154 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_4128 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_4128  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 374 aa  733    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3521  Sarcosine oxidase  61.24 
 
 		 389 aa  431  1e-119  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0264649 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4345  Sarcosine oxidase  35.54 
 
 		 380 aa  181  2e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0304  FAD dependent oxidoreductase  35.6 
 
 		 384 aa  168  2e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6193  Sarcosine oxidase  37.02 
 
 		 352 aa  166  8e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.522956  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2363  Sarcosine oxidase  34.66 
 
 		 392 aa  156  5.0000000000000005e-37  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.182058  normal  0.337109 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1573  N-methyltryptophan oxidase  31.08 
 
 		 372 aa  150  4e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.596756 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1564  N-methyltryptophan oxidase  31.08 
 
 		 371 aa  149  6e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.223957  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1706  N-methyltryptophan oxidase  31.08 
 
 		 371 aa  149  6e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0258535  hitchhiker  0.000102665 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1672  N-methyltryptophan oxidase  31.08 
 
 		 371 aa  149  6e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0077  sarcosine oxidase  34.25 
 
 		 366 aa  145  1e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34590  glycine/D-amino acid oxidase, deaminating  34.32 
 
 		 399 aa  140  3.9999999999999997e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0115291  normal  0.563037 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3678  Sarcosine oxidase  32.78 
 
 		 376 aa  139  6e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4751  N-methyltryptophan oxidase  33.88 
 
 		 376 aa  138  2e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0979372  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01055  N-methyltryptophan oxidase, FAD-binding  30.4 
 
 		 372 aa  137  4e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2587  Sarcosine oxidase  30.4 
 
 		 372 aa  137  4e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01063  hypothetical protein  30.4 
 
 		 372 aa  137  4e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2028  N-methyltryptophan oxidase  30 
 
 		 372 aa  136  6.0000000000000005e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1257  N-methyltryptophan oxidase  30 
 
 		 372 aa  135  8e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.381174  normal  0.53223 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1228  N-methyltryptophan oxidase  30 
 
 		 372 aa  135  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.431985 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1272  N-methyltryptophan oxidase  30 
 
 		 372 aa  135  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1182  N-methyltryptophan oxidase  30.13 
 
 		 372 aa  135  9.999999999999999e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.929893  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2541  N-methyltryptophan oxidase  30.13 
 
 		 372 aa  135  9.999999999999999e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.771923  normal  0.494055 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2268  N-methyltryptophan oxidase  29.87 
 
 		 372 aa  134  3e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2070  N-methyltryptophan oxidase  29.6 
 
 		 372 aa  133  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.384764  normal  0.194177 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1438  N-methyltryptophan oxidase  29.87 
 
 		 372 aa  134  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.478275  normal  0.0445868 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1182  N-methyltryptophan oxidase  29.87 
 
 		 372 aa  132  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2212  N-methyltryptophan oxidase  29.22 
 
 		 372 aa  131  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.551548  normal  0.375717 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1596  Sarcosine oxidase  33.33 
 
 		 383 aa  131  2.0000000000000002e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0461748 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0115  N-methyltryptophan oxidase  33.07 
 
 		 377 aa  130  3e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3520  Sarcosine oxidase  34.46 
 
 		 390 aa  130  5.0000000000000004e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2708  Sarcosine oxidase  31.5 
 
 		 391 aa  129  6e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.36729 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3393  N-methyltryptophan oxidase  32.98 
 
 		 381 aa  129  9.000000000000001e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1288  Sarcosine oxidase  29.68 
 
 		 389 aa  126  5e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0118  N-methyltryptophan oxidase  32.35 
 
 		 389 aa  125  1e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1892  N-methyltryptophan oxidase  28.49 
 
 		 371 aa  122  7e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.417309  hitchhiker  0.000636371 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3081  N-methyltryptophan oxidase  31.45 
 
 		 378 aa  122  9.999999999999999e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.519221 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2926  N-methyltryptophan oxidase  34.13 
 
 		 375 aa  120  3e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.793921  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1323  Sarcosine oxidase  31.5 
 
 		 376 aa  120  4.9999999999999996e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3775  sarcosine oxidase, putative  30.88 
 
 		 382 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000086866 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2528  N-methyltryptophan oxidase  32.16 
 
 		 379 aa  117  3e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0471949 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2497  N-methyltryptophan oxidase  30.33 
 
 		 381 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.474752  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1558  sarcosine oxidase  28.69 
 
 		 394 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.467304  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3311  N-methyltryptophan oxidase  30.85 
 
 		 390 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3327  sarcosine oxidase  30.54 
 
 		 391 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0248673  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2460  N-methyltryptophan oxidase  30.89 
 
 		 381 aa  110  3e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.580586  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2505  N-methyltryptophan oxidase  30.89 
 
 		 381 aa  110  3e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.18985  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3158  N-methyltryptophan oxidase  29.38 
 
 		 391 aa  108  2e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00132325  normal  0.11336 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2285  N-methyltryptophan oxidase  29.66 
 
 		 386 aa  106  8e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2484  N-methyltryptophan oxidase  29.84 
 
 		 395 aa  106  8e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0768  N-methyltryptophan oxidase  29.65 
 
