More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_0895 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008740  Maqu_0895  response regulator receiver protein  100 
 
 		 250 aa  501  1e-141  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1888  response regulator receiver protein  36.73 
 
 		 365 aa  99.4  4e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.660438  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2287  response regulator receiver domain-containing protein  38.58 
 
 		 460 aa  97.4  2e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000712178  hitchhiker  0.00000369164 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3020  response regulator receiver protein  36.44 
 
 		 121 aa  79.7  0.00000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.447611  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2900  response regulator receiver protein  35.59 
 
 		 121 aa  78.2  0.0000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.197839  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3577  response regulator receiver protein  35.59 
 
 		 121 aa  78.2  0.0000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.400966  normal  0.141746 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0902  response regulator receiver protein  34.75 
 
 		 121 aa  77  0.0000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.844306 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3689  response regulator receiver protein  35.96 
 
 		 121 aa  74.3  0.000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.443278  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0693  response regulator receiver protein  31.43 
 
 		 639 aa  73.9  0.000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000123693 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2780  response regulator receiver protein  35.09 
 
 		 121 aa  74.3  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.76051 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3337  response regulator receiver protein  35.09 
 
 		 121 aa  74.3  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3776  response regulator receiver domain-containing protein  35.71 
 
 		 120 aa  73.2  0.000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.143561 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0489  response regulator receiver  32.76 
 
 		 121 aa  72.8  0.000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.646514  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2622  response regulator receiver  36.11 
 
 		 123 aa  72.4  0.000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2691  putative PAS/PAC sensor protein  31.87 
 
 		 385 aa  72.4  0.000000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.10412 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1137  response regulator receiver domain-containing protein  37.04 
 
 		 121 aa  72  0.000000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.635456 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0758  response regulator receiver protein  32.52 
 
 		 132 aa  71.2  0.00000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0540632 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0717  response regulator receiver protein  31.53 
 
 		 115 aa  71.2  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3990  response regulator receiver protein  28.57 
 
 		 146 aa  71.6  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.27172  normal  0.4632 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1139  response regulator receiver  30.17 
 
 		 121 aa  70.5  0.00000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0392  response regulator receiver  30.77 
 
 		 351 aa  70.9  0.00000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.196838  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0743  response regulator receiver protein  31.71 
 
 		 132 aa  70.1  0.00000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5033  type IV pilus response regulator PilH  32.76 
 
 		 121 aa  70.5  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3768  response regulator receiver protein  34.15 
 
 		 120 aa  70.1  0.00000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.48045  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1372  response regulator receiver domain-containing protein  34.55 
 
 		 121 aa  70.5  0.00000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0313107  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0670  response regulator receiver domain-containing protein  33.33 
 
 		 122 aa  70.5  0.00000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00691443  normal  0.823575 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3970  response regulator receiver protein  32.74 
 
 		 121 aa  69.7  0.00000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0244969 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0913  response regulator receiver protein  33.88 
 
 		 301 aa  69.7  0.00000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.348072  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3999  adenylate/guanylate cyclase  31.65 
 
 		 351 aa  69.7  0.00000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.558191 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4019  response regulator receiver protein  30.17 
 
 		 396 aa  69.7  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2960  response regulator receiver  37.04 
 
 		 190 aa  69.3  0.00000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0852903  normal  0.915615 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4057  response regulator receiver protein  30.17 
 
 		 396 aa  69.7  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0404  response regulator receiver protein  31.9 
 
 		 121 aa  69.3  0.00000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0515  response regulator receiver protein  31.93 
 
 		 120 aa  68.9  0.00000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.163432  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2467  response regulator receiver modulated serine phosphatase  34.04 
 
 		 385 aa  69.3  0.00000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1234  response regulator receiver protein  34.26 
 
 		 122 aa  68.9  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1264  response regulator receiver protein  34.26 
 
 		 122 aa  68.9  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0578681  hitchhiker  0.00155192 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3353  response regulator receiver protein  36.36 
 
 		 121 aa  68.9  0.00000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.392561  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0473  response regulator receiver protein  34.78 
 
 		 121 aa  68.9  0.00000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.950452  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4625  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 121 aa  68.6  0.00000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.635313  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3183  chemotaxis response regulator  33.33 
 
 		 126 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.258509  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0356  response regulator receiver protein  35.65 
 
 		 121 aa  68.2  0.0000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0780111  normal  0.957515 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0669  putative twitching motility two-component response regulator transcription regulator protein  31.53 
 
 		 122 aa  67.4  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3968  response regulator receiver protein  29.66 
 
 		 125 aa  67.8  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0719  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.43 
 
 		 531 aa  67.4  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0749  response regulator receiver protein  40.24 
 
 		 406 aa  67.8  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.893418  normal  0.0890519 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2695  response regulator receiver domain-containing protein  31.45 
 
 		 186 aa  67.4  0.0000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00269866  normal  0.78823 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3680  response regulator receiver domain-containing protein  26.09 
 
 		 127 aa  67.4  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.383377  normal  0.047176 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1573  response regulator receiver protein  33.63 
 
