More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_1291 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013158  Huta_2012  arginyl-tRNA synthetase  78.51 
 
 
583 aa  892    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.750372  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1420  arginyl-tRNA synthetase  70.5 
 
 
600 aa  767    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.435817  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0169  arginyl-tRNA synthetase  69.93 
 
 
602 aa  764    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3171  arginyl-tRNA synthetase  73.67 
 
 
595 aa  832    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1291  arginyl-tRNA synthetase  100 
 
 
591 aa  1188    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.456077  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1008  arginyl-tRNA synthetase  42.62 
 
 
569 aa  430  1e-119  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1739  arginyl-tRNA synthetase  40.27 
 
 
567 aa  400  9.999999999999999e-111  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1508  arginyl-tRNA synthetase  41.19 
 
 
558 aa  396  1e-109  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.818041  normal  0.873479 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2213  arginyl-tRNA synthetase  41.59 
 
 
555 aa  387  1e-106  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0216  arginyl-tRNA synthetase  39.9 
 
 
558 aa  388  1e-106  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2837  arginyl-tRNA synthetase  41.83 
 
 
555 aa  384  1e-105  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0222286 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0271  arginyl-tRNA synthetase  39.71 
 
 
558 aa  382  1e-104  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0568  arginyl-tRNA synthetase  36.99 
 
 
566 aa  371  1e-101  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.078202  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1633  arginyl-tRNA synthetase  37.16 
 
 
566 aa  365  1e-99  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1102  arginyl-tRNA synthetase  34.13 
 
 
574 aa  365  1e-99  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0268  arginyl-tRNA synthetase  36.66 
 
 
566 aa  362  9e-99  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.107833  hitchhiker  0.000347929 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0288  arginyl-tRNA synthetase  38.06 
 
 
559 aa  347  3e-94  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.124809 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0350  arginyl-tRNA synthetase  34.92 
 
 
569 aa  342  1e-92  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.522224  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0562  arginyl-tRNA synthetase  36.36 
 
 
550 aa  335  9e-91  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1251  arginyl-tRNA synthetase  30.68 
 
 
566 aa  253  6e-66  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0998852 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0564  arginyl-tRNA synthetase  30.43 
 
 
635 aa  253  8.000000000000001e-66  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1017  arginyl-tRNA synthetase  29.53 
 
 
630 aa  236  1.0000000000000001e-60  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.341311 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0438  arginyl-tRNA synthetase  31.06 
 
 
601 aa  233  6e-60  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4135  arginyl-tRNA synthetase  32.3 
 
 
591 aa  233  9e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0971  arginyl-tRNA synthetase  30.39 
 
 
590 aa  227  5.0000000000000005e-58  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.168665  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08210  arginyl-tRNA synthetase  28.05 
 
 
566 aa  223  8e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1633  arginyl-tRNA synthetase  29.64 
 
 
565 aa  220  5e-56  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00726529  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2198  arginyl-tRNA synthetase  30.14 
 
 
562 aa  220  6e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00225057 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1915  arginyl-tRNA synthetase  29.47 
 
 
565 aa  218  2.9999999999999998e-55  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00499149  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1036  arginyl-tRNA synthetase  28.57 
 
 
628 aa  217  5.9999999999999996e-55  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00475054 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0586  arginyl-tRNA synthetase  28.91 
 
 
632 aa  216  9e-55  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.000562405 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0612  arginyl-tRNA synthetase  31.46 
 
 
562 aa  216  9.999999999999999e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.954769  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1992  arginyl-tRNA synthetase  28.88 
 
 
562 aa  216  9.999999999999999e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0418452  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1974  arginyl-tRNA synthetase  29.45 
 
 
562 aa  216  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0585277  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1577  arginyl-tRNA synthetase  30.24 
 
 
635 aa  216  9.999999999999999e-55  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.502048  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1756  arginyl-tRNA synthetase  29.14 
 
 
630 aa  215  1.9999999999999998e-54  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0324309  hitchhiker  0.00414873 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2010  arginyl-tRNA synthetase  28.38 
 
 
562 aa  213  5.999999999999999e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0025269  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2181  arginyl-tRNA synthetase  28.95 
 
 
562 aa  213  5.999999999999999e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.519125  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2323  arginyl-tRNA synthetase  29.7 
 
 
564 aa  213  5.999999999999999e-54  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2318  arginyl-tRNA synthetase  29 
 
 
562 aa  213  9e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000273467  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1335  arginyl-tRNA synthetase  28.15 
 
 
565 aa  213  1e-53  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0262  arginyl-tRNA synthetase  28.6 
 
 
553 aa  212  1e-53  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2606  arginyl-tRNA synthetase  31.24 
 
 
574 aa  212  1e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.629784 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0632  arginyl-tRNA synthetase  30.81 
 
 
564 aa  212  2e-53  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2021  arginyl-tRNA synthetase  29.12 
 
 
562 aa  211  3e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000995488  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2175  arginyl-tRNA synthetase  29.12 
 
 
562 aa  211  3e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000337819  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0329  arginyl-tRNA synthetase  29.32 
 
 
613 aa  211  3e-53  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0065  arginyl-tRNA synthetase  29.98 
 
 
563 aa  211  3e-53  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.079588  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1935  arginyl-tRNA synthetase  29.77 
 
 
564 aa  211  3e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000950947  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0441  arginyl-tRNA synthetase  29.98 
 
