More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_1414 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013743  Htur_1414  extracellular solute-binding protein family 5  100 
 
 
636 aa  1301    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2388  extracellular solute-binding protein family 5  29.48 
 
 
583 aa  197  5.000000000000001e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4406  twin-arginine translocation pathway signal  28.28 
 
 
541 aa  192  2e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0490152 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2201  extracellular solute-binding protein family 5  26.43 
 
 
567 aa  183  8.000000000000001e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4407  twin-arginine translocation pathway signal  26.43 
 
 
541 aa  176  9e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.095613 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1438  extracellular solute-binding protein family 5  25.42 
 
 
554 aa  127  5e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.3177  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2957  4-phytase  32.09 
 
 
520 aa  126  1e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1982  putative ABC transporter, periplasmic binding protein  28.83 
 
 
524 aa  125  2e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0990283  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7558  putative dipeptide ABC transporter (substrate-binding protein)  27.52 
 
 
515 aa  125  2e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.864379 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0195  extracellular solute-binding protein  29.28 
 
 
526 aa  124  5e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0883  extracellular solute-binding protein family 5  28.47 
 
 
547 aa  120  7.999999999999999e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0748  extracellular solute-binding protein  27.1 
 
 
535 aa  119  9.999999999999999e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0310  extracellular solute-binding protein family 5  31.37 
 
 
509 aa  119  1.9999999999999998e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2798  extracellular solute-binding protein family 5  30.72 
 
 
557 aa  119  1.9999999999999998e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2760  extracellular solute-binding protein  29.71 
 
 
544 aa  119  1.9999999999999998e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5662  extracellular solute-binding protein  27.88 
 
 
544 aa  119  1.9999999999999998e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.76313 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1569  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  28.17 
 
 
511 aa  119  1.9999999999999998e-25  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0750  extracellular solute-binding protein  27.42 
 
 
535 aa  118  3.9999999999999997e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0910  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport systems, periplasmic components  31.2 
 
 
572 aa  117  6e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.293935  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1595  extracellular solute-binding protein  26.98 
 
 
557 aa  116  1.0000000000000001e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0133917  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4254  extracellular solute-binding protein  26.93 
 
 
527 aa  116  1.0000000000000001e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.340537  normal  0.123719 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1270  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  31.13 
 
 
542 aa  115  2.0000000000000002e-24  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.593504  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1651  extracellular solute-binding protein  26.04 
 
 
516 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5235  extracellular solute-binding protein family 5  26.28 
 
 
522 aa  115  2.0000000000000002e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1545  extracellular solute-binding protein  26.65 
 
 
557 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.2137  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2569  ABC transporter substrate-binding protein  29.78 
 
 
558 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.217608 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1553  extracellular solute-binding protein  26.96 
 
 
559 aa  115  3e-24  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.208561  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2116  hypothetical protein  27.94 
 
 
510 aa  115  3e-24  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0479  4-phytase  27.49 
 
 
535 aa  114  6e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0187568  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0930  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  30.52 
 
 
588 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.476779  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3400  extracellular solute-binding protein family 5  32.1 
 
 
567 aa  112  2.0000000000000002e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.110204  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2761  extracellular solute-binding protein  29.28 
 
 
544 aa  112  3e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0426  extracellular solute-binding protein  25.76 
 
 
522 aa  112  3e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.133353  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0015  extracellular solute-binding protein family 5  28.61 
 
 
516 aa  111  3e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.406265  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1652  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  27.12 
 
 
511 aa  112  3e-23  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.2387  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1507  extracellular solute-binding protein family 5  27.54 
 
 
516 aa  111  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.221484  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3566  dipeptide/oligopeptide-binding protein  30.05 
 
 
562 aa  111  4.0000000000000004e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.672958  normal  0.0864129 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1565  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  28.97 
 
 
534 aa  111  4.0000000000000004e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3221  extracellular solute-binding protein  26.65 
 
 
517 aa  111  5e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.102229  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2583  putative ABC transporter, substrate binding subunit  29.94 
 
 
524 aa  111  5e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0432339 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1352  extracellular solute-binding protein family 5  28.32 
 
 
534 aa  110  6e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0745  extracellular solute-binding protein  26.13 
 
 
534 aa  110  6e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0611  extracellular solute-binding protein family 5  29.49 
 
 
527 aa  110  7.000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0328  extracellular solute-binding protein family 5  28.53 
 
 
540 aa  110  7.000000000000001e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4859  putative ABC transporter, substrate-binding protein  27.73 
 
 
532 aa  108  2e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.176928  normal  0.590645 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3647  4-phytase  30.49 
 
 
509 aa  109  2e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.770065 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0015  extracellular solute-binding protein family 5  28.69 
 
 
516 aa  108  3e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0343  extracellular solute-binding protein family 5  29.54 
 
 
537 aa  108  3e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2424  twin-arginine translocation pathway signal  29.46 
 
 
565 aa  108  3e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0912792  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0140  peptide/opine/nickel ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  28.04 
 