 		 428 aa  103  4e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.398492  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0471  N-methyltryptophan oxidase  29.65 
 
 		 443 aa  103  5e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0943155  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2677  N-methyltryptophan oxidase  31.52 
 
 		 391 aa  102  8e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.895142 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0123  N-methyltryptophan oxidase  24.67 
 
 		 373 aa  102  9e-21  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0149  Sarcosine oxidase  26.87 
 
 		 385 aa  102  1e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00237457 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0024  Sarcosine oxidase  29.52 
 
 		 381 aa  99.4  8e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5312  FAD dependent oxidoreductase  23.98 
 
 		 379 aa  99.4  9e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3166  N-methyltryptophan oxidase  29.47 
 
 		 391 aa  97.4  3e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2632  Sarcosine oxidase  28.39 
 
 		 379 aa  88.2  2e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.04249  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4345  FAD dependent oxidoreductase  26.43 
 
 		 363 aa  85.9  0.000000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.118221 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04101  putative sarcosine oxidase  21.64 
 
 		 394 aa  84.7  0.000000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0903484  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8831  FAD dependent oxidoreductase  28.89 
 
 		 402 aa  84  0.000000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.276493  hitchhiker  0.00295943 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1492  FAD dependent oxidoreductase  24.8 
 
 		 398 aa  81.6  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.117516 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6672  FAD dependent oxidoreductase  26.37 
 
 		 398 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0863126  normal  0.289815 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02786  conserved hypothetical protein  24.74 
 
 		 428 aa  80.9  0.00000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2073  FAD dependent oxidoreductase  29.76 
 
 		 372 aa  79  0.0000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.568265  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3930  FAD dependent oxidoreductase  31.3 
 
 		 355 aa  77.8  0.0000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08657  fructosyl amino acid oxidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G06440)  23.75 
 
 		 615 aa  75.5  0.000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.683305  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0194  putative sarcosine oxidase  27.93 
 
 		 367 aa  72  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7077  FAD dependent oxidoreductase  27.69 
 
 		 367 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1845  FAD dependent oxidoreductase  26.39 
 
 		 422 aa  64.7  0.000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.360147 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4607  FAD dependent oxidoreductase  29.05 
 
 		 364 aa  64.7  0.000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7805  FAD dependent oxidoreductase  25.54 
 
 		 395 aa  62.8  0.000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.436057  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4803  FAD dependent oxidoreductase  27.15 
 
 		 399 aa  62.8  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.355272  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3636  FAD dependent oxidoreductase  26.73 
 
 		 394 aa  61.6  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.295113  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0224  putative sarcosine oxidase  27.72 
 
 		 396 aa  61.2  0.00000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2939  FAD dependent oxidoreductase  25.81 
 
 		 378 aa  61.2  0.00000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0252  putative sarcosine oxidase  24.8 
 
 		 397 aa  60.5  0.00000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2489  D-amino acid dehydrogenase, small subunit  22.16 
 
 		 371 aa  58.2  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000926626  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2777  oxidoreductase, DadA family  22.25 
 
 		 371 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.848486  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2529  DadA family oxidoreductase  22.51 
 
 		 371 aa  57.4  0.0000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0933493  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2715  DadA family oxidoreductase  22.51 
 
 		 371 aa  57.4  0.0000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2728  oxidoreductase, DadA family  22.51 
 
 		 371 aa  57.4  0.0000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000981681 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1890  FAD dependent oxidoreductase  30.81 
 
 		 390 aa  56.6  0.0000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.125592  normal  0.229246 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2454  D-amino acid dehydrogenase small subunit  22.62 
 
 		 371 aa  56.6  0.0000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.295637  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0048  FAD dependent oxidoreductase  25.8 
 
 		 376 aa  56.6  0.0000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0255  oxidoreductase, FAD-binding protein  24.8 
 
 		 384 aa  56.2  0.0000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2732  oxidoreductase, DadA family  21.74 
 
 		 371 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.909372  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2742  DadA family oxidoreductase  21.74 
 
 		 371 aa  55.5  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00153462  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2569  oxidoreductase, DadA family  21.74 
 
 		 371 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0599885 
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0036  hydroxyglutarate oxidase  25.98 
 
 		 397 aa  54.3  0.000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.925555  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4693  FAD dependent oxidoreductase  24.94 
 
 		 423 aa  54.3  0.000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7056  FAD dependent oxidoreductase  30.77 
 
 		 393 aa  53.9  0.000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.370606 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04975  fructosyl amino acid oxidasesarcosine oxidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G10130)  25.5 
 
 		 441 aa  53.5  0.000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.656567 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3036  FAD dependent oxidoreductase  25.82 
 
 		 394 aa  53.9  0.000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.385806 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1848  FAD dependent oxidoreductase  21.17 
 
 		 373 aa  52.8  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.344381  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2430  FAD dependent oxidoreductase  20.97 
 
 		 371 aa  52.8  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0834847  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0161  FAD dependent oxidoreductase  25.51 
 
 		 394 aa  52.4  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0284  FAD dependent oxidoreductase  26.6 
 
 		 376 aa  52  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006683  CNN00040  expressed protein  22.22 
 
 		 520 aa  51.2  0.00003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>