain protein  27.59 
 
 
752 aa  63.9  0.00000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.71131  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1320  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  26.51 
 
 
815 aa  63.5  0.00000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    decreased coverage  0.00000000000720865 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1167  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.09 
 
 
744 aa  63.2  0.00000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1707  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.45 
 
 
808 aa  63.2  0.00000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0661739  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1247  DEAD/DEAH box helicase domain protein  36.19 
 
 
743 aa  62.4  0.00000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000127914 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1438  DEAD/DEAH box helicase domain protein  26.32 
 
 
807 aa  62  0.0000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2983  DEAD/DEAH box helicase domain protein  26.72 
 
 
972 aa  62  0.0000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2637  helicase-like protein  28.74 
 
 
1528 aa  62.4  0.0000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.209062  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1976  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.04 
 
 
838 aa  62.4  0.0000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2842  DEAD/DEAH box helicase-like  29.31 
 
 
321 aa  61.6  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.567167 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4387  DEAD/DEAH box helicase domain protein  28.36 
 
 
1489 aa  60.8  0.0000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.351978  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2258  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.61 
 
 
897 aa  60.8  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.22294  normal  0.971461 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0370  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.22 
 
 
778 aa  60.8  0.0000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0213184  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1240  DEAD/H associated domain protein  33.95 
 
 
1632 aa  60.8  0.0000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1574  DEAD/H associated domain protein  29.13 
 
 
1379 aa  60.5  0.0000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3426  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  42.11 
 
 
738 aa  60.5  0.0000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3077  DEAD/DEAH box helicase domain protein  39.78 
 
 
706 aa  60.1  0.0000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.711638  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2198  DEAD/DEAH box helicase domain protein  28.97 
 
 
1198 aa  60.5  0.0000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1206  DEAD/DEAH box helicase domain protein  37.37 
 
 
711 aa  60.1  0.0000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.369938  hitchhiker  0.000000452648 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28840  putative helicase  42.11 
 
 
736 aa  59.3  0.0000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000474734  decreased coverage  0.00000000117417 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_40984  predicted protein  37.36 
 
 
815 aa  59.3  0.0000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.954801  normal  0.413505 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2543  DEAD/DEAH box helicase  28.67 
 
 
751 aa  59.3  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0088  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  26.98 
 
 
913 aa  58.5  0.000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.403606 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>