276 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_1446 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013202  Hmuk_1446  Pyrrolo-quinoline quinone  100 
 
 
412 aa  820    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0499  Pyrrolo-quinoline quinone  43.61 
 
 
439 aa  306  3e-82  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0271  Pyrrolo-quinoline quinone  44.27 
 
 
445 aa  304  1.0000000000000001e-81  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.943298 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2473  Pyrrolo-quinoline quinone  46.31 
 
 
455 aa  302  6.000000000000001e-81  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0401  Pyrrolo-quinoline quinone  39.86 
 
 
469 aa  273  5.000000000000001e-72  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.448913  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0677  Pyrrolo-quinoline quinone  33.22 
 
 
431 aa  130  5.0000000000000004e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.350335  normal  0.177219 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0697  Pyrrolo-quinoline quinone  27.25 
 
 
415 aa  119  7.999999999999999e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4167  Pyrrolo-quinoline quinone  29.28 
 
 
432 aa  118  1.9999999999999998e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.275915 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3730  serine/threonine protein kinase  27.92 
 
 
687 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00433941 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0609  Pyrrolo-quinoline quinone  28.7 
 
 
352 aa  112  8.000000000000001e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.471438  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1455  Pyrrolo-quinoline quinone  33.67 
 
 
1454 aa  112  1.0000000000000001e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3300  serine/threonine protein kinase  32.07 
 
 
795 aa  109  1e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5123  Pyrrolo-quinoline quinone  27.18 
 
 
475 aa  106  7e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.513174  normal 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3290  serine/threonine protein kinase  30.19 
 
 
963 aa  105  2e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0556916 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1990  Pyrrolo-quinoline quinone  29.51 
 
 
463 aa  105  2e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3898  Pyrrolo-quinoline quinone  29.01 
 
 
423 aa  102  1e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.122997  normal  0.375271 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4961  Pyrrolo-quinoline quinone  29.75 
 
 
440 aa  100  5e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.559065 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3526  Pyrrolo-quinoline quinone  25.93 
 
 
514 aa  99.8  7e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.103878  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2164  serine/threonine protein kinase  27.39 
 
 
652 aa  96.7  6e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.563698  hitchhiker  0.00000786383 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4041  serine/threonine protein kinase  28.46 
 
 
774 aa  94.7  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.224391  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1465  protein kinase  27.84 
 
 
653 aa  94  4e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.355835  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2694  Pyrrolo-quinoline quinone  33.96 
 
 
450 aa  92.4  1e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  hitchhiker  0.00958514  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2189  Pyrrolo-quinoline quinone  26.6 
 
 
484 aa  92  2e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.718843 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3737  hypothetical protein  26.84 
 
 
1682 aa  88.2  3e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2782  cell surface protein  28.72 
 
 
2122 aa  87  5e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.759691  hitchhiker  0.00484383 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0659  Pyrrolo-quinoline quinone  27.16 
 
 
322 aa  86.7  6e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4514  Pyrrolo-quinoline quinone  25.41 
 
 
445 aa  86.7  7e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1297  Pyrrolo-quinoline quinone  26.84 
 
 
322 aa  85.9  0.000000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.315704  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1379  Pyrrolo-quinoline quinone  27.8 
 
 
322 aa  86.3  0.000000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2941  Pyrrolo-quinoline quinone  25.52 
 
 
396 aa  82.8  0.00000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.324041  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1643  Pyrrolo-quinoline quinone  26.88 
 
 
457 aa  82  0.00000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2153  Pyrrolo-quinoline quinone  28.48 
 
 
365 aa  81.6  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.75992  normal  0.0359383 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3412  Pyrrolo-quinoline quinone  25.06 
 
 
402 aa  77  0.0000000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0513  Pyrrolo-quinoline quinone  25.78 
 
 
422 aa  76.6  0.0000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3012  Pyrrolo-quinoline quinone  25.2 
 
 
382 aa  76.3  0.0000000000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.345618  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1550  Pyrrolo-quinoline quinone  25.07 
 
 
809 aa  76.3  0.0000000000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.183569  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1114  Pyrrolo-quinoline quinone  27.21 
 
 
374 aa  75.5  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0348875  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0128  serine/threonine protein kinase  26.99 
 
 
611 aa  74.3  0.000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.178932  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1305  Pyrrolo-quinoline quinone  25.88 
 
 
324 aa  74.3  0.000000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.551369  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0878  cobaltochelatase  26.47 
 
 
1812 aa  73.9  0.000000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0391  Pyrrolo-quinoline quinone  25.57 
 
 
486 aa  73.9  0.000000000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00019845  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0210  Pyrrolo-quinoline quinone  27.22 
 
 
397 aa  73.9  0.000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2056  Pyrrolo-quinoline quinone  26.13 
 
 
705 aa  73.6  0.000000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.9756  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2514  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.18 
 
 
1383 aa  72.8  0.00000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_911  PQQ enzyme repeat domain protein  23.3 
 
 
371 aa  72.4  0.00000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00179441  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1041  PQQ repeat-containing protein  22.74 
 
 
371 aa  71.6  0.00000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.331576  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0737  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  24.53 
 
 
396 aa  72  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.918396  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3622  Pyrrolo-quinoline quinone  26.44 
 
