57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_4095 on replicon NC_013744
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013744  Htur_4095  extracellular solute-binding protein family 5  100 
 
 
567 aa  1167    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0050  extracellular solute-binding protein family 5  28.35 
 
 
628 aa  152  2e-35  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.600017  normal  0.630489 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4466  extracellular solute-binding protein family 5  27.67 
 
 
564 aa  133  1.0000000000000001e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0117733  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4449  extracellular solute-binding protein family 5  26.37 
 
 
604 aa  119  9.999999999999999e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4447  extracellular solute-binding protein family 5  26 
 
 
604 aa  113  1.0000000000000001e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0329376  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4448  extracellular solute-binding protein family 5  26.07 
 
 
604 aa  107  4e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2233  extracellular solute-binding protein family 5  23.25 
 
 
735 aa  105  2e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.039331  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1189  extracellular solute-binding protein family 5  22.24 
 
 
621 aa  105  2e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.105584  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4667  extracellular solute-binding protein family 5  22.85 
 
 
587 aa  96.7  9e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3887  extracellular solute-binding protein family 5  23.49 
 
 
601 aa  90.9  5e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.544175  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3888  extracellular solute-binding protein family 5  23.89 
 
 
589 aa  85.9  0.000000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.170596  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2585  extracellular solute-binding protein family 5  21.91 
 
 
603 aa  72.8  0.00000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5701  ABC-type dipeptide transport system periplasmic component-like protein  23.6 
 
 
607 aa  68.6  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.167771  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1142  extracellular solute-binding protein family 5  21.8 
 
 
616 aa  68.6  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.163498  normal  0.236826 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1796  extracellular solute-binding protein  20.55 
 
 
616 aa  63.9  0.000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000801458  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0901  extracellular solute-binding protein family 5  20.28 
 
 
675 aa  63.2  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0685  extracellular solute-binding protein  24.29 
 
 
682 aa  62.8  0.00000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.025918 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1494  extracellular solute-binding protein  21.93 
 
 
716 aa  60.5  0.00000009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.580792 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1305  extracellular solute-binding protein family 5  20.74 
 
 
693 aa  58.9  0.0000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0389  extracellular solute-binding protein  20.48 
 
 
810 aa  58.2  0.0000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.0000267846  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0033  extracellular solute-binding protein  24.72 
 
 
781 aa  55.1  0.000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.649183  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0875  extracellular solute-binding protein  32.18 
 
 
774 aa  53.9  0.000008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1315  extracellular solute-binding protein  23.35 
 
 
788 aa  53.1  0.00001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.440295 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2437  extracellular solute-binding protein  25.34 
 
 
554 aa  53.5  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4518  extracellular solute-binding protein family 5  22.52 
 
 
615 aa  52.8  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.872953 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1161  extracellular solute-binding protein  24.08 
 
 
775 aa  52  0.00003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0552  extracellular solute-binding protein  27.5 
 
 
788 aa  51.6  0.00004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.295853 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0654  extracellular solute-binding protein  30.69 
 
 
810 aa  51.2  0.00005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0507861  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2624  extracellular solute-binding protein family 5  24 
 
 
547 aa  51.2  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.276954  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3011  ABC transporter related  19.94 
 
 
577 aa  50.8  0.00006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.631119  normal  0.383065 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0482  extracellular solute-binding protein family 5  23.71 
 
 
693 aa  50.1  0.0001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.181954  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0232  extracellular solute-binding protein  23.03 
 
 
787 aa  50.1  0.0001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1848  extracellular solute-binding protein  26.81 
 
 
821 aa  49.3  0.0002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1424  extracellular solute-binding protein  19.9 
 
 
779 aa  48.9  0.0002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0120501 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1274  extracellular solute-binding protein  21.53 
 
 
794 aa  48.9  0.0002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.000000437479 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2053  extracellular solute-binding protein  20.31 
 
 
579 aa  49.3  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0131056  normal  0.653692 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0387  extracellular solute-binding protein family 5  22.87 
 
 
503 aa  48.9  0.0002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000000219856  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1189  extracellular solute-binding protein  23.49 
 
 
793 aa  48.9  0.0002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.109434  hitchhiker  0.000120302 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3658  extracellular solute-binding protein family 5  22.7 
 
 
366 aa  48.5  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.720757  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7456  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  22.3 
 
 
563 aa  47.8  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.388989 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0600  extracellular solute-binding protein  32.5 
 
 
790 aa  47.4  0.0006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3951  extracellular solute-binding protein family 5  21.41 
 
 
633 aa  46.6  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2028  oligopeptide ABC transporter periplasmic oligopeptide-binding protein  22.28 
 
 
544 aa  45.8  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.593092  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2501  extracellular solute-binding protein family 5  22.97 
 
 
608 aa  45.8  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1450  peptide ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  19.81 
 
 
511 aa  45.1  0.003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000000430411  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3842  extracellular solute-binding protein family 5  24.32 
 
 
535 aa  45.4  0.003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.298652  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0334  extracellular solute-binding protein  24.11 
 
 
541 aa  45.4  0.003  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.768653  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0467  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  24.8 
 
 
525 aa  45.4  0.003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0536  extracellular solute-binding protein family 5  20.68 
 
 
565 aa  45.1  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1071  peptide ABC transporter, peptide-binding protein OppA  22.31 
 
 
591 aa  44.7  0.004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000408917  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13240  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  24.8 
 
 
504 aa  44.3  0.006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0803154  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2728  extracellular solute-binding protein family 5  23.22 
 
 
568 aa  44.3  0.006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.768674  normal  0.998981 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3968  extracellular solute-binding protein  22.98 
 
 
537 aa  44.3  0.006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.252184  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17760  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  20.71 
 
 
609 aa  44.3  0.007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.321388  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0778  extracellular solute-binding protein  24.49 
 
 
778 aa  43.9  0.007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0537  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  25.88 
 
 
525 aa  43.9  0.007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.75807  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00493  ABC-type dipeptide transporter periplasmic component  21.81 
 
 
519 aa  43.5  0.009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>