More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_1777 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_1777  response regulator receiver protein  100 
 
 
129 aa  264  2.9999999999999995e-70  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.723308  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3026  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  39.84 
 
 
819 aa  89  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.956622  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2148  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.19 
 
 
819 aa  82.8  0.000000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.233006  hitchhiker  0.00949178 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0632  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.36 
 
 
695 aa  82.8  0.000000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.554525  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_138  response regulator  36.13 
 
 
130 aa  81.3  0.000000000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0131  response regulator  36.13 
 
 
130 aa  80.9  0.000000000000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0240  response regulator receiver protein  36.13 
 
 
130 aa  80.9  0.000000000000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1502  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  34.86 
 
 
952 aa  79  0.00000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2497  multi-sensor hybrid histidine kinase  32 
 
 
1168 aa  77.8  0.00000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.436801 
 
 
-
 
NC_002936  DET1016  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  32.79 
 
 
1258 aa  77.4  0.00000000000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0903  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 
1262 aa  74.3  0.0000000000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4259  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.09 
 
 
804 aa  72.8  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0886  GAF sensor hybrid histidine kinase  30 
 
 
842 aa  71.6  0.000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00435524 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0231  GAF sensor hybrid histidine kinase  31.36 
 
 
844 aa  70.9  0.000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.794534  normal  0.63544 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5165  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  32.77 
 
 
593 aa  70.5  0.000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_887  sensor histidine kinase/response regulator  32.23 
 
 
1258 aa  70.5  0.000000000008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6114  putative PAS/PAC sensor protein  35 
 
 
532 aa  70.1  0.000000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.249535  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0891  response regulator receiver domain-containing protein  34.48 
 
 
137 aa  68.6  0.00000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1694  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  34.48 
 
 
472 aa  68.6  0.00000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2780  histidine kinase  40 
 
 
558 aa  67.8  0.00000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4350  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.36 
 
 
686 aa  67.8  0.00000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4373  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.67 
 
 
687 aa  67.4  0.00000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0865062  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1396  sensor histidine kinase/response regulator  31.4 
 
 
1092 aa  66.6  0.0000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1405  sensor histidine kinase/response regulator  34.71 
 
 
1379 aa  66.2  0.0000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3002  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.55 
 
 
1234 aa  66.2  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.131007 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4217  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.51 
 
 
686 aa  65.1  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.34172  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4367  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.9 
 
 
800 aa  64.3  0.0000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.522603  normal  0.113968 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5744  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.03 
 
 
510 aa  64.3  0.0000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.739341 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1916  response regulator receiver protein  32.76 
 
 
128 aa  64.3  0.0000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.639162  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0988  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  31.93 
 
 
468 aa  63.9  0.0000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6389  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.45 
 
 
688 aa  63.9  0.0000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2145  two component signal transduction response regulator  31.62 
 
 
492 aa  63.5  0.000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1970  GAF sensor hybrid histidine kinase  38.14 
 
 
602 aa  63.2  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.316288  normal  0.365319 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1247  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.45 
 
 
235 aa  63.5  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.464606  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3251  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  33.64 
 
 
465 aa  62.4  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3647  two component, sigma-54 specific, Fis family transcriptional regulator  32.48 
 
 
471 aa  62.4  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0209004  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1294  DNA-binding response regulator  33.33 
 
 
180 aa  62  0.000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000125664  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2028  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.77 
 
 
1247 aa  62  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.138072 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2678  two component, sigma-54 specific, Fis family transcriptional regulator  30.89 
 
 
457 aa  62  0.000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1397  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  31.09 
 
 
458 aa  62  0.000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1287  response regulator receiver domain-containing protein  33.9 
 
 
127 aa  62  0.000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.442215  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1106  response regulator receiver protein  33.33 
 
 
180 aa  61.2  0.000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0674112  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1214  response regulator receiver protein  29.75 
 
 
125 aa  61.2  0.000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.678516  hitchhiker  0.000513941 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0018  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  35.29 
 
 
461 aa  61.2  0.000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.709029  normal  0.924426 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1300  PAS  35.09 
 
 
695 aa  60.8  0.000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.233563 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6741  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  32.73 
 
 
728 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2820  multi-sensor hybrid histidine kinase / cell cycle control histidine kinase CckA  36.51 
 
 
829 aa  60.5  0.000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1078  DNA-binding response regulator  33.33 
 
