More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_2066 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013422  Hneap_2066  multi-sensor hybrid histidine kinase  100 
 
 		 1167 aa  2383    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.082343  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1845  multi-sensor hybrid histidine kinase  40 
 
 		 878 aa  433  1e-120  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.187428  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2068  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.19 
 
 		 948 aa  378  1e-103  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0534  multi-sensor hybrid histidine kinase  44.61 
 
 		 697 aa  304  5.000000000000001e-81  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.608337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1924  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.49 
 
 		 901 aa  291  6e-77  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2093  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.75 
 
 		 530 aa  278  3e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.874358  normal  0.342392 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3548  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.86 
 
 		 1007 aa  277  9e-73  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.508984  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6413  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  42.51 
 
 		 404 aa  272  2.9999999999999997e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.341429  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1409  Signal transduction histidine kinase-like  39.86 
 
 		 685 aa  272  2.9999999999999997e-71  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2390  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.9 
 
 		 618 aa  271  5e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.868312  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0186  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.92 
 
 		 657 aa  271  7e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00908915 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1918  ATP-binding region, ATPase-like protein  41.93 
 
 		 935 aa  266  1e-69  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2356  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.73 
 
 		 602 aa  264  8e-69  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1019  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.51 
 
 		 869 aa  262  2e-68  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3120  putative periplasmic ligand-binding sensor protein  27.26 
 
 		 1653 aa  258  4e-67  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3167  signal transduction histidine kinase-like protein  39.19 
 
 		 1077 aa  258  5e-67  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0540842 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3690  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.75 
 
 		 833 aa  253  1e-65  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0862317  normal  0.782884 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1124  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.89 
 
 		 502 aa  250  1e-64  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.963767  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2129  sensory box histidine kinase/response regulator  37.35 
 
 		 746 aa  236  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.706377  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0099  signal transduction histidine kinase-like protein  38.44 
 
 		 938 aa  234  5e-60  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.878773 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1939  PAS  36.24 
 
 		 779 aa  229  2e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.627435  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1643  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.33 
 
 		 633 aa  228  5.0000000000000005e-58  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.231435  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5383  Signal transduction histidine kinase  35.46 
 
 		 784 aa  228  5.0000000000000005e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.626951  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1029  multi-sensor hybrid histidine kinase  24.7 
 
 		 1820 aa  224  9.999999999999999e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.165868 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1035  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.42 
 
 		 1041 aa  221  5e-56  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.73134 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2100  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.83 
 
 		 637 aa  219  2e-55  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.269626 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2494  signal transduction histidine kinase-like protein  36.49 
 
 		 1317 aa  216  1.9999999999999998e-54  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.206751 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0213  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.03 
 
 		 974 aa  215  3.9999999999999995e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0934932  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1118  GAF sensor signal transduction histidine kinase  36.62 
 
 		 437 aa  215  3.9999999999999995e-54  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4701  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.48 
 
 		 1274 aa  213  2e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0613664  normal  0.609464 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1277  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.6 
 
 		 969 aa  211  5e-53  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2674  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.38 
 
 		 1305 aa  210  2e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0420  PAS  36.58 
 
 		 787 aa  209  4e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0516903 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2831  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.63 
 
 		 1407 aa  207  8e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.160519  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0601  Signal transduction histidine kinase-like protein  24.27 
 
 		 1442 aa  205  4e-51  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4021  multi-sensor hybrid histidine kinase  36 
 
 		 1013 aa  205  4e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.864375 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1705  histidine kinase  33.41 
 
 		 910 aa  205  4e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2304  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.64 
 
 		 870 aa  204  8e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1968  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.96 
 
 		 846 aa  204  8e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3366  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.95 
 
 		 762 aa  204  9.999999999999999e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4184  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.99 
 
 		 783 aa  203  9.999999999999999e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5573  multi-sensor hybrid histidine kinase  24.17 
 
 		 1203 aa  204  9.999999999999999e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.805596  normal  0.315829 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1825  Hpt sensor hybrid histidine kinase  32.69 
 
 		 932 aa  204  9.999999999999999e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3975  Cache sensor hybrid histidine kinase  36.38 
 
 		 811 aa  203  1.9999999999999998e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000222358  hitchhiker  0.00723661 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0715  multi-sensor hybrid histidine kinase  24.92 
 
 		 1767 aa  202  3e-50  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3307  multi-sensor hybrid histidine kinase  24.92 
 
