More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_1207 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_1207  ABC transporter-related protein  100 
 
 		 232 aa  464  9.999999999999999e-131  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2716  ABC transporter related  82.48 
 
 		 234 aa  385  1e-106  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0337117  normal  0.373128 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4111  ABC transporter related  71.67 
 
 		 248 aa  323  1e-87  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.241879 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2306  ABC transporter related protein  47.6 
 
 		 236 aa  219  1.9999999999999999e-56  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3456  ABC transporter related  44.09 
 
 		 236 aa  197  9e-50  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0197  ABC transporter related  46.76 
 
 		 234 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1048  ABC transporter related  44.09 
 
 		 236 aa  197  2.0000000000000003e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1577  ABC transporter related  44.44 
 
 		 238 aa  197  2.0000000000000003e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.787524  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6727  ABC transporter related  45.65 
 
 		 233 aa  195  5.000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2309  ABC transporter related  45.34 
 
 		 236 aa  195  6e-49  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3462  ABC transporter related  46.98 
 
 		 235 aa  194  8.000000000000001e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2686  ABC transporter-like protein  45.78 
 
 		 484 aa  194  9e-49  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.473658  normal  0.293946 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3085  ABC transporter related  43.84 
 
 		 237 aa  192  3e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.639001  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2029  ABC transporter related  45.75 
 
 		 246 aa  192  4e-48  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.178802  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5821  ABC transporter related  45.22 
 
 		 233 aa  191  8e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.602049  normal  0.151305 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2157  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  43.78 
 
 		 232 aa  190  1e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.360084  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2768  ABC transporter related  43.38 
 
 		 237 aa  191  1e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0458182  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3208  ABC transporter related  43.58 
 
 		 231 aa  190  1e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.365386  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1099  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  45.09 
 
 		 231 aa  189  2.9999999999999997e-47  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.810395  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0950  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  43.93 
 
 		 230 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3687  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  43.93 
 
 		 230 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.137759 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2866  ABC transporter related  45.41 
 
 		 233 aa  189  4e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.699047 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2997  ABC transporter related  45.06 
 
 		 232 aa  189  4e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.700022  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1793  ABC transporter related  42.2 
 
 		 235 aa  188  5e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0222  ABC transporter related  43.81 
 
 		 243 aa  188  5e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4027  ABC transporter related  45.87 
 
 		 232 aa  188  5e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.578971  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3295  ABC branched-chain amino acid transporter, ATPase subunit  45.87 
 
 		 232 aa  188  5.999999999999999e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.123926  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0050  ABC transporter related  46.26 
 
 		 232 aa  187  1e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.906419  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2255  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  45.58 
 
 		 230 aa  187  1e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.255025  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3290  ABC transporter related  45.41 
 
 		 232 aa  187  2e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.116153  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3165  ABC transporter related  43.66 
 
 		 241 aa  187  2e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.317931  normal  0.242045 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1957  putative branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  42.42 
 
 		 231 aa  186  3e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1020  ABC transporter related  43.54 
 
 		 240 aa  186  3e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2496  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  42.86 
 
 		 232 aa  185  4e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0491391  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0028  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  39.82 
 
 		 238 aa  185  6e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0669  ABC-type branched-chain amino acid transport systems ATPase component  45.05 
 
 		 234 aa  185  6e-46  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.488377 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4658  ABC transporter related  45.21 
 
 		 236 aa  185  7e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.387595  normal  0.829022 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0186  ABC transporter related  43.12 
 
 		 244 aa  184  7e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5724  ABC transporter related  45.07 
 
 		 233 aa  185  7e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6088  ABC transporter related  45.07 
 
 		 233 aa  185  7e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.89804  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1403  ABC transporter related  43.58 
 
 		 237 aa  184  8e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.668018  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1754  amino-acid ATP-binding ABC transporter protein  43.98 
 
 		 239 aa  184  9e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.395881  normal  0.658202 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2929  ABC transporter related  46.08 
 
 		 230 aa  184  9e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3053  ABC transporter related protein  45 
 
 		 235 aa  184  1.0000000000000001e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4010  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  43.38 
 
 		 235 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00833524  normal  0.256095 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3649  ABC transporter-related protein  42.86 
 
 		 237 aa  184  1.0000000000000001e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3737  putative branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  46.05 
 
 		 234 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.548098  normal  0.605749 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2926  ABC transporter related  42.52 
 
 		 231 aa  184  1.0000000000000001e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.103898  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1425  ABC transporter-related protein  43.98 
 
 		 232 aa  184  1.0000000000000001e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0615  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  43.19 
 
 		 231 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1261  ABC transporter related  43.3 
 
