More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_06880 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_06880  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  100 
 
 		 307 aa  622  1e-177  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0918509  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4276  ABC transporter related protein  60.66 
 
 		 303 aa  377  1e-103  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.258754  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0452  ABC transporter related protein  59.87 
 
 		 305 aa  370  1e-101  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0790883 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4168  ABC transporter related  60.26 
 
 		 318 aa  365  1e-100  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000564346 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1854  ABC transporter related protein  59.87 
 
 		 303 aa  360  1e-98  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0626891  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4447  ABC transporter related  57.48 
 
 		 303 aa  355  3.9999999999999996e-97  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3788  ABC transporter related  58.28 
 
 		 318 aa  353  2.9999999999999997e-96  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.352086  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0603  ABC transporter-like protein  57.43 
 
 		 317 aa  352  5e-96  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.715889  normal  0.858609 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1133  ABC transporter related protein  55.96 
 
 		 304 aa  348  7e-95  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0977  ABC transporter related  56.25 
 
 		 328 aa  345  6e-94  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0400236 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3975  ABC transporter related  43.09 
 
 		 312 aa  225  6e-58  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.138186  normal  0.317235 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2235  ABC transporter related protein  41.18 
 
 		 334 aa  206  3e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0461241  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2859  ABC transporter related  44.95 
 
 		 301 aa  171  2e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1219  ABC transporter related  42.31 
 
 		 299 aa  165  1.0000000000000001e-39  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.538125  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3488  ABC transporter related protein  42.79 
 
 		 316 aa  164  2.0000000000000002e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4167  ABC transporter related protein  38.89 
 
 		 330 aa  160  2e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.400455  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1320  ABC transporter related  36.79 
 
 		 300 aa  160  3e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1436  ABC-type multidrug transport system ATPase component  37.58 
 
 		 308 aa  160  4e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.200508  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18430  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  35.14 
 
 		 324 aa  159  7e-38  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2441  ABC transporter related protein  39.72 
 
 		 250 aa  158  1e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1021  ABC transporter related  36.79 
 
 		 298 aa  155  8e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1208  ABC transporter related  40.47 
 
 		 339 aa  155  8e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.697219  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0418  ABC transporter related  36.54 
 
 		 307 aa  155  8e-37  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.987895 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6250  ABC transporter related  38.78 
 
 		 457 aa  155  9e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1163  ABC transporter related  32.78 
 
 		 303 aa  154  1e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2521  ABC transporter related  41.83 
 
 		 284 aa  154  2e-36  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.436198 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1717  ABC transporter related protein  38.94 
 
 		 335 aa  154  2e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3765  ABC transporter related protein  33.22 
 
 		 306 aa  154  2e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.456335  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2467  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  30.97 
 
 		 305 aa  154  2e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2470  ABC transporter related protein  43.87 
 
 		 297 aa  154  2e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00132883  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2963  ABC transporter-like  30.82 
 
 		 316 aa  153  2.9999999999999998e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.23893  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1577  ABC transporter related protein  34.18 
 
 		 318 aa  153  2.9999999999999998e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2062  copper ABC transporter, ATP-binding protein  40.93 
 
 		 309 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.947517  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4130  ABC transporter related  40.48 
 
 		 303 aa  153  4e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0056  ABC transporter related  37.66 
 
 		 311 aa  152  5e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.576476 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0993  copper ABC transporter, ATP-binding protein  40.85 
 
 		 304 aa  152  5e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.193362  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0214  ABC transporter related  37.27 
 
 		 303 aa  152  5e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000423562  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2117  copper ABC transporter, ATP-binding protein  40.85 
 
 		 304 aa  152  5e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0732  ABC transporter related protein  41.43 
 
 		 318 aa  152  5.9999999999999996e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.515959  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2664  ABC transporter related  36.44 
 
 		 296 aa  152  7e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000181001  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0427  ABC transporter related  33.99 
 
 		 317 aa  151  1e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3742  ABC transporter related protein  34.85 
 
 		 312 aa  151  1e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1171  ABC transporter related protein  40.2 
 
 		 230 aa  151  2e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2969  ABC transporter related protein  39.82 
 
 		 373 aa  150  2e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.297443  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3951  ABC transporter related  37.27 
 
 		 300 aa  150  3e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.445411 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0761  ABC transporter related protein  41.43 
 
 		 242 aa  150  3e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.7197  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1321  ABC transporter-related protein  39.05 
 
 		 259 aa  150  3e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0916068  normal  0.515129 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6010  copper ABC transporter, ATP-binding protein NosF  42.22 
 
 		 306 aa  150  3e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.00601626  normal  0.07018 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1804  ABC transporter, ATP-binding protein  29.41 
 
 		 312 aa  150  3e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0781  ABC transporter, ATP-binding protein  28.21 
 