 		 1767 aa  202  3e-50  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1796  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.78 
 
 		 1965 aa  201  7e-50  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0791  ATP-binding region ATPase domain protein  35.38 
 
 		 2051 aa  201  7.999999999999999e-50  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.417988  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3846  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 		 860 aa  201  9e-50  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1464  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.96 
 
 		 1135 aa  201  9e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.396763 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0072  histidine kinase  32.53 
 
 		 810 aa  200  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1426  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  23.81 
 
 		 1079 aa  199  2.0000000000000003e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.688315  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3189  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.38 
 
 		 1075 aa  198  4.0000000000000005e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0551  PAS  35 
 
 		 1026 aa  198  5.000000000000001e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.425664 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1550  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.42 
 
 		 995 aa  198  6e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4006  histidine kinase  32.58 
 
 		 736 aa  197  1e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.155316  hitchhiker  0.00128379 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3211  histidine kinase  31.84 
 
 		 781 aa  197  1e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.306218  normal  0.65795 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0565  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.56 
 
 		 947 aa  197  1e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2946  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal  35.17 
 
 		 777 aa  196  2e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2148  Cache sensor hybrid histidine kinase  32.33 
 
 		 937 aa  196  2e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.198843 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1140  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.32 
 
 		 1193 aa  196  2e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1117  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  34.54 
 
 		 770 aa  196  2e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1170  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.32 
 
 		 1193 aa  196  2e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3419  multi-sensor hybrid histidine kinase  24.65 
 
 		 1767 aa  196  2e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2383  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  24.51 
 
 		 1177 aa  195  5e-48  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.467753 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1913  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.65 
 
 		 1118 aa  194  8e-48  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2180  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.42 
 
 		 1410 aa  194  1e-47  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2811  PAS  33.72 
 
 		 1023 aa  193  2e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0211559  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1351  histidine kinase  35.85 
 
 		 596 aa  193  2e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.57626  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2114  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.02 
 
 		 674 aa  193  2e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1896  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.57 
 
 		 865 aa  192  2.9999999999999997e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1189  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.01 
 
 		 971 aa  192  4e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0065  histidine kinase  34.34 
 
 		 578 aa  192  4e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4715  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.37 
 
 		 1350 aa  191  5.999999999999999e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.726459  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0179  histidine kinase  31.49 
 
 		 758 aa  191  7e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5254  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  33.41 
 
 		 579 aa  191  8e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.601488  normal  0.0228125 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3006  PAS  32.54 
 
 		 1560 aa  190  1e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.755684 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2396  histidine kinase  33.65 
 
 		 539 aa  189  3e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.106517 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3243  PAS sensor protein  34.06 
 
 		 1323 aa  189  3e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1017  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.57 
 
 		 1323 aa  189  3e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0385374  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1822  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  33.1 
 
 		 582 aa  188  4e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.146561 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1987  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.57 
 
 		 767 aa  188  4e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1820  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.77 
 
 		 780 aa  189  4e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00145182  normal  0.723891 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0819  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.39 
 
 		 844 aa  188  6e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0848  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.39 
 
 		 844 aa  188  6e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0831  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.94 
 
 		 957 aa  187  7e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2976  two-component hybrid sensor and regulator  32.55 
 
 		 1132 aa  187  7e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.210238 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1082  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.04 
 
 		 1068 aa  187  8e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.31862 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0057  histidine kinase  33.67 
 
 		 588 aa  187  9e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000185994 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2508  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.34 
 
 		 784 aa  187  9e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.033945 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0958  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.26 
 
 		 734 aa  187  1.0000000000000001e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0232  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  32.71 
 
 		 738 aa  187  1.0000000000000001e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1441  PAS  32.27 
 
 		 794 aa  187  1.0000000000000001e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.876573  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1390  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.18 
 
 		 1977 aa  187  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3284  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  46.03 
 
 		 856 aa  186  2.0000000000000003e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0250894  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2225  histidine kinase  32.74 
 
 		 845 aa  186  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0086849  normal  0.197777 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4135  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  31.49 
 
 		 922 aa  186  2.0000000000000003e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000000370631  normal  0.0140414 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2163  histidine kinase  32.74 
 
 		 845 aa  186  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2453  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.09 
 
 		 969 aa  186  2.0000000000000003e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.19952  normal  0.304956 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2536  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.18 
 
 		 801 aa  186  2.0000000000000003e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.087707 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>