More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_5351 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_5351  protein of unknown function UPF0118  100 
 
 		 364 aa  702    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0138969  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1450  hypothetical protein  42.09 
 
 		 350 aa  233  3e-60  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.996482  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3895  hypothetical protein  43.17 
 
 		 340 aa  193  3e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0467618  normal  0.207617 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1984  hypothetical protein  42.25 
 
 		 340 aa  192  7e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.372704  normal  0.185401 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0340  hypothetical protein  42.25 
 
 		 340 aa  191  1e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0956  hypothetical protein  42.17 
 
 		 349 aa  183  4.0000000000000006e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0392869 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4216  hypothetical protein  43.56 
 
 		 346 aa  174  1.9999999999999998e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.329203  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3832  protein of unknown function UPF0118  34.66 
 
 		 372 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0915  hypothetical protein  34.12 
 
 		 346 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0244  protein of unknown function UPF0118  36.79 
 
 		 376 aa  173  5e-42  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2262  hypothetical protein  36.06 
 
 		 381 aa  171  2e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0141033  normal  0.407022 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4585  putative transport protein/permease  33.16 
 
 		 382 aa  160  3e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2700  hypothetical protein  33.7 
 
 		 368 aa  158  1e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0306531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3439  hypothetical protein  35.74 
 
 		 370 aa  158  1e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.190134  normal  0.242294 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2711  hypothetical protein  33.15 
 
 		 395 aa  157  3e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.569285 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3110  protein of unknown function UPF0118  32.97 
 
 		 383 aa  156  6e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2554  hypothetical protein  36.31 
 
 		 356 aa  155  1e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1508  protein of unknown function UPF0118  33.52 
 
 		 395 aa  152  8.999999999999999e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.634886  normal  0.895228 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1905  hypothetical protein  33.84 
 
 		 379 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.358826 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2675  hypothetical protein  31.82 
 
 		 391 aa  145  1e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.173775  normal  0.141253 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1787  protein of unknown function UPF0118  34.21 
 
 		 392 aa  145  1e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.190485  normal  0.0890558 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1508  hypothetical protein  34.5 
 
 		 401 aa  144  2e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0662165  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1411  hypothetical protein  35.47 
 
 		 369 aa  141  1.9999999999999998e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2235  hypothetical protein  33.64 
 
 		 395 aa  140  3e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.55122  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2806  hypothetical protein  31.69 
 
 		 372 aa  137  3.0000000000000003e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.217461  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4286  hypothetical protein  36.81 
 
 		 343 aa  134  1.9999999999999998e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.573481  normal  0.303485 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1751  hypothetical protein  33.74 
 
 		 353 aa  134  3e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.903333  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2233  hypothetical protein  30.97 
 
 		 379 aa  128  1.0000000000000001e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.195735  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0783  hypothetical protein  35.05 
 
 		 365 aa  126  5e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.930721  normal  0.646408 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0134  hypothetical protein  27.83 
 
 		 358 aa  124  2e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.980357  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07661  permease  27.7 
 
 		 358 aa  121  1.9999999999999998e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.0677332 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0908  hypothetical protein  33.22 
 
 		 355 aa  119  7e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0708322  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3009  protein of unknown function UPF0118  31.76 
 
 		 382 aa  114  3e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0518  hypothetical protein  30.26 
 
 		 387 aa  113  6e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07191  permease  28.2 
 
 		 359 aa  110  4.0000000000000004e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.626992  normal  0.434396 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3926  protein of unknown function UPF0118  28.05 
 
 		 340 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2392  hypothetical protein  26.88 
 
 		 349 aa  104  2e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.89361 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1078  protein of unknown function UPF0118  29.79 
 
 		 336 aa  103  5e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.359333 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2189  protein of unknown function UPF0118  26.23 
 
 		 396 aa  99  1e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.289237  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2027  protein of unknown function UPF0118  28.48 
 
 		 354 aa  99  1e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.294883  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2955  hypothetical protein  23.69 
 
 		 373 aa  98.2  2e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0331656  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3369  protein of unknown function UPF0118  30.22 
 
 		 344 aa  98.2  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2927  hypothetical protein  24.2 
 
 		 361 aa  97.8  2e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2316  hypothetical protein  24.2 
 
 		 361 aa  97.8  2e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.582551  hitchhiker  0.00000126508 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2637  permease  24.52 
 
 		 348 aa  97.8  3e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.386693  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2721  hypothetical protein  24.17 
 
 		 361 aa  97.4  3e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00186421  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2961  hypothetical protein  24.52 
 
 		 361 aa  97.8  3e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0186622  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2709  hypothetical protein  24.2 
 
 		 361 aa  97.1  5e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000235293  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2660  permease  24.2 
 
 		 361 aa  97.1  5e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00181766  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2916  hypothetical protein  24.2 
 