 
422 aa  71.2  0.00000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0923  Pyrrolo-quinoline quinone  22.59 
 
 
371 aa  71.2  0.00000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00190176  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004346  YfgL protein  25.57 
 
 
386 aa  71.2  0.00000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1661  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  27.44 
 
 
402 aa  70.9  0.00000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.274941 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01070  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  24.67 
 
 
386 aa  69.7  0.00000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1531  Pyrrolo-quinoline quinone  27.37 
 
 
546 aa  68.9  0.0000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.497288  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2182  serine/threonine protein kinase  25.68 
 
 
619 aa  69.7  0.0000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1484  hypothetical protein  23.44 
 
 
384 aa  68.6  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1308  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  24.79 
 
 
395 aa  68.6  0.0000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000307899  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2103  Pyrrolo-quinoline quinone  23.56 
 
 
383 aa  67.8  0.0000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0841326  normal  0.0433282 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5726  WD40-like repeat-domain-containing protein  26.83 
 
 
901 aa  67.4  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1729  Pyrrolo-quinoline quinone  25.48 
 
 
372 aa  67.4  0.0000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1499  hypothetical protein  23.12 
 
 
384 aa  67  0.0000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0262  Pyrrolo-quinoline quinone  26.46 
 
 
407 aa  67  0.0000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4249  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  26.23 
 
 
414 aa  66.6  0.0000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.548158  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2046  hypothetical protein  25.72 
 
 
400 aa  66.2  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.500116  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2202  Pyrrolo-quinoline quinone  37.39 
 
 
363 aa  65.9  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1656  PQQ repeat-containing protein  36.52 
 
 
363 aa  64.3  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2290  Pyrrolo-quinoline quinone  37.39 
 
 
363 aa  64.3  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0893  Pyrrolo-quinoline quinone  22.41 
 
 
645 aa  63.9  0.000000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1437  PQQ repeat-containing protein  25.64 
 
 
384 aa  63.5  0.000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.234341  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0821  Pyrrolo-quinoline quinone  25.47 
 
 
372 aa  63.2  0.000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.403647  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1293  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  25.53 
 
 
395 aa  63.2  0.000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.664438  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1899  Pyrrolo-quinoline quinone  22.3 
 
 
395 aa  62.4  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.70821 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1232  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  22.78 
 
 
395 aa  62.8  0.00000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2251  PQQ enzyme repeat domain protein  22.3 
 
 
395 aa  62.4  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1397  serine/threonine protein kinase  26.07 
 
 
643 aa  62  0.00000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.323701  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1231  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  22.78 
 
 
395 aa  61.6  0.00000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1302  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  22.47 
 
 
395 aa  62  0.00000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1740  Pyrrolo-quinoline quinone  27.86 
 
 
451 aa  61.2  0.00000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1800  hypothetical protein  25.95 
 
 
2272 aa  61.2  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.999068 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1435  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  25.18 
 
 
395 aa  61.2  0.00000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00436536  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1384  Pyrrolo-quinoline quinone  24.21 
 
 
612 aa  60.8  0.00000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.868816  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3251  serine/threonine protein kinase  25.82 
 
 
861 aa  60.8  0.00000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0225262 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0732  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  23.28 
 
 
385 aa  60.8  0.00000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1359  Pyrrolo-quinoline quinone  23.55 
 
 
377 aa  60.5  0.00000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000339921 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1963  S-layer domain protein  23.81 
 
 
1009 aa  60.1  0.00000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000481253  normal  0.0221131 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2083  Pyrrolo-quinoline quinone  21.12 
 
 
392 aa  60.1  0.00000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.397286  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1593  metallophosphoesterase  24.22 
 
 
611 aa  60.1  0.00000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.245606 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0944  Pyrrolo-quinoline quinone  23.53 
 
 
448 aa  59.7  0.00000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6658  metallophosphoesterase  23.08 
 
 
616 aa  59.3  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.492609 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0165  WD-40 repeat-containing protein  24.27 
 
 
848 aa  59.3  0.0000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.748884  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2069  Pyrrolo-quinoline quinone beta-propeller repeat protein  26.54 
 
 
407 aa  59.7  0.0000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.213316  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1547  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  24.39 
 
 
395 aa  59.3  0.0000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00611389  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1989  cell surface protein  27.13 
 
 
1241 aa  58.5  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.565549  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1993  cell surface protein  26.26 
 
 
1969 aa  58.5  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.147717  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1121  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  32.59 
 
 
393 aa  58.9  0.0000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3085  Pyrrolo-quinoline quinone  23.37 
 
 
455 aa  58.9  0.0000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00761305  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1009  Pyrrolo-quinoline quinone beta-propeller repeat protein  27.14 
 
 
438 aa  58.9  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3493  Pyrrolo-quinoline quinone  22.07 
 
 
461 aa  58.5  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.546086 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1794  cell surface protein  27.13 
 
 
1328 aa  58.2  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.193749  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1802  hypothetical protein  26.26 
 
 
2036 aa  57.8  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.993129 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1171  Pyrrolo-quinoline quinone  22.15 
 
 
399 aa  58.2  0.0000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0406546  normal  0.22444 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>