More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_6114 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_6114  putative PAS/PAC sensor protein  100 
 
 
532 aa  1075    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.249535  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4645  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  25.83 
 
 
644 aa  154  4e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.224961  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4350  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.79 
 
 
686 aa  149  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4373  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.18 
 
 
687 aa  144  3e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0865062  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6389  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.57 
 
 
688 aa  140  3.9999999999999997e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1747  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.65 
 
 
850 aa  139  1e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.346291  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3516  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  24.95 
 
 
614 aa  137  4e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.166046 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2543  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.94 
 
 
823 aa  133  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.906632  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2200  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  25.93 
 
 
848 aa  132  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00863508  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1676  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.9 
 
 
850 aa  130  7.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.109527  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1771  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.57 
 
 
923 aa  124  4e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.357218 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4217  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.11 
 
 
686 aa  124  5e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.34172  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1575  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.63 
 
 
683 aa  104  3e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.539969  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2148  multi-sensor hybrid histidine kinase  23.55 
 
 
819 aa  103  8e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.233006  hitchhiker  0.00949178 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2189  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.37 
 
 
628 aa  99  2e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0671838  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0632  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  24.73 
 
 
695 aa  99  2e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.554525  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1016  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  22.12 
 
 
1258 aa  95.1  3e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5807  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.16 
 
 
990 aa  94.4  5e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5744  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.96 
 
 
510 aa  93.6  7e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.739341 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2685  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  23.47 
 
 
660 aa  91.3  4e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.41147  normal  0.190122 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5165  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  23.9 
 
 
593 aa  90.9  5e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0903  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  21 
 
 
1262 aa  90.1  9e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0420  PAS  26.7 
 
 
787 aa  89.4  1e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0516903 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4259  multi-sensor hybrid histidine kinase  21.65 
 
 
804 aa  89.4  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3878  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  22.42 
 
 
673 aa  87.8  4e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0119  PAS sensor protein  32.8 
 
 
1561 aa  86.7  0.000000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1916  response regulator receiver protein  35 
 
 
128 aa  86.3  0.000000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.639162  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1405  sensor histidine kinase/response regulator  20.83 
 
 
1379 aa  86.3  0.000000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0225  multi-sensor hybrid histidine kinase  21.58 
 
 
1418 aa  85.5  0.000000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.180068  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3966  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  22.44 
 
 
677 aa  85.9  0.000000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000186378 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4367  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.79 
 
 
800 aa  84.3  0.000000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.522603  normal  0.113968 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1970  GAF sensor hybrid histidine kinase  36.7 
 
 
602 aa  84.3  0.000000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.316288  normal  0.365319 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6615  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  24.91 
 
 
660 aa  84  0.000000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0224174  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4343  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  21.63 
 
 
759 aa  82.8  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.77937  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3294  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.1 
 
 
714 aa  81.6  0.00000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.523166 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3362  PAS sensor protein  25.46 
 
 
678 aa  82  0.00000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3026  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  38.66 
 
 
819 aa  79.7  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.956622  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1138  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.76 
 
 
983 aa  79  0.0000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1075  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  21.29 
 
 
829 aa  78.6  0.0000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  2.46099e-33 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2719  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  24.51 
 
 
683 aa  77.4  0.0000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0226  multi-sensor hybrid histidine kinase  23.18 
 
 
1018 aa  77  0.0000000000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1082  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.92 
 
 
1068 aa  75.5  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.31862 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03075  hybrid sensory histidine kinase in two-component regulatory system with ArcA  22.71 
 
 
778 aa  75.1  0.000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0497  multi-sensor hybrid histidine kinase  22.71 
 
 
778 aa  75.1  0.000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4533  aerobic respiration control sensor protein ArcB  22.71 
 
 
778 aa  75.1  0.000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3506  aerobic respiration control sensor protein ArcB  22.71 
 
 
778 aa  75.1  0.000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.648174  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0490  aerobic respiration control sensor protein ArcB  22.71 
 
 
778 aa  75.1  0.000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.512879 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03026  hypothetical protein  22.71 
 
 
778 aa  75.1  0.000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3698  aerobic respiration control sensor protein ArcB  22.71 
 
 
778 aa  75.1  0.000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3560  aerobic respiration control sensor protein ArcB  22.71 
 
 
778 aa  74.7  0.000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3403  aerobic respiration control sensor protein ArcB  22.71 
 
