More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_1205 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008527  LACR_1205  peptide ABC transporter ATPase  100 
 
 
233 aa  474  1e-133  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1004  ABC transporter, ATP-binding protein  69.1 
 
 
233 aa  333  2e-90  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00659829  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0745  ABC transporter, ATP-binding protein  66.95 
 
 
233 aa  325  5e-88  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.913109  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0728  ABC transporter, ATP-binding protein  66.95 
 
 
233 aa  325  5e-88  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1081  peptide ABC transporter ATPase  66.09 
 
 
236 aa  322  3e-87  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2590  ABC transporter related  62.34 
 
 
234 aa  309  2e-83  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1689  peptide ABC transporter ATPase  62.23 
 
 
233 aa  305  4.0000000000000004e-82  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2178  ABC transporter related  60.09 
 
 
233 aa  304  1.0000000000000001e-81  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0773  ABC transporter related  58.8 
 
 
233 aa  300  9e-81  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.805493  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01920  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  59.66 
 
 
233 aa  297  8e-80  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0563  ABC transporter related protein  61.8 
 
 
233 aa  296  2e-79  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1114  ABC transporter related  57.94 
 
 
233 aa  289  2e-77  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1363  ABC transporter related  57.33 
 
 
234 aa  287  1e-76  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1515  SalX-type ABC antimicrobial peptide transport system ATPase  58.37 
 
 
233 aa  283  1.0000000000000001e-75  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2453  ABC transporter related  57.14 
 
 
234 aa  280  2e-74  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000726379  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0132  ABC transporter, ATP-binding protein  56.22 
 
 
233 aa  276  2e-73  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2356  ABC transporter related  54.94 
 
 
233 aa  265  5e-70  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0836286  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0390  ABC transporter related  53.02 
 
 
232 aa  255  3e-67  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1715  ATPase  53.68 
 
 
236 aa  253  1.0000000000000001e-66  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2874  ABC transporter related  53.12 
 
 
236 aa  251  5.000000000000001e-66  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.675054  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0216  hypothetical protein  53.1 
 
 
236 aa  246  2e-64  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1479  ABC transporter-related protein  49.11 
 
 
244 aa  243  1.9999999999999999e-63  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2084  ABC transporter related  52.04 
 
 
239 aa  242  3e-63  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2656  ABC transporter, ATPase subunit  52.02 
 
 
248 aa  242  3e-63  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.177844  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1509  ABC transporter related  49.57 
 
 
248 aa  243  3e-63  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1421  ABC transporter related  50.44 
 
 
244 aa  242  3e-63  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2841  ABC transporter related  52.02 
 
 
244 aa  242  3e-63  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.321502  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1212  ABC transporter related  48.7 
 
 
251 aa  241  5e-63  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00777209 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1576  ABC transporter related  49.55 
 
 
236 aa  241  5e-63  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2747  ABC transporter-related protein  51.57 
 
 
244 aa  241  7e-63  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00686798  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1279  ABC transporter related  46.96 
 
 
253 aa  241  9e-63  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2064  ABC transporter related protein  50.89 
 
 
244 aa  240  2e-62  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.325549  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1583  ABC transporter related  48.05 
 
 
232 aa  238  5e-62  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1942  ABC transporter related  50.89 
 
 
254 aa  238  6.999999999999999e-62  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.934009  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4676  Sigma 54 interacting domain protein  52.47 
 
 
234 aa  238  6.999999999999999e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1479  ABC transporter related  49.55 
 
 
240 aa  237  1e-61  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1125  ATPase  49.33 
 
 
245 aa  236  2e-61  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.237557 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4268  ABC transporter-related protein  50.89 
 
 
238 aa  236  2e-61  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3436  putative ABC transporter, ATP-binding protein  52.23 
 
 
245 aa  235  4e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.165594  normal  0.540344 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0062  ABC transporter, ATP-binding protein  47.84 
 
 
234 aa  235  4e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.857763  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2302  ABC transporter related  49.11 
 
 
243 aa  235  4e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.704098  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5377  putative ABC transporter, ATP-binding protein  51.34 
 
 
253 aa  235  4e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.409003 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4501  ABC transporter related  48.66 
 
 
234 aa  234  7e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.293779 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4369  ABC transporter related  48.66 
 
 
234 aa  234  7e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2067  peptide ABC transporter ATP-binding protein  49.11 
 
 
240 aa  234  7e-61  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.610569 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2961  ABC transporter related  48.88 
 
 
238 aa  231  5e-60  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.109609  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1056  ABC transporter related  49.78 
 
 
240 aa  231  8.000000000000001e-60  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1918  ABC transporter related  48.66 
 
 
236 aa  231  8.000000000000001e-60  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0076  ABC transporter ATP-binding protein  48.66 
 
 
235 aa  231  9e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.514919 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2206  ABC transporter related  48.21 
 