 
180 aa  60.5  0.000000008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.00000000000063084  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1490  sensory box histidine kinase/response regulator  35.09 
 
 
695 aa  60.5  0.000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.135352  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0010  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.77 
 
 
508 aa  60.1  0.000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0502065  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0981  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.26 
 
 
221 aa  59.7  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.416641 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0387  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  31.01 
 
 
487 aa  59.7  0.00000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0207452  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1495  sigma-54 dependent DNA-binding response regulator  31.09 
 
 
458 aa  59.3  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.301103  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6441  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  33.05 
 
 
470 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3549  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.21 
 
 
702 aa  58.9  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5980  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  32.2 
 
 
469 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6276  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  32.2 
 
 
469 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2827  response regulator receiver protein  30.51 
 
 
137 aa  58.9  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3914  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.2 
 
 
1022 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.1  normal  0.0660292 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2650  response regulator receiver domain-containing protein  32.8 
 
 
125 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.6169 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7223  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  30.58 
 
 
473 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.58817  normal  0.218696 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1991  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  30.89 
 
 
357 aa  58.5  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0960  two component transcriptional regulator  29.69 
 
 
236 aa  58.9  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0214647 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3372  response regulator receiver protein  33.7 
 
 
106 aa  58.5  0.00000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.457029  normal  0.363016 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4549  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.71 
 
 
221 aa  58.5  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.703481  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1988  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  32.77 
 
 
509 aa  58.5  0.00000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2389  two component transcriptional regulator  33.08 
 
 
219 aa  58.2  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.753035  normal  0.0318145 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2782  two component transcriptional regulator  32.28 
 
 
231 aa  58.2  0.00000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.92379  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2716  response regulator  30.33 
 
 
125 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.59583  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0970  response regulator receiver  31.75 
 
 
438 aa  58.2  0.00000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3485  two component transcriptional regulator  28.91 
 
 
236 aa  58.2  0.00000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1191  hybrid sensory histidine kinase BarA  30.58 
 
 
950 aa  58.2  0.00000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000146059  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5575  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  31.4 
 
 
472 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5939  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  31.4 
 
 
472 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.862183 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3745  response regulator receiver domain-containing protein  32.79 
 
 
133 aa  57.8  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.368149  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1727  response regulator receiver  33.85 
 
 
132 aa  57.8  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0248964  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4635  multi-sensor hybrid histidine kinase  35 
 
 
857 aa  57.8  0.00000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.576155  normal  0.315346 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3383  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  33.33 
 
 
475 aa  57.8  0.00000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.542066  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2449  response regulator receiver  31.15 
 
 
142 aa  57.4  0.00000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000856797 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2229  multi-sensor hybrid histidine kinase  30 
 
 
925 aa  57.8  0.00000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.843602  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2334  response regulator receiver protein  27.73 
 
 
151 aa  57.4  0.00000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0719  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  32.48 
 
 
307 aa  57.8  0.00000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3029  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.08 
 
 
652 aa  57.4  0.00000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2719  response regulator receiver protein  29.37 
 
 
120 aa  57.4  0.00000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0959171  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0673  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.45 
 
 
235 aa  57.4  0.00000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.996485  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6147  two component transcriptional regulator, winged helix family  29.91 
 
 
244 aa  57.4  0.00000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.200947 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4235  sensor histidine kinase  32.23 
 
 
754 aa  57  0.00000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.507157  normal  0.848747 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4630  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.5 
 
 
845 aa  57  0.00000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.153941 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1534  response regulator receiver protein  31.93 
 
 
439 aa  57  0.00000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1635  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  31.71 
 
 
457 aa  57  0.00000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2157  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.46 
 
 
226 aa  56.2  0.0000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0845  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  31.62 
 
 
508 aa  56.6  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.903712  hitchhiker  0.00198769 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0393  DNA-binding response regulator  31.3 
 
 
228 aa  56.2  0.0000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.632289  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0520  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.47 
 
 
556 aa  56.6  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.936608  normal  0.731504 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2986  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.3 
 
 
1228 aa  56.2  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.387618 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6070  two component response regulator  32.26 
 
 
228 aa  56.6  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0615  response regulator  31.36 
 
 
484 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.177724  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4023  two component response regulator  33.33 
 
 
119 aa  56.6  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0092  response regulator receiver protein  29.91 
 
 
682 aa  56.6  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6507  two component transcriptional regulator  31.93 
 
 
270 aa  56.6  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0763131  normal  0.20607 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>