89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_2658 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_2658  phosphoglycerate mutase  100 
 
 		 216 aa  423  1e-117  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0521  fructose-2,6-biphosphatase  48.91 
 
 		 183 aa  159  4e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.37319  normal  0.0108392 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2301  fructose-2,6-biphosphatase  53.33 
 
 		 199 aa  157  9e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0845  phosphoglycerate mutase  41.33 
 
 		 204 aa  139  3.9999999999999997e-32  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.249912 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1028  phosphoglycerate mutase  37.97 
 
 		 183 aa  132  3.9999999999999996e-30  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0927  phosphoglycerate mutase  40.78 
 
 		 194 aa  101  9e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0214676  normal  0.879508 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5687  phosphoglycerate mutase  36.7 
 
 		 200 aa  94  2e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00492509  normal  0.129432 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2568  Phosphoglycerate mutase  35.98 
 
 		 183 aa  81.6  0.000000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.691388  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0677  phosphoglycerate mutase  41.43 
 
 		 203 aa  79.7  0.00000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0384229  normal  0.186973 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0151  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  38.04 
 
 		 185 aa  78.2  0.00000000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4486  Phosphoglycerate mutase  30.53 
 
 		 174 aa  78.2  0.00000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0491254 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0739  phosphoglycerate mutase  34.95 
 
 		 182 aa  77.8  0.0000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.691436 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0090  phosphoglycerate mutase  26.78 
 
 		 177 aa  76.6  0.0000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0656  Phosphoglycerate mutase  41.6 
 
 		 203 aa  76.3  0.0000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0161157  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0640  phosphoglycerate mutase  37.35 
 
 		 184 aa  74.3  0.000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0203907 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1343  Phosphoglycerate mutase  41.22 
 
 		 202 aa  74.3  0.000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.390919  normal  0.275943 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2609  phosphoglycerate mutase  38.1 
 
 		 181 aa  72.8  0.000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0690  phosphoglycerate mutase family protein  35.48 
 
 		 199 aa  72  0.000000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2322  phosphoglycerate mutase family protein  35.48 
 
 		 199 aa  72  0.000000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0938513  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2964  phosphoglycerate mutase family protein  35.48 
 
 		 199 aa  72  0.000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1033  alpha-ribazole phosphatase  35.48 
 
 		 199 aa  72  0.000000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.341718  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1039  alpha-ribazole phosphatase  35.48 
 
 		 199 aa  72  0.000000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.634348  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1634  alpha-ribazole phosphatase  35.48 
 
 		 199 aa  72  0.000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.135976  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1193  phosphoglycerate mutase family protein  35.48 
 
 		 616 aa  71.6  0.000000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.670037  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2395  hypothetical protein  34.62 
 
 		 192 aa  68.9  0.00000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0609145 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2208  alpha-ribazole phosphatase  37.5 
 
 		 196 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0271379  normal  0.94187 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0632  phosphoglycerate mutase  31.9 
 
 		 177 aa  65.5  0.0000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.209628  normal  0.482177 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3497  putative phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  29.82 
 
 		 196 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.668358  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0100  phosphoglycerate mutase  28.92 
 
 		 191 aa  64.3  0.000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0704  phosphoglycerate mutase family protein  32.5 
 
 		 179 aa  63.5  0.000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000429574 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0839  phosphoglycerate mutase family protein, putative  33.69 
 
 		 196 aa  62  0.000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.543457  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1000  alpha-ribazole phosphatase  29.24 
 
 		 196 aa  61.6  0.000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3764  Phosphoglycerate mutase  35.5 
 
 		 196 aa  60.8  0.00000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1298  Phosphoglycerate mutase  32.48 
 
 		 211 aa  61.2  0.00000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000085953  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2026  phosphoglycerate mutase family protein  33.94 
 
 		 177 aa  60.8  0.00000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0128823 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2661  alpha-ribazole phosphatase  30.69 
 
 		 192 aa  58.9  0.00000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.321223  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2367  alpha-ribazole phosphatase  32.98 
 
 		 194 aa  58.5  0.00000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2203  alpha-ribazole phosphatase  32.42 
 
 		 192 aa  57.8  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0925085 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1411  phosphoglycerate mutase  31.15 
 
 		 197 aa  57.8  0.0000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.722686  normal  0.228639 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2456  alpha-ribazole phosphatase  34.05 
 
 		 194 aa  57  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.788863  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5377  Phosphoglycerate mutase  29.13 
 
 		 177 aa  55.5  0.0000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1840  phosphoglycerate mutase  33.16 
 
 		 194 aa  55.5  0.0000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0552863  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2451  phosphoglycerate mutase  33.16 
 