 
629 aa  210  5e-53  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1715  arginyl-tRNA synthetase  28.92 
 
 
619 aa  210  6e-53  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1846  arginyl-tRNA synthetase  28.72 
 
 
625 aa  210  8e-53  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.757566  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3135  arginyl-tRNA synthetase  28.62 
 
 
562 aa  209  1e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0137352  normal  0.0340703 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0850  arginyl-tRNA synthetase  29.92 
 
 
551 aa  209  1e-52  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0122015 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1577  arginyl-tRNA synthetase  27.83 
 
 
621 aa  207  4e-52  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.879493  normal  0.0268874 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2678  arginyl-tRNA synthetase  28.71 
 
 
592 aa  205  2e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0686  arginyl-tRNA synthetase  25.08 
 
 
628 aa  205  2e-51  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0466  arginyl-tRNA synthetase  28.6 
 
 
564 aa  205  2e-51  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.795792  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2295  arginyl-tRNA synthetase  29.46 
 
 
551 aa  202  9.999999999999999e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0648  arginyl-tRNA synthetase  29.5 
 
 
559 aa  202  9.999999999999999e-51  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0541152  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5485  arginyl-tRNA synthetase  27.21 
 
 
556 aa  202  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2103  arginyl-tRNA synthetase  27.38 
 
 
563 aa  202  1.9999999999999998e-50  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00628973  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5045  arginyl-tRNA synthetase  27.21 
 
 
556 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0077  arginyl-tRNA synthetase  27.49 
 
 
586 aa  202  1.9999999999999998e-50  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2109  arginyl-tRNA synthetase  27.49 
 
 
592 aa  201  3.9999999999999996e-50  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.513959  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2013  arginyl-tRNA synthetase  29.52 
 
 
589 aa  201  5e-50  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1644  arginyl-tRNA synthetase  30.76 
 
 
640 aa  200  6e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.705073  hitchhiker  0.00244092 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5158  arginyl-tRNA synthetase  27.09 
 
 
556 aa  200  6e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5542  arginyl-tRNA synthetase  27.05 
 
 
556 aa  199  9e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.051551  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5061  arginyl-tRNA synthetase  27.05 
 
 
556 aa  199  9e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0285  arginyl-tRNA synthetase  28.46 
 
 
564 aa  199  9e-50  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0318968  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0630  arginyl-tRNA synthetase  26.91 
 
 
553 aa  199  9e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0645  arginyl-tRNA synthetase  26.91 
 
 
553 aa  199  9e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5493  arginyl-tRNA synthetase  27.05 
 
 
556 aa  199  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5455  arginyl-tRNA synthetase  27.05 
 
 
556 aa  199  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5213  arginyl-tRNA synthetase  27.05 
 
 
556 aa  198  2.0000000000000003e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2008  arginyl-tRNA synthetase  29.21 
 
 
589 aa  198  2.0000000000000003e-49  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0052  arginyl-tRNA synthetase  28.89 
 
 
570 aa  199  2.0000000000000003e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000995895  decreased coverage  0.000521306 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5611  arginyl-tRNA synthetase  27.05 
 
 
556 aa  198  2.0000000000000003e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0186  arginyl-tRNA synthetase  26.92 
 
 
597 aa  199  2.0000000000000003e-49  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1309  arginyl-tRNA synthetase  31.41 
 
 
613 aa  198  2.0000000000000003e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.925397  normal  0.535647 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1535  arginyl-tRNA synthetase  27.29 
 
 
624 aa  197  4.0000000000000005e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2421  arginyl-tRNA synthetase  29.43 
 
 
559 aa  197  4.0000000000000005e-49  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0639128  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0899  arginyl-tRNA synthetase  27.4 
 
 
566 aa  197  4.0000000000000005e-49  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0249713  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3089  arginyl-tRNA synthetase  30.16 
 
 
586 aa  197  6e-49  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.191401  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1053  arginyl-tRNA synthetase  28.21 
 
 
556 aa  197  6e-49  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0280  arginyl-tRNA synthetase  30.42 
 
 
562 aa  197  6e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0920432  normal  0.27324 
 
 
-
 
NC_002936  DET1270  arginyl-tRNA synthetase  28.21 
 
 
556 aa  196  1e-48  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0106385  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0039  arginyl-tRNA synthetase  28.7 
 
 
599 aa  196  1e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.285018  normal  0.0776701 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05910  arginyl-tRNA synthetase  27.85 
 
 
592 aa  196  1e-48  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2487  arginyl-tRNA synthetase  28.41 
 
 
553 aa  194  4e-48  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.619732  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1215  arginyl-tRNA synthetase  28.04 
 
 
563 aa  194  4e-48  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0263  arginyl-tRNA synthetase  30.43 
 
 
586 aa  193  6e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2169  arginyl-tRNA synthetase  29.04 
 
 
585 aa  193  6e-48  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0704  arginyl-tRNA synthetase  29.51 
 
 
575 aa  193  6e-48  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.281403 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1620  arginyl-tRNA synthetase  29.57 
 
 
562 aa  193  8e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.010963  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2451  arginyl-tRNA synthetase  28.62 
 
 
612 aa  193  9e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.339647 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3643  arginyl-tRNA synthetase  25.95 
 
 
571 aa  192  1e-47  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.679016  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2318  arginyl-tRNA synthetase  26.45 
 
 
593 aa  192  1e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.291854 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5465  arginyl-tRNA synthetase  26.77 
 
 
556 aa  192  1e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>