More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_1916 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_1916  response regulator receiver protein  100 
 
 
128 aa  260  4e-69  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.639162  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6389  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  44.35 
 
 
688 aa  114  5e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1970  GAF sensor hybrid histidine kinase  41.82 
 
 
602 aa  104  5e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.316288  normal  0.365319 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5744  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.34 
 
 
510 aa  100  9e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.739341 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2148  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.32 
 
 
819 aa  94.7  4e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.233006  hitchhiker  0.00949178 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3026  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  40.5 
 
 
819 aa  91.3  4e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.956622  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4373  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.17 
 
 
687 aa  90.9  6e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0865062  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1771  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.55 
 
 
923 aa  90.5  8e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.357218 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4217  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.17 
 
 
686 aa  90.1  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.34172  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4350  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.33 
 
 
686 aa  89.7  1e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5165  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  34.75 
 
 
593 aa  88.6  2e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2200  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.71 
 
 
848 aa  86.3  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00863508  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0223  histidine kinase  37.84 
 
 
647 aa  85.9  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6114  putative PAS/PAC sensor protein  35 
 
 
532 aa  83.6  9e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.249535  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4367  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.66 
 
 
800 aa  82.4  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.522603  normal  0.113968 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1747  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 
850 aa  82  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.346291  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1676  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 
850 aa  81.3  0.000000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.109527  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0852  GAF sensor hybrid histidine kinase  40.16 
 
 
1055 aa  80.5  0.000000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4645  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.19 
 
 
644 aa  78.6  0.00000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.224961  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0574  response regulator receiver  36.36 
 
 
130 aa  75.1  0.0000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.4385  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1658  response regulator/GGDEF domain-containing protein  33.33 
 
 
458 aa  71.2  0.000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.939598  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0252  response regulator receiver protein  36.51 
 
 
239 aa  71.2  0.000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.114255 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1382  histidine kinase  35.71 
 
 
912 aa  70.5  0.000000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3002  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.75 
 
 
1234 aa  70.1  0.000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.131007 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1469  response regulator receiver protein  32.79 
 
 
116 aa  70.1  0.000000000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1423  response regulator receiver protein  32.79 
 
 
116 aa  70.1  0.000000000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1681  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.38 
 
 
926 aa  70.1  0.000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.270935  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2980  response regulator receiver protein  37.4 
 
 
121 aa  70.1  0.000000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2543  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.64 
 
 
823 aa  69.3  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.906632  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0598  sigma-54 dependent DNA-binding response regulator  36.44 
 
 
470 aa  69.7  0.00000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.885444  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3647  two component, sigma-54 specific, Fis family transcriptional regulator  36.94 
 
 
471 aa  70.1  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0209004  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0247  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36 
 
 
640 aa  70.1  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0678153 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3222  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  43.82 
 
 
447 aa  69.7  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0905113 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2746  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.02 
 
 
1096 aa  69.7  0.00000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.455726  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1405  sensor histidine kinase/response regulator  31.4 
 
 
1379 aa  69.3  0.00000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0684  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  38.66 
 
 
469 aa  68.9  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000150794 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3086  response regulator receiver protein  36.59 
 
 
121 aa  68.9  0.00000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.342425  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04130  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  35.43 
 
 
236 aa  68.9  0.00000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.118973  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0343  response regulator receiver  35.48 
 
 
232 aa  68.9  0.00000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.86362  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1174  putative two-component response regulator  32.52 
 
 
126 aa  69.3  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.289144  normal  0.876478 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2109  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  35.83 
 
 
515 aa  68.9  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2860  response regulator receiver  36.59 
 
 
121 aa  68.9  0.00000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.388237  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0665  response regulator receiver domain-containing protein  34.15 
 
 
127 aa  69.3  0.00000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.709306  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5807  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.72 
 
 
990 aa  68.9  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4657  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.83 
 
 
240 aa  69.3  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2401  phosphate regulon transcriptional regulatory protein phoB  37.3 
 
 
229 aa  68.6  0.00000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2028  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.04 
 
 
1247 aa  68.2  0.00000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.138072 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0671  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  38.66 
 
 
469 aa  68.6  0.00000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3112  putative PAS/PAC sensor protein  36.97 
 
 
733 aa  68.2  0.00000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4259  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 
804 aa  68.6  0.00000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0891  response regulator receiver domain-containing protein  39.08 
 
 
137 aa  68.2  0.00000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2189  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.27 
 
 
628 aa  68.2  0.00000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0671838  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0766  two component transcriptional regulator  35.94 
 
 
233 aa  68.2  0.00000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.528482  normal  0.302775 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3997  response regulator receiver protein  36.59 
 