 
534 aa  108  4e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.259377  normal  0.633025 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1284  extracellular solute-binding protein  30.19 
 
 
543 aa  107  5e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3804  extracellular solute-binding protein  30.31 
 
 
509 aa  107  5e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00625229  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1870  dipeptide transport protein  27.43 
 
 
540 aa  107  6e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5138  putative periplasmic peptide-binding protein ABC transporter  28.11 
 
 
495 aa  107  8e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0462348 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1935  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  26.73 
 
 
511 aa  106  1e-21  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0146  peptide/opine/nickel ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  27.64 
 
 
539 aa  106  1e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.29775 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4455  extracellular solute-binding protein  29.78 
 
 
509 aa  106  1e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.661138  hitchhiker  0.000234808 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1450  peptide ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  27.02 
 
 
511 aa  106  1e-21  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000000430411  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1494  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  29.47 
 
 
543 aa  105  2e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0931394  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1663  extracellular solute-binding protein family 5  24.79 
 
 
578 aa  106  2e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0397427  normal  0.183706 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1592  extracellular solute-binding protein  26.9 
 
 
560 aa  105  2e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.382923  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0671  extracellular solute-binding protein  26.04 
 
 
534 aa  105  2e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3968  extracellular solute-binding protein  30 
 
 
537 aa  105  2e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.252184  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6559  extracellular solute-binding protein family 5  27.1 
 
 
536 aa  105  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.67626  normal  0.403463 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2405  extracellular solute-binding protein family 5  27.83 
 
 
532 aa  105  3e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000184044  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1244  extracellular solute-binding protein family 5  28.14 
 
 
588 aa  105  3e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.863592  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0785  extracellular solute-binding protein  29.61 
 
 
512 aa  105  3e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0600833  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1755  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  26.1 
 
 
511 aa  104  4e-21  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3842  extracellular solute-binding protein  30.41 
 
 
568 aa  104  4e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0450891  normal  0.108057 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4615  4-phytase  28.09 
 
 
502 aa  103  7e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2745  extracellular solute-binding protein  28.42 
 
 
551 aa  103  7e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4831  putative ABC transporter (substrate-binding protein)  28.91 
 
 
527 aa  103  7e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.153883  normal  0.947205 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0786  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein, putative  29.35 
 
 
537 aa  103  8e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.527095  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0722  radical SAM domain-containing protein  30.06 
 
 
522 aa  103  1e-20  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.597639 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2014  twin-arginine translocation pathway signal  28.53 
 
 
534 aa  103  1e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.533924  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6144  extracellular solute-binding protein family 5  27.42 
 
 
533 aa  103  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.5133  hitchhiker  0.00348679 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2913  extracellular solute-binding protein family 5  27.24 
 
 
533 aa  102  2e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.037834  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1807  extracellular solute-binding protein family 5  25.45 
 
 
528 aa  102  2e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1284  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  26.18 
 
 
545 aa  102  3e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000669385  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3678  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  28.24 
 
 
525 aa  101  3e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0885273 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0510  extracellular solute-binding protein  28.66 
 
 
510 aa  101  3e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0306064  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1440  extracellular solute-binding protein family 5  25.68 
 
 
514 aa  101  4e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.136539  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2686  extracellular solute-binding protein  31.19 
 
 
528 aa  101  5e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.0000382125  normal  0.980281 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2585  putative ABC transporter, substrate binding subunit  27.91 
 
 
520 aa  101  5e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0598963 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3746  extracellular solute-binding protein family 5  26.98 
 
 
513 aa  100  6e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5299  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  27.22 
 
 
556 aa  100  7e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0810  extracellular solute-binding protein  28.84 
 
 
489 aa  100  7e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0262  extracellular solute-binding protein family 5  31.72 
 
 
587 aa  100  7e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.578222  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1313  extracellular solute-binding protein  27.87 
 
 
493 aa  100  9e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1810  extracellular solute-binding protein  25.31 
 
 
595 aa  100  1e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2655  extracellular solute-binding protein  26.15 
 
 
539 aa  100  1e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000125789  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3039  4-phytase  28.68 
 
 
518 aa  99.4  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3320  extracellular solute-binding protein  27.67 
 
 
528 aa  98.6  3e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0123121  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3677  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  27.14 
 
 
520 aa  98.6  3e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.969921  normal  0.0940549 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0782  extracellular solute-binding protein  28.75 
 
 
494 aa  99  3e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.319175  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5067  extracellular solute-binding protein  28.99 
 
 
495 aa  99  3e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.68424  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1012  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  29.23 
 
 
492 aa  98.2  4e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.622148  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0954  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  28.92 
 
 
479 aa  98.2  4e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2408  extracellular solute-binding protein  28.41 
 
 
505 aa  98.2  4e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.000286915  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1145  extracellular solute-binding protein  27.73 
 
 
565 aa  97.8  5e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00838015  normal  0.546746 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>