More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_0483 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_0483  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 226 aa  462  1e-129  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5987  transcriptional regulator, TetR family  36.05 
 
 		 204 aa  85.9  5e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2373  TetR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 205 aa  81.3  0.00000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15710  transcriptional regulator  29.57 
 
 		 221 aa  80.9  0.00000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.274511  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3938  transcriptional regulator, TetR family  28.5 
 
 		 231 aa  79  0.00000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00284915  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6341  TetR family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 206 aa  75.5  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0497044  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1751  TetR family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 206 aa  75.5  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1738  TetR family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 206 aa  75.5  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2996  TetR family transcriptional regulator  34.66 
 
 		 237 aa  72.4  0.000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1225  TetR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 208 aa  71.6  0.000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.657492  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1264  TetR family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 206 aa  69.3  0.00000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.599329  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3354  transcriptional regulator, TetR family  45.21 
 
 		 210 aa  68.9  0.00000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.216649  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2460  TetR family transcriptional regulator  30.6 
 
 		 201 aa  66.2  0.0000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.315446  normal  0.37249 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2461  TetR family transcriptional regulator  28.64 
 
 		 234 aa  65.9  0.0000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.460998  normal  0.536684 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1969  TetR family transcriptional regulator  49.15 
 
 		 205 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0320964 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2291  transcriptional regulator, TetR family  49.15 
 
 		 205 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.857741  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1116  TetR family transcriptional regulator  34.19 
 
 		 209 aa  63.9  0.000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.863597  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3524  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 187 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0397  transcriptional regulator, TetR family  27.37 
 
 		 211 aa  63.5  0.000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0669765  normal  0.062689 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5034  TetR family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 206 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.553825 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0686  transcriptional regulator, TetR family  28.66 
 
 		 247 aa  62.8  0.000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1659  TetR family transcriptional regulator  30.72 
 
 		 206 aa  62.4  0.000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6268  TetR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 182 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.700387  normal  0.409486 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1521  TetR family transcriptional regulator  31.79 
 
 		 206 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.375612 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3219  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 215 aa  61.2  0.00000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1659  TetR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 206 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0955  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 212 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2161  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 206 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.720901  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3995  transcriptional regulator, TetR family  38.16 
 
 		 197 aa  60.8  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.200757  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2327  TetR family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 199 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.194102 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2294  TetR family regulatory protein  44.44 
 
 		 206 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4364  TetR family transcriptional regulator  50.88 
 
 		 206 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3722  TetR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 202 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.869277  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2102  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 206 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.526616  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3795  TetR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 202 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.796114  normal  0.124585 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4193  TetR family transcriptional regulator  40.82 
 
 		 200 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3734  TetR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 202 aa  60.1  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0165853  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5358  transcriptional regulator, TetR family  36.47 
 
 		 196 aa  60.1  0.00000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.25838  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5045  TetR family transcriptional regulator  47.37 
 
 		 206 aa  58.5  0.00000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.906168  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5815  TetR family transcriptional regulator  47.37 
 
 		 206 aa  58.5  0.00000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0737  transcriptional regulator, TetR family  31.03 
 
 		 209 aa  58.2  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2290  TetR family transcriptional regulator  53.57 
 
 		 206 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.721121  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4043  TetR family transcriptional regulator  44.29 
 
 		 228 aa  57.8  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.168546 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5812  TetR family transcriptional regulator  45.61 
 
 		 188 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0159111 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9154  putative transcriptional regulator, TetR family  26.83 
 
 		 226 aa  57.4  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.231214  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28480  transcriptional regulator  34.88 
 
 		 326 aa  57.4  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.552525 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1293  TetR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 199 aa  57  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0477  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 211 aa  57  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.178939  normal  0.0289146 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3724  TetR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 200 aa  55.5  0.0000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.29601  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3797  TetR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 200 aa  55.5  0.0000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.388195  normal  0.0386626 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5280  TetR family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 175 aa  55.1  0.0000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4194  TetR family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 201 aa  55.1  0.0000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0687  TetR family transcriptional regulator  37.08 
 