 
778 aa  74.7  0.000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2409  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  23.86 
 
 
713 aa  74.7  0.000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00581493 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3771  multi-sensor hybrid histidine kinase  21.18 
 
 
714 aa  74.3  0.000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.756709  normal  0.201817 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01633  aerobic respiration control sensor protein ArcB  22.6 
 
 
784 aa  73.9  0.000000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2950  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.44 
 
 
710 aa  73.9  0.000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4639  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  24.3 
 
 
1453 aa  73.2  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.432269  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0223  histidine kinase  41.12 
 
 
647 aa  72.8  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0904  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  22 
 
 
785 aa  72.8  0.00000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2865  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  21.85 
 
 
853 aa  72.4  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0231  GAF sensor hybrid histidine kinase  24.7 
 
 
844 aa  71.6  0.00000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.794534  normal  0.63544 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2383  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.12 
 
 
1177 aa  71.6  0.00000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.467753 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0813  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  25.2 
 
 
837 aa  71.6  0.00000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.461679  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0550  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  21.44 
 
 
540 aa  71.6  0.00000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0519596 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1919  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.14 
 
 
862 aa  71.2  0.00000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.592004  normal  0.385421 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2945  sensor histidine kinase/response regulator  25.19 
 
 
505 aa  70.9  0.00000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.16803 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4603  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.72 
 
 
783 aa  70.5  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1777  response regulator receiver protein  35 
 
 
129 aa  70.1  0.00000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.723308  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1798  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  22 
 
 
1023 aa  70.5  0.00000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.100128 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2463  two component sensor kinase  22.49 
 
 
872 aa  70.1  0.00000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.899501  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2889  sensory transduction histidine kinase; sporulation kinase A  23.57 
 
 
801 aa  70.1  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.516791  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0674  multi-sensor hybrid histidine kinase  22.33 
 
 
1021 aa  69.7  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3477  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  22.83 
 
 
1465 aa  69.7  0.0000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3143  sporulation kinase  23.57 
 
 
801 aa  70.1  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.564779 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1961  multi-sensor hybrid histidine kinase  23.28 
 
 
867 aa  69.3  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.126106 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2115  sporulation kinase  23.32 
 
 
801 aa  69.3  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2587  PAS  31.71 
 
 
671 aa  69.3  0.0000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.187407  normal  0.694957 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2960  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  25.62 
 
 
622 aa  68.9  0.0000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1982  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  35.29 
 
 
1355 aa  68.9  0.0000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6741  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  40.16 
 
 
728 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2336  signal transduction histidine kinase  29.45 
 
 
3706 aa  68.9  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0320  multi-sensor hybrid histidine kinase  21.68 
 
 
838 aa  68.9  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.88782 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1908  histidine kinase  23.9 
 
 
772 aa  68.9  0.0000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0199543  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0505  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  32.74 
 
 
952 aa  68.6  0.0000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.337439 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2537  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  22.09 
 
 
1222 aa  67.8  0.0000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2350  diguanylate cyclase with PAS/PAC and GAF sensors  34.43 
 
 
1000 aa  68.2  0.0000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.521127 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4481  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  22.82 
 
 
737 aa  67.8  0.0000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.913087  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1175  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  23.66 
 
 
821 aa  67.4  0.0000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0725739 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2590  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.4 
 
 
1959 aa  67  0.0000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0694001 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0734  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  26.47 
 
 
881 aa  67.4  0.0000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.702942  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1608  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  29.05 
 
 
1015 aa  67  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00363686 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2842  PAS sensor protein  25.62 
 
 
622 aa  67  0.0000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.174863  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3068  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  25.62 
 
 
622 aa  67  0.0000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.231547  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1953  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.53 
 
 
458 aa  67  0.0000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4028  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  22.43 
 
 
846 aa  67  0.0000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.118602  normal  0.0390699 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2854  putative two component signal transduction protein  26.47 
 
 
917 aa  66.6  0.0000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1697  histidine kinase  25.36 
 
 
505 aa  66.6  0.0000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2816  sensory box histidine kinase/response regulator  21.27 
 
 
882 aa  66.6  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1273  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.43 
 
 
1090 aa  66.6  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1302  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.43 
 
 
1090 aa  66.6  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0842919  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3122  sporulation kinase  23.05 
 
 
801 aa  66.6  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>