More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_1898 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013202  Hmuk_1898  multi-sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
1042 aa  2065    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.755924 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0657  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.46 
 
 
1052 aa  232  4e-59  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0683  putative PAS/PAC sensor protein  44.78 
 
 
750 aa  208  4e-52  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.987157  normal  0.214918 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2195  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.65 
 
 
655 aa  176  1.9999999999999998e-42  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2976  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.86 
 
 
732 aa  172  3e-41  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.98148  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0888  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.13 
 
 
1045 aa  169  4e-40  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.628916  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1464  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.67 
 
 
663 aa  166  1.0000000000000001e-39  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2850  histidine kinase  42.92 
 
 
343 aa  162  4e-38  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0497366  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0261  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.78 
 
 
657 aa  147  9e-34  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.514383  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1570  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.87 
 
 
594 aa  143  1.9999999999999998e-32  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.138463  normal  0.212604 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2488  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.57 
 
 
579 aa  142  1.9999999999999998e-32  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.352979  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4311  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  23.36 
 
 
1291 aa  142  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2051  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.45 
 
 
748 aa  138  5e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.167205 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3223  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.19 
 
 
654 aa  137  9.999999999999999e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3740  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.46 
 
 
603 aa  135  5e-30  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3059  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.43 
 
 
493 aa  134  7.999999999999999e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0178  histidine kinase  38.03 
 
 
557 aa  132  3e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.283442  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0851  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.67 
 
 
469 aa  132  5.0000000000000004e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0355773  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2351  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.78 
 
 
991 aa  131  6e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.248597  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0906  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.51 
 
 
1195 aa  129  2.0000000000000002e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0253  histidine kinase  38.19 
 
 
588 aa  129  4.0000000000000003e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1080  GAF sensor signal transduction histidine kinase  36.44 
 
 
1128 aa  127  8.000000000000001e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0421  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.44 
 
 
563 aa  126  2e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.410196  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3188  GAF sensor signal transduction histidine kinase  35.87 
 
 
810 aa  123  9.999999999999999e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3654  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.1 
 
 
689 aa  123  1.9999999999999998e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3297  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.31 
 
 
700 aa  123  1.9999999999999998e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0978  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.42 
 
 
562 aa  122  3e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.121796  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3151  putative PAS/PAC sensor protein  28.96 
 
 
1589 aa  122  4.9999999999999996e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.274524  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4237  putative PAS/PAC sensor protein  28.76 
 
 
843 aa  120  9e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.28007  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1762  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.07 
 
 
830 aa  119  1.9999999999999998e-25  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3605  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.65 
 
 
438 aa  120  1.9999999999999998e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1802  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  35.81 
 
 
572 aa  119  3e-25  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1265  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.47 
 
 
574 aa  119  3.9999999999999997e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2389  histidine kinase  37.61 
 
 
298 aa  117  1.0000000000000001e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0317166  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1083  GAF sensor signal transduction histidine kinase  37.27 
 
 
973 aa  115  3e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1113  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.97 
 
 
1042 aa  115  4.0000000000000004e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1000  histidine kinase  32.92 
 
 
582 aa  114  6e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.798946  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1537  putative PAS/PAC sensor protein  31.69 
 
 
636 aa  114  8.000000000000001e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3311  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.09 
 
 
1300 aa  113  2.0000000000000002e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.703453  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1946  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.65 
 
 
734 aa  113  2.0000000000000002e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0751397  normal  0.355386 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2022  multi-sensor hybrid histidine kinase  25 
 
 
1258 aa  112  5e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.250401  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0919  GAF sensor signal transduction histidine kinase  34.43 
 
 
404 aa  111  7.000000000000001e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  decreased coverage  0.0000529164 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3535  putative PAS/PAC sensor protein  29.19 
 
 
684 aa  111  8.000000000000001e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1704  histidine kinase  32.3 
 
 
294 aa  111  9.000000000000001e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.318661  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2594  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.97 
 
 
1359 aa  110  1e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1570  GAF sensor signal transduction histidine kinase  38.13 
 
 
383 aa  110  1e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0028  histidine kinase  37.56 
 
 
362 aa  110  1e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.801683  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2652  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  30.08 
 