 		 194 aa  55.5  0.0000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.20579  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2783  phosphoglycerate mutase  27.8 
 
 		 195 aa  52.8  0.000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.448968  normal  0.574141 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0327  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  35.34 
 
 		 189 aa  52.4  0.000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0660  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  30.63 
 
 		 196 aa  52  0.000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0759  alpha-ribazole-5'-phosphate phosphatase, putative  30.19 
 
 		 208 aa  50.4  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1817  Phosphoglycerate mutase  33.62 
 
 		 208 aa  50.1  0.00003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0771  Phosphoglycerate mutase  32.93 
 
 		 222 aa  49.7  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0621  phosphoglycerate mutase family protein  32.93 
 
 		 222 aa  49.7  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2499  phosphoglycerate mutase  34.1 
 
 		 194 aa  49.3  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.458709  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23210  fructose-2,6-bisphosphatase  36.56 
 
 		 189 aa  49.3  0.00005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00235832 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3818  Phosphoglycerate mutase  29.52 
 
 		 227 aa  48.9  0.00007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.824484  normal  0.361533 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4141  phosphoglycerate mutase  29.5 
 
 		 196 aa  48.5  0.00008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.287698 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5852  Phosphoglycerate mutase  35.76 
 
 		 197 aa  48.5  0.00008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.415555  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1185  Phosphoglycerate mutase  32.4 
 
 		 191 aa  47.8  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1026  Phosphoglycerate mutase  29.77 
 
 		 182 aa  47.4  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2083  Phosphoglycerate mutase  34.35 
 
 		 412 aa  45.8  0.0004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.244664  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0686  alpha-ribazole phosphatase  29.41 
 
 		 213 aa  45.8  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000115234  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1696  Phosphoglycerate mutase  31.3 
 
 		 201 aa  45.8  0.0005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2159  hypothetical protein  26.35 
 
 		 213 aa  45.8  0.0005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0651  phosphoglycerate mutase  31.71 
 
 		 235 aa  45.8  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.761339 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1928  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  34.57 
 
 		 201 aa  45.8  0.0005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0314739  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0114  Phosphoglycerate mutase  24.73 
 
 		 210 aa  45.1  0.0008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000110333  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5782  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  37.25 
 
 		 194 aa  45.1  0.0008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.400935 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0759  alpha-ribazole phosphatase  29.83 
 
 		 202 aa  44.7  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0339259  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0843  alpha-ribazole phosphatase  32.43 
 
 		 195 aa  44.7  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2449  phosphoglycerate mutase  25.38 
 
 		 204 aa  44.7  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0639  Phosphoglycerate mutase  32.59 
 
 		 193 aa  45.1  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2250  Phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 		 195 aa  43.9  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.408643 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1453  Phosphoglycerate mutase  28.72 
 
 		 190 aa  44.3  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0695577  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3403  aminotransferase class I and II  34.27 
 
 		 188 aa  44.3  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0624643  normal  0.192224 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1379  Phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 		 197 aa  43.9  0.002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1513  phosphoribosyltransferase, putative/phosphoglycerate mutase family protein  25.37 
 
 		 438 aa  44.3  0.002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000537342 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3656  phosphoglycerate mutase family protein  30.93 
 
 		 277 aa  43.9  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0464  alpha-ribazole-5`-phosphate phosphatase CobC, putative  32.91 
 
 		 197 aa  43.5  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2605  phosphoglycerate mutase family protein  31.82 
 
 		 180 aa  43.5  0.002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3578  Phosphoglycerate mutase  29.29 
 
 		 225 aa  43.1  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00100767 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0746  alpha-ribazole phosphatase  29.28 
 
 		 202 aa  43.5  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.0000196602  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0803  alpha-ribazole phosphatase  29.28 
 
 		 202 aa  43.5  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00133737  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0700  alpha-ribazole phosphatase  29.83 
 
 		 202 aa  43.1  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00606561  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4807  Phosphoglycerate mutase  30.43 
 
 		 198 aa  43.5  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.000268692  normal  0.187033 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0628  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  31.88 
 
 		 197 aa  43.5  0.003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.190097  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0234  Phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 		 181 aa  42.7  0.004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.953882 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4661  phosphoglycerate mutase  29.31 
 
 		 185 aa  42.4  0.006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0209  phosphoglycerate mutase  34.21 
 
 		 218 aa  42  0.007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6815  Fructose-2 6-bisphosphatase-like protein  32.31 
 
 		 452 aa  42  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.142428 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1239  alpha-ribazole phosphatase  31.45 
 
 		 189 aa  41.6  0.008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.670412  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0598  phosphoglycerate mutase  38.54 
 
 		 194 aa  42  0.008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>