 		 348 aa  96.7  5e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2916  hypothetical protein  24.2 
 
 		 361 aa  97.1  5e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000469324 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2742  protein of unknown function UPF0118  29.91 
 
 		 344 aa  96.7  6e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0922989  unclonable  0.00000000268058 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1354  hypothetical protein  28.12 
 
 		 375 aa  95.9  1e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000360215  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2670  protein of unknown function UPF0118  27.69 
 
 		 345 aa  94.7  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3434  protein of unknown function UPF0118  27.69 
 
 		 345 aa  94.7  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2668  phosphoribosylaminoimidazole-succinocarboxamide synthase  31.61 
 
 		 665 aa  94.4  3e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1995  hypothetical protein  24.5 
 
 		 361 aa  94  4e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0255666  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0061  hypothetical protein  26.43 
 
 		 383 aa  94  4e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1275  hypothetical protein  29.52 
 
 		 329 aa  92.4  1e-17  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4544  hypothetical protein  25.62 
 
 		 381 aa  91.7  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4001  hypothetical protein  27.05 
 
 		 368 aa  91.3  2e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.591053 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1195  hypothetical protein  34.32 
 
 		 329 aa  89.7  8e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2491  protein of unknown function UPF0118  26.89 
 
 		 353 aa  88.2  2e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3863  hypothetical protein  26.86 
 
 		 347 aa  87  4e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.596541  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1235  protein of unknown function UPF0118  26.29 
 
 		 354 aa  87.4  4e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3575  protein of unknown function UPF0118  32.04 
 
 		 344 aa  86.7  6e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00192559  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4237  hypothetical protein  25.38 
 
 		 355 aa  86.7  6e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4286  hypothetical protein  25 
 
 		 355 aa  86.3  7e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4123  hypothetical protein  25 
 
 		 355 aa  86.3  7e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4134  hypothetical protein  25 
 
 		 355 aa  86.3  7e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4618  hypothetical protein  25 
 
 		 355 aa  86.3  7e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.569611  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4470  hypothetical protein  25 
 
 		 355 aa  86.3  7e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000112475 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4510  hypothetical protein  25.38 
 
 		 355 aa  86.3  8e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0726  hypothetical protein  25.38 
 
 		 355 aa  85.9  9e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16391  permease  27 
 
 		 360 aa  85.1  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.216071 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1488  hypothetical protein  28.35 
 
 		 341 aa  84.7  0.000000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000137756  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09400  predicted permease  34.07 
 
 		 357 aa  84.3  0.000000000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.291782 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2868  protein of unknown function UPF0118  26.97 
 
 		 400 aa  84  0.000000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.579917  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2478  hypothetical protein  32.5 
 
 		 369 aa  83.2  0.000000000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2922  protein of unknown function UPF0118  25 
 
 		 357 aa  83.2  0.000000000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.512956  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6535  protein of unknown function UPF0118  26.67 
 
 		 394 aa  82.4  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.278292  normal  0.0349253 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0633  hypothetical protein  26.89 
 
 		 348 aa  81.3  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0451762  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02869  transport protein  26.8 
 
 		 338 aa  81.6  0.00000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4793  hypothetical protein  26.65 
 
 		 344 aa  81.6  0.00000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.560868 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5210  protein of unknown function UPF0118  31.4 
 
 		 345 aa  81.3  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000144016 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3493  protein of unknown function UPF0118  26.41 
 
 		 348 aa  80.9  0.00000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3102  hypothetical protein  25.65 
 
 		 352 aa  80.1  0.00000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0929  hypothetical protein  20.83 
 
 		 405 aa  80.1  0.00000000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0960  protein of unknown function UPF0118  28.05 
 
 		 353 aa  80.1  0.00000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1860  permease  26.74 
 
 		 369 aa  80.1  0.00000000000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1762  hypothetical protein  25.1 
 
 		 329 aa  79.7  0.00000000000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1793  hypothetical protein  27.65 
 
 		 387 aa  79.7  0.00000000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.116515  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1773  hypothetical protein  26.63 
 
 		 357 aa  79  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000027115  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1485  protein of unknown function UPF0118  27.69 
 
 		 455 aa  79  0.0000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.823858  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2589  hypothetical protein  26.33 
 
 		 348 aa  78.2  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.148207  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1964  hypothetical protein  25.6 
 
 		 378 aa  78.6  0.0000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3895  protein of unknown function UPF0118  25.54 
 
 		 529 aa  77.8  0.0000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.374859  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1196  hypothetical protein  32.43 
 
 		 359 aa  77.8  0.0000000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1113  hypothetical protein  27.5 
 
 		 363 aa  77.8  0.0000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0939063  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8629  permease-like protein  23.55 
 
 		 423 aa  77.8  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>