 
598 aa  110  2e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0175  histidine kinase  36.36 
 
 
322 aa  108  4e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0979792  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0920  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.53 
 
 
655 aa  108  4e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.301008  decreased coverage  0.000022653 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3020  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.13 
 
 
483 aa  108  6e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.670561  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1571  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.13 
 
 
873 aa  108  7e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2491  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.9 
 
 
516 aa  107  2e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1440  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.44 
 
 
351 aa  107  2e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0258  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.47 
 
 
472 aa  105  5e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.209845  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2158  histidine kinase  35.14 
 
 
391 aa  105  5e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.249399  normal  0.778679 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0519  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.66 
 
 
1532 aa  105  6e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0715  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.29 
 
 
618 aa  105  6e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.97393 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3597  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.66 
 
 
587 aa  103  1e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0330  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.33 
 
 
758 aa  103  2e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0546  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.55 
 
 
578 aa  102  5e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1743  histidine kinase  29.36 
 
 
559 aa  101  6e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1021  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.74 
 
 
960 aa  100  1e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3771  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.2 
 
 
1039 aa  100  1e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  unclonable  0.0000191257 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1231  histidine kinase  35.47 
 
 
376 aa  100  2e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  hitchhiker  0.000541094 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1004  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.97 
 
 
921 aa  100  2e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.627886  normal 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3664  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27 
 
 
708 aa  99.4  3e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0199  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.85 
 
 
426 aa  99.4  3e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.525056  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4049  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.81 
 
 
883 aa  98.2  6e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1908  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.97 
 
 
529 aa  97.8  8e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0120  multi-sensor signal transduction histidine kinase  21.28 
 
 
1568 aa  97.8  9e-19  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1800  histidine kinase  33.33 
 
 
588 aa  97.8  1e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.89662  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4272  putative PAS/PAC sensor protein  29.68 
 
 
919 aa  97.4  1e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.312579  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2352  histidine kinase  33.49 
 
 
387 aa  97.1  2e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2425  membrane bound his kinase A  33.97 
 
 
350 aa  96.7  2e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0749883  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3655  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.15 
 
 
858 aa  95.9  4e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2078  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.39 
 
 
511 aa  93.6  2e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0103276  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2820  histidine kinase  33.65 
 
 
265 aa  92  5e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2409  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.13 
 
 
759 aa  91.7  6e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.456195  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2827  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.24 
 
 
1064 aa  91.3  8e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0150  putative PAS/PAC sensor protein  42.06 
 
 
1969 aa  90.1  2e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3482  putative PAS/PAC sensor protein  37.9 
 
 
994 aa  89.7  2e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1012  putative PAS/PAC sensor protein  28.41 
 
 
1154 aa  90.1  2e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0819572  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1670  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.18 
 
 
632 aa  90.1  2e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03078  sensor histidine kinase  28.75 
 
 
678 aa  89.7  2e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3382  putative PAS/PAC sensor protein  33.51 
 
 
952 aa  88.6  6e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1647  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  23.16 
 
 
638 aa  88.2  8e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.211834  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2215  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.6 
 
 
810 aa  87.4  0.000000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2774  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.4 
 
 
535 aa  87.4  0.000000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2186  histidine kinase  29.73 
 
 
383 aa  87  0.000000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0452975  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3216  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.34 
 
 
568 aa  86.7  0.000000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0600543  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0718  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.9 
 
 
649 aa  85.9  0.000000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.746522 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2663  multi-sensor hybrid histidine kinase  24.38 
 
 
1369 aa  85.1  0.000000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0497  multi-sensor signal transduction histidine kinase  21.39 
 
 
1181 aa  85.1  0.000000000000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1541  putative PAS/PAC sensor protein  30.19 
 
 
1071 aa  84.7  0.000000000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0673  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  25.93 
 
 
1215 aa  84.7  0.000000000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3335  multi-sensor hybrid histidine kinase  22.98 
 
 
1122 aa  81.3  0.00000000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0318  putative PAS/PAC sensor protein  42.34 
 
 
590 aa  80.9  0.0000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.375606  normal  0.106516 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2371  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.94 
 
 
1171 aa  80.9  0.0000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.516834  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3337  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.9 
 
 
685 aa  80.5  0.0000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>