 		 121 aa  67.8  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.146471 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5307  response regulator receiver domain-containing protein  32.76 
 
 		 121 aa  67  0.0000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0137607  normal  0.215998 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05330  twitching motility protein PilH  31.03 
 
 		 121 aa  66.6  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0509  twitching motility protein PilH  31.03 
 
 		 121 aa  66.6  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0986  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  30.95 
 
 		 433 aa  66.2  0.0000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0645349  normal  0.624976 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3499  transcriptional regulator LuxR family  26.06 
 
 		 312 aa  66.2  0.0000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0059  response regulator receiver domain-containing protein  34.21 
 
 		 125 aa  66.2  0.0000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.157498  normal  0.212271 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2401  phosphate regulon transcriptional regulatory protein phoB  29.5 
 
 		 229 aa  66.2  0.0000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2841  ATPase domain-containing protein  40.37 
 
 		 577 aa  66.2  0.0000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.274853  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3067  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  40.37 
 
 		 577 aa  66.2  0.0000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.405289  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3136  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  28.5 
 
 		 919 aa  65.9  0.0000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3877  response regulator receiver protein  34.85 
 
 		 130 aa  65.9  0.0000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3633  response regulator receiver domain-containing protein  31.53 
 
 		 120 aa  65.9  0.0000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.480345  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3308  response regulator receiver protein  35.16 
 
 		 130 aa  65.9  0.0000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.678314  normal  0.215079 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3115  chemotaxis response regulator  33.33 
 
 		 126 aa  65.9  0.0000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2860  chemotaxis response regulator  33.33 
 
 		 126 aa  65.9  0.0000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3436  chemotaxis response regulator  33.33 
 
 		 126 aa  65.9  0.0000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.487873  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0078  chemotaxis two-component response regulator CheY1  33.33 
 
 		 126 aa  65.9  0.0000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3856  chemotaxis protein CheY  33.33 
 
 		 126 aa  65.9  0.0000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.119201  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1014  CheA signal transduction histidine kinase  37.61 
 
 		 928 aa  65.5  0.0000000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.186099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3937  chemotaxis protein CheY  33.33 
 
 		 126 aa  65.9  0.0000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.450944  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1683  chemotaxis response regulator  33.33 
 
 		 126 aa  65.9  0.0000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.058459  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2959  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  38.26 
 
 		 571 aa  65.5  0.0000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5041  response regulator receiver protein  32.2 
 
 		 121 aa  65.1  0.0000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0561  response regulator receiver protein  32.48 
 
 		 122 aa  65.1  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.718467 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0647  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.58 
 
 		 944 aa  64.7  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0902383 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3355  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  32.73 
 
 		 405 aa  64.7  0.000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0613  response regulator receiver protein  32.48 
 
 		 122 aa  65.1  0.000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.242329  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0601  Signal transduction histidine kinase-like protein  31.93 
 
 		 1442 aa  64.7  0.000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0246  osmolarity response regulator  33.33 
 
 		 246 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0521802  normal  0.0191352 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2502  sensor histidine kinase/response regulator  31.19 
 
 		 676 aa  63.9  0.000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000989132  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5109  GAF sensor hybrid histidine kinase  34.52 
 
 		 2099 aa  63.9  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0669819 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2789  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 121 aa  64.3  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0135  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  35.19 
 
 		 858 aa  63.9  0.000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.711395  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0130  response regulator receiver  28.81 
 
 		 121 aa  64.7  0.000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3794  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  30.7 
 
 		 376 aa  63.9  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0277983  normal  0.543799 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3066  two component transcriptional regulator, LuxR family  24.07 
 
 		 305 aa  63.9  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2143  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  27.05 
 
 		 755 aa  63.9  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1815  response regulator receiver domain-containing protein  32.2 
 
 		 411 aa  64.3  0.000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.800608  normal  0.49797 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2152  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  30.89 
 
 		 273 aa  64.3  0.000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0525986 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0494  CheA signal transduction histidine kinases  30.83 
 
 		 798 aa  64.3  0.000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1509  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  32.09 
 
 		 571 aa  64.3  0.000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.44121  normal  0.0349148 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2977  response regulator receiver domain-containing protein  29.27 
 
 		 303 aa  64.3  0.000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.13601 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1847  CheA signal transduction histidine kinase  28.95 
 
 		 934 aa  63.9  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.379526 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0271  osmolarity response regulator  33.33 
 
 		 246 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0261  osmolarity response regulator  33.33 
 
 		 246 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.429713 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4862  CheA signal transduction histidine kinase  28.83 
 
 		 1646 aa  63.2  0.000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00418474 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1114  response regulator receiver modulated serine phosphatase  34.75 
 
 		 391 aa  63.5  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0692  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  29.85 
 
 		 270 aa  63.5  0.000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.370043  unclonable  0.00000000838432 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0681  response regulator receiver protein  28.57 
 
 		 639 aa  63.9  0.000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.657626  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3340  response regulator receiver  31.75 
 
 		 131 aa  63.5  0.000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.269643 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3248  response regulator receiver protein  33.71 
 
 		 121 aa  63.5  0.000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.500247 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>