 		 309 aa  149  4e-35  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1057  ABC transporter related  37.09 
 
 		 310 aa  149  4e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2937  ABC transporter related  39.32 
 
 		 279 aa  149  4e-35  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1136  ABC transporter related  37.09 
 
 		 310 aa  149  4e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0444125  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2257  putative copper-related ABC transport system, ATP-binding protein  40.93 
 
 		 747 aa  149  5e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1781  ABC transporter related  37.09 
 
 		 306 aa  149  5e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00159996  normal  0.877081 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30550  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  39.18 
 
 		 368 aa  149  5e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5380  ABC transporter related protein  37.39 
 
 		 322 aa  149  6e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0478769  normal  0.847068 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0690  ABC transporter related  44.95 
 
 		 319 aa  149  6e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3536  ABC transporter, ATP-binding protein  29.74 
 
 		 312 aa  149  7e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2142  ABC transporter, ATPase subunit  32.48 
 
 		 311 aa  149  7e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.560639  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0892  ABC transporter related  39.08 
 
 		 302 aa  149  7e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1411  ABC transporter-related protein  38.64 
 
 		 303 aa  149  7e-35  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0264  ABC transporter related  31.56 
 
 		 309 aa  148  9e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3790  ABC transporter related  39.72 
 
 		 304 aa  148  9e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.021696  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1915  ABC transporter, ATP-binding protein  29.41 
 
 		 312 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1480  ABC transporter-related protein  36.01 
 
 		 338 aa  148  1.0000000000000001e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.132633 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3287  ABC transporter related protein  39.91 
 
 		 261 aa  148  1.0000000000000001e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1865  ABC transporter, ATP-binding protein  29.41 
 
 		 312 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.216814  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1639  multidrug ABC transporter, ATP-binding protein  29.41 
 
 		 312 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000283257  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26830  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  38.96 
 
 		 291 aa  147  2.0000000000000003e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.381076  normal  0.317185 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2323  copper ABC transporter, ATP-binding protein  40.57 
 
 		 304 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.797197  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0660  ABC transporter related  34.55 
 
 		 313 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.946314  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7020  ABC transporter related  34.43 
 
 		 306 aa  147  2.0000000000000003e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1841  ABC transporter, ATP-binding protein  29.41 
 
 		 312 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09560  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  35.06 
 
 		 319 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.212664 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1658  ABC transporter related  29.41 
 
 		 312 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0672996  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1661  ABC transporter ATP-binding protein  29.41 
 
 		 312 aa  147  3e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1608  multidrug ABC transporter, ATP-binding protein  29.41 
 
 		 312 aa  147  3e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1793  ABC transporter ATP-binding protein  29.41 
 
 		 312 aa  147  3e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0872  ABC transporter related  32.24 
 
 		 316 aa  147  3e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0892  ABC transporter related  39.91 
 
 		 332 aa  147  3e-34  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0904315  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36090  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  38.36 
 
 		 295 aa  147  3e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  hitchhiker  0.00151864  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3159  ABC transporter related  36.04 
 
 		 259 aa  146  4.0000000000000006e-34  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0427  ATPase  38.57 
 
 		 282 aa  146  4.0000000000000006e-34  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.965922 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0454  ABC transporter related protein  38.14 
 
 		 316 aa  146  4.0000000000000006e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.815425  normal  0.0841628 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2587  ABC transporter related  37.79 
 
 		 339 aa  146  4.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1681  ABC transporter related protein  42.18 
 
 		 298 aa  146  4.0000000000000006e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.948388  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3519  ABC transporter related  37.79 
 
 		 339 aa  146  4.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1955  ABC transporter, ATP-binding protein  31.84 
 
 		 282 aa  146  5e-34  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0758  ABC transporter related  37.17 
 
 		 305 aa  145  6e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.334038 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0549  ABC transporter related  41.2 
 
 		 300 aa  146  6e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.802344  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0561  ABC transporter related  41.2 
 
 		 300 aa  146  6e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.494582 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0539  ABC transporter related  41.2 
 
 		 300 aa  146  6e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4170  ABC transporter related  38.79 
 
 		 304 aa  145  6e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.720041  hitchhiker  0.00203248 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2706  ABC transporter related protein  29.85 
 
 		 369 aa  145  8.000000000000001e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000123322  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0215  ABC transporter-related protein  35.48 
 
 		 310 aa  145  8.000000000000001e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.314538  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4160  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.44 
 
 		 339 aa  145  9e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.144366 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3402  ABC transporter-related protein  37.9 
 
 		 322 aa  145  9e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00371017  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0501  ABC transporter-related protein  40.76 
 
 		 300 aa  145  1e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0121  ABC transporter related  38.97 
 
 		 270 aa  144  1e-33  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>