 		 261 aa  54.3  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.794796  normal  0.223624 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2575  transcriptional regulator, TetR family  29.03 
 
 		 211 aa  54.7  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000582548  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2510  TetR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 209 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00262483  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2304  TetR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 211 aa  53.9  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.373552  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2272  TetR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 211 aa  53.9  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000566042  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2226  TetR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 211 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0397604  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0314  TetR family transcriptional regulator  44.12 
 
 		 211 aa  53.9  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4724  regulatory protein, TetR  38.16 
 
 		 191 aa  53.5  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1017  repressor protein  44.12 
 
 		 211 aa  53.9  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3035  transcriptional regulator, TetR family  31.52 
 
 		 219 aa  53.5  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.514093  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0852  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  44.12 
 
 		 211 aa  53.9  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1632  transcriptional regulator, TetR family  45.45 
 
 		 239 aa  53.9  0.000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2479  TetR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 211 aa  53.9  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.660065  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3493  TetR family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 211 aa  53.9  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.729173  normal  0.75311 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0679  TetR family transcriptional regulator  44.12 
 
 		 211 aa  53.9  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0402  transcriptional regulator, TetR family  35.21 
 
 		 219 aa  54.3  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.67084  normal  0.0771341 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0972  TetR family transcriptional regulator  30.84 
 
 		 233 aa  54.3  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.93446  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3703  TetR family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 199 aa  54.3  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2500  transcriptional regulator, TetR family  29.35 
 
 		 211 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2443  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  44.12 
 
 		 211 aa  53.9  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1428  TetR family transcriptional regulator  27.56 
 
 		 204 aa  53.9  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.530378  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3716  TetR family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 199 aa  54.3  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0057  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  44.12 
 
 		 211 aa  53.9  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3776  TetR family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 199 aa  54.3  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.450606 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4321  TetR family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 199 aa  54.3  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.675467  normal  0.0583361 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0857  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  44.12 
 
 		 211 aa  53.9  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5646  TetR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 233 aa  53.9  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.176197  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0609  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  44.12 
 
 		 211 aa  53.9  0.000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.780096  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7768  putative transcriptional regulator, TetR family  28.68 
 
 		 194 aa  53.1  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2434  transcriptional regulator, TetR family  36.62 
 
 		 211 aa  53.1  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6828  TetR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 225 aa  53.5  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.196798  normal  0.216852 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2000  TetR family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 234 aa  53.1  0.000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.920156  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3910  TetR family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 242 aa  52.8  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.104674 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47520  putative transcriptional regulator  34.48 
 
 		 197 aa  52.8  0.000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2610  TetR family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 234 aa  53.1  0.000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.341012  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6228  transcriptional regulator, TetR family  38.27 
 
 		 194 aa  52.8  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.301912  normal  0.923303 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6204  transcriptional regulator, TetR family  35.71 
 
 		 199 aa  52.4  0.000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.308886  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3736  TetR family transcriptional regulator  25.47 
 
 		 200 aa  52.4  0.000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.042499  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2000  transcriptional regulator, TetR family  35.94 
 
 		 193 aa  52  0.000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0444  TetR family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 220 aa  52  0.000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.275459  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12460  hypothetical protein  29.31 
 
 		 211 aa  52  0.000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1012  transcriptional regulator, TetR family  28.47 
 
 		 212 aa  52  0.000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.156612  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3457  TetR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 238 aa  52  0.000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3923  TetR family transcriptional regulator  34.86 
 
 		 214 aa  51.6  0.000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5941  TetR family transcriptional regulator  44.64 
 
 		 213 aa  51.2  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.272965 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0195  TetR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 194 aa  51.2  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.5282  normal  0.427112 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2214  transcriptional regulator, TetR family  31.63 
 
 		 201 aa  51.2  0.00001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000301704  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4359  regulatory protein, TetR  45 
 
 		 196 aa  51.2  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00193568  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>