 
251 aa  230  1e-59  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.661126  normal  0.0101904 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1013  ABC transporter related  50.45 
 
 
245 aa  230  1e-59  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2281  ABC transporter related  50.45 
 
 
235 aa  228  6e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.341913  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1145  ABC transporter related  45.45 
 
 
236 aa  228  7e-59  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1666  ABC transporter related protein  49.36 
 
 
235 aa  227  1e-58  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.029475  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1693  ABC transporter related  48.48 
 
 
232 aa  226  2e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3583  ABC transporter related  48.88 
 
 
241 aa  226  2e-58  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6252  ABC transporter related  51.21 
 
 
234 aa  223  2e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.946819  normal  0.438945 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4213  ABC transporter related  46.88 
 
 
245 aa  221  9e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1583  ABC transporter ATPase  49.11 
 
 
241 aa  221  9.999999999999999e-57  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.929196  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5173  ABC transporter related  46.19 
 
 
238 aa  219  1.9999999999999999e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0324  ABC transporter related protein  47.77 
 
 
235 aa  217  1e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.985254 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03250  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  44.64 
 
 
233 aa  217  1e-55  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.684387  normal  0.338705 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0109  ABC transporter related  47.58 
 
 
243 aa  217  1e-55  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.112558  normal  0.0826339 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0302  ABC transporter related  49.11 
 
 
250 aa  214  9.999999999999999e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01810  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  46.51 
 
 
236 aa  211  7.999999999999999e-54  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl019  glutamine ABC transporter  44.55 
 
 
604 aa  201  7e-51  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0021  ABC transporter, ATP-binding protein  43.1 
 
 
345 aa  201  7e-51  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1514  ABC transporter related  44.09 
 
 
232 aa  201  9e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3337  ABC transporter, ATP-binding protein  46.32 
 
 
246 aa  199  3e-50  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0440126  decreased coverage  0.00217746 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1084  ABC transporter related  48.64 
 
 
234 aa  198  6e-50  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0369  ABC transporter related  47.49 
 
 
234 aa  198  7e-50  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.548641  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0521  ABC transporter related  48.43 
 
 
225 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0272537  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03342  ABC transporter ATP-binding protein  44.75 
 
 
229 aa  197  2.0000000000000003e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1543  ABC transporter related  47 
 
 
234 aa  196  3e-49  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.686883  normal  0.0297617 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0223  ABC transporter related  48.87 
 
 
225 aa  194  9e-49  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0225  ABC transporter related  48.87 
 
 
225 aa  194  9e-49  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0669  ABC transporter related  44 
 
 
242 aa  194  1e-48  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0633  ABC transporter, ATPase subunit  44.02 
 
 
252 aa  193  2e-48  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0652413  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0743  ABC transporter related  43.56 
 
 
226 aa  193  2e-48  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0694  ABC transporter related  44.34 
 
 
230 aa  192  3e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00813244  hitchhiker  0.000136942 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3220  ABC transporter related  42.36 
 
 
235 aa  192  3e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000135458  normal  0.0828287 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1678  ABC transporter related  45.33 
 
 
235 aa  192  4e-48  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.184707  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0741  ABC transporter related  43.67 
 
 
228 aa  192  4e-48  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00469755  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0331  peptide ABC transporter ATPase  42.02 
 
 
662 aa  191  7e-48  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0848713  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0583  ABC transporter related  44.44 
 
 
234 aa  191  1e-47  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.540435  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0568  ABC transporter related  44.44 
 
 
234 aa  191  1e-47  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2628  ABC transporter related  43.81 
 
 
241 aa  190  2e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2210  ABC transporter related protein  43.98 
 
 
234 aa  190  2e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00255017  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2931  ABC transporter related  44.86 
 
 
228 aa  190  2e-47  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000152083  normal  0.599943 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1563  ABC transporter related  45.33 
 
 
249 aa  190  2e-47  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2759  ABC transporter related  43.54 
 
 
256 aa  189  2e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000159269  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0872  ABC transporter-like protein  43.58 
 
 
248 aa  190  2e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.175759  normal  0.103583 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1574  ABC transporter related  45.25 
 
 
225 aa  190  2e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0590821  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0199  ABC transporter related  43.38 
 
 
230 aa  189  2.9999999999999997e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2301  ABC transporter related protein  42.86 
 
 
264 aa  189  4e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00393831  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3314  ABC transporter related protein  42.86 
 
 
643 aa  189  4e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2297  ABC transporter related  44.09 
 
 
225 aa  189  4e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2457  ABC-type transport systems, involved in lipoprotein release, ATPase components  43.48 
 
 
244 aa  188  5e-47  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1995  ABC transporter related protein  39.91 
 
 
229 aa  188  5.999999999999999e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.691117  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2148  ABC transporter related  42.01 
 
 
225 aa  188  5.999999999999999e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.357033  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>