 		 235 aa  183  2.0000000000000003e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6571  ABC transporter related  45.07 
 
 		 233 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.177691  normal  0.0408481 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0655  ABC transporter related  43.19 
 
 		 231 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.139364 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4329  ABC transporter related  42.17 
 
 		 237 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1755  ABC transporter related  46.98 
 
 		 234 aa  183  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0660  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  41.74 
 
 		 237 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0661  ABC transporter related  43.19 
 
 		 231 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.579097  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4555  ABC transporter related  47.2 
 
 		 238 aa  183  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64310  putative ABC transport ATP-binding subunit  44.24 
 
 		 232 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.349847  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1715  ABC transporter related  43.29 
 
 		 234 aa  183  2.0000000000000003e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0199922  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2580  ABC transporter related protein  45.24 
 
 		 230 aa  183  3e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.630043  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4367  ABC transporter related  44.04 
 
 		 236 aa  182  3e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.583666  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0697  ABC transporter related  42.86 
 
 		 232 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0175  ABC transporter related  45.62 
 
 		 259 aa  182  4.0000000000000006e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.154822  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0736  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  44.91 
 
 		 234 aa  182  4.0000000000000006e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1858  ABC transporter-related protein  43.06 
 
 		 237 aa  182  4.0000000000000006e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.115149 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0701  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  40.26 
 
 		 230 aa  182  4.0000000000000006e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.944292  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5583  urea ABC transporter ATP-binding protein UrtE  43.78 
 
 		 232 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0412532  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2456  ABC transporter related  43.3 
 
 		 237 aa  182  5.0000000000000004e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0157  ABC transporter related  45.62 
 
 		 259 aa  182  5.0000000000000004e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2498  ABC transporter related  45.45 
 
 		 235 aa  181  6e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0405923  normal  0.181063 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4922  ABC transporter related  42.54 
 
 		 233 aa  182  6e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000104533  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2387  ABC transporter related  40.27 
 
 		 231 aa  181  7e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0332278  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1673  ABC transporter related  41.35 
 
 		 251 aa  181  7e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.646828  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3528  ABC transporter related  45.79 
 
 		 234 aa  181  8.000000000000001e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.140844  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1076  ABC transporter related  46.73 
 
 		 234 aa  181  8.000000000000001e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.0000101179  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0225  ABC transporter related  44.95 
 
 		 237 aa  180  1e-44  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.633175  normal  0.041415 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3676  putative branched-chain amino acid transport system ATP-binding protein  46.54 
 
 		 234 aa  179  2e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.399578  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0537  ABC transporter related  42.08 
 
 		 249 aa  179  2e-44  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.135709  unclonable  0.0000000163343 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1992  ABC transporter related  41.47 
 
 		 232 aa  179  2e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.17917  normal  0.282199 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2518  ABC transporter related  40.52 
 
 		 248 aa  179  2e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.778502  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2574  ABC transporter related  42.99 
 
 		 231 aa  180  2e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.261355  normal  0.546641 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3373  ABC transporter related  45.69 
 
 		 236 aa  180  2e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.710585  normal  0.0235657 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2189  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  42.99 
 
 		 230 aa  180  2e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.113026 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0025  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  39.82 
 
 		 238 aa  180  2e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1853  ABC transporter-related protein  44.5 
 
 		 235 aa  180  2e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03303  leucine/isoleucine/valine transporter subunit  42.99 
 
 		 237 aa  179  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0261  ABC transporter related protein  42.99 
 
 		 237 aa  179  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03256  hypothetical protein  42.99 
 
 		 237 aa  179  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2790  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  40.09 
 
 		 232 aa  179  2.9999999999999997e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1088  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  39.91 
 
 		 230 aa  179  2.9999999999999997e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1903  ABC transporter related  42.99 
 
 		 244 aa  179  2.9999999999999997e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.638808  normal  0.412761 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3735  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  42.99 
 
 		 237 aa  179  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3312  ABC transporter related  41.12 
 
 		 231 aa  179  2.9999999999999997e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.000555614  hitchhiker  0.00984182 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0262  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  42.99 
 
 		 237 aa  179  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3207  ABC transporter related  45.12 
 
 		 230 aa  179  2.9999999999999997e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.973641  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2330  ABC transporter related  40.95 
 
 		 248 aa  179  2.9999999999999997e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.109731  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3868  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  42.99 
 
 		 241 aa  179  2.9999999999999997e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4754  ABC transporter-related protein  44.19 
 
 		 234 aa  179  2.9999999999999997e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4770  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  42.99 
 
 		 237 aa  179  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.355686 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>