 
121 aa  68.2  0.00000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0883649 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3094  response regulator receiver protein  34.15 
 
 
121 aa  67.8  0.00000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1694  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  31.4 
 
 
472 aa  67.8  0.00000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2924  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  33.9 
 
 
470 aa  66.6  0.0000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.777319  hitchhiker  0.0000000000564278 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0378  two component transcriptional regulator  35.29 
 
 
234 aa  66.6  0.0000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2198  response regulator receiver protein  34.15 
 
 
127 aa  66.6  0.0000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.16592  normal  0.62826 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0493  signal transduction histidine kinase, LytS  34.17 
 
 
1022 aa  65.5  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000359244  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1889  ATPase domain-containing protein  35.65 
 
 
280 aa  65.5  0.0000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.508337  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0886  GAF sensor hybrid histidine kinase  27.87 
 
 
842 aa  65.5  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00435524 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1740  multi-sensor hybrid histidine kinase / cell cycle control histidine kinase CckA  34.68 
 
 
866 aa  65.9  0.0000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0223971  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1179  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  35.83 
 
 
457 aa  65.5  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.655382  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2811  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.97 
 
 
498 aa  65.9  0.0000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.782124  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0231  GAF sensor hybrid histidine kinase  32.79 
 
 
844 aa  65.9  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.794534  normal  0.63544 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2550  multi-sensor signal transduction histidine kinase  45.24 
 
 
685 aa  65.1  0.0000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2629  two component signal transduction response regulator  36.07 
 
 
238 aa  65.1  0.0000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0541  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  35 
 
 
575 aa  65.5  0.0000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0941  response regulator receiver  34.96 
 
 
125 aa  65.1  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1696  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  37.93 
 
 
481 aa  65.1  0.0000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.481364  normal  0.940549 
 
 
-
 
NC_002936  DET1294  DNA-binding response regulator  34.58 
 
 
180 aa  64.7  0.0000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000125664  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5456  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.96 
 
 
641 aa  64.7  0.0000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0579502  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0677  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  42.53 
 
 
343 aa  64.7  0.0000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.756866  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2741  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  32.5 
 
 
474 aa  64.7  0.0000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0363909  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4869  response regulator receiver domain-containing protein  35.96 
 
 
123 aa  64.7  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.337506  normal  0.697748 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2107  response regulator receiver protein  33.06 
 
 
768 aa  64.7  0.0000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2539  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  41.86 
 
 
487 aa  64.7  0.0000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.846517  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4267  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.54 
 
 
1076 aa  64.7  0.0000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.715458 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0241  response regulator receiver protein  35.09 
 
 
123 aa  64.7  0.0000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1106  response regulator receiver protein  35.51 
 
 
180 aa  64.7  0.0000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0674112  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3620  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.81 
 
 
239 aa  64.3  0.0000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0253056  normal  0.477246 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4410  response regulator receiver protein  34.15 
 
 
131 aa  64.3  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.686937 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2685  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.61 
 
 
660 aa  64.3  0.0000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.41147  normal  0.190122 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1157  response regulator receiver protein  34.96 
 
 
127 aa  64.3  0.0000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.116971  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04120  response regulator with CheY-like receiver domain protein and winged-helix DNA-binding domain protein  36.36 
 
 
220 aa  64.3  0.0000000006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.745463 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2419  response regulator receiver domain-containing protein  31.67 
 
 
124 aa  64.3  0.0000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.730066  hitchhiker  0.0000120546 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3516  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.41 
 
 
614 aa  64.3  0.0000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.166046 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0504  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  35.25 
 
 
443 aa  64.3  0.0000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1777  response regulator receiver protein  32.76 
 
 
129 aa  64.3  0.0000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.723308  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1214  response regulator receiver protein  31.03 
 
 
125 aa  64.3  0.0000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.678516  hitchhiker  0.000513941 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0517  histidine kinase  34.65 
 
 
726 aa  63.9  0.0000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.978002  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1042  two component signal transduction response regulator  33.88 
 
 
465 aa  63.9  0.0000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.472622  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5220  response regulator receiver protein  33.07 
 
 
126 aa  63.9  0.0000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.472283  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3770  response regulator receiver protein  36.21 
 
 
391 aa  63.9  0.0000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  unclonable  0.0000112062 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0096  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.52 
 
 
741 aa  63.9  0.0000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.770159  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0387  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  34.23 
 
 
487 aa  63.5  0.0000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0207452  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3097  diguanylate cyclase  32.48 
 
 
458 aa  63.9  0.0000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.948135  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0640  two component transcriptional regulator  34.92 
 
 
233 aa  63.9  0.0000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.772339  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1655  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  36.67 
 
 
462 aa  63.5  0.0000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000025661  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>