285 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_1252 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007802  Jann_1252  lipoyltransferase  100 
 
 		 216 aa  438  9.999999999999999e-123  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.33407 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2381  lipoate-protein ligase B  73.36 
 
 		 220 aa  315  4e-85  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.735279  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1045  lipoyltransferase  71.16 
 
 		 246 aa  312  1.9999999999999998e-84  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0860459  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0665  lipoate-protein ligase B  72.3 
 
 		 218 aa  304  7e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.119674  normal  0.0262975 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3088  lipoyltransferase  74.76 
 
 		 225 aa  300  8.000000000000001e-81  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1026  lipoate-protein ligase B  70.09 
 
 		 262 aa  297  9e-80  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00000441542  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0589  lipoate-protein ligase B  68.69 
 
 		 267 aa  296  1e-79  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2774  lipoate-protein ligase B  70.89 
 
 		 225 aa  296  2e-79  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.258038  normal  0.144607 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0698  lipoate-protein ligase B  68.2 
 
 		 244 aa  295  4e-79  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0528  lipoate-protein ligase B  69.95 
 
 		 218 aa  295  5e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.740621  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1878  lipoate-protein ligase B  69.95 
 
 		 218 aa  294  6e-79  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0555  lipoate-protein ligase B  68.22 
 
 		 267 aa  294  8e-79  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3805  lipoate-protein ligase B  69.3 
 
 		 243 aa  293  1e-78  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0737011 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3655  lipoate-protein ligase B  67.44 
 
 		 270 aa  292  3e-78  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.347972  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6295  lipoate-protein ligase B  66.36 
 
 		 236 aa  288  5.0000000000000004e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1948  lipoate-protein ligase B  65.89 
 
 		 243 aa  285  5e-76  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1936  lipoyltransferase  71.03 
 
 		 218 aa  284  7e-76  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00922586 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2371  lipoate-protein ligase B  69.12 
 
 		 255 aa  280  1e-74  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.417087  normal  0.838068 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3161  lipoate-protein ligase B  71.5 
 
 		 241 aa  276  1e-73  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1621  lipoate-protein ligase B  64.35 
 
 		 239 aa  275  3e-73  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00888371  normal  0.103618 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0898  lipoate-protein ligase B  59.35 
 
 		 241 aa  275  3e-73  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.572856  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1871  lipoate-protein ligase B  66.36 
 
 		 237 aa  274  6e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.159982  normal  0.0798648 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2074  lipoate-protein ligase B  66.36 
 
 		 237 aa  274  8e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4082  lipoate-protein ligase B  64.95 
 
 		 262 aa  272  2.0000000000000002e-72  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3083  lipoate-protein ligase B  65.9 
 
 		 255 aa  266  1e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.372719 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1996  lipoate-protein ligase B  62.62 
 
 		 216 aa  266  2e-70  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.895983  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2163  lipoyltransferase  68.2 
 
 		 241 aa  264  8.999999999999999e-70  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3579  lipoate-protein ligase B  68.06 
 
 		 245 aa  261  6.999999999999999e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4211  lipoate-protein ligase B  64.02 
 
 		 244 aa  260  8.999999999999999e-69  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.374535 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4581  lipoate-protein ligase B  63.55 
 
 		 244 aa  258  5.0000000000000005e-68  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0695462 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5311  lipoate-protein ligase B  67.29 
 
 		 235 aa  257  8e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0319626 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1731  lipoyltransferase  65.44 
 
 		 231 aa  256  3e-67  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.558674  normal  0.523049 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4726  lipoate-protein ligase B  66.12 
 
 		 211 aa  251  8.000000000000001e-66  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.78228  normal  0.0194812 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1401  lipoate-protein ligase B  59.33 
 
 		 223 aa  249  3e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.482656  normal  0.150956 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1745  lipoate-protein ligase B  64.81 
 
 		 226 aa  248  4e-65  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.548162  normal  0.138545 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4892  lipoate-protein ligase B  65.44 
 
 		 240 aa  247  1e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.861284  normal  0.17832 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3348  lipoate-protein ligase B  66.2 
 
 		 247 aa  247  1e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.292157  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2290  lipoate-protein ligase B  56.82 
 
 		 228 aa  236  2e-61  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1014  lipoate-protein ligase B  47.44 
 
 		 205 aa  228  4e-59  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.449501  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1350  lipoate-protein ligase B  55.77 
 
 		 217 aa  224  6e-58  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.619841  normal  0.0278741 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0371  lipoate-protein ligase B  46.98 
 
 		 214 aa  216  2e-55  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0131987  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0120  lipoate-protein ligase B  50.91 
 
 		 232 aa  214  5e-55  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.580477  normal  0.0291639 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0640  lipoate-protein ligase B  46.54 
 
 		 214 aa  214  7e-55  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0094  lipoate-protein ligase B  58.59 
 
 		 222 aa  212  3.9999999999999995e-54  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0100  lipoate-protein ligase B  43.52 
 
 		 209 aa  194  6e-49  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0350  lipoate-protein ligase B  41.79 
 
 		 211 aa  144  1e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4819  lipoate-protein ligase B  42.31 
 
 		 218 aa  143  2e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4359  lipoate-protein ligase B  40.66 
 
 		 218 aa  137  1e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.100426  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0528  lipoate-protein ligase B  41.18 
 
 		 212 aa  137  2e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.58244  normal  0.525035 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2704  lipoate-protein ligase B  45.68 
 
 		 203 aa  135  4e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3560  lipoate-protein ligase B  40.98 
 
 		 213 aa  134  7.000000000000001e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0292579 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04288  lipoate-protein ligase B  40.11 
 
 		 224 aa  135  7.000000000000001e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0269  lipoate-protein ligase B  43.32 
 
 		 218 aa  134  9e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.896037 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3326  lipoate-protein ligase B  41.71 
 
 		 213 aa  134  9e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.117098  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10460  lipoate-protein ligase B  45 
 
 		 246 aa  133  1.9999999999999998e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.00811076  normal  0.015008 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3335  lipoate-protein ligase B  39.78 
 
 		 216 aa  133  1.9999999999999998e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000375701  normal  0.0176495 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0179  lipoate-protein ligase B  39.78 
 
 		 215 aa  133  1.9999999999999998e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.799971  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05530  lipoate-protein ligase B  38.14 
 
 		 233 aa  133  1.9999999999999998e-30  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2842  lipoate-protein ligase B  40.43 
 
 		 214 aa  132  3e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.117951  hitchhiker  0.000142913 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4467  lipoate-protein ligase B  35.87 
 
 		 230 aa  131  6e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4854  lipoate-protein ligase B  37.91 
 
 		 215 aa  131  6e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0620  lipoate-protein ligase B  38.46 
 
 		 215 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2747  lipoate-protein ligase B  37.19 
 
 		 213 aa  129  3e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0299  lipoate-protein ligase B  35.48 
 
 		 226 aa  129  4.0000000000000003e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00479336 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1015  lipoate-protein ligase B  39.36 
 
 		 217 aa  128  6e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1701  lipoate-protein ligase B  39.57 
 
 		 231 aa  128  6e-29  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4801  lipoate-protein ligase B  37.91 
 
 		 216 aa  128  7.000000000000001e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.255218 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3443  lipoate-protein ligase B  39.56 
 
 		 236 aa  128  7.000000000000001e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.822951  normal  0.715309 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4676  lipoate-protein ligase B  37.91 
 
 		 215 aa  128  7.000000000000001e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.946401  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1514  lipoyltransferase  32.14 
 
 		 199 aa  128  8.000000000000001e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0294  lipoate-protein ligase B  35.48 
 
 		 226 aa  128  8.000000000000001e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0109  lipoate-protein ligase B  38.38 
 
 		 207 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.20872  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1469  lipoyltransferase  32.14 
 
 		 199 aa  127  1.0000000000000001e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2037  lipoate-protein ligase B  34.91 
 
 		 228 aa  127  1.0000000000000001e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2630  lipoate-protein ligase B  38.46 
 
 		 224 aa  127  1.0000000000000001e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1554  lipoate-protein ligase B  35.71 
 
 		 217 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00660992  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5876  lipoate-protein ligase B  38.54 
 
 		 245 aa  127  1.0000000000000001e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.615379 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1710  lipoate-protein ligase B  36.76 
 
 		 235 aa  126  2.0000000000000002e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.905957  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3155  lipoate-protein ligase B  37.91 
 
 		 227 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000182986  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3026  lipoate-protein ligase B  37.36 
 
 		 233 aa  127  2.0000000000000002e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0519842  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2954  lipoate-protein ligase B  37.36 
 
 		 233 aa  127  2.0000000000000002e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000757866  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4188  lipoyltransferase  38.33 
 
 		 213 aa  126  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0627971 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1854  lipoate-protein ligase B  37.36 
 
 		 232 aa  126  2.0000000000000002e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000629456  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0992  lipoyltransferase  40.18 
 
 		 236 aa  126  3e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0378956  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2500  lipoate-protein ligase B  41.21 
 
 		 218 aa  126  3e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4964  lipoate-protein ligase B  37.02 
 
 		 215 aa  125  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1921  lipoate-protein ligase B  44.2 
 
 		 247 aa  125  4.0000000000000003e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00431373  hitchhiker  0.000603896 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1176  lipoate-protein ligase B  37.91 
 
 		 227 aa  125  4.0000000000000003e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000926852  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08450  lipoate-protein ligase B  39.78 
 
 		 218 aa  125  5e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.699386  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04631  lipoate-protein ligase B  33.85 
 
 		 214 aa  125  5e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.451371  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3714  lipoate-protein ligase B  34.62 
 
 		 219 aa  125  5e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000923711  hitchhiker  0.00434688 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4880  lipoate-protein ligase B  37.04 
 
 		 226 aa  125  6e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0466  lipoyltransferase  35.6 
 
 		 244 aa  125  6e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0288  lipoate-protein ligase B  41.42 
 
 		 205 aa  125  7e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0097  lipoate-protein ligase B  36.32 
 
 		 207 aa  125  7e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2259  lipoate-protein ligase B  38.71 
 
 		 259 aa  124  8.000000000000001e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0600  lipoate-protein ligase B  40.11 
 
 		 226 aa  124  8.000000000000001e-28  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.180969  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1196  lipoate-protein ligase B  37.36 
 
 		 222 aa  124  1e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0237  lipoate-protein ligase B  39.71 
 
 		 227 aa  124  1e-27  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.543697  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0468  lipoate-protein ligase B  36.46 
 
 		 219 aa  124  1